新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。 在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪，对于理解它们的生物学功能和揭示其机制至关重要。目前，荧光点亮RNA适配体(FLAP)被认为是强有力的活细胞RNA荧光成像工具。其中，RhoBAST是一种表现优异的FLAP成像工具，可以结合并激活一种接触淬灭型罗丹明衍生物TMR-DN，并在RNA的超分辨率成像中表现出优异的性能，但其结合和激活荧光染料的结构机制还不清楚。 研究人员首先应用X射线晶体学解析了RhoBAST与TMR-DN复合物的高分辨率结构，发现RhoBAST折叠成一种四分支结构，整体结构类似于不对称的“A”字形。研究发现，RhoBAST的结构刚性以及半开放的结构口袋的......阅读全文
RNA－Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
Quantitating－RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA提取
RNA提取（主要内容如下）Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA，约含60～80个核苷酸，在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息，可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA－电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
RNA标记
RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求： 1. 操作简单，灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RN
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
凝胶成像仪成像仪特点
自动对焦（Auto Focus)凝胶成像分析系统，解决了新手在拍摄凝胶照片过成中，经常发生的被拍摄照片的亮度和对比度，焦距不准使照片不清晰的问题。 简介 自动对焦（Auto Focus）是利用物体光反射的原理,将反射的光被相机上的传感器CCD接受，通过计算机处理，带动电动对焦装置进行对焦的方式叫
薄层成像系统和凝胶成像系统区别
不一样的...Bio-Rad的紫外灯管是装在底板上的，薄层板不能透过或者透过率很低，达不到成像的要求的；薄层的成像系统紫外灯光是从板上部照射下来成像的。只拍白光的薄层板理论上是可以的，但是貌似要拍出彩色片的话要调节软件里的成像参数。
凝胶成像仪的凝胶成像种类
（1）UV凝胶成像分析系统：可以对蛋白电泳凝胶，DNA凝胶样品进行图象采集并进行定性和定量分析，样品包括：EB、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸监测；以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、
植物荧光成像仪——荧光成像简介
荧光是自然界常见的一种发光现象。荧光是光子与分子的相互作用产生的，这种相互过程可以通过雅布隆斯基(Jablonslc)分子能级图描述：大多数分子在常态下，是处于基态的最低振动能级So，当受到能量（光能、电能、化学能等等）激发后，原子核周围的电子从基态能级So跃迁到能量较高的激发态（第一或第二激发
热成像夜视仪的成像原理
热成像夜视仪能在全黑、薄雾及烟雾情况下产生逼真、清晰的热像。可以与宽屏导航系统、多功能导航系统进行无缝连接。摄像镜头可自由水平旋转360度，上下俯仰±90度，让您体验军事技术带来的感官享受和安全保障。 为增强驾驶员视觉能力而设计。系统可在全黑夜间、雾霾等恶劣天气以及车灯眩光等人眼能见度
植物荧光成像仪——荧光成像原理
荧光是自然界常见的一种发光现象。荧光是光子与分子的相互作用产生的，这种相互过程可以通过雅布隆斯基(Jablonslc)分子能级图描述：大多数分子在常态下，是处于基态的最低振动能级So，当受到能量（光能、电能、化学能等等）激发后，原子核周围的电子从基态能级So跃迁到能量较高的激发态（第一或第二激发
红外成像和热成像的具体区别
红外成像：将红外图像直接或间接转换成可见光图像的器件。主要有红外变像管、红外摄像管和固体成像器件等。红外变像管主要由对近红外辐射敏感的光电阴极、电子光学系统 红外成像器件和荧光屏三部分组成(见图)。 编辑本段成像原理 通常使用的光电阴极是银氧铯光电阴极（S1阴极），其电子逸出光电阴极所需的激发能量
光学成像与光声成像对比
小动光学活体成像主要采用生物发光（bioluminescence）与荧光（fluorescence）两种技术。生物发光是用荧光素酶（Luciferase）基因标记细胞或DNA，而荧光技术则采用荧光报告基团（GFP、RFP, Cyt及dyes等）进行标记。利用一套非常灵敏的光学检测仪器，让研究
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达，这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa，称为“小活化RNA”（saRNA）。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
RNA干扰相关知识Small－interfering－RNA（siRNA）
Small interfering RNA（siRNA）：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸），由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员，激发与之互补的目标mRNA的沉默。
凝胶/化学发光成像系统凝胶成像种类
（1）普通凝胶成像分析系统：可以对蛋白电泳凝胶，DNA凝胶样品进行图象采集并进行定性和定量分析，样品包括：EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸监测；以及Coomassie Blue、SYPR
双光子成像和光声成像的区别
特点、性质。双光子成像和光声成像的区别在于特点、性质。1、特点：光声成像能够实现高特异性光谱组织的选择激发。双光子成像能够调节分辨率和成像深度，是近年来新兴的成像技术。2、性质：光声成像 结合了光学成像和声学成像的优点。双光子是近红外(NIR)一区(750-1000nm)和NIR二区(1000-17
热成像夜视仪的成像原理分析
热成像夜视仪能在全黑、薄雾及烟雾情况下产生逼真、清晰的热像。可以与宽屏导航系统、多功能导航系统进行无缝连接。 摄像镜头可自由水平旋转360度，上下俯仰±90度，让您体验军事技术带来的感官享受和安全保障。为增强驾驶员视觉能力而设计。 系统可在全黑夜间、雾霾等恶劣天气以及车灯眩光等
活体成像中荧光染料的选择与成像
Cy5.5（Ex/Em：678/701 nm）和Cy7（Ex/Em：749/776 nm）是对分子标记的最优选择之一；DiD（Ex/Em：644/663 nm）、DiR（Ex/Em：748/780）染料则常用于活体成像实验中对细胞进行标记。 一、Cy5.5 、Cy7 Cy5.5 、Cy7避开了可见
纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA
实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织，直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织（0.05~0.3 g）在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿，混合均匀，冰浴 15 分钟
Science聚焦：球形RNA让RNA疗法重获新生
几十年来，RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过，随着新型RNA（球形核酸SNA）在人体试验中取得成功，这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。 RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上，研究人员
什么是RNA？RNA的作用是什么？
核糖核酸（缩写为RNA，即Ribonucleic Acid），存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种，即A（腺嘌呤）、G（鸟嘌呤）、C（胞嘧啶）、U（尿嘧啶），其中，U（尿
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(2)
1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫（C. elegans）反义RNA （antisenseRNA ）的过程中发现的，由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年，Guo等发现注射正义RNA （senseRNA ）和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(1)
Rnai最近由于RNA 干扰（RNA interference，RNA i）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA 干扰是
RNA干扰（RNA－interference，RNAi）基础知识(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA)：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸），由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员，激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA