创新计算框架在蛋白质设计方面获突破

在今年诺贝尔化学奖表彰计算蛋白质设计领域的重大进展后,美国能源部阿贡国家实验室团队宣布开发出一种名为MProt-DPO的创新计算框架,该框架利用人工智能(AI)和世界顶尖的超级计算机,推动蛋白质设计取得新突破。这一成就标志着向AI自主科学发现迈出了重要一步。利用MProt-DPO框架,科学家设计了一种苹果酸脱氢酶,保留了蛋白质的关键结构和关键结合区域。图片来源:阿贡国家实验室MProt-DPO框架的关键在于其能将传统的蛋白质序列数据与实验结果、分子模拟及基于文本的叙述相结合。这一特性有望大幅加速蛋白质发现,特别是在疫苗开发和环保酶设计等领域。蛋白质设计的核心挑战之一是从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构及其功能。由于蛋白质的氨基酸组成极其复杂,即使是微小变化也会导致成千上万种不同的可能性。因此,传统实验方法难以高效完成。鉴于此,团队结合了大型语言模型(LLM)和超级计算机的强大算力。团队利用了包括阿贡国家实验室的“极光”在内的多个顶......阅读全文

蛋白质印迹法的测定蛋白质含量

1、制作标准曲线(1 )从-20℃取出1mg/ml BSA,室温融化后,备用。(2) 取18个1.5ml离心管,3个一组,分别标记为0μg,2.5μg,5.0μg,10.0μg,20.0μg,40.0μg。(3 )按下表在各管中加入各种试剂。0μg2.5μg5.0μg10.0μg20.0μg40.0

蛋白质测定仪用于羊奶蛋白质测定

      研究表明,羊奶是最接近母乳的奶,分子结构与母乳最相似,含有大量的乳清蛋白,婴儿对羊奶的消化率可达94%以上。因此在现代的很多奶制品生产企业,羊奶的生产频率很高,而在这些企业的品控中心,一般都配备有蛋白质测定仪这样的检测仪器,用于测定羊奶中的蛋白质含量,从而保障产品的质量。     

蛋白质的结构及蛋白质的功能(一)

   蛋白质为生物高分子物质之一,具有三维空间结构,因而执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功能之间的关系非常密切。在研究中,一般将蛋白质分子的结构分为一级结构与空间结构两类。  一、蛋白质的一级结构  蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(

球状蛋白质和纤维状蛋白质区别

  以长轴和短轴之比为标准,球状蛋白质小于10,纤维状蛋白质大于10 [2] 。纤维状蛋白多为结构蛋白,是组织结构不可缺少的蛋白质,由长的氨基酸肽链连接成为纤维状或蜷曲成盘状结构,成为各种组织的支柱,如皮肤、肌腱、软骨及骨组织中的胶原蛋白;球状蛋白的形状近似于球形或椭圆形。许多具有生理活性的蛋白质,

蛋白质分离实验_分离已知pI-的蛋白质

实验材料含10 mg蛋白质/ml 的溶于水的样品试剂、试剂盒缓冲液(pH>pI)仪器、耗材50 μm 内径的未包被的融合硅毛细管柱CE 仪器实验步骤1. 用 pH 高于蛋白质的pI的 5 mmol/L 缓冲液 1/10 (V/F) 稀释蛋白质样品,使蛋白质(终浓度 = 1.0 mg/ml) 产生电荷

完全蛋白质和半完全蛋白质等简介

  完全蛋白质  所含必需氨基酸种类齐全,数量充足,相互之问比例也适当,不但能够维持成人的健康,也能够促进人体的生长发育,如乳中的酪蛋白、蛋类中的卵白蛋白、大豆球蛋白、小麦中的麦符蛋白等。   半完全蛋白质  所含各种必需氨基酸种类齐全,但各种氨基酸含量多少不匀,互相之间比例不合适。在膳食中作为唯一

球状蛋白质和纤维状蛋白质区别

以长轴和短轴之比为标准,球状蛋白质小于10,纤维状蛋白质大于10。纤维状蛋白多为结构蛋白,是组织结构不可缺少的蛋白质,由长的氨基酸肽链连接成为纤维状或蜷曲成盘状结构,成为各种组织的支柱,如皮肤、肌腱、软骨及骨组织中的胶原蛋白;球状蛋白的形状近似于球形或椭圆形。许多具有生理活性的蛋白质,如酶、转运蛋白

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验

ATP储存液的配制依赖环核苷酸的蛋白质激酶蛋白质激酶C酪蛋白激酶酪氨酸激酶凝胶蛋白质激酶分析试剂、试剂盒ATP储存液                                                          实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多

关于蛋白质工程融合蛋白质的介绍

  脑啡肽(Enk)N端5肽线形结构是与δ型受体结合的基本功能区域,干扰素(IFN)是一种广谱抗病毒抗肿瘤的细胞因子。黎孟枫等人化学合成了EnkN端5肽编码区,通过一连接3肽编码区与人α1型IFN基因连接,在大肠杆菌中表达了这一融合蛋白。以体外人结肠腺癌细胞和多形胶质瘤细胞为模型,采用3H-胸腺嘧啶

蛋白质定量/蛋白质含量的测定(LOWRY法)

实验概要运用LOWRY法测定蛋白质的含量。实验原理Lowry法是双缩脲法和福林酚法的结合与发展,其原理是:蛋白质溶液用碱性铜溶液处理,形成铜-蛋白质的络合盐,再加入酚试剂后,除使肽链中酪氨酸、色氨酸和半胱氨酸等显色外,还使双缩脲法中肽键、碱性铜的显色效果更强烈。因此,Lowry法的显色效果比单独使用

蛋白质根据蛋白质分子的外形进行分类

1.球状蛋白质分子形状接近球形,水溶性较好,种类很多,可行使多种多样的生物学功能。2.纤维状蛋白质分子外形呈棒状或纤维状,大多数不溶于水,是生物体重要的结构成分,或对生物体起保护作用。3.膜蛋白质一般折叠成近球形,插入生物膜,也有一些通过非共价键或共价键结合在生物膜的表面。生物膜的多数功能是通过膜蛋

简述蛋白质结构在蛋白质设计中的应用

  蛋白质设计的目标是通过计算机辅助的算法以生成符合目标蛋白质三维结构的氨基酸序列,经过漫长的进化,自然界已经筛选出了数量众多的蛋白质,但天然蛋白质只有在自然条件下才发挥最佳功能,这使得人们利用这些蛋白质受到了限制,因此需要对蛋白质进行改造使其能适应特定条件发挥特定的功能。蛋白质分子的设计分为3类:

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质及蛋白质含量测定的几种方法

蛋白质是生命的物质基础,没有蛋白质就没有生命。蛋白质主要用于维持、生长、妊娠和泌乳等需要。因此蛋白质含量的检测成为一项日常性且必需性的工作。 蛋白质含量测定的几种方法  1紫外分光光度法 蛋白质分子中存在含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,使蛋白质对280nm的光波具有最大吸收值,在一定的范围内,蛋白质溶

蛋白质测定仪测定粗蛋白质的应用

凯氏定氮法是目前国家测定粮食、油料、饲料等粗蛋白质含量的标准方法。是先测定出样品中的含氮量,再乘以蛋白子换算系数。在测定过程中需用已知含氮量的标准物质做对照试验经常用无水硫酸按,其含氮量为21.19%,但由于系统误差的存在, 测定值与实际含氮量之间总是要存在一些误差。通过多年的试验对比,计算氮的回收

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

食品蛋白质测定的利器—蛋白质测定仪

  目前食品中蛋白质含量的测定主要采用凯氏定氮法,但是操作烦琐,试剂用量大,耗时较长。而新型仪器蛋白质测定仪具有简单、方便、快速,试剂用量少等优点。本文使用蛋白质测定仪和电位滴定仪检测食品中的蛋白质含量,对消化条件和测定条件进行了摸索,并与凯氏定氮法进行了比对,结果报告如下:    材料与方法  1

蛋白质分离方法根据蛋白质溶解度不同

1、蛋白质的盐析中性盐对蛋白质的溶解度有显著影响,一般在低盐浓度下随着盐浓度升高,蛋白质的溶解度增加,此称盐溶;当盐浓度继续升高时,蛋白质的溶解度不同程度下降并先后析出,这种现象称盐析,将大量盐加到蛋白质溶液中,高浓度的盐离子(如硫酸铵的SO4和NH4)有很强的水化力,可夺取蛋白质分子的水化层,使之

蛋白质及蛋白质含量测定的几种方法

   蛋白质是生命的物质基础,没有蛋白质就没有生命。蛋白质主要用于维持、生长、妊娠和泌乳等需要。因此蛋白质含量的检测成为一项日常性且必需性的工作。    蛋白质含量测定的几种方法   1紫外分光光度法   蛋白质分子中存在含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,使蛋白质对280nm的光波具

蛋白质合成实验

实验步骤                                                         材料 无菌 细胞培养,如 1X104~ 1X106 个细胞,24 孔板 3H-亮氨酸。无血淸培养基中 2 MBq /ml (~50uCi/ml) (特异活性并不重要

蛋白质质谱仪类型

蛋白质质谱仪类型有多种。1、按分析目的可分:蛋白质化验室质谱仪和蛋白质工业质谱仪。2、按联用方式可分:蛋白质气质联用仪、蛋白质液质联用仪和蛋白质多级质谱仪等。3、按分析规模可分:小型蛋白质质谱仪和大型蛋白质质谱仪。4、按质量分析器的时空属性可分:时间型蛋白质质谱仪和空间型蛋白质质谱仪。5、按质量分析

蛋白质纯化原则

蛋白纯化要利用不同蛋白间内在的相似性与差异,利用各种蛋白间的相似性来除去非蛋白物质的污染,而利用各蛋白质的差异将目的蛋白从其他蛋白中纯化出来。每种蛋白间的大小、形状、电荷、疏水性、溶解度和生物学活性都会有差异,利用这些差异可将蛋白从混合物如大肠杆菌裂解物中提取出来得到重组蛋白。蛋白的纯化大致分为粗分

蛋白质检测

·         Protein detection (Aberdeen's Lab)The method used to locate the proteins following 2D-PAGE depends on the nature of the original sample.

蛋白质组成成分

单纯蛋白质的元素组成为碳50~55%、氢6%~7%、氧19%~24%、氮13%~19%,除此之外还有硫0~4%.有的蛋白质含有磷、碘。少数含铁、铜、锌、锰、钴、钼等金属元素。各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%.由于体内组织的主要含氮物是蛋白质,因此,只要测定生物样品中的氮含量,就可以按下式推算出

蛋白质纯化-程序

分离纯化某一特定蛋白质的一般程序可以分为前处理、粗分级、细分级三步。前处理分离纯化某种蛋白质,首先要把蛋白质从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出来并保持原来的天然状态,不丢失生物活性。为此,动物材料应先剔除结缔组织和脂肪组织,种子材料应先去壳甚至去种皮以免受单宁等物质的污染,油料种子最好先用低沸点

蛋白质分离纯化

蛋白质分离纯化是用生物工程下游技术从混合物之当中分离纯化出所需要得目的蛋白质的方法。

蛋白质(六)病症

病症过量表现蛋白质如果摄取过量的话也会在体内转化成脂肪,造成脂肪堆积。肾脏要排泄进食的蛋白质,当分解蛋白质时会产生大量的氮素这样会增加肾脏的负担。蛋白质,尤其是动物性蛋白摄入过多,对人体同样有害。首先过多的动物蛋白质的摄入,就必然摄入较多的动物脂肪和胆固醇。其次蛋白质过多本身也会产生有害影响。正常情

蛋白质组成成分

单纯蛋白质的元素组成为碳50~55%、氢6%~7%、氧19%~24%、氮13%~19%,除此之外还有硫0~4%.有的蛋白质含有磷、碘。少数含铁、铜、锌、锰、钴、钼等金属元素。 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%.由于体内组织的主要含氮物是蛋白质,因此,只要测定生物样品中的氮含量,就可以按下式推

蛋白质抽取实验

蛋白质在细菌中表现后,以反复的冷冻-解冻方法打破细胞,再用硫酸铵把蛋白质沉淀下来,此步骤可以去除大部份核酸、多醣、脂质等杂物。仪器用具:恒温震荡培养箱37℃;高速冷冻离心机及离心管 (使用20,000 rpm离心陀)使用高速离心机要注意: 离心机及离心陀的温度要预冷完全,相对位置的两只离心管要平衡好

蛋白质回收实验

实验材料 蛋白质试剂、试剂盒 SDSDTT脱色液染色液仪器、耗材 电泳仪透析膜实验步骤 1.  凝胶浸泡在染色液中于室温缓慢摇动染色15~20 min,然后移至脱色液中于4℃温和摇动下脱色2~3 h。2.  切下染色后的凝胶条带,于4℃水中浸泡2~3 h,期间换几次水。然后分别将每条胶移入Petri