dGTP激活SAMHD1四聚体结构机制研究获进展
近日，国际期刊Nature Communications发表了中科院高能物理研究所多学科中心蛋白质结构中心龚勇研究员与天津大学生科院于晓方教授合作完成的研究成果——dGTP激活SAMHD1四聚体的结构机制研究(Structural insight into dGTP-dependent activation of tetrameric SAMHD1 deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase)。 SAMHD1是近年来新发现的抑制爱滋病毒(HIV)的人源蛋白质分子。Nature杂志在2011年同期发表了两篇论文，证明了SAMHD1是一个新的病毒抑制因子。SAMHD1具有dNTPase活性，有可能通过降解反转录病毒复制所需要的原料dNTP，在某些细胞内阻断HIV的复制。目前这一蛋白质分子已经成为HIV研究领域的新热点。 最新发表的Nature Co......阅读全文
硅的晶体结构
两个面心立方结构相互套构而成，其中一个面心立方结构沿另一个的体对角线平移1/4。
什么是晶体结构？
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞，因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达可采
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法，crystal structure determination，即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度（即结构振幅）而测不到相角，这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据，而要利用其他方法。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法，crystal structure determination，即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度（即结构振幅）而测不到相角，这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据，而要利用其他方法。
dGTP激活SAMHD1四聚体结构机制研究获进展
近日，国际期刊Nature Communications发表了中科院高能物理研究所多学科中心蛋白质结构中心龚勇研究员与天津大学生科院于晓方教授合作完成的研究成果——dGTP激活SAMHD1四聚体的结构机制研究(Structural insight into dGTP-dependent
上海药物所首次揭示维甲酸X受体四聚体抑制机制
RXR的配体结合结构域在不同状态下采取的不同三维结构 维甲酸X受体(RXR)是核受体蛋白家族的核心成员。作为一种配体调节的转录因子，RXR参与了细胞发育和代谢调节等众多生理过程，被认为是治疗癌症和代谢性疾病的重要药物靶标。 2011年1月，国际重要学术期刊《生物
如何选择蛋白晶体结构？
在使用殷赋云计算平台的时候，有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中，研究人员通常使用动物模型（如小鼠）来研究人源蛋白。这样做有许多原因，比如：1） 无
晶体结构的固定熔点
实验表明：从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热，反之，从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明：在相同的热力学条件下，与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比，晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下，以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比，晶体是稳定的，非晶体是不稳定的，后者有自发转变为晶体
原子晶体的晶体结构
结构特征：空间立体网状结构（如金刚石、晶体硅、二氧化硅等）。原子晶体的结构特点：①由原子直接构成晶体，所有原子间只靠共价键连接成一个整体。②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。③破坏共价键需要较高的能量。在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子，原子间以坚强的共价键相结合，如单质硅（Si）、金刚石
简述晶体结构的信息
晶体结构即晶体的微观结构，是指晶体中实际质点（原子、离子或分子）的具体排列情况。自然界存在的固态物质可分为晶体和非晶体两大类，固态的金属与合金大都是晶体。晶体与非晶体的最本质差别在于组成晶体的原子、离子、分子等质点是规则排列的（长程序），而非晶体中这些质点除与其最相近外，基本上无规则地堆积在一起
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候，有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中，研究人员通常使用动物模型（如小鼠）来研究人源蛋白。这样做有许
简述葡糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域， 大小区域之间通过连接区域连接，两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象，当葡萄糖浓度较低时，GK处于非活性超开放构象；当体内葡萄糖浓度升高时，GK与葡萄糖结合，处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶，葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两
关于晶体结构的基本介绍
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞，因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达
请问晶体结构有哪些类型？
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子，然后通过离子键结合成氯化钠晶体，每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子，然后通过分子间键或范德华(Van
果胶酶的晶体结构
所有果胶酶结构都包括一个由七到九个平行β-螺旋组成的棱柱形右手圆柱体。产生该结构棱柱形状的三个平行β螺旋被称为PB1、PB2和PB3，PB1和PB2产生反平行的β，PB3与PB2垂直。各种酯酶、水解酶和裂合酶的所有底物结合位点都位于结构上的突出环和PB1之间的中央平行β-螺旋结构的外部裂缝上。
晶体结构分析的相关介绍
晶体学中的一个重要的领域，它研究晶态物质内部在原子尺度下的微观结构。它为固体物理学、材料科学、结构化学、分子生物学、矿物学、医药学等许多学科的基础研究和应用研究提供必不可少的实验资料，使人们有可能从分子、原子以及电子分布的水平上去理解有关物质的行为规律。 按所用试样的不同，晶体结构分析有多晶体
晶体结构的解理性简介
当晶体受到敲打、剪切、撞击等外界作用时，可有沿某一个或几个具有确定方位的晶面劈裂开来的性质。如固体云母（一种硅酸盐矿物）很容易沿自然层状结构平行的方向劈为薄片，晶体的这一性质称为解理性，这些劈裂面则称为解理面。自然界的晶体显露于外表的往往就是一些解理面。
晶体结构鉴定手段或方法
X射线衍射分析、红外光谱分析X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上，所得的衍射图称为粉末图。用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法。其优点是所需样品少，甚至0.1mg也可以测定，收集的衍生数据完全，仪器设备和试验
晶体结构的主要类型介绍
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子，然后通过离子键结合成氯化钠晶体，每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子，然后通过分子间键或范德华(Van d
原子晶体的晶体结构介绍
结构特征：空间立体网状结构（如金刚石、晶体硅、二氧化硅等）。 原子晶体的结构特点： ①由原子直接构成晶体，所有原子间只靠共价键连接成一个整体。 ②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。 ③破坏共价键需要较高的能量。 在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子，原子间以坚强的共价键相结合，
四聚体——抗原特异性T细胞检测金标准
实验概要 抗原特异性T细胞在细胞免疫应答中发挥着核心作用，因此定量测定抗原特异性T细胞数量在判定机体细胞免疫功能方面提供重要的信息。传统的抗原特异性T细胞功能检测方法有经典的Cr51释放试验、有限稀释法（LDA）、酶联免疫斑点试验（ELISPOT）等，但是这些方法或多或少都存在操作繁琐、检测结果误差
四聚体——抗原特异性T细胞检测金标准
实验概要 抗原特异性T细胞在细胞免疫应答中发挥着核心作用，因此定量测定抗原特异性T细胞数量在判定机体细胞免疫功能方面提供重要的信息。传统的抗原特异性T细胞功能检测方法有经典的Cr51释放试验、有限稀释法（LDA）、酶联免疫斑点试验（ELISPOT）等，但是这些方法或多或少都存在操作繁琐、
关于晶体结构晶体的共性介绍
如果将大量的原子聚集到一起构成固体，那么显然原子会有无限多种不同的排列方式。而在相应于平衡状态下的最低能量状态，则要求原子在固体中有规则地排列。若把原子看作刚性小球，按物理学定律，原子小球应整齐地排列成平面，又由各平面重叠成规则的三维形状的固体。 人们很早就注意一些具有规则几何外形的固体，如岩
如何用衍射仪判断晶体结构
一种物质会有可能会有多种晶型，因此就有多个pdf卡片，如不同的αfe或γfe。有了pdf卡片，这种晶型的该物质的结构就已经确定了，卡上有该晶体的空间群晶格常数等信息。对于未知物质或其晶体类型，需要用透射电子衍射或者会聚束方法
稳定无活性维甲酸X受体四聚体构象的天然小分子首次被发现
维甲酸X受体（RXR）是核受体家族蛋白中的一员，在核受体调控信号通路中发挥重要作用。RXR能与三分之一的核受体家族蛋白形成异源二聚体，参与了包括细胞生长、分化、代谢和胚胎发育等许多重要生理过程的调节。因此，RXR被认为是治疗癌症和代谢性疾病的重要药物作用靶标之一。RXR主
于晓方课题组Nature子刊揭示蛋白活化机制
来自天津大学、天津大学第一附属医院、中科院高能物理研究所等机构的研究人员，在新研究中报告了分辨率为1.8埃，同源四聚体SAMHD1与变构激活体及底物dGTP/dATP的复合物晶体结构，由此揭示了dGTP依赖性四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸酶(dNTPase) 活化的结构机制。这一成果发表在
白介素受体复合物的晶体结构
白细胞介素（interleukin）是淋巴细胞、单核细胞以及其它非单核细胞等产生的细胞因子（cytokine），它们在细胞间相互作用、免疫调节、造血过程以及炎症反应中起到重要作用。而其中的白细胞介素4（IL-4）和白细胞介素13（IL-13）对于T细胞介导的体液免疫应答非常关键，与过敏和哮喘等疾病相
简述晶体结构的固定熔点的介绍
实验表明：从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热，反之，从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明：在相同的热力学条件下，与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比，晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下，以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比，晶体是稳定的，非晶体是不稳定的，后者有自发转变为
Cell：Ⅱ型大麻素受体的晶体结构
中国科研小组与俄罗斯和美国科学家一起获得了Ⅱ型大麻素受体的晶体结构。这些知识将有助于开发抗炎症、神经退行性疾病和其他疾病的药物。发表在《Cell》杂志上的文章作者对Ⅰ型和Ⅱ型大麻素受体进行了比较，并得出结论说，这两种受体是人体大麻素系统的“阴和阳”。 盲目治疗 大麻素受体是人体信号系统的关键
简述葡萄糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域， 大小区域之间通过连接区域连接，两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象，当葡萄糖浓度较低时，GK处于非活性超开放构象；当体内葡萄糖浓度升高时，GK与葡萄糖结合，处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶，葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两