重大突破！新加坡发布长读长RNA测序数据集SGNEx
由新加坡科技研究局基因组研究所领导的科学家团队，发布了迄今全球最大、最全面的长读长RNA测序数据集之一——新加坡纳米孔表达数据集（SG-NEx）。这一成果有望解决疾病研究中长期存在的技术瓶颈，使研究人员能够更精确地解析RNA的复杂结构，为制定下一代精准诊断和治疗策略奠定了坚实基础。相关研究发表在最新一期《自然·方法学》期刊上。短读长RNA测序是现代转录组学的核心工具，但其局限性日益显现。它通常无法完整捕获全长RNA分子以及诸如剪接异构体、融合转录本等复杂变异，也无法识别影响疾病进展（如癌症）的关键RNA化学修饰。这些缺陷限制了其在发现临床相关生物标志物方面的应用潜力。相比之下，SG-NEx采用的是长读长RNA测序技术，能够直接读取完整的RNA分子，从而揭示更深层次的生物学信息，并显著减少分析盲区。这种能力对于发现新的生物标志物和开发更精确的治疗方法至关重要。为了形象理解，可以将RNA比作一本书：短读长测序就像将书页撕成碎片后尝试......阅读全文
Science：利用单细胞RNA测序分析黑色素瘤
单细胞分析是一种开创性方法，如今在整个生物领域中正被用来研究一个共同的问题：如何研究异质细胞群体中的细胞多样性。这种多样性能够对细胞存活和增殖、对药物疗法和干预作出的反应以及很多其他的生物过程产生深刻影响。单细胞技术已被用于众多研究---比如，研究自身免疫疾病中的免疫反应异质性，研究传染病中的宿
军科院：小RNA测序鉴定微生物病原体
最近，研究人员利用小RNA（small RNA，sRNA）深度测序鉴定miRNA在植物和动物基因表达过程中转录和后转录的调控功能，该技术也是植物和无脊椎动物中发现病毒的有效策略。由于小RNA片段中可能含有来自所有RNA分子的RNA代谢物，如rRNAs，tRNAs，mRNA，snRNA，snoRN
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10) 是一
张锋团队开发出高通量的单细胞RNA测序方法
去年，Broad研究所的研究人员在《Science》上发表了一种称为sNuc-Seq的单核RNA测序方法。这种方法让人们能够研究那些难以分离的单细胞中的基因表达谱。如今，Broad研究所领导的团队克服了sNuc-Seq应用的一大障碍：规模。 8月28日，研究人员在《Nature Methods
Nature公布新兴测序技术绘制的人类组织RNA多样性
由纽约基因组中心和布罗德研究所的科学家完成了一项对人类组织中RNA多样性的研究，最近发表在Nature杂志上。当遗传密码转录成RNA时，一个基因通常会产生几种不同形式的RNA分子，或具有不同功能的转录本。虽然这一现象几十年来一直为人所知，但人类转录本的目录仍然不完整。“我们配备了最新的测序技术，能够
单细胞－RNA－测序揭示了体内不同的细胞异质性
植入体内的生物材料和设备具有广泛的临床应用，如组织再生和细胞移植。在细胞微环境的组成部分中，结构特征（宏观，微观和纳米特征）在指导细胞行为方面起着至关重要的作用。 2021年5月26日，四川大学满毅团队在Science Advances 在线发表题为“Dissecting the microe
北京大学Nature子刊单细胞RNA测序新成果
来自北京大学第三医院、教育部辅助生殖重点实验室的研究人员，采用先进的单细胞RNA测序技术绘制出了人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组全景图，这一重要的研究成果发表在8月11日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。
新冠病毒RNA直接测序－这次科学家得到了什么？
澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及合作者，提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列，详细介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构，并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相关论文3月7日发布于预印本服务器bioRx
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10) 是一
农林RNA测序助力玉米籽粒Dek10突变体研究
呼吸作用是线粒体最重要的代谢。其中，线粒体中5个和呼吸相关的复合物起到了重要影响。很多呼吸链相关蛋白都是由线粒体基因组编码的。这些RNA会受到细胞核内诸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的转录后修饰。玉米defective kernel 10(dek10)
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞RNA测序发现新视网膜神经节细胞亚型
单细胞测序技术填补了生命科学领域的许多空白，依靠这项技术，康涅狄格大学健康中心和杰克逊实验室（JAX）的研究人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞（retinal ganglion cells，RGCs）亚型，以及用于区分它们的遗传标记和转录因子。 得益于液滴单细胞RNA测序技术（drople
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞RNA测序发现新视网膜神经节细胞亚型
单细胞测序技术填补了生命科学领域的许多空白，依靠这项技术，康涅狄格大学健康中心和杰克逊实验室（JAX）的研究人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞（retinal ganglion cells，RGCs）亚型，以及用于区分它们的遗传标记和转录因子。 得益于液滴单细胞RNA测序技术（drople
单细胞RNA测序新成果－带你解开心脏发育的长久谜题
制造一颗心脏，这不是简单的事情。在子宫内，这个器官开始是一根管，芽珠状的硬块，自动折叠，最终变成了更熟悉的四腔结构。 但确切地说，心脏细胞是如何按照它们的基因程序，来构建这个复杂的、维持生命的泵状器官呢？这仍然是一个谜。哈佛医学院遗传学教授、心脏病学研究员Jonathan Seidman说：“
研究开发出小分子RNA高通量测序数据整合分析软件
高通量测序技术的普及带来测序数据的高速增加，但分析工具的发展却远远跟不上研究的需要。目前大多数高通量测序数据分析工具的用户对象是具备一定数据分析能力的研究人员，大量的数据分析任务仍然落在少数生物信息实验室上，严重阻碍了整个研究领域的发展。功能更强大、使用更方便的生物信息分析工具亟待开发
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
Nature－Methods新方法能矫正RNAseq测序的技术偏差
基因表达分析正越来越多地用于癌症的诊断和检测，是生物学研究的主要工具，一种新型的计算方法可以提高基因表达分析的准确性。 来自卡耐基梅隆大学和纽约州立大学石溪分校的研究人员称，他们的方法（被称作Salmon）能够矫正转录组测序技术（RNA-seq）中的技术偏差。而且这种技术预估基因表达水平的速度
安捷伦：用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案
简化的RNA和DNA测序解决方案，用于精简临床NGS 2020年9月1日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计，为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法，从而确保客户能够简化并整合其工作流程，而无
单细胞RNA测序新成果－带你解开心脏发育的长久谜题
制造一颗心脏，这不是简单的事情。在子宫内，这个器官开始是一根管，芽珠状的硬块，自动折叠，最终变成了更熟悉的四腔结构。 但确切地说，心脏细胞是如何按照它们的基因程序，来构建这个复杂的、维持生命的泵状器官呢？这仍然是一个谜。哈佛医学院遗传学教授、心脏病学研究员Jonathan Seidman说：“
从表达谱至海绵机制完美进阶－环状RNA测序加机制研究！
禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属，慢病毒亚科的家族成员，可引起禽类多种肿瘤性疾病，如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症，以及禽类骨髓白血病，导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛，既能水平传播又能垂直传播，往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我
PNAS：RNA测序解开“为什么大多数克隆动物胚胎会失败？”
生物通报道：自从20年前英国科学家成功克隆出克隆羊多莉已经20年了，但是克隆哺乳动物仍然是一个挑战。最近，由美国和法国研究人员进行的一项新研究，阐释了为什么大多数克隆胚胎可能会失败。 多莉羊是利用“体细胞核转移”技术克隆出来的，来自一个成年细胞的细胞核被转移到已经去核的未受精卵子中，然后电击以
利用单细胞RNA测序技术阐明机体多种类型味觉细胞机制
日前，一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中，来自美国滨州莫奈尔中心(Monell Center)的研究人员通过研究开发出了一种新技术能够鉴别出了任何味觉受体细胞的一整套基因，相关研究或能帮助研究人员阐明味觉感受器细胞发挥特殊功能的分子机制。 研究者Sunil S
准确高效的单细胞RNA测序的最佳手段—Quartzseq2
为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法，日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自西班牙的科学家们通过研究发现，日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源：CC0 P
Predica与华大智造携手开启肿瘤精准医疗新纪元：高通量测序平台赋能靶向RNA测序技术
7月11日，肿瘤诊断领域的领先创新者Predica Diagnostics与华大智造宣布达成合作，共同在华大智造高通量测序平台上开发Predica的靶向RNA测序技术，助力精准医疗。 此次合作旨在通过实现早期癌症检测和促进个性化靶向治疗策略，通过将Predica Diagnostics的先进测
革命性工具：更快捷－更准确的单细胞RNA测序处理方法
2018年12月，《Science》杂志称，如果没有基于scRNA-seq的可视化技术，一个细胞一个细胞地跟踪胚胎发育就不可能实现，因此这是今年最大的突破这一。2019年，研究人员写道，毫无疑问，FIt-SNE将加速发育生物学、神经科学以及癌症研究等领域的进一步工作。 就像从针孔相机到偏光片一
RNA测序和三级质谱相结合发现CRISPR失效原因
德国欧洲分子生物学实验室Wolfgang Huber、Lars M. Steinmetz和葛兰素史克公司Gerard Drewes等研究人员发现，生物可塑性能够挽救CRISPR敲除中的靶标活性。2019年10月28日，《自然—方法学》在线发表了这项成果。 研究人员设计了一种实验策略，将RNA测
科研人员研发RNA甲基化7甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。 中国科