华大基因成功开发移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics™

2012年7月17日,华大基因宣布其成功开发出一套适用于异种移植瘤模型生物信息学分析的新算法——PDXomics™,该算法能够将移植瘤与宿主基因组序列进行区分,有效地排除后续分析中异源物种数据的污染,保证分析结果的准确性和可靠性,从而可使移植瘤模型更为有效的应用于肿瘤新药开发和疾病机理研究。 移植瘤模型在生物医学研究的许多领域都发挥着重要作用,比如肿瘤学、免疫学、HIV病理学研究以及新药筛选,尤其在当前的抗肿瘤药物研发和癌症机理研究中,异种移植瘤模型具有重要的应用价值。目前常用的异种移植瘤模型多是在裸鼠或重症联合免疫缺陷性小鼠(SCID)上进行的。近些年随着基因组学的不断发展,高通量测序技术为移植瘤模型提供了更好的遗传背景支持,有助于优化和筛选更好的异种移植瘤模型。同时,在抗肿瘤药物筛选、评价及肿瘤治疗过程中,对移植瘤基因组的深入剖析,可进一步了解药物与肿瘤之间的相互作用机制,鉴定相对应的可用于个性化治疗的潜在生物标记......阅读全文

华大基因完成肠道微生物基因组关联分析

  从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期

华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目

  华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。  EMP将对来自全球的20万个样本进

华大基因成功开发移植瘤生物信息分析新算法――PDXomics™

  2012年7月17日,华大基因宣布其成功开发出一套适用于异种移植瘤模型生物信息学分析的新算法——PDXomics™,该算法能够将移植瘤与宿主基因组序列进行区分,有效地排除后续分析中异源物种数据的污染,保证分析结果的准确性和可靠性,从而可使移植瘤模型更为有效的应用于肿瘤新药开发和疾病机理研究。

华大基因再发Science进行基因组比对

  来自深圳华大基因研究院,丹麦哥本哈根大学,澳洲科学院等处的研究人员利用Illumina的 HiSeq 系统,完成了两种蝙蝠的高通量全基因组测序分析,并进行了基因比对,为解析蝙蝠的飞行起源,以及蝙蝠为何会携带多种致病性强的病毒,提出了新的观点。相关成果公布在Science杂志上。   文章的

华大基因发布基因组测序新成果

  来自深圳华大基因研究院的研究人员,对4种代表性的弹涂鱼(mudskippers)进行了基因组测序,由此阐明了两栖鱼类适应陆地生活环境的分子机制。相关研究论文发布于12月2日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  深圳华大基因研究院的石琼(Qiong Shi)研究员

华大基因参与破译虎尾海马全基因组

  2016年12月15日,由中国科学院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院共同组成的研究小组,联合破译了虎尾海马(Hippocampus comes)的全基因组,有关研究成果以封面文章的形式发表在Nature杂志上。  海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高

华大基因发表宏基因组测序新成果

  人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关,但揭示其中的因果关系并不容易。  2014年七月,华南理工大学、华大基因、哥本哈根大学等单位在Nature biotechnolog

2016热门基因组测序,华大基因风头劲

  大千世界无奇不有,这都是进化的功劳。大航海时代,科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今,科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,华大基因参与的两项测序研究格外引人瞩目。  种属:大西洋鲑  基因组:2.97

Nature子刊:华大基因参与破解白蚁基因组

  湿木白蚁是一种真社会性昆虫。研究人员获得了湿木白蚁的遗传学蓝图,并在此基础上向人们展现了这种白蚁与其他社会性昆虫(蚂蚁、黄蜂和蜜蜂等)的关键异同,为理解社会性昆虫的演化提供了重要的线索。此外,这项研究也可以帮助人们寻找有助于控制白蚁的基因功能。  湿木白蚁主要生活在木头中,不怎么出去。研究人员测

全基因组重测序的生物信息分析内容

1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体

华大基因宏基因组研究获颠覆性发现

  婴儿的微生物组需要在成长过程中慢慢成熟。科学家们对98名一岁以内的瑞典婴儿进行了肠道菌群分析。他们发现,即使引入了固体食物,非母乳婴儿的微生物组仍旧比母乳婴儿更接近成人。这项研究发表在五月十三日的Cell Host & Microbe杂志上。  “我们一直以为引入固体食物是改变婴儿肠道菌群的关键

华大基因携手爱丁堡大学,共促基因组学研究

  2012年7月24日,深圳华大基因研究院与英国爱丁堡大学签署合作协议,宣布双方将在基因组领域展开广泛的科研合作,通过汇聚中英两国研究专长,加速基因组学在人类健康和农业及其他相关领域的创新和发展。   在签署的合作备忘录中,双方将着眼于对人类和其他生物的科学认识,通过共同努力,对遗传信息进行深入

华大基因测序近700种植物的基因组

   近日,华大基因的研究人员对云南瑞丽植物园内部及周边近700种植物的基因组进行了测序和分析。这项工作有助于推动地球生物基因组计划(EBP)以及万种植物基因组计划(10KP)。  在华大基因研究院副院长刘心的领导下,研究团队收集了761个植物样本,并产生了54 Tb的测序数据,每个物种的平均测序深

华大基因Cell子刊发表宏基因组测序新成果

  人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。  微生物组研究过去主要依赖16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降,针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐。目前,双胞胎

我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目

  近日,深圳华大基因研究院宣布,我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目,对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序,从而建立一个全球性的基因图谱,并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。  与以往的微

Lal-Teer畜牧公司联合华大基因成功绘制水牛基因组图谱

  2014年1月24日,孟加拉Lal Teer畜牧科技公司(孟加拉Lal Teer种业科技公司的联营公司,以下简称"Lal Teer")与华大基因联合宣布水牛基因组图谱绘制完成。该项科研成果将为深入了解水牛这一物种的起源、驯化过程及其品种选育等奠定重要的遗传学基础。   水牛,也叫印度水牛,

GE医疗携手华大基因开展干细胞研究项目

       6月12日,深圳 ―― 全球领先的医疗技术和服务提供商GE医疗集团宣布与全球卓越的基因组学研究机构华大基因(BGI)在干细胞学研究建立长期的战略合作关系。此次合作旨在更好地了解及发现不同种族的人类干细胞系的基本遗传变异,进一步推进干细胞检测方法在药物发现和

重磅内幕:传华大基因CEO王俊已离职,下家尚不明确

  近日,从王俊朋友圈的状态显示,他本人日前接受网易采访是其最后一次以华大基因CEO身份出现在媒体面前,暗示着这位曾领导华大基因一步步走向辉煌的领军人物悄然离开了华大的舞台,而他的下一步去向尚不明确。此消息一出,引起业内人士一片哗然。今天SME小编就来扒一扒此事件的来龙去脉。  而从其微博的昵称看,

华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪器系统

  12月24日,华大基因宣布与实时单分子测序技术(SMRT)领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司(PacificBiosciencesofCalifornia,Inc.,以下简称PacBio)再次合作,购入亚洲第一台Sequel测序系统,并有后续购买计划,会将SMRT测序平台纳入其全球业务。今年初华

Coimbra基因和华大基因联合发起胃癌基因组研究计划

  2013年9月30日,华大基因和来自葡萄牙的一家新兴生物公司Coimbra基因联合发起了一项胃癌基因组研究计划,以解密胃癌背后的遗传奥秘。该项目的启动经费达90万美元,将成为胃癌领域内首个大规模基因组研究项目。该项目的科研团队包括来自葡萄牙波尔图顶级癌症研究所 ――IPATIMUP的遗传学家

华大基因与SAMRC合作建成非洲首个高通量基因组测序中心

近日,南非医学研究理事会(SAMRC)基因组学中心在开普敦正式启用,成为非洲首个高通量基因组测序中心。  南非医学研究理事会(SAMRC)成立于1969年,是南非卫生部下属机构,旨在通过研发和技术转移,改善南非人口健康,使民众能够享受到更好的生活质量。SAMRC主要研究领域包括结核病、艾滋病、心血管

“万种脊椎动物基因组计划”宣布启动

  拟两年解码101种物种 建立遗传信息数据库   深圳华大基因研究院与“万种脊椎动物基因组计划”联盟(G10KCOS)的科学家联合宣布启动万种脊椎动物基因组一期计划。该计划将依托华大基因先进的新一代测序技术平台、前沿的信息分析和数据处理能力,在未来两年内完成对101种脊椎动物的全基因组测序,解析

华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务

2015年12月24日,中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术(SMRT)领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下简称PacBio)再次合作,购入亚洲第一台Seque

超级计算机“天河一号”首次涉足基因研究领域

  记者从国家超算天津中心获悉,目前中国最快的超级计算机“天河一号”日前与全球最大的基因组研究机构深圳华大基因研究院签署合作协议,这也是“天河一号”首次涉足基因研究领域。   深圳华大基因研究院是国际知名基因组学研究中心,其新一代测序能力位居全球第一。去年9月,华大基因北方基地落户天津空港,成为其

华大基因投资百亿在武汉建千亿产业园

  在4月28日的签约仪式上,华大基因方面宣布,投资100亿元重点用于五大项目上,力争打造1000亿元产值。投资分两类,一是耗资5亿建立创新平台,每年通过教学,向全国输送4000名基因人才。利用该平台,华大基因还将在武汉建立万万亿次超算中心,用于数据信息分析,发展云计算产业。另外,95亿元是要规划1

华大基因子公司宣布收购无锡青兰生物

  2018年7月19日,深圳华大基因股份有限公司(股票代码:300676.SZ)下属子公司北京六合华大基因科技有限公司宣布收购无锡青兰生物科技有限公司(以下简称青兰生物),收购完成后,华大基因将在青兰生物现有技术的基础上,共同开发高通量基因合成技术和下一代DNA合成技术,更好地服务于合成生物学发展

香港中文大学—华大基因跨组学创新研究院成立

  香港中文大学与深圳华大基因研究院7月18日举行典礼,宣布合作成立“香港中文大学—华大基因跨组学创新研究院”,结合双方科研实力,致力培养基因组学、蛋白质组学、代谢学、临床遗传学、临床基因组学等学科人才,推动基因科学的研究发展。  华大基因研究院理事长杨焕明院士、港中大校长沈祖尧教授等参加

华大基因王俊卸任CEO

   上周五,有媒体报道深圳华大基因科技有限公司(下称华大基因)CEO王俊离职。深晚记者经过核实,王俊确实不再担任华大基因CEO,但王俊本人并未离开华大基因,而是将主导组建以人工智能为核心、关注前瞻性业务发展的新业务机构。   继续留任华大基因董事会   据华大基因7月17日官网发布消息:“为配合新

首届国际基因组学大会美洲分会在费城成功召开

  2012年9月27日至28日,为期两天的首届国际基因组学大会美洲分会(The International Conference on Genomics in the Americas,ICG Americas 2012)在美国费城儿童医院(CHOP)成功召开。本次会议由华大基因与费城儿童

华大基因等Cell子刊首次全基因组水平解析等级表观遗传

  来自华大基因,纽约大学医学院,宾州大学医学院等多处研究机构组成的研究小组发表了题为“Genome-wide and Caste-Specific DNA Methylomes of the Ants Camponotus floridanus and Harpegnathos salta