中国团队研发出新型高通量蛋白互作组鉴定技术BIPseq
近日，中国水稻研究所水稻生物育种全国重点实验室研究员张健团队和华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟团队在国际期刊《先进科学》（Advanced Science）在线发表研究论文。他们研发出一种低成本、高通量鉴定蛋白互作的技术——BIP-seq，并在模式植物水稻中成功鉴定到超过23032个蛋白互作组合，为解析水稻及其它物种的蛋白互作网络提供了强有力的技术支持和数据支撑。蛋白相互作用（PPI）是蛋白质精准调控生物学过程的重要形式。然而，经典的PPI鉴定技术局限于少数蛋白的互作关联，鉴定的通量和效率偏低。近年来，科学家们尝试开发了多套高通量PPI鉴定技术体系，但均难以兼顾通量高、周期短、成本低、仪器依赖程度低等需求，限制了其在非模式物种和小型分子生物学实验室场景中的应用。BIP-seq（Barcode-indexed PCR Coupled with HiFi Long-read Sequencing）利用......阅读全文
中国团队研发出新型高通量蛋白互作组鉴定技术BIPseq
近日，中国水稻研究所水稻生物育种全国重点实验室研究员张健团队和华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟团队在国际期刊《先进科学》（Advanced Science）在线发表研究论文。他们研发出一种低成本、高通量鉴定蛋白互作的技术——BIP-seq，并在模式植物水稻中成功鉴定到
怎么理解蛋白与核酸的互作
如果是相互作用的话。我的理解是，核酸是细胞内携带遗传信息的物质。在生物蛋白质的合成中占有重要的作用。这就是为什么我们吃了猪肉没有长成猪，而是合成了自己的蛋白质。
NatureMethods公布最大人类蛋白互作网络
一个国际研究小组公布了迄今为止最大的蛋白互作数据库资源，这将有助于解析众多疾病相关的基因如何促发疾病发生和进程的。这项研究由麻省总医院MGH和Broad研究院领衔完成，相关数据库： InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在线公布在11月28日Nature Methods杂志上。“现代遗
蛋白互作研究技术：「FRET」VS「Duolink－PLA」
荧光能量共振转移 （FRET）检测活体中生物大分子纳米级距离和纳米级距离变化的有力工具，广泛应用于生物大分子相互作用分析、细胞生理研究、免疫分析等。原理当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠，并且两个分子的距离在 10nm 范围以内时，就会发生一种非放射性的能量转移，即 FRET 现象
各种蛋白互作检测方法优缺点分析
聚焦蛋白质互作研究进展与实验方法研究蛋白-蛋白相互作用是理解生命活动的基础。蛋白质—蛋白质互作网络是生物信息调控的主要实现方式，是决定细胞命运的关键因素。检测蛋白质间相互作用的实验方法有哪些？这些检测方法各有什么优缺点?总结如下。1. 生化方法●共纯化、共沉淀，在不同基质上进行色谱层析(需要补充)●
钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术
通过深入了解基因组产物形成的相互作用网络，人类基因组注释功能得以飞速发展。随着技术的进步，我们已经实现了DNA-DNA、蛋白质 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因组映射图谱。但完成人类蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的全基因组映射图谱仍然是一项艰巨任务。 目前，大规模PP
看得见的蛋白互作新技术Duolink－PLA
现今，科技发展的齿轮正在高速运转，每隔2-3年就会出现一个重大的技术变革引领生命科学走向更精细、更微观、更真实的水平，这其中也包括蛋白的研究。在疾病的致病机理、分子机制、信号通路、药物筛选以及新型诊断标志物的发现中，传统的蛋白研究“金标准”方法如Co-IP、Western blot、ELISA、
Nature子刊：揭示蛋白互作的链式反应
科学家们开发了一种新方法，不需要用酶就可以在固定样本中鉴定蛋白之间的互作。 细胞内的所有生物学过程基本上都是蛋白质控制的，蛋白一般通过互作来执行其正常功能。可想而知，研究蛋白互作是理解细胞生物学的关键。不过，灵敏可靠的检测蛋白质互作并不是一件容易的事。 举例来说，用荧光标记的两种抗体对蛋白互
Nature发表蛋白质互作里程碑成果
德克萨斯大学和多伦多大学的科学家们日前绘制了超大规模的蛋白质互作图谱。这项研究发表在九月七日的Nature杂志上，为研究阿尔茨海默症、帕金森症和癌症等疾病的提供了强大的新工具。 细胞中的蛋白通常以蛋白复合体的形式，执行特异性的生物学功能。研究人员发现，海葵、线虫、小鼠和人类共享近千种关键的蛋白
BLT小课堂丨植物蛋白互作技术（二）
免疫共沉淀技术(CoIP)：借助抗体和抗原之间的专一性，确定两种蛋白质在完整细胞内生理性的相互作用。当用预先固化在argarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白，那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离，对B蛋白进行检测，进而证明两者间的相互作用。优
BLT小课堂丨植物蛋白互作技术（一）
植物蛋白互作技术我们的世界物种多种多样，而与我们人类生存关系最密切的就是植物。随着时间的推移与科技的进步，人类在逐步揭示自身基因真相的同时，也在不断探寻植物基因的种种功能。其中，蛋白质是植物生命活动的主要承担者。因此，在植物学相关研究中，蛋白质之间的相互作用是研究的重要基础和手段。目前，研究蛋白质-
分子互作仪选择宝典
在现代生物学、医学及转化医学、药物学等研究中，随着功能基因组研究的深入，生物大小分子的生物学功能研究占具着非常重要的地位；生物大小分子的相互作用分析成为目前分子功能学研究中不可缺少的重要手段，因此一个好的分子互作研究工具，无疑将对我们的科研起到极大的促进作用。目前研究分子互作的检测技术层出不穷，从传
分子互作方法之BIAcore！
BIAcore是一种基于光学表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance，简称SPR）原理的用于分子互作分析的常用方法。因为其准确性高、重复性好、应用广泛，目前SPR原理用于药物分析的方法已经被录入中国、美国、日本的药典，基于BIAcore方法的文献也已经超过了15000篇。那
张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作
来自美国哥伦比亚大学，同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章，提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方
Nature：科学家发现新型的蛋白质互作机制
日前，一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中，来自苏黎世大学等机构的研究人员通过研究发现了一种蛋白质互作的新机制，同时还阐明了细胞如何组织蛋白质间互相作用的发生。这种新型机制主要包括两种完全无组织的蛋白质能够根据其相反的净电荷来形成超高亲和力的复合体，蛋白质之间通常是相互结合的，因为其三维
科学家系统解析Midnolin蛋白质互作组
中国科学院上海药物研究所研究员陈小华、谭敏佳团队发展了多重光交联化学生物学策略，系统解析了Midnolin的蛋白质互作组，揭示其介导的非泛素依赖的底物降解机制，显著拓展了Midnolin的降解底物谱及潜在的可调控蛋白空间，为靶向“难成药”靶标的降解提供了新思路。3月12日，相关研究成果发表于《美国化
Cell：最大规模的蛋白质互作组网络图谱
人类大约有2万个蛋白质编码基因，尽管自十年前首次完成人类基因组测序以来取得了一些显著的进展，对于这些蛋白质如何在细胞内发挥功能，科学家们仍然只详细了解了其中的一小部分。 作为人类基因组计划的延伸，蛋白质组学领域正在致力揭示蛋白质是如何执行由生成它们的基因所编码的过程的。一些先进的工具已帮助鉴别
Cell－Research：研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病，比如冠状病毒（如新冠病毒，SARS-CoV-2）、黄病毒属（如寨卡病毒，ZIKV；登革热病毒，DENV）、丝状病毒（如埃博拉病毒，EBOV）以及流感病毒（Influenza virus）等。由RNA病毒引起的疾病，比
Nature－Neuroscience:蛋白互作网络图谱助大脑疾病的药物开发
就像儿童有什么问题不能全怪父母一样，根据由USC医学院的神经学家的最新研究成果，自闭症等大脑紊乱疾病并不是由单基因的突变导致的。 为了帮助研究者们看到完整的调控网络，Marcelo P. Coba首次创建了大脑蛋白质相互作用的网络，这一工作首次为开发相关的药物提供了线索。 "我们目前使用的药
PNAS：蛋白RBM38和p53互作调控肿瘤发展
科学家早就知道p53蛋白会抑制肿瘤。然而，加州大学戴维斯分校研究人员最近的一项动物研究发现p53与另一种蛋白质RBM38之间有复杂关系，揭示身体如何校准p53蛋白水平。RBM38太多会降低p53水平，增加患癌症的风险。RBM38太少允许p53表达增加，从而导致早衰。这项研究结果发表在PNAS杂志
上海生科院揭示LysM蛋白介导的真菌—昆虫互作效应机制
近日，中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所王成树研究组的最新研究成果，以Divergent LysM effectors contribute to the virulence of Beauveria bassiana by evasion of insect immune de
通过TFEB激活吞噬溶酶体线粒体互作
巨噬细胞是我们先天免疫反应的关键细胞，这些细胞几乎遍布我们身体的所有组织，在维持我们器官的健康状态方面起着至关重要的作用。巨噬细胞特别擅长吸收、消化和破坏外来物质，它们会不断清除死亡细胞或入侵组织的微生物或病原体。然而，某些微生物和细菌，如沙门氏菌或分枝杆菌，已经发展出保护自己免受巨噬细胞消化的策略
科学家发现引发囊性纤维化的关键蛋白互作机制
近日，一项刊登在国际著名杂志Nature上的研究论文中，来自斯克里普斯研究所（TSRI）的研究人员通过研究发现，引发多种囊性纤维化的突变蛋白可以和错误的“细胞邻居”发生频繁的交流，而错误的“细胞邻居”并不具有正常的功能而且会发生过早降解。通过有效移除这两者之间的“交流”，研究者就可以部分恢复突变
环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复
作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期，其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查，发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用
Cell子刊：研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病，比如冠状病毒（如新冠病毒，SARS-CoV-2）、黄病毒属（如寨卡病毒，ZIKV；登革热病毒，DENV）、丝状病毒（如埃博拉病毒，EBOV）以及流感病毒（Influenza virus）等。由RNA病毒引起的疾病，
Mol－Cell－Proteomics：研究揭示HCV病毒蛋白与人体细胞互作网络
近日，Helmholtz Zentrum München科学家首次解密丙型肝炎病毒与活人体细胞蛋白的相互作用网络。他们的研究结果将有助于更好地理解丙型肝炎病毒造成炎症性肝病的背后机制，并开辟新治疗途径。该研究结果发表在Molecular & Cellular Proteomics杂志上。 病毒
蒋华良研究组合作发表最新PNAS文章：蛋白互作界面预测
来自中科院上海药物研究所，美国莱斯大学的研究人员报道了最新研究成果，在可药性蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）界面预测与识别计算方法发展方面取得重要进展。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上，文章的通讯作者是上海药物研究所蒋华良研究员，以及莱斯大学José N. Onuchic博
纳米材料蛋白冠互作调控肿瘤免疫微环境研究新进展
近日，国家纳米科学中心陈春英课题组在石墨炔-胞内蛋白质互作与调控巨噬细胞表型的机制研究方面取得重要进展。研究成果“The Underlying Function and Structural Organization of the Intracellular Protein Corona on
内质网蛋白VAPA/B与自噬蛋白互作调控自噬小体形成
4月23日，《当代生物学》（Current Biology）发表了中国科学院生物物理研究所张宏课题组的研究论文：The ER contact proteins VAPA/B interact with multiple autophagy proteins to modulate autopha
植物与病原互作研究获重要进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519114.shtm