研究开发出新型植物三维表型解析技术
近日,沈阳农业大学苗腾课题组研发出虚拟可变点云数据驱动的植物三维表型解析技术,相关成果发表在ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing杂志上。 植物三维表型解析技术通过整合光学传感器和人工智能技术方法,可高通量采集用于表征植物三维结构性状的点云数据,挖掘“基因型——形态结构表型——环境型”内在关系,最终揭示植物形态结构的形成机制。现代植物三维表型解析工具的研发需要大量的标签化点云数据做支撑,但存在数据制作成本大的现实问题。 为了解决上述问题,研究团队以玉米为例,开发了一种基于虚拟可变点云的植物三维表型解析技术框架,通过高度可控的物理变形方法将少量标签化点云转化为海量的虚拟点云数据,用于训练高精度的深度学习模型并形成植物三维表型解析技术工具。 研究成果可为植物表型组学提供数据支撑,并提升了表型组大数据处理的智能化水平。......阅读全文
研究开发出新型植物三维表型解析技术
近日,沈阳农业大学苗腾课题组研发出虚拟可变点云数据驱动的植物三维表型解析技术,相关成果发表在ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing杂志上。 植物三维表型解析技术通过整合光学传感器和人工智能技术方法,可高通量采集用于表征植物三维结构性
研究开发出新型植物三维表型解析技术
近日,沈阳农业大学苗腾课题组研发出虚拟可变点云数据驱动的植物三维表型解析技术,相关成果发表在ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing杂志上。植物三维表型解析技术通过整合光学传感器和人工智能技术方法,可高通量采集用于表征植物三维结构性状的点云
重要癌症靶标三维结构获解析
上海科技大学iHuman研究所徐菲课题组与复旦大学、美国南加州大学和斯克瑞普斯研究所等单位合作,解析了重要癌症靶标人源Smoothened受体的多结构域晶体结构,分辨率达到2.9埃(1埃=10-10米),相关成果日前在线发表于《自然—通讯》。 Smoothened受体是Hedgehog信号通路
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
Nature:首次!叶绿素合成关键酶三维结构被解析
10月23日,《自然》(Nature)在线发表叶绿素生物合成关键酶三维结构解析论文,该成果由中国农业科学院生物技术研究所微生物功能基因组创新团队联合国内外相关单位共同完成。该研究首次解析了叶绿素生物合成关键酶——光依赖型原叶绿素酸酯氧化还原酶(LPOR)的三维晶体结构,揭开了光合作用终极能量来源
张德强团队系统解析多基因控制林木表型遗传变异
近日,北京林业大学教授张德强团队依托“973”课题与教育部引智计划项目,在前期对控制木材形成重要候选基因内等位变异关联作图研究的基础上,首次系统解析了生物学途径上多个关键基因联合控制林木生长与品质性状的遗传变异。 林木重要经济性状的遗传调控机制十分复杂,由加性、显性与上位性遗传效应协同作用。如
植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学
Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型
人类细胞内的DNA,即我们熟知的基因型,为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的,但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成,这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色,身高,体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些
重要作物染色质三维构象新特征成功解析
山东农业大学李平华课题组和香港中文大学钟思林课题组的合作研究团队,日前在重要作物大基因组染色质研究领域获得重大突破。近日,国际学术期刊《分子植物》发表了该项研究成果论文。 该团队利用最新的高通量染色体构象捕获技术,通过对玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色质空间结构进行研究,成功揭示了
我国冷冻电镜再发Nature-三维结构解析免疫机制
10月2日,《自然》杂志在线发表了我国科学家的一项关于免疫系统如何发挥作用的重要成果。通过海量的实验与计算,来自中国科学院物理所、中国医学科学院等单位的研究人员,成功解析与原核短Ago系统相关的高分辨率三维蛋白结构,同时彻底弄清楚了原核短Ago系统在病毒入侵前后所发生的结构变化。原核短Ago中辅酶I
解析Analyst全新的集成化三维电磁仿真工具
AnalystTM是一款功能强大,并行的3维有限元(FEM)电磁仿真相分析工具,它无缝的集成到AWR的Microwave Office设计环境中。同时首次实现了不需要通过第三方/CAD绘图工具或仿真环境而将3维电磁仿真功能集成到电路设计软件中的功能。Analyst允许您通过一次鼠标点击实现从电路
我国科学家解析乙肝表面抗原三维结构
·这一研究不仅解决了结构生物学和病毒学领域的长期谜题,还为疫苗的优化、中和性抗体构效关系的理解提供了重要依据,特别是有望加速直接靶向病毒表面蛋白和囊膜组装的小分子药物以及引导表面蛋白降解的PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)的研发。乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染是全球严
冷冻电镜三维重构解析揭示丝状病毒IKe结构
清华大学医学院向烨研究组与以色列特拉维夫大学Amir Goldbourt组合作于2019年2月28日在《美国科学院院报》(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, PNAS)杂
冷冻电镜解析了哪种蛋白的三维结构
近日,中国科学技术大学微尺度物质科学国家研究中心和生命科学与医学部教授陈宇星和周丛照课题组与孙林峰课题组合作,利用冷冻电镜技术首次解析了人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的近原子分辨率三维结构,为深入理解该类膜蛋白转运的分子机制以及其突变引发疾病的致病机理提供了基础。该研究成果以Cryo-
上海有机所等解析首个Piezo复合物三维结构
Piezo家族离子通道感知机械力环境变化,将机械力信号转化为下游电化学信号,介导多种重要的生理活动,包括触觉、痛觉的感知、淋巴管发育、血压调节、神经轴突再生等。它的功能的异常会导致触觉超敏痛、淋巴管发育不良、神经退行性疾病等。而围绕Piezo家族蛋白功能机制的研究,仍存在诸多未解之谜。例如,Piez
人源大麻素受体三维精细结构成功解析
CB1 上海科技大学iHuman研究所在人体细胞信号转导研究领域取得重大突破。研究人员经过3年努力成功解析了人源大麻素受体的三维精细结构,为高特异性、低副作用的药物设计开启新篇章。日前,相关研究成果发表于《细胞》期刊。 据了解,人源大麻素受体(CB1)是人类中枢神经系统中表达量最高的G蛋白偶联受
【技术解析】GPU如何实现三维渲染及非图形计算?(一)
谜一样的GPU 手机,现在已经是人手一部甚至两部了,餐厅酒吧、地铁巴士、马路街边随处可见的低头族大家早就见惯不怪,在饭桌上如果你发现没有人低头看手机的话反而会怀疑自己是不是到了外星球。 吸引人们对手机目不转睛的自然是它显示的内容, 相对于个人电脑刚刚问世时候只能呈现有限的文字以及低分
科学家解析猕猴大脑微米分辨率三维结构
7月26日,中国科学院深圳理工大学(筹)/中科院深圳先进技术研究院脑认知与脑疾病研究所教授毕国强、刘北明,与副研究员徐放带领深圳理工大学/深圳先进院、中国科学技术大学和合肥综合性国家科学中心人工智能研究院团队,通过自主研发的高通量三维荧光成像VISoR技术和灵长类脑图谱绘制SMART流程,并与中
【技术解析】GPU如何实现三维渲染及非图形计算?(三)
通常和色彩一起存放于色彩缓存的阿尔法通道(Alpha Channel)包含了每个像素的相对不透明值,开发人员可以在进行深度测试之前对到来的片元先执行名为阿尔法测试(Alpha Test)的操作。如果片元的 alpha 值测试(一般是等于、大于等简单的操作)为“假”,那么这个像
【技术解析】GPU如何实现三维渲染及非图形计算?(二)
视图(Viewport,或者视口)变换 现在的实时渲染场景中包含的对象(模型)可以有很多个,但是只有被摄像机(或者说观察者,也即是设定的视角覆盖)的区域才会被渲染。这个摄像机在世界空间里有一个用来摆放的位置和面向的方向。 为了实现接下来的投影、裁剪处理,摄像机和模型都需要进行视图
植物表型分析系统—植物表型的名词解释
“植物表型是指能够反映植物细胞、组织、器官、植株和群体的结构及功能特征的物理、生理和生化性质,其本质实际是植物基因图谱的时序三维表达及其地域分异特征和代际演进规律”。这是目前所见最精辟的定义。 那么什么是高通量植物表型的?高通量植物表型技术是从器官、个体到群体水平上高通量、自动化获取产量、抗性
中科院大连化物所利用三维电子衍射技术解析全新三维小孔磷铝分子筛
近日,我所低碳催化与工程研究部(DNL12)郭鹏研究员和刘中民院士团队通过精确调控有机结构导向剂,合成了一种全新小孔磷铝分子筛DNL-17,并采用先进的三维电子衍射技术解析其复杂的晶体结构。磷铝(AlPO)分子筛是由磷氧四面体和铝氧四面体通过共氧顶点相互连接而成、具有规则孔道或笼状结构的晶态磷铝酸盐
科学家解析非洲猪瘟病毒颗粒精细三维结构
非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的家猪、野猪的一种急性、热性、高度接触性动物传染病,所有品种和年龄的猪均可感染,发病率和死亡率高可达100%。世界动物卫生组织将其列为法定报告动物疫病,我国也将其列为一类动物疫病。2018年8月3日,农业农村部新闻办公室通报我国首例非洲猪瘟疫情,随后病毒很快传播到全国
蛋白质三维结构解析固体核磁共振方法获进展
中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子物理国家重点实验室的杨俊研究组,在发展蛋白质高分辨三维结构的固体核磁共振测定新技术和新方法方面取得重要进展,相关研究结果于近日在《美国化学会》(J. Am. Chem. Soc.)上在线发表。 相对于液体核磁共振和X射线晶体衍射技术
解析绿藻光合状态转换超分子复合体的三维结构
光合作用作为重要的物质和能量转化过程,是地球上几乎所有生命赖以生存和发展的基础。光合作用状态转换是光合膜在光环境变化条件下调节激发能在光系统I(PSI)和光系统II(PSII)间均衡分配的一种快速适应机制,通过PSII主要捕光天线(LHCII)在PSII和PSI之间的迁移和可逆结合,改变两个光系
研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构
由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构,整体分辨率达到2.9 埃(Å)。 该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,
匡廷云院士团队携手攻克光系统I三维结构解析
光系统I(Photosystem I,PSI)是执行光合作用光反应的一个重要的超大色素-蛋白复合体。它通过一系列复杂的色素网络捕获太阳能,并通过驱动跨膜电子转移从而将光能转化成化学能,被称作自然界中最高效的光能转化装置。目前,国际上已经解析了原核生物蓝藻PSI以及高等植物豌豆PSI的捕光色素蛋白
表型组的定义
中文名称表型组英文名称phenome定 义一个细胞、组织、器官、生物体或物种所有表型的总和。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)