复旦大学粟硕团队绘制全球首个哺乳动物高分辨率微生物与耐药基因图谱
哺乳动物体内微生物及其携带的抗生素耐药基因(ARG)的跨宿主传播,是潜藏的重大公共卫生风险源。然而,现有研究面临多重技术瓶颈:低丰度微生物难以检测导致潜在病原漏报;大量未报道的微生物物种缺失限制了多样性认知;物种及功能注释精度不足阻碍了明确 ARG 与可移动遗传元件(MGE)的关联;现有宏基因组分析方法分辨率有限(通常仅到物种或属水平),难以精确追踪不同宿主同源菌株或基因的传播,使得解析复杂的跨宿主传播网络极具挑战。2025 年 8 月 26 日,复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队(在读博士生石宇旗、李昱星为论文共同第一作者)在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为:Extensive cross-species transmission of pathogens and antibiotic resistance genes in mammals neglected by public health sur......阅读全文
复旦大学粟硕团队绘制全球首个哺乳动物高分辨率微生物与耐药基因图谱
哺乳动物体内微生物及其携带的抗生素耐药基因(ARG)的跨宿主传播,是潜藏的重大公共卫生风险源。然而,现有研究面临多重技术瓶颈:低丰度微生物难以检测导致潜在病原漏报;大量未报道的微生物物种缺失限制了多样性认知;物种及功能注释精度不足阻碍了明确 ARG 与可移动遗传元件(MGE)的关联;现有宏基因组分析
微生物所在人体肠道细菌耐药基因研究方面取得进展
人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育
微生物所揭示不动杆菌中新型固有耐药基因水平转移机制
不动杆菌的耐药性包括获得性耐药和固有耐药。固有耐药是细菌对某类抗生素的天然耐受,由固有耐药基因决定。固有耐药基因是指存在于某类细菌染色体上位置保守的与耐药相关的一类基因。固有耐药基因的发现可以为新药研制提供药物作用靶标,并且固有耐药基因可以被移动原件捕获而成为获得性耐药的来源。 针对固有耐药,
寻找疟原虫耐药基因
对疟原虫(malaria parasites)进行的全基因组测序研究(Whole-genome sequencing)发现了与疟原虫对青蒿素类抗疟药(artemisinin-based drug)耐药机制有关的基因组位点。这一发现有助于科学家们发现疟原虫的耐药机制,以及这种耐药机制的传播
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日,国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日,华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章,在动物和住院患者中发现多粘
基因代谢速度决定哺乳动物进化
通常认为人类和黑猩猩之间仅有1%~2%的基因差异,但事实上,区分人类和黑猩猩的基因比科学家预料的要多。一项新的研究表明,把人类和近亲——黑猩猩区分开的是人类获得新基因、抛弃旧基因的速率。 人类比黑猩猩和其他哺乳动物基因代谢速度快。(图片提供:《科学》杂志网站) 人类和黑猩猩这两个物种
新质谱法可快速鉴定耐药微生物
如果医生要准确诊断患者并对其进行适当的药物治疗,那么快速鉴定危险和抗药性细菌感染的临床样本就十分重要。最近,在第27届欧洲临床微生物学和传染病大会(ECCMID)上,一个研究小组描述了他们的最新研究成果——一种用质谱仪来快速评估微生物发病机制的新方法。 各种耐药菌株的实例 在这项新的研究中,
解读|微生物耐药全国性计划
一、起草背景及过程微生物耐药是全球公共健康领域面临的重大挑战,也是各国政府和社会广泛关注的世界性问题。世界卫生组织多年来呼吁各国重视微生物耐药问题,联合国大会、世界卫生大会、G20峰会等重要国际会议多次研究讨论微生物耐药问题。2016年,为积极响应世界卫生组织发布的《抗微生物药物耐药性全球行动计划》
Nature:寻找疟原虫耐药基因
对疟原虫(malaria parasites)进行的全基因组测序研究(Whole-genome sequencing)发现了与疟原虫对青蒿素类抗疟药(artemisinin-based drug)耐药机制有关的基因组位点。这一发现有助于科学家们发现疟原虫的耐药机制,以及这种耐药机制的传播
中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展
中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员
中国学者首次绘制哺乳动物高分辨率微生物图谱
复旦大学公共卫生学院教授粟硕团队首次系统解析了大量此前未知的哺乳动物微生物组多样性,并绘制了临床重要功能元件ARGs的跨宿主共享网络,就像给微生物世界绘制了一张前所未有的“地图”,拓展了人类对于微生物组成和多样性的认知边界和深度,并为微生物源疾病和抗生素耐药性防控提供重要理论基础。相关研究8月26日
干细胞+基因编辑=哺乳动物同性繁殖
中国科学院的研究人员培育出了有两个妈妈的健康小鼠(小鼠可以拥有自己的正常后代),同时,有两个爸爸的小鼠也出生了,但只存活了几天,研究发表在10月11日的《Cell Stem Cell》。同性动物产生后代如此具有挑战性,这项研究指出,利用干细胞和有针对性的基因编辑可以克服这些障碍。 “我们对哺乳动物
哺乳动物细胞基因突变试验
哺乳动物体外培养细胞的基因正向突变试验常用的测试系统有小鼠淋巴瘤L5178Y细胞,中国仓鼠肺V79细胞和卵巢CHO细胞的三个基因位点的突变,即次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)、胸苷激酶(TK)及Na+/K+ATP酶(OUA)位点。HGRPT和Na+/K+ATP酶位点突变可用于上述三种细胞,O
中科院微生物所解析出耐药基因在细菌间传播网络规律
近日,中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究领域取得进展。该研究首次以基因组学大数据为依托,解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。相关成果已在线发表于《应用与环境微生物学》,并将以“封面故事”形式发表。 近年来,随着“
突破耐药基因组测序缺陷-靶向测序对抗耐药菌新契机
自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来,细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后,情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下,敏感菌株被抑制或杀灭,天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播,导致细菌的耐药性增高。 细
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织 试剂、试剂盒
哺乳动物细胞基因稳定转染的实验
分析基因的功能常需要形成含有稳定整合了该基因的哺乳动物细胞系。在转染中大约有1/104细胞将稳定整合外源因而可用一显性(正向)选择标记来分离稳定的转化细胞。用可高效转染的细胞系来确保转染成功。另外,应包括合适的对照以确定目的基因无细胞毒性。实验材料哺乳动物细胞试剂、试剂盒完全培养液仪器、耗材培养箱离
哺乳动物中制备基因组DNA实验
实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1. 切下组织并立即剪成小块,置于液氮中冻结。 2. 将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用锤子将其捣为细粉末,每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.
哺乳动物细胞基因稳定转染的实验
实验材料 哺乳动物细胞试剂、试剂盒 完全培养液仪器、耗材 培养箱离心管实验步骤 1. 确定所要转染的细抱系能呈独立集落生长。对于贴壁细胞,在10 cm 组织培养培养皿中接种约100个细胞,培养10~12天,毎4天换液1次。亚甲蓝染色后对成活的细胞集落进行计数。 2. 确定母代细胞的选择条件:将一
哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成
从鸭嘴兽到蓝鲸,每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少,现在,一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上,对理解哺乳动物的进化和保护工作具有重要意义。 研究人员利用了来自32个活物种的高质量基因组序列,这
哺乳动物细胞基因稳定转染的实验
基本方案 实验材料 哺乳动物细胞 试剂、试剂盒
微生物耐药性变异的现象有哪些
其产生可通过细菌染色体耐药基因的突变、耐药质粒的转移和转座子的插入,使细菌产生一些新的酶类或多肽类物质,破坏抗菌药物或阻挡药物向靶细胞穿透,或发生新的代谢途径,从而产生对抗生素的耐药性,造成临床药物治疗的失败。
微生物耐药性:人类健康的重大威胁
“我家孩子从没使用过阿奇霉素,咋也耐药了?”今年8月初,在福建省厦门市思明区莲前街道社区卫生服务中心,家长李华向医生表达了自己的疑惑。 在儿科门诊,患儿家长频繁向医生提出这个问题。事实上,不仅是儿童,很多人都被这个问题困扰。 微生物耐药性,特别是细菌的耐药性,已被世界卫生组织列为严重威胁人类
微生物检验必须掌握的三大耐药机制
微生物检验必须掌握的三大耐药机制 你知道什么是微生物检验吗?你对微生物检验了解吗?下面是我为大家带来的关于微生物检验必须要知道的三大耐药机制的知识,欢迎阅读。 一、产生灭活抗生素的各种酶 1、 β—内酰胺酶(β-lactamase) β—内酰胺类抗生素都共同具有一个核心β—内酰胺环,其基
微生物耐药性:人类健康的重大威胁
“我家孩子从没使用过阿奇霉素,咋也耐药了?”今年8月初,在福建省厦门市思明区莲前街道社区卫生服务中心,家长李华向医生表达了自己的疑惑。在儿科门诊,患儿家长频繁向医生提出这个问题。事实上,不仅是儿童,很多人都被这个问题困扰。微生物耐药性,特别是细菌的耐药性,已被世界卫生组织列为严重威胁人类安全的公共卫
HBV多位点耐药基因检测结果分析
目的 分析乙型肝炎患者HBV核苷(酸)类似物耐药相关的10个位点的突变情况及其临床意义。 方法 采用焦磷酸测序法对658例各型乙型肝炎患者行核苷类似物抗乙肝病毒多位点耐药基因检测并分析不同核苷(酸)类似物耐药的突变形式,对常见突变模式者ALT和HBV-DNA水平进行比较。 结果 300
乙型肝炎病毒耐药基因检测方法
1.PCR产物直接测序:是将HBV基因组的逆转录酶区进行扩增后直接进行测序分析的方法。PCR产物直接测序法可检测已知和可能的未知耐药变异位点,是最常用的基因型耐药检测方法之一。PCR产物直接测序的方法一般作为基因型耐药检测的金标准。该方法的缺点是灵敏性较差,只有当变异株超过HBV准种池的20%时
乙型肝炎病毒耐药基因检测概述
一、乙型肝炎病毒耐药基因检测的临床意义 WHO相关资料显示,全球感染过乙型肝炎病毒(HBV)的患者超过三分之一,而慢性乙型肝炎患者约有2.4亿,乙肝严重影响着人类的生命健康。HBV是传染性疾病乙型病毒性肝炎的主要病因,感染HBV可引起肝硬化甚至肝细胞癌变。HBV属嗜肝DNA病毒科,为双链DNA
多耐药基因mdr1检测简介
药物耐受是影响肿瘤化疗的最大障碍。多药耐药(MDR)是指细胞可耐受结构、功能及杀伤机制不同的多种药物的致死剂量。耐药的根本原因是多耐药基因mdr-1表达升高。 mdr-1基因是一个相对保守的基因,人类mdr-1基因位于染色体7q21-21、1,共有28个外显子,其cDNA长度4.3kb,编码一