中国计量大学首次提出“计量组学”概念

5月20日是世界计量日,也是国际《米制公约》签署150 周年纪念日。为进一步促进计量科学与农业科学、生命健康、食品安全等领域交叉融合发展,中国计量大学生命科学学院院长徐沛等首次提出了“计量组学”(Metrolomics)概念,并于5月20日当天刊发于《现代农业》杂志。“计量组学”的科学内涵 中国计量大学供图据介绍,传统的计量研究适合静态、可控环境下的单参数高精度测量。然而,在农业领域中,农产品、食品的品质等通常受到多个因素共同影响,传统的孤立测量模式难以揭示全局关联。徐沛解释说:“譬如水分的吸收、肥料的使用和光照条件都会影响水果的甜度。”他表示,高精度甜度检测只能做到“知其然”,只有进一步结合蛋白组学、基因组学等方法挖掘水果甜度变化的机理才能做到“知其所以然”。“知其所以然”的实现,为智慧决策添加了一道强有力的屏障。“计量组学”将多维度的组学信息与温度、土壤、气象等环境信息结合,将准确性、一致性、精密性、......阅读全文

代谢组学新工具:METLIN

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   超过上万个代谢物   目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,

徐国良院士Nature发表表观遗传学重要成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶(DNMT)介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰,在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此实现

GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘

  盐城4公分厚外墙岩棉板报价    岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。

4D组学新时代!更精确的磷酸化修饰组学

离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白

【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展

  自从精准医学概念提出以来,组学研究一直都是全球最热的研究领域,其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初,中国发起了精准医学研究专项课题,目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台,推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时

叶渚沛与白求恩的X光机

    最近,“文旅中国”公众号发布文章《百年百物|白求恩的X光机》。文章写道,这台X光机是白求恩率领医疗队随身携带的医疗器械之一,长28厘米、宽21厘米、高16厘米,美国制造。在我国抗日敌后根据地,白求恩在短短4个多月里,行程高达700多公里,救治伤员1000多名,先后操作300多次大手术,这台X

徐麟研究组揭示植物再生的伤口信号转导机制

  强大的再生能力是植物适应严酷环境的生存技能之一。受伤离体的枝条或叶片掉落在湿润的土壤表面后,能够在伤口处快速再生不定根,顽强的生存下去。“受伤”是引发再生的原因,但是我们对伤口信号如何控制再生知之甚少。2019年4月22日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所徐麟研究组于Nat

蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

  AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSp

代谢组学,妙手何来?|迈理奥,开拓代谢组学新科技的先锋

今天要讲到的代谢组学妙手来自何方? 来自我们优秀的用户——迈理奥(Meliomics)。迈理奥的快速崛起,源自于他们对代谢组学领域的深刻理解和持续创新,而安捷伦出色的仪器和解决方案也为其提供了重要支持。日前,我们有幸采访到了迈理奥首席科学家厉良教授(加拿大皇家科学院院士)和学术总监李佳博士,深入了解

组学发展的机遇与挑战,--高通量成为组学研究关键因素

近年来随着新技术的不断涌现,加快了组学研究飞速发展。特别是生命科学领域,随着基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学以及脂质组学技术的不断完善与进化,组学向分子水平的各个分支领域不断进化和完善,研究者更是利用组学研究思路和手段,不断推进衍生出了食品组学,金属组学等新型组学研究方向,从而引领大组学研究不

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学

  科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。  基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借

时空组学技术助力生物学和医学发展

一直以来,科学家们努力解读由30亿碱基对组成的生命“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破,人们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到身体每个细胞的全景特征,为理解基因组“天书”以及生物学和医学研究带来新机遇。8月22日,《细胞》刊发了华大生命科学研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组学技术如

时空组学技术助力生物学和医学发展

  一直以来,科学家们努力解读由30亿碱基对组成的生命“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破,人们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到身体每个细胞的全景特征,为理解基因组“天书”以及生物学和医学研究带来新机遇。  8月22日,《细胞》刊发了华大生命科学研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组

竹类组学和分类学信息平台发布

日前,中国科学院昆明植物研究所研究员李德铢带领的研究团队在《分子植物》上在线发表论文,发布了“竹类组学和分类学信息平台(BambooBase,https://bamboo.genobank.org/)”。BambooBase收录了竹类植物18个基因组、476个转录组和16个表观基因组的数据,以及13

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

什么是蛋白质组学

(Marc Wilkins(1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein

蛋白质组学研究技术

可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,

质谱在组学中的应用

质谱在组学中的应用无疑是当前最热门的,而且各种组学都广泛深入的得到了开展。这其中有一些比较有特色的应用领域,最近十分热门,它们前景如何?技术瓶颈在哪里?市场推广还有哪些问题,值得相关专业人士思考。      质谱成像技术(Imaging MS)诞生了近20年,最早主要是在二次离子质谱(SIMS)领域

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

什么是蛋白质组学

这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的

进入前景光明的代谢组学

内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

什么是蛋白质组学

这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的