中国学者发文探讨荧光RNA技术应用前景
近日,华东理工大学教授杨弋、陈显军团队在《细胞生物学趋势》上发表观点文章,系统总结了荧光RNA在活细胞RNA动态可视化研究中的最新进展、面临挑战及未来发展方向。荧光RNA是一类由RNA适配体与荧光染料组成的成像工具,能够在无需依赖蛋白质标记的情况下,实现活细胞中RNA动态的高时空分辨成像。近年来,随着性能大幅提升,荧光RNA已经可以进行单分子水平、超分辨率、多重成像乃至内源RNA标记与成像,在RNA生物学研究中展现出广阔应用前景。文章中系统总结了荧光RNA在推动RNA动态研究方向的最新突破,并提出了一定的使用建议。作者就选择生物正交的荧光RNA进行多色RNA成像、选择合适的高亮度荧光RNA、优化染料的标记浓度获得高信噪比成像图片等进行了具有实操性的建议,以期帮助研究人员更好地开展实验,助力RNA生物学功能与调控机制研究。荧光RNA技术在活细胞RNA动态成像中的多场景应用。图片由研究团队挺提供文章最后,作者探讨了荧光RNA技术未来......阅读全文
RNA荧光原位杂交
原位杂交:在研究DNA分子复制原理的基础上发展起来的一种技术。其基本原理是两条核苷酸单链片段,在适宜的条件下,能过氢键结合,形成DNA-DNA、DNA-RNA或 RNA-RNA 双键分子的特点,应带有标记的(有放射性同位素,如3H、35S、32P、荧光素生物素、地高辛等非放射性物质)DAN或 RNA
研究发展RNA“缓冲荧光探针”
近日,中国科学院大连化学物理研究所副研究员乔庆龙和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合,在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN,实现了对核仁动态轮廓的成像,并通过活细胞内药物诱导下核仁特定形态的可视化,为核仁应激试剂的筛选提供可视化的工具。相关成果发表在《先进科学》。
研究发展RNA“缓冲荧光探针”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519783.shtm
研究人员合成高性能荧光RNA实现活细胞RNA成像
2019年11月5日,华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室杨弋教授等在Nature Biotechnology(《自然—生物技术》)杂志上发表了封面学术论文,题为“Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fl
荧光RNA传感器研究获进展
基因编码的荧光传感器可以在单细胞水平追踪代谢物、蛋白质或重金属离子等细胞内靶标的丰度变化和动力学分布,并解析活细胞的生理过程和信号传导通路。7月24日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院北京生命科学研究院李幸团队撰写的题为Genetically en
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。 在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理
荧光定量pcr仪是怎样测试dna,rna的
荧光定量pcr仪是怎样测试dna,rna的普通的基因扩增仪(PCR仪)只能够定性地分析是否存在目标片段。但是价格要低很多,而且运行成本也要低很多。不过不能直接得到扩增结果,还需要做电泳检测。实际中检测遗传疾病,品种分子标记筛选,甚至亲自鉴定等都可以由普通PCR仪完成。但是,某些需要定量的实验就必须用
遗传编码荧光RNA探针研究获新进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503155.shtm
中国学者发文探讨荧光RNA技术应用前景
近日,华东理工大学教授杨弋、陈显军团队在《细胞生物学趋势》上发表观点文章,系统总结了荧光RNA在活细胞RNA动态可视化研究中的最新进展、面临挑战及未来发展方向。荧光RNA是一类由RNA适配体与荧光染料组成的成像工具,能够在无需依赖蛋白质标记的情况下,实现活细胞中RNA动态的高时空分辨成像。近年来,随
联合团队解析荧光RNA同染料识别和发色机制
华东理工大学药学院、生物反应器工程国家重点实验室、光遗传学与合成生物学交叉学科研究中心教授杨弋、朱麟勇,浙江大学生命科学研究院研究员任艾明课题组联合,在荧光RNA研究中取得新进展,为进一步理解和探索荧光RNA适配体潜在的通用结构提供了重要线索。相关研究发表于《自然—化学生物学》。荧光RNA是近些年来
联合团队解析荧光RNA同染料识别和发色机制
华东理工大学药学院、生物反应器工程国家重点实验室、光遗传学与合成生物学交叉学科研究中心教授杨弋、朱麟勇,浙江大学生命科学研究院研究员任艾明课题组联合,在荧光RNA研究中取得新进展,为进一步理解和探索荧光RNA适配体潜在的通用结构提供了重要线索。相关研究发表于《自然—化学生物学》。荧光RNA是近些年来
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水
RNA荧光(RiboGreen)定量检测试剂盒使用说明
主要用途 RNA荧光(RiboGreen)定量检测试剂是一种旨在通过使用RiboGreen荧光染料与样品中RNA的高度结合而产生荧光信号来精确定量样品中RNA含量的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。其适用于各种分子生物学实验,例如体外转录RNA、Northern Bo
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(二)
##六、从组织或培养细胞提取 RNARNA可以从各种来源的样本包括培养的细胞(例如神经元细胞、肝细胞等)和组织中分离得到(见 注 释 1) 。 mRNA 的 纯 化 对 FRAP-PCR 方法来说并不需要,因为mRNA 仅占细胞总 R N A 的 3 % 〜5 % (13)。因而在本章所描述
原代细胞DNA与RNA的吖啶橙荧光染色法
基本原理:吖啶橙(acridine orange,AO)是一种常用荧光染料,吖啶橙与原代细胞内的DNA、RNA都有亲和力,但有一定的特异性,即结合后发不同颜色的荧光,DNA呈亮绿色,而RNA呈橘红色至火红色。此法简便快捷,既可染活原代细胞又可染固定原代细胞。用于直接染色观察活原代细胞或固定染色观
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C
原代细胞DNA与RNA的吖啶橙荧光染色法
基本原理:吖啶橙(acridine orange,AO)是一种常用荧光染料,吖啶橙与原代细胞内的DNA、RNA都有亲和力,但有一定的特异性,即结合后发不同颜色的荧光,DNA呈亮绿色,而RNA呈橘红色至火红色。此法简便快捷,既可染活原代细胞又可染固定原代细胞。用于直接染色观察活原代细胞或固定染色观
美开发出无需荧光标记的新型DNA和RNA检测方法
据物理学家组织网近日报道,美国佐治亚大学的科研人员采用专门设计的纳米材料,开发出了无标记的新型DNA和RNA检测方法,有望降低常用基因检测技术的成本和复杂性。相关研究报告发表在近期出版的《美国化学学会期刊》上。科学家称,他们的发现或可用于帮助医生诊断白血病和淋巴癌等特定的癌症,还能探测出在组织中存在
RNA“缓冲荧光探针”用于细胞核核仁成像和核仁应激试剂筛选
近日,我所生物技术研究部分子探针与荧光成像研究组(1818组)乔庆龙副研究员和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合,在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN,实现了对核仁动态轮廓的成像,并通过活细胞内药物诱导下核仁特定形态的可视化,为核仁应激试剂的筛选提供可视化的工具。
研究实现活细胞及线虫体内DNA和RNA的同步荧光成像
近期,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所智能微纳器件研究室研究员张忠平和王振洋领导的团队在生物体核酸结构的同步原位影像分析方面取得新进展,合成了一种具有高效生物膜穿透能力的阳离子碳量子点,实现了对活细胞及线虫体内DNA和RNA的同步荧光成像。相关研究成果发表在国际化学期刊《德国应用化学》
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育
RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后
反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA