Nature子刊:汤玮欣团队开发更高活性、更好序列兼容性的腺嘌呤碱基编辑器

芝加哥大学汤玮欣团队(博士后肖玉兰为第一作者)在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:An adenine base editor variant expands context compatibility 的研究论文。 该论文通过巧妙的定向进化设计,从野生型大肠杆菌的TadA出发,经历五轮定向进化,获得了具有更高活性与更好序列兼容性的TadA8r,拓宽了腺嘌呤碱基编辑器(ABE)在疾病治疗的应用范围。 为了提高ABE在“RA”序列上的活性,研究团队构建了一套基于细菌抗生素抗性基因编辑的高通量筛选系统。研究团队将GATC序列置于抗生素抗性基因中,GATC的安装会导致抗生素抗性蛋白失活,只有当GATC序列被有活性的TadA*编辑为GGTC之后才能使抗生素抗性蛋白恢复活性。在E. coli中,几乎所有GATC中的A均被DNA腺嘌呤甲基转移酶 (Dam)在N6位甲基化。TadA*无法接受甲基化的A为底物,......阅读全文

Nature子刊:汤玮欣团队开发更高活性、更好序列兼容性的腺嘌呤碱基编辑器

  芝加哥大学汤玮欣团队(博士后肖玉兰为第一作者)在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:An adenine base editor variant expands context compatibility 的研究论文。  该论文通过巧妙的定向进化设计,从野生型大肠杆菌的T

Nature子刊|碱基编辑器新拓展

作为Cas9核酸酶的进化祖先,IscB蛋白作为紧凑RNA引导的DNA内切酶和缺口酶,使其成为碱基编辑的强有力候选者。然而,目标范围狭窄限制了IscB系统的应用;因此,有必要找到更多识别不同靶邻基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日,辉大基因张海南、李彤、复旦大学黄锦海、中科院脑科学与智能技

汤玮欣/可爱龙团队开发基于IscB的微型基因编辑工具

  近年来,刘如谦团队等在CRISPR-Cas系统的基础上,开发了新一代基因编辑系统——碱基编辑(BE)、先导编辑(PE)。其中,碱基编辑能够在基因组靶位点有效地转换单个碱基,而不会引起DNA双链断裂。目前,研究人员已经开发了CBE、ABE、CGBE、AYBE等多种碱基编辑器。  IscB被认为是C

Nature子刊:毕昌昊/张学礼团队开发基于糖基化酶的新型碱基编辑器

  中国科学院天津工业生物技术研究所毕昌昊团队和张学礼团队合作,在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Glycosylase-based base editors for efficient T-to-G and C-to-G editing in mammalian cel

华东师大科研团队填补碱基编辑领域最后一块拼图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503069.shtm华东师范大学生命科学学院李大力教授团队继2022年10月在国际著名学术期刊 Nature Chemical Biology 报道新一代精准安全的腺嘌呤碱基编辑器ABE9以及11月在国际

本科毕业即“711”,这位985博士生很拼

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497812.shtm 从本科普通二本学校到考上985高校的硕博,陈亮没有停下脚步,跟随导师华东师范大学教授李大力,陈亮在硕博5年期间连续攻克了4项技术突破,接连发表了4篇Nature子刊。 他说,

新型腺嘌呤碱基编辑器可让细胞RNA编辑最小化

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所和哈佛大学的研究人员发现有证据表明使用碱基编辑器会导致细胞中出现意想不到的RNA编辑。相关研究结果发表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,论文标题为“Analysis and minimization of cellular RNA

单碱基基因编辑研究进展速览

  本文中,小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展,分享给大家!  【1】Nat Commun:科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪

全新「碱基编辑器」:不用「切割」也能精准编辑基因

原标题:不用「切割」也能精准编辑基因了,华人学者开发全新「碱基编辑器」摘要:CRISPR 基因编辑技术之外的新工具。基因编辑技术有了重大进展。Broad 研究所的华人学者 David Liu 教授的团队开发出了一种「碱基编辑器」,可以让细胞内 DNA 的一种碱基通过简单的化学反应,变成另一种

David-Liu首次通过AAV病毒载体在动物体内进行碱基编辑作用

  碱基编辑器用于研究和治疗遗传性疾病的成功取决于将其体内传递给相关细胞类型的能力。通过腺相关病毒(AAV)的传送受AAV打包能力的限制(AAV的基因组包装大小限制为≤5kb),因此无法使用全长碱基编辑器。  2020年1月14日,博德研究所David Liu团队在Nature Biomedical

Nature子刊:DNA碱基编辑新方法

10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diver

Nature子刊:DNA碱基编辑新方法

  10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div

科学家找到基因治疗新利器

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503037.shtm6月16日,华东师范大学生命科学学院教授李大力团队在《自然-生物技术》发表论文,报道了一系列新型腺嘌呤颠换编辑工具(AXBEs和ACBEs),并证明了ACBEs在不同细胞系与小鼠胚胎中

Nature子刊:如何更好地培养iPS细胞

  干细胞能够分化成为机体内的任何细胞类型。日本科学家山中伸弥(Shinya Yamanaka)开发的诱导多能干细胞技术(iPS),可以将成熟细胞重编程为多能细胞,使其回到类似干细胞的状态,重新获得强大的分化能力。这一技术在再生医学领域有着广阔的应用前景,被视为细胞替代疗法的新希望。  然而,目前人

Nature子刊:董一洲团队开发仿生纳米颗粒递送mRNA

  针对T细胞共刺激受体的抗体目前已被开发用来激活T细胞免疫,并在癌症免疫治疗中应用。然而,肿瘤浸润性免疫细胞往往缺乏共刺激分子的表达,这可能阻碍抗体介导的免疫治疗。  癌症免疫治疗包括多种刺激抗肿瘤免疫反应的方法,包括癌症疫苗,基于细胞的治疗,免疫检查点阻断,单克隆抗体,基于mRNA的免疫治疗和纳

中国科学家实现线粒体致病突变体内原位纠正

华东师范大学教授李大力、刘明耀团队联合临港实验室青年研究员陈亮团队,开发出高性能线粒体腺嘌呤碱基编辑器(eTd-mtABEs),并利用eTd-mtABEs成功构建了感音神经性耳聋和Leigh综合症大鼠疾病模型。此外,团队使用重新改造的DdCBE变体,首次实现线粒体致病突变的体内原位纠正,成功逆转了l

生物物理所等研究团队实现精准修正胶质瘤致癌基因突变

  胶质瘤(Glioblastoma, GBM))是一种严重威胁人类健康的脑部恶性肿瘤,目前尚缺乏有效的防治手段,以往的研究报道83%原发性胶质瘤携带端粒酶基因(TERT)启动子区域的致癌突变(Killela PJ, et al.PNAS 2013, PMID: 23530248),该突变重新激活端

2020年重要成就回顾01

  利用基因编辑技术治疗遗传性血液病的想法得到了CRISPR Therapeutics、Beam Therapeutics等多家生物初创公司的关注,基于CRISPR/Cas9系统开发的疗法在2020年取得了积极的早期结果。  2020年底的美国血液学会(ASH)年会上,CRISPR Therapeu

天津工生所在新一代碱基编辑技术开发方面取得新进展

  碱基编辑(base editing,BE)作为前沿的基因组编辑技术,能够在基因组水平上实现精确、高效的单碱基编辑。该技术广泛应用于基础研究、基因治疗和细胞工厂构建等领域。常用的DNA碱基编辑器主要是通过将可编程的DNA结合蛋白(如Cas9)与碱基脱氨酶融合实现的,包括胞嘧啶碱基编辑器(CBE)、

天津工生所在新一代碱基编辑技术开发方面获进展

  碱基编辑(base editing,BE)作为前沿的基因组编辑技术,能够在基因组水平上实现精确、高效的单碱基编辑。该技术广泛应用于基础研究、基因治疗和细胞工厂构建等领域。常用的DNA碱基编辑器主要是通过将可编程的DNA结合蛋白(如Cas9)与碱基脱氨酶融合实现的,包括胞嘧啶碱基编辑器(CBE)、

非脱氨酶依赖的嘧啶碱基编辑器TBE获得进展

  DNA碱基编辑工具的进步为疾病治疗带来了巨大的希望,可修复由单核苷酸多态性(SNPs)【1】引起的单基因遗传疾病。目前,胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器主要依靠脱氨酶将胞嘧啶(C)或腺嘌呤(A)转化为尿嘧啶(U)或肌苷(I),脱氨后的U和I会分别被识别为胸腺嘧啶(T)和鸟嘌呤(G),从而促进C

Nature子刊:代谢调控神经元活性

  饮食疗法可以控制许多癫痫患者的发病,此前人们一直不清楚这种治疗的作用机理。日前,McGill大学和Zurich大学的科学家们找到了答案,他们发现大脑细胞信号传递的能力与细胞的代谢有直接联系。这项研究于一月十六日发表在Nature Communications杂志上。   神经学研究者们往往

能预测碱基编辑效果的新模型开发成功

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)动物表观基因组学创新团队研发出一种预测碱基编辑效果的新模型,该模型大幅提升了预测碱基编辑器在基因组内源靶位点编辑效果的准确性。相关研究成果发表在《细胞发现》(Cell Discovery)上。碱基编辑技术是一

Nature-Biotechnology:新研究拓宽碱基编辑器的靶向范围

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas9是由一种原始的细菌免疫系统改编而成的,它的作用方式是首先在基因组的一个靶位点上切割

单碱基基因编辑系统,基因治疗又一利器

TaC9-ABE单碱基编辑技术原理。黄博纯 供图近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学与五邑大学副教授邹庆剑团队合作首次将腺苷脱氨酶与转录激活因子样效应子(TALE)融合,开发了一种不会产生Cas9依赖性脱靶的新型碱基编辑系统TaC9-ABE。相关研究3月24日在线发表于《细胞发现》(

科研人员实现精准修正胶质瘤致癌基因突变

  胶质瘤(Glioblastoma, GBM))是一种严重威胁人类健康的脑部恶性肿瘤,目前尚缺乏有效的防治手段,以往的研究报道83%原发性胶质瘤携带端粒酶基因(TERT)启动子区域的致癌突变(Killela PJ, et al.PNAS 2013, PMID: 23530248),该突变重新激活端

不依赖脱氨酶的碱基编辑器开发成功

  记者1月14日从中国科学院天津工业生物技术研究所获悉,该所研究员毕昌昊团队和研究员张学礼团队合作开发了不依赖脱氨酶(DAF)的新型碱基编辑器。该成果扩展了碱基编辑器的类型,为工业菌株改造和生物医药等领域研究提供了新的技术工具。相关研究成果近日发表于国际期刊《自然-生物技术》。  碱基对是形成DN

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(上)

  前言:近年来,CRISPR基因编辑技术正在席卷整个生物医学研究领域,上一期我们已先从CRISPR系统开发及机制研究方面梳理了2018年相关大事件。伴随着基础技术不断优化,CRISPR技术的应用也更加广泛,如动物造模、药物筛选、单碱基编辑技术、细胞谱系示踪、基础疾病研究、疾病诊断、体内编辑和遗传病

高彩霞团队开发出不依赖CRISPR的全新碱基编辑工具

  基因组编辑可以对生物体遗传信息进行精准、高效的修饰,已成为生命科学领域的一项颠覆性技术。通过融合nCas9(切口酶形式的Cas9)与脱氨酶,美国哈佛大学David Liu团队先后开发出胞嘧啶碱基编辑系统(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑系统(Adenine ba

糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究中获进展

  碱基编辑技术可实现精确的碱基转换,当前,有三类碱基编辑器被广泛应用,包括胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor,GBE)。  20