营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪接成为成熟的mRNA一般需要在多种蛋白质及snRNA的帮助下，经历两步转酯剪接反应来完成。目前对于第二步剪接反应的调控知之甚少。 冯英研究组在前期工作中发现了一种特殊的mRNA前体，该前体在剪接反应已经开启的情况下，仅将转酯反应进行到第一步即停止，第二步反应则被完全抑制。冯英研究员指导的博士生李璜等研......阅读全文
科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型
西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文，11月27日在《科学》杂志以长文形式发表。此文报道了酿酒酵母处于激活状态的剪接体2.5埃的高分辨率电镜结构，该结构是目前报道的最高分辨率的剪接体结构，首次展
上海生科院发现肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
4月10日，国际学术期刊PLOS Genetics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所惠静毅课题组题为The RNA-binding protein QKI suppresses cancer-associated aberrant splicing 的研究
上海生科院发现mRNA剪接蛋白对脂肪细胞分化的调控作用
近日，国际学术期刊Molecular and Cellular Biology在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所冯英组的最新研究进展SRSF10 regulates alternative splicing and is required for adipocyte d
分子遗传学词汇基因剪接
中文名称：基因剪接外文名称：Gene splicing别 名：重组DNA定 义：基因剪接是通过一些酶学操作使一条DNA分子与另一条DNA分子相连。即在mRNA成熟期，切除基因的内含子，连接基因的外显子的过程，称为基因剪接。而天然基因的某些片段被合成的DNA链所取代或连成整体的过程称为基因
发现重复基因剪接信号演化特点
近日，中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组张振国等人发现基因重复后基因剪接信号演化特点，以及这些变化对基因新结构形成的影响，该成果在线发表在《基因组生物学》(Genome Biology)杂志上。 在物种进化过程中，基因重复是经常发生的。那么基因重复后，基
关于基因剪接的历史发现介绍
1972年，加州大学旧金山分校的微生物学家赫伯特·伯耶（Herbert Boyer）、斯坦福大学的研究员史坦利·科恩（Stanley Cohen）在火奴鲁鲁参加学术会议时在一家现成食品店里遇到了对方。他们一边吃着熏牛肉三明治，一边构思除了一个开创了现代生物技术产业的实验。回到加州后，这两个人成功
酵母剪接体分析实验（一）
实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体，它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成，每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。试剂、试剂盒 Tris HCI 溶液EDTATE乙酸钠SDSRNA 的匀浆缓冲液RNA 的溶解缓冲液T
分子遗传学词汇tRNA剪接
中文名称：tRNA剪接英文名称：tRNA splicing定 义：切除前体tRNA中的内含子。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
酵母剪接体分析实验（二）
4. 设备(1) 液氮 （N2）。(2) 离心机，匀浆器，旋转真空浓缩仪。(3) 各种试管、离心管。(4) 玻璃板：一块为 26.5 cm 高、20.2 cm 宽、0.4 cm 厚。带凹口的玻璃板尺寸同前一块，但带一 2.2 cm 深、16.3 cm 宽的凹口。(5) 聚四氟乙烯垫片和梳子：垫片和梳
miRNA与剪接因子相互作用调控胚胎干细胞的分子机制
该项研究发现在胚胎干细胞中miRNA介导调控了近六百个可变剪接事件，其中大部分是由miR-294所调控，包括Foxp1的可变剪接。结合RNA干扰和高通量测序发现，miR-294主要通过抑制剪接调控因子Muscle blind-like蛋白（Mbnl1/2）的表达来起作用的。有趣的是，分化过程
致癌新机制：“选择性剪接”
由于正常细胞周期基本机制（如复制、DNA修复和细胞死亡）遭到破坏，在世界范围内，癌症已成为死亡的主要原因之一。 在基因组测序技术的帮助下，如今的生物医学研究人员已经可以鉴定不同肿瘤患者体内的常见遗传突变。 通常情况，人们认为只有DNA突变会导致癌症。9月21日《Cell Reports》杂志
剪接体功能研究取得新突破
在国家自然科学基金等项目的资助下，广东省科学院南繁种业研究所教授王振宇、副研究员顾进宝团队联合海南波莲生物有限公司副研究员安保光，在剪接体功能研究方面取得新突破：基因编辑技术揭示水稻OsSm基因家族的作用。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。水稻SM基因突变体的发育
研究人员开发环形RNA定量和剪接体转换识别新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
研究人员揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用
2019年10月8日，美国贝勒医学院Joshua Shulman教授课题组在Cell Reports发表题为Tau-mediated Disruption of the Spliceosome Triggers Cryptic RNA-splicing and Neurodegeneration
上海生科院发现mRNA剪接蛋白对肌肉分化和糖代谢的调控作用
11月11日，国际学术期刊Cell reports 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所冯英组的最新研究进展：SRSF10 plays a role in myoblast differentiation and glucose production via regulation
营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制
1月18日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展：Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
Nature子刊:深度学习预测传统RNASeq无法检测的选择性剪接
项目负责人Yi Xing博士是CHOP计算和基因组医学中心主任，本周他与博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》报道了这款DARTS的框架。DARTS，又称为深度学习加强的RNA-seq转录剪接分析（Deep-learning Augmented
《自然》：科学家破解DNA中“剪接密码”
加拿大多伦多大学教授布雷登·费雷率领的研究团队发现，在DNA中一个隐藏的“剪接密码”可用来解释为什么有限数目的人体基因能够产生出如此巨大数量的遗传信息。相关文章将发表在5月6日出版的《自然》（Nature）杂志上。 该发现揭开了遗传学研究中最主要的奥秘之一。科学家可据此来解
杨力受邀发表MolecularCell综述解析可变剪接
中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组受邀在《分子细胞》（Molecular Cell）发表了题为RNA structure switches RBP binding 的专评文章，对该刊同期发表的一项题为RNA sequence context effects measured in
Science挑战传统认知，剪接的多样性
大多数的哺乳动物蛋白编码基因都可能有许多种转录物，它们是由纳入外显子变化所导致。过去人们认为所谓的选择性剪接(alternative splicing)事件在物种间有可能是保守的，然而发表在12月20日《科学》(Science)杂志上的两项研究表明大多数并非如此。研究人员甚至认为，高度的选择
酵母前体mRNA剪接提取物实验
真核生物前体 mRNA ( pre-mRNA ) 的剪接分为两步，即先从前体切去内含子，然后将两个外显子连接在一起形成成熟的 mRNA。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使
酵母前体mRNA剪接提取物实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。
研究发现转录后剪接特异性调控叶肉细胞光响应及光形态建成
光是重要的环境信号，是植物进行光合作用的能量来源，参与调控植物各个阶段的生长发育过程，如种子萌发、幼苗形态建成、叶片发育、茎的伸长与生长、向光性、气孔与叶绿体运动、开花、昼夜节律及避荫反应等。植物幼苗破土见光后，光信号迅速启动，发生光形态建成，即下胚轴生长受到抑制、子叶张开并变绿以进行光合作用。这是
研究发现剪接蛋白SRSF2在肝癌发生发展中的调控作用
1月12日，国际学术期刊《癌症研究》（Cancer Research）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所冯英组的最新研究进展“SRSF2 regulates alternative splicing to drive hepatocellular carcinoma devel
Cell子刊：RNA剪接或成治疗阿尔兹海默症的潜在分子靶标
众所周知，RNA剪接失调与某些神经退行性疾病的发展有关，例如脊髓性肌萎缩和肌萎缩性侧索硬化症。而阿尔兹海默症作为世界上最常见的神经退行性疾病，在这一领域仍未得到详细的研究。 于是，在2013年，美国Emory大学的Seyfried教授课题组在这一领域开启了最前沿的研究。该研究首次发现RNA剪接
生化与细胞所揭示YB1调控3’剪接位点识别的重要功能
6月22日，国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所惠静毅研究组题为YB-1 binds to CAUC motifs and stimulates exon inclusion by enhancing the recruitmen
遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展
作为一种重要的基因转录后调控机制，可变剪接在真核生物中普遍发生，在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异，然而，决定这些差异的因素还尚不为人知。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同
聚合酶链反应剪接的原理和应用
中文名称聚合酶链反应剪接英文名称PCR splicing定 义利用聚合酶链反应进行基因剪接以删除DNA中一段特定序列的方法。系设计两组引物，先分别扩增拟删除序列上下游两侧的序列,再用上游序列5′端引物和下游序列3′端引物用PCR反应进行连接。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二
西湖大学在次要剪接体领域再获突破
3月15日，《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题，在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破，这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学讲席教授施一公团队，第一作者是西湖大学副研究员白蕊。 完全组装的次要剪接体的三维结构。课题组供图 如果说，每
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 前体 mRNA 底物试剂、试剂盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇