我国科研团队首次完整公布小鼠基因组全部染色体

西湖大学遗传物质表达与重构全国重点实验室俞晓春团队11日在国际学术期刊《科学》(Science)发表成果:完整的端粒到端粒小鼠Y染色体序列,构建了覆盖小鼠全部染色体的参考序列。小鼠的基因组与人类高度同源,从疾病机制解析到新药研发验证,从发育规律探索到遗传功能研究,绝大多数生命科学问题的回答,都要先在小鼠身上寻找线索。因此,小鼠基因组研究的完整程度,直接影响着相关研究的可靠性与准确度,Y染色体或许是其中最难整理的一项。小鼠Y染色体超过90%的序列由高度重复单元构成,传统测序技术既无法辨析它们的各自归属,也无法确定其排列顺序。同时,Y染色体末端还存在一段伪常染色体区(PAR),它与X染色体在此处高度同源,在减数分裂中,X与Y需在此配对并交换遗传物质。这种极高的相似性,极易导致数据“张冠李戴”。通过研究,俞晓春团队最终获得全长95.21Mbp(9521万碱基对)的高质量Y染色体序列,新增8.70Mbp(870万碱基对)此前未被鉴定的序......阅读全文

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。

小鼠肝基因组DNA制备

原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。

构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库

  研究人员开发出一种方法,构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。   CR

12个基因组区域影响小鼠抚育行为

  遗传学亲代抚育  科技日报北京5月9日电 (记者张梦然)英国《自然》杂志日前发表的一项遗传学研究,以两种小鼠为研究对象,考察了亲代抚育行为的遗传驱动因素。该研究识别出了12个影响小鼠亲代抚育行为的基因组区域,并揭示了复杂的社会行为背后的神经生物学基础。  对很多生命而言,后代发育成长的先决条件是

小鼠基因组DNA抽提操作规程

一、原理与意义先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解,然后用蛋白酶去除其中的蛋白,再用氯仿一次抽提(无需用酚抽提)、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇再沉淀即可得到完整DNA。该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA。抽提出来的DNA能用于几乎所

Nature子刊构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库

  研究人员开发出一种方法,构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。   CR

基因组所小鼠组织新转录本鉴定研究取得进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用新一代测序数据,运用生物信息学方法,在小鼠的几个组织中发现了几千个新的转录本。该研究成果的完成拓宽了转录组数据分析的思路,有利于更全面地认识小鼠的转录组组成,并进一步补充了其基因组的注释,相关成果论文在frontiers in genetics

任兵教授Nature重要成果:首张小鼠功能基因组图谱

  通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下,基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。   在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中,来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的

科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱

近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合

科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱

近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合

我国科研团队首次完整公布小鼠基因组全部染色体

西湖大学遗传物质表达与重构全国重点实验室俞晓春团队11日在国际学术期刊《科学》(Science)发表成果:完整的端粒到端粒小鼠Y染色体序列,构建了覆盖小鼠全部染色体的参考序列。小鼠的基因组与人类高度同源,从疾病机制解析到新药研发验证,从发育规律探索到遗传功能研究,绝大多数生命科学问题的回答,都要先在

CRISPR–Cas9基因组编辑可用于耳聋小鼠模型恢复听觉

  一篇论文称,研究将CRISPR–Cas9基因组编辑技术用于恢复人类遗传性耳聋小鼠模型的听力。这项于12月21日发表于《自然》的研究凸显了CRISPR-Cas9用于治疗某些显性遗传性听觉损失疾病的潜力。  将近一半的耳聋是由遗传因素造成的,但能治疗遗传性听觉损失的方法却有限。美国马萨诸塞州哈佛大学

我国科学家全面描绘DUX在小鼠胚胎基因组激活中的作用

  2019年10月7日,来自同济大学的高绍荣教授研究团队在Cell Research杂志上在线发表了题为“Precise temporal regulation of Dux is important for embryodevelopment”的文章,对Dux在早期胚胎中的作用做了全面描绘。  

高绍荣团队全面描绘DUX在小鼠胚胎基因组激活中的作用

  哺乳动物高度分化的精子与卵子结合形成受精卵,受精卵随后经过多次卵裂和细胞分化最终发育成具有成千上万种细胞类型的新个体。处于胚胎发育很早期的细胞具有同时发育为胚胎和胚外组织的能力,因此被定义为全能性细胞。  在体内,成熟的卵母细胞在MII时期停滞并且是转录沉默的,在受精以后受精卵重新进入有丝分裂开

PNAS:在小鼠细胞中利用CRISPRCas9技术高效进行基因组编辑

  为了利用CRISPR-Cas9基因编辑系统切割基因,人们必需设计一种与靶基因的DNA相匹配的RNA序列。大多数基因具有上百个这样的在基因组中的活性和独特性上存在差异的序列。因此,寻找最佳的序列很难通过手工实现。一种新的“CrispRGold”程序有助科学家们鉴定出最为高效的和最为特异性的RNA序

从小鼠脾脏分离小鼠天然杀伤细胞

实验步骤基本方案12.为 检 验 细 胞 纯 度 ,可 加 入 终 浓 度 为 lOug/ml 的 抗 C D 3- F I T C 和 P K 136-PE (抗N K 1. 1 ) 抗体,进 行 流 式 分 析(第四章)。展

小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠

  前几天有“砖家”同学写了两篇《鼠年说鼠》(一)和(二)。为了留作永久的学习材料,小编在经过原作者同意后,现进行转载。本文将两部分内容融在一起,并对(一)和 (二)顺序进行了调换。   抗体药发现的两大矿场   抗体药主要有两个大矿场,一个是依赖于体外展示技术的全合成/半合成/天然抗体

小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠(二)

RenMabTM小鼠的免疫系统发育 人源化抗体鼠的主要用途是用在新药研发上的全人源抗体发现,如果RenMabTM鼠的免疫系统发育缺陷,不能正常地产生抗体,或者是不能以正常的方式产生抗体(比如AlivaMab鼠),那就失去了其存在的意义。 RenMabTM鼠目前来看是个六能鼠,能吃、能喝、能拉、能睡、

小鼠中的黄金矿脉RenMabTM小鼠(一)

抗体药发现的两大矿场 抗体药主要有两个大矿场,一个是依赖于体外展示技术的全合成/半合成/天然抗体文库矿,比较耳熟能详的是剑桥抗体技术公司(药王阿达木单抗)、后来的Dyax和现在的MorphoSys(特诺雅®古塞奇尤单抗注射液)。著名的矿主有2018年诺贝尔化学奖得主温特爵士(噬菌体展示平台)和MIT

小鼠细胞鉴定

STR分型已作为成熟的金标方法用于人源细胞株鉴定,但在小鼠源细胞株鉴定方面,国内则缺乏相关STR鉴定试剂盒;而像IJC等外文期刊已经有条件的要求作者对小鼠源细胞进行鉴定。为满足各位老师对小鼠源细胞株鉴定的迫切需求,苏州鉴达自行研发18位点小鼠源细胞株鉴定试剂盒,正式开启小鼠源细胞株STR鉴定服务。经

小鼠microct原理

当X-射线透过样本时,样本的各个部位对X-射线的吸收率不同。小动物microct检测通常采用锥形X线束(ConeBeam)。采用锥形束不仅能够获得真正各向同性的容积图像,提高空间分辨率,提高射线利用率,而且在采集相同3D图像时速度远远快于扇形束CT。小动物microct检测成像的原理是当X-射线透过

小鼠免疫程序

一、抗原的准备 1、收到抗原时,首先要了解抗原的种类、性质和浓度,以便采取不同的处理方法。 2、多肽抗原,一般分多肽―偶联KLH和多肽―偶联BSA(或GGG)或裸多肽三种。多肽―偶联KLH一般用于免疫,而多肽―偶联BSA或裸肽一般用于检测,在免疫时注意区分使用。 3、分装 (1)收到抗原后,应及时

小鼠免疫实验

实验方法原理 实验材料 任意品系小鼠(6~8 周)试剂、试剂盒 PBS完全和不完全弗氏佐剂抗原仪器、耗材 22-G 注射针头带塞的 3 ml 注射器双头带塞的连接器无菌剪刀剃须刀片解剖刀片木制涂棒实验步骤 1. 准备等体积 PBS 含 25~100 μg 抗原和弗氏完全佐剂的乳化液(200~40

小鼠麻醉“101”

麻醉:通过给予麻醉剂,抑制局部或中枢神经系统的直觉与动作反射。一般分为两种:吸入性麻醉和注射性麻醉。吸入性麻醉使用吸入性麻醉剂对小鼠进行诱导或者麻醉。一般需要通过气体麻醉蒸发仪配合小鼠麻醉操作。常用的吸入性麻醉剂有:IsofluraneSevofluraneHalothane注射性麻醉可根据实验或手

模式生物——小鼠

小鼠(mouse)————学名:mus musculus,在生物分类学上属脊椎动物门、哺乳动物纲、啮齿目、鼠科、鼷鼠属、小家鼠种。小鼠以其高繁殖、易饲养、表达明显等特点,成为实验室里常用的实验动物。以下是几种常用的实验小鼠品系。 A、近交系(ired strain): 1)BALB/c小鼠

年轻小鼠骨髓能够提高老年小鼠大脑的活性

  一项新的研究发现,将年轻实验室小鼠的骨髓移植到老鼠身上可以防止老鼠的认知能力下降,保持他们的记忆力和学习能力。  “虽然之前的研究表明,从幼鼠体内引入血液可以逆转老鼠的认知能力下降,但对于这种情况的发生情况尚不清楚,”Cedars-Sinai医学和生物医学科学副教授Helen Goodridge

分离小鼠胚胎实验

            实验方法原理 胚胎是怀孕最初两个月内的幼体。囊胚、胚的早期发育和胚胎发育是一个连续过程。在体节时期,三个胚层都发生了变化。外胚层在背部中线凹陷成沟,称神经沟,沟的两岸称神经脊。神经脊逐渐接近、愈合,致使神经演变为纵贯胚体的神经管。神经管和神经

分离小鼠胚胎实验

实验方法原理 无菌条件下切除孕鼠(已知怀孕时间)子宫,分离胚胎。实验材料 DBSS试剂、试剂盒 70%乙醇仪器、耗材 培养皿尖镊子尖剪刀超净工作台本生灯实验步骤 1. 交配。将分笼的雄鼠和雌鼠合笼进行交配,雌鼠 3 天后可进入动情期,此时交配的成功率最高。这一过程可以有计划地进行,使胚胎在适宜的时间

模式生物——小鼠(一)

小鼠(mouse)————学名:mus musculus,在生物分类学上属脊椎动物门、哺乳动物纲、啮齿目、鼠科、鼷鼠属、小家鼠种。小鼠以其高繁殖、易饲养、表达明显等特点,成为实验室里常用的实验动物。以下是几种常用的实验小鼠品系。A、近交系(inbred strain):1)BALB/c小鼠形成了许多

小鼠腹腔注射、采血

一、实验类型  提高型实验  二、实验原理  小鼠是医学实验最常用的一种动物,常用于药物筛选、急性毒性试验、采血制备抗血清、进行常规检查或某些生物化学分析等,本实验学习小鼠捉持方法、腹腔注射方法以及采血方法。  三、实验方法  材料:  小鼠,注射器,生理盐水,采血管,EP管,弯头镊子,酒精棉球等。