营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪接成为成熟的mRNA一般需要在多种蛋白质及snRNA的帮助下，经历两步转酯剪接反应来完成。目前对于第二步剪接反应的调控知之甚少。 冯英研究组在前期工作中发现了一种特殊的mRNA前体，该前体在剪接反应已经开启的情况下，仅将转酯反应进行到第一步即停止，第二步反应则被完全抑制。冯英研究员指导的博士生李璜等研......阅读全文
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S10
酵母前体mRNA剪接提取物实验（一）
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶试剂、试剂盒 YPTris-HCl ETDASD
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 前体 mRNA 底物试剂、试剂盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇
西湖大学在次要剪接体领域再获突破
3月15日，《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题，在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破，这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学讲席教授施一公团队，第一作者是西湖大学副研究员白蕊。 完全组装的次要剪接体的三维结构。课题组供图 如果说，每
酵母前体mRNA剪接提取物实验（二）
(12) RNA 洗脱缓冲液：20 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.6)，0.5 mol/L NaCl，10 mmol/L EDTA，2% ( V/V ) 苯酚（Tris EDTA 或 NaAc-EDTA 平衡），4°C 保存。(13) 7.5 moI/L 乙酸铵（NH4Ac）：用 0
次要剪接体：不次要的生命“剪辑师”
如果把微观生命活动比作一部电影，那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的，它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的，就是基因。而在基因塑造生命的过程中，有个隐秘而伟大的遗传“剪辑师”——次要剪接体。 1.每一次剪接，都关乎细胞“命运” 剪接体的故
次要剪接体：不次要的生命“剪辑师”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/496757.shtm 如果把微观生命活动比作一部电影，那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的，它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的，就是基因。而在基因
酵母前体mRNA剪接提取物实验（一）
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。 实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶 试剂、试剂盒 YPT
Cell－Reports－|－郭采薇等揭示RNA剪接在阿尔茨海默症中的作用
pre-mRNA剪接过程是基因表达调控的重要步骤，对于形成极具多样性的神经细胞转录组尤为关键。因此，RNA 剪接失调能够引起包括脊髓性肌肉萎缩症和肌萎缩性脊髓侧索硬化症等多种神经疾病【1,2】。2013年，美国Emory大学的Seyfried教授课题组发现RNA剪接失调可能也是引起阿尔兹海默症的
科学家揭示SAP30BP对CDK11调控剪接功能的关键激活作用
近日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员程红团队与武汉大学教授周宇团队、中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队合作以CDK11 requires a critical activator SAP30BP to regulate pre-mRNA splicing为题在《欧洲分子生物学学会
科学家揭示SAP30BP对CDK11调控剪接功能的关键激活作用
近日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员程红团队与武汉大学教授周宇团队、中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队合作以CDK11 requires a critical activator SAP30BP to regulate pre-mRNA splicing为题在《欧洲分子生物学
中科院最新PNAS文章
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing re
罗氏剪接修饰剂risdiplam在美国进入优先审查！
罗氏（Roche）近日宣布，美国食品和药物管理局（FDA）已受理risdiplam的新药申请（NDA）并授予了优先审查，该药是一种运动神经元生存基因2（SMN2）剪接修饰剂，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的治疗。FDA已指定处方药用户收费法（PDUFA）目标日期为2020年5月24日。之前，FDA
上海生科院揭示反式剪接的发生机制
4月1日，Genes & Development 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐永镇研究组题为A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究论
罗氏剪接修饰剂risdiplam在美国进入优先审查！
罗氏（Roche）近日宣布，美国食品和药物管理局（FDA）已受理risdiplam的新药申请（NDA）并授予了优先审查，该药是一种运动神经元生存基因2（SMN2）剪接修饰剂，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的治疗。FDA已指定处方药用户收费法（PDUFA）目标日期为2020年5月24日。之前，FDA
premRNA中存在的修饰及其对剪接影响
2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表彰她在生物医学领域，尤其是RNA生物学领域中所发挥
中科院Cell子刊发布选择性剪接研究新发现
来自中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员证实，SRSF10通过调控选择性剪接在成肌细胞分化及葡萄糖生成中起重要作用。这一研究发现发布在11月11日的《Cell Reports》杂志上。 领导这一研究的是中科院上海生命科学研究院营养科学研究所代谢性疾病的基因表达调控研究组组长冯英（Y
HippoYAP信号通路在RNA加工水平上的调控新机制获进展
6月13日，国际期刊Nature Communications（《自然·通讯》）发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组及大连医科大学汪洋研究组等研究人员的共同研究成果：A splicing isoform of TEAD4 attenuates the Hippo–YAP
Science：科学家成功解析人类剪接体关键结构
看看任何一个真核细胞基因组内的蛋白编码基因，不管是动物，植物，真菌还是原生生物，我们都会发现由于内含子的存在，编码基因被隔断成几个片段。当一个基因发生转录，这些内含子会在蛋白质合成之前从mRNA前体中被移除，虽然关于这些内含子的移除过程已经得到了几十年的深入研究，但是在一些三维动态结构研究技术出
蛋白质剪接在生物技术中的应用
内含肽在蛋白质剪接方面非常有效，因此它们在生物技术中发挥了重要作用。迄今已鉴定出200多个内含肽；大小范围为100–800AA。Inteins已被设计用于特定应用，例如蛋白质半合成和蛋白质片段的选择性标记，这对于大蛋白质的NMR研究非常有用。内含肽切除的药物抑制可能是药物开发的有用工具；如果内含肽不
Mol－Cell：基因的剪接作用如何影响机体的患病风险
没人知道一天中有多少次，甚至在一个小时内，我们体内的数万亿个细胞需要制造多少蛋白质，但我们知道，细胞会以大规模的方式在不断制造蛋白质，一旦该过程发生的话，细胞核中就会发生一种称之为RNA剪接（RNA splicing）的编辑过程，其能够确保RNA指令被传送至与机体基因蓝图精确对应的细胞工厂中。图
催化活化酵母剪接体的结构揭示了分枝机理
在1977年，Phillip Sharp和Richard Roberts俩个研究组独立发现了剪切这一过程，紧接着，1979年， Steitz研究组发现五种称为U1，U2，U4，U5和U6 snRNA的富含尿苷的小核RNA（snRNA）和7种12-35kDa的蛋白质（snRNPs）。之后，
tNAS（转录组新可变剪接位点的发现）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；发现您样品中的新可变剪接事件，揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题的答案。 我们的流程：1. Pr
我科学家揭示剪接体组装及激活机制
日前，清华大学生命科学学院施一公研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》期刊发表题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》的论文，报道了酿酒酵母剪接体处于被激活前阶段的两个完全组装的关键构象——预催化剪接体前体和预催化剪接体。 这两个高分辨率三维结构首次展示了在剪接体组装过程中剪接位点和分支点
调控NMD因子UPF3A的选择性剪接在结直肠癌中的重要功能
4月11日，国际学术期刊International Journal of Cancer 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所冯英组的最新研究进展“U2-related proteins CHERP and SR140 contribute to colorectal tumorigenesi
Nature子刊探究人类干细胞调控新层面
来自新加坡科技研究局基因组研究所(GIS)的科学家们，与来自加拿大、香港与美国的同行展开协作，发现了一个蛋白质介质SON对人类胚胎干细胞(hESCs)的健康和正常发挥功能起至关重要的作用。这一研究发现报道在9月8日的《自然细胞生物学》(Nature Cell Biology)杂志上。
北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展
6月28日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even
Nat－Rev－Genetics－|－环状RNA的合成与功能
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)，是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明，环状RNA具
我科学家发现一类新型长非编码RNA
国际著名学术期刊《分子细胞》近日以封面故事发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文，揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制，及其参与剪接调控的重要功能。这将为进一步了解PWS综合征的病理机制提供新的研究思路。 几乎所有哺乳动物细胞的基因
清华大学生科院Cell：酿酒酵母“催化后剪接体”的结构
这篇题为Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae的论文首次展示了pre-mRNA中3’剪接位点的识别状态，该结构为回答RNA剪接反应过程中pre-mRNA中的3’剪接位点如何被识别，第二步转