路思达张猛:生物信息产业是一座大金矿
很多人小时候都曾被问长大后想干什么,“我要当科学家”或者“我要做医生”或许是其中的经典答复。 如果按照刚读大学时既定的发展轨迹,现在的张猛会穿着白大褂研究实验样品。他读过临床医学和免疫学,并以排名第一的成绩考入中国科学院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所)攻读博士学位,师从著名基因组学专家于军。 既没有成为医生,也没有继续在研究所里从事科研工作,张猛在不断尝试中调整着事业发展的坐标。 与产业结缘 张猛毫不讳言自己曾经的困惑和纠结。 十多年前,一批顶尖科学家曾经感到困惑:基因组学研究能为人类带来什么呢?带着这个疑问,一项名为“人类基因组计划”启动了。 今年,刚好是该计划宣布完成十周年。据最新估计,这一载入史册的研究项目所创造的经济效益已达1万亿美元。更重要的是,其未来价值不断体现。 张猛有幸参与该计划,并借此锻炼了科研以外的能力。1998年成立的遗传发育所人类基因组中心与为运作......阅读全文
基因芯片——生物信息精灵
基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期发展出来的高科技产物。基因芯片大小如指甲盖一般,其基质一般是经过处理后的玻璃片。每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区。在指定的小区内,可固定大量具有特定功能、长约20个碱基序列的核酸分子(也叫分子探针)。由于被固定的分子探针在基质上形成不同的探针阵列
Cystatin基因家族的生物信息学分析
实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用,在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因
2018基因检测与生物信息分析论坛圆满闭幕
2018年9月16-17日由江苏人民政府主办,易贸医疗协办的2018基因检测与生物信息分析论坛在江苏泰州举办。这是一场生信人的大聚会,13场嘉宾发言,2场晚间沙龙,1场嘉宾访谈和1场闭门圆桌论坛,大家意犹未尽,期待下次的相聚!16日下午 大会首先由泰州医药高新技术产业园区管委会副主任梁洪基先生
转基因生物反应器的相关信息介绍
转基因动物是指人们按照自己的意愿有目的地将外源基因导人动物细胞内,通过与动物基因组进行稳定的整合,将生物性状传递给后代动物。转基因动物反应器是指从转基因动物体液或血液中收获目标产物的生命系统,其原理是将编码活性蛋白的基因导人动物的受精卵或早期胚胎内,以制备转基因动物,并使外源基因在动物体内(乳汁
全基因组重测序的生物信息分析内容
1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体
华大基因成功开发移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics™
2012年7月17日,华大基因宣布其成功开发出一套适用于异种移植瘤模型生物信息学分析的新算法——PDXomics™,该算法能够将移植瘤与宿主基因组序列进行区分,有效地排除后续分析中异源物种数据的污染,保证分析结果的准确性和可靠性,从而可使移植瘤模型更为有效的应用于肿瘤新药开发和疾病机理研究。
生物信息学技术:基因芯片实验原理与方法
本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达,检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化,显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据,仅仅进行差异表达分析还远远不够,如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
天津工业生物所通过信息整合获得更可靠的基因组注释
不同来源的数据信息的比较整合是提高数据质量,获得对特定生物更准确认识进而进行设计改造的常用方法。目前已有多种基于web的基因组注释服务(如RAST, JCVI, IMG, IGS等),通过这些服务提交序列信息即可得到基因注释结果,但不同服务得到的结果往往有较大不同,因此对不同来源的基因注
“计算生物学与生物信息学术研讨会”在基因组所召开
随着生命科学研究及基因测序等相关技术的飞速发展,计算生物学的重要性和复杂性在当前生物学数据量的不断增长中日益显现,并逐渐成为现代生物学研究的核心方法之一。为了推动国内相关研究单位间计算生物学和生物数据库等领域的交流与合作,10月27日至28日,中科院北京基因组研究所召集国内外众多
信息素生物测定的概念
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
信息素生物测定的定义
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
信息素生物测定的定义
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
信息素生物合成的定义
中文名称信息素生物合成英文名称biosynthesis of pheromone定 义在生物体内生成信息素的过程。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
基因组学:将数字信息转化为生物学功能
优势 · 同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆 · 从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程 · 从样品涂布到挑取、复制和重排记录并追踪样品数据 · 每天准确挑取超过30000个筛选到的克隆,效率>98% 美国能源部联合基因组研究所(
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能
VHL基因的基本信息
VHL基因的突变会导致林岛综合征(Von Hippel—Lindau Syndrome,VHL),即VHL综合征,也VHL基因名字的来源。VHL综合征是常染色体显性遗传性肿瘤疾病,一般包括肾囊肿、肾细胞癌、胰腺囊肿、胰腺癌、嗜铬细胞瘤、视网膜血管瘤、上皮性囊腺瘤和大脑脊髓的血管瘤病。发病机制为VHL
生物芯片用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
《基因组蛋白质组与生物信息学报》影响因子显著提高
在日前举行的第四届中国英文版科技期刊研讨会上,中国科学技术信息研究所发布了《2007年版中国英文版科技期刊引证报告》。根据这一报告提供的数据,中科院北京基因组研究所主办的《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,简称GPB)的
生物信息学在人类基因组计划中的应用
生物信息学是当前生物学领域的研究热点,预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加,近期生物信息学将在以下几方面迅速发展:大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前
转基因生物的概念
“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”,因为在上世纪70年代,重组脱氧核糖核酸技术(rDNA)刚开始应用于动植物育种的时候,常规的做法是将外源目的基因转入生物体内,使其得到表达,因而在早期的英语文献中,这种移植了外源基因的生物被形象地称为“transgenic
转基因生物的发展
随着分子生物技术的不断发展,尤其是上世纪90年代末以来,科学家们能够在不导入外源基因的情况下,通过对生物体本身遗传物质的加工、敲除、屏蔽等方法也能改变生物体的遗传特性,获得人们希望得到的性状。 在此类情形下,没有转入外源基因,严格说就不能再称为转基因,称为“基因修饰”更加合适和全面,因此现在开
转基因生物的种类
应用转基因技术培育的转基因生物已多达上百种,它们中有的用于生产医药类的疫苗、生物制剂;有的用于生产食品工业中的纤维素酶、凝乳酶;有的用于消除环境污染;还有许多转基因生物在农业生产中发挥了重要作用。
Qiagen公司收购生物信息公司OmicSoft
分析测试百科网讯 近日,Qiagen公司宣布已使用现金收购了生物信息公司OmicSoft。 该交易的具体价格未作披露。 OmicSoft推出了一套工具,使研究人员能够分析和可视化数据,并将其与大型的,可公开获得的多组学数据集进行比较。 Qiagen说,该收购将为其提供可扩展和灵活的软件架构解
生物素的基本信息
中文名称:生物素 中文别名:维生素H;D-生物素 ;D-(+)-生物素 ;VH英文名称:Vitamin H维生素H英文别名:D-Biotin ;Biotin ;Vitamin B7 ;CAS:58-85-5EINECS:200-399-3 分子式:C10H16N2O3S 分子量:244.303
生物样本库的信息系统
生物样本库(Biobank)资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此: 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统的功能包括但不限于:追踪捐赠者的问卷和知情同意,管理生物样本采集、
关于生物酶的信息简介
生物酶是一种无毒、对环境友好的生物催化剂,其化学本质为蛋白质。人类利用生物酶的历史已非常悠久,远在6000年前,巴比伦人已用麦芽酿造类似啤酒的饮料。5000年前,巴比伦人已懂得将乙醇转变为醋的方法,阿拉伯人利用羊胃膜凝乳酶制造干酪。我国先民利用酶的历史也非常悠久,秦汉以前人们已掌握制造美味豆酱的
生物识别技术:-领跑信息安全时代
生物识别技术因其安全、便捷等优势近年获得了用户的青睐,得到快速的发展。但是利用生物识别技术收集在数据库中的信息,却是它的“阿喀琉斯之踵”,能否保证这些信息的安全,防止信息被复制和滥用就成为影响其健康发展的重要因素。 进入现代社会以后,人们的生活高度信息化,一个突出特征就是人们高度依赖由互联