研究开发出植物高效精准大片段DNA操纵及染色体编辑技术
基因组结构变异(SV)是植物遗传多样性的重要来源,也是基因组进化和优异农艺性状形成的重要驱动力。因此,探究如何高效精准地操纵植物基因组结构变异对植物性状改良和农业生物育种具有重要意义。目前,基于CRISPR/Cas的基因组编辑技术在植物性状改良中得到广泛应用。而这些技术的编辑尺度大部分情况下局限于少数几个核苷酸的替换、删除和插入。尽管CRISPR/Cas9结合双sgRNAs能够在植物中实现基因组大片段DNA的删除和倒位等操纵,但效率较低。同时,由于该策略依赖于DNA双链断裂(DSBs)产生,编辑产物常常引入较多非预期的编辑,甚至导致复杂的染色体重排。因此,开发不依赖于DSBs、高效且精准的植物大片段DNA和染色体操纵技术,对植物遗传改良具有重要意义,是植物染色体工程和生物育种技术创新的迫切需求。近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所王延鹏研究组与中国农业大学小麦研究中心科研人员合作,开发了高效且精准的植物基因组大片段DNA操纵技......阅读全文
最新《科学》研究开辟哺乳动物染色体编辑新领域
染色体连接小鼠“小竹” 课题组供图8月26日,《科学》 杂志在线发表了中国科学院动物研究所、北京干细胞与再生医学研究院李伟研究员与周琪研究员团队的重要研究成果:在全球范围内首次实现了哺乳动物完整染色体的可编程连接,并创造出具有全新核型(染色体组型)的小鼠。染色体重排(Chromosomal Rea
Cell:打破常规!发现独特的DNA编辑功能
一种单细胞纤毛虫物种以一种看似不可能的方式使用细胞转录复合体。在一项新的研究中,来自瑞士伯尔尼大学的研究人员首次详细地描述了 “垃圾DNA”在遭受降解之前转录的机制。这种机制是非常巧妙的。 它听起来像是一场设计竞赛中的获奖设计方案:当小片段信息太短而不适合放入读取设备中时,如何读取这些小片段信
科学家编辑水稻DNA防御病原体
外媒称,细菌性枯萎病袭击着东南亚和西非的稻田。这是一种被研究得非常透彻的作物疾病,它常常被用作研究微生物与其寄主植物间相互作用的一个模型系统。这种病原体被称为水稻黄单胞菌水稻致病变种,简称Xoo,它通过劫持一些外排糖的水稻基因来维持生存。研究人员已研究出如何编辑水稻的基因组以阻止这种劫持行为。
染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁
北京时间11月21日,发表在《Nature》上的一篇新研究发现,在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA),改变了与癌症相关基因的表达方式,从而促进了癌细胞的侵袭性,并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力(如化疗、放疗和其他治疗)中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥
植物染色体DNA的抽取及浓度测定
目的意义DNA是遗传信息的载体和基本遗传物质,它在遗传变异、代谢调控等方面起着重要作用,是分子生物学和基因工程研究的对象,但无论是研究植物DNA的结构和功能,还是开展外源DNA的转化、转导的研究,首先要做的就是从植物组织中提取天然状态的高分子量的纯化DNA。因此,本实验的目的是学习植物基因组DNA提
科学家首次改造了真核生物超过50%的DNA
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511977.shtm11月8日,合成酵母基因组计划(Sc2.0)的研究人员在《细胞》和《细胞基因组学》上发表了3篇研究,表示制造出了一种基因组中超过50%的DNA序列均是人工合成的酿酒酵母菌株。标准酿酒
色氨酸操纵子的操纵子遗传改造
由于色氨酸操纵子的调控作用,自然界不可能存在高产Trp菌株,为了获得高产Trp菌株,就必须对色氨酸操纵子进行改造,解除其调节作用。早期的研究策略主要依靠传统诱变方法,经过长期努力,获得了一些有价值的研究结果,如获得了TrpR - 菌株,通过缺失某些片断解除了弱化作用,得到了一些抗反馈抑制的酶。许多T
Cell发文:贺建奎编辑试验可导致染色体丢失等副作用
纠正人类胚胎中的致病突变具有减轻遗传疾病负担,并改善对具有致病突变的夫妇进行替代胚胎选择的潜力。 2020年10月29日,美国纽约哥伦比亚大学Dieter Egli团队在Cell 在线发表题为“Allele-Specific Chromosome Removal after Cas9 Clea
上海生科院发现DNA碱基编辑的新方法
10月10日,国际学术期刊《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
科学家提出通过编辑DNA治疗肥胖症
在实验过程中,研究人员发现,FTO基因变异将诱发与IRX3基因和IRX5基因相关的过多活性,而这两种基因负责形成脂肪组织细胞。细胞本身存在两种形式——白细胞和脂肪细胞,而脂肪细胞以脂肪的形式存储能量,而棕色脂肪细胞用它来生产热量。提升IRX3基因和IRX5基因活性有助于形成白色脂肪细胞,从而导
DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!
DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此
Y染色体完整测序或改善细菌DNA研究
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507607.shtm
癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)
实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且
Neuron:用光操纵记忆?
最近,加州大学戴维斯分校神经科学中心和心理学系的研究人员,利用光消除了小鼠脑中的特定记忆,并证明了一个关于“大脑不同部分如何共同工作来检索情景记忆”的基本理论。相关研究结果发表在最近的《Neuron》杂志。 光遗传学(Optogenetics),是斯坦福大学Karl Diesseroth首创的
Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑
近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生
Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑
近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生
美国放行基因编辑蘑菇和玉米-不含任何外源DNA
美国农业部对采用基因编辑技术的新型作物网开一面,是由于基因编辑后的作物,不含任何新引入的遗传物质或外源DNA。当技术飞奔时,既面临重新定义转基因,也要思考监管如何收放。 在不到一周的时间里,美国农业部相继豁免了一种基因编辑蘑菇和一种基因编辑玉米的监管。 它们都采用了一种名为CRISPR
治愈人类疾病的一把钥匙:肠道细菌DNA编辑
“我们称其为拟态(mimicry),”Rockefeller大学基因编码小分子实验室主任Sean Brady说。这项突破性发现发表在《Nature》杂志。 Brady和同事Louis Cohen发现,肠道细菌和人类细胞虽然是两种生物,但它们却互通相同的以配体分子为基础的化学语言。 他们开发了
加深癌症了解!新基因工具可按时序编辑DNA序列
据物理学家组织网23日报道,美国研究人员在最新一期《分子细胞》杂志撰文指出,他们发明了一种新基因编辑技术,可按时间顺序对切割点或编辑点进行编辑,有望促进癌症研究等领域的发展。 基因编辑领域的“当红炸子鸡”CRISPR使科学家能改变细胞内DNA的序列,或添加所需序列或基因。CRISPR使用名为C
《Nature-Genetics》染色体外DNA会改变癌基因扩增水平
恶性胶质瘤(glioblastoma,GBM)是最常见且最具攻击性的脑癌,标准治疗反应很差,两年生存率仅为15%。最近,《Nature Genetics》的一篇文章发现了GBM肿瘤耐药的一个关键密码。 为了靶向遏制GBM的攻击性,杰克逊实验室(Jackson Laboratory,JAX)教授
如何将染色体上DNA与组蛋白分离
用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.TE 缓冲液琼脂糖凝胶电泳或紫外分光光度计
研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA
人血浆中细胞游离的DNA(cfDNA)的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间,观察到胎儿血浆DNA(主要是胎盘来源)是线性DNA片段,比母体来源(主要是造血来源)DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA(eccDNA)。但是,尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。
操纵组的概念介绍
操纵组(英语:Operon)又称操纵子或操纵元,是指一组关键的核苷酸序列,包括了一个操纵基因(Operator),一个普通的启动子,及一个或以上的结构基因被用作生产信使RNA(mRNA)的基元。
什么是操纵子?
操纵组(英语:Operon)又称操纵子或操纵元,是指一组关键的核苷酸序列,包括了一个操纵基因(Operator),一个普通的启动子,及一个或以上的结构基因被用作生产信使RNA(mRNA)的基元。
显微操纵系统RI
Integra Ti显微操纵系统的主要特点 最新设计全机械传动, 全集成整体一体化结构,占用空间最少 ·最新设计的全机械传动, 操纵器TDU5000具有X、Y、Z三个方向的微调与粗调功能,令操作更加可靠、平稳和直观,避免了电动式操纵反应滞后,克服了液压式步进马达的位移不连续性等弊
关于λ噬菌体的特点介绍
λ噬菌体是长尾噬菌体科的一种温和噬菌体。λ噬菌体是双链DNA噬菌体,有直径55nm的二十面体头部,末端有细长尾丝的非收缩尾。DNA是线性分子,有黏性末端即单链延伸12个核苷酸,故感染后线性基因组可立即环化。 [2] λ DNA有一个噬菌体结合位点,可与细菌结合位点形成碱基配对,细菌结合位点位于
《自然》正式刊登论文证实——编辑人类早期胚胎DNA安全有效
经再三斟酌,英国《自然》杂志终于决定2日将一篇论文公之于众:美国科学家利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,修正了未被植入子宫前的人类胚胎中,一种与遗传性心脏疾病“肥厚型心肌病(HCM)”有关的基因变异。结果证实,编辑人类生殖细胞系(卵子、精子或早期胚胎)的DNA是安全有效的。 每500人中
基因编辑技术走向市场-替换健康DNA即可治疗疾病
给你的基因动动手术 英国《自然》杂志网站近日在报道中指出,未来,病人或许不需要通过服用药片来治疗疾病,而是选择“基因手术”——使用CRISPR这种创新性的基因编辑技术将有害的变异剪除并植入健康的DNA来治疗疾病。目前,已经有人看到了其中的商机,创办了公司来研发和推广这种基因编辑技术。CRISPR技
科学家观察酶“编辑”DNA过程-助力纠正遗传疾病
一个国际研究小组在了解酶如何“编辑”基因方面取得了重要进展:观察到了一类被称为CRISPR的酶绑定并改变DNA(脱氧核糖核酸)结构的过程。这项发表于5月27日(北京时间)美国《国家科学院学报》上的研究成果有望为纠正人类的遗传疾病铺平道路。 CRISPR意即“成簇的规律间隔的短回文重复”,在上世
精确编辑基因!利用机器预测细胞修复CRISPR诱发的DNA断裂
当双螺旋DNA因损伤(比如X射线暴露)发生断裂时,细胞中的分子机器会开展基因“自动校正(auto-correction)”,从而将基因组重新连接在一起,但是这种修复通常是不完美的。细胞中的天然DNA修复过程能够以一种看似随机且不可预测的方式在断裂位点处添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Ca