基因组信息如何加密制定标准是必须
随着基因测序成本直线下降，专家认为，我们的基因组将有助于医生发现疾病，拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。现在，密码学家正在完善一个新的隐私保护工具，可将遗传信息转变成安全而实用的格式。 所谓的同态加密方法，可以帮助保持基因组隐私，就好像基因检测转移到廉价的在线云服务一样。 现有的加密技术常以数据无法使用为代价而保证数据安全的。正因为此，大多数基因序列在发送出去进行分析前，会被简单地匿名。然而，麻省剑桥郡 Whitehead生物医学研究所的计算生物学家Yaniv Erlich表示，随着遗传侦察技术的逐步推进，这些匿名的数据可以很容易追溯到其所属者，他已经准确地将12%的男性基因配对。 2009 年，IBM发布了第一个基于格的加密方案。几何为基础的加密方法允许数据通过乘法和加法运算来操作，而数据仍保持加密。研究人员意识到，基因测试中使用的复杂算法可以借两个基本的数学运算较精密......阅读全文
国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系
近日，国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建设
－华大基因收购美国上市公司CG－奠定基因大数据基础
对深圳华大基因，腾讯马化腾有一段评价：用大数据的算法，与以前的医学理论不一样。看一个人的疾病，只是看他得病的特征与哪种病吻合，推导出具体对哪个部 位对症下药。到时，药可能是治基因的某一段。基因哪一段出问题，就拿相应的药去治。这个思路很开放，用了大数据，是一个很好的案例。 带领华大基因建
日本研究气象数据如何影响水稻基因
将气温、降水量等气象数据输入电脑程序，就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况，这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。 这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究，研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8
双创：科技是基因－大数据是骨骼
2016年5月30日，全国科技创新大会明确了我国科技事业的发展目标，并把创新驱动放在了国家发展全局的核心位置。 作为新兴前沿科技，大数据是这个时代开放与创新的标志。数字经济时代所带来的颠覆与革新，正在让这个世界悄然发生着巨变。数字经济完全打破了区域时空的限制，让资源配置更有效率，促进了产
首款体内基因编辑疗法公布首批数据
今天美国生物技术公司Sangamo公布了其Hunter氏症（也称MPS II）体内基因编辑疗法SB-913的早期数据。两位低剂量患者没有什么应答，但两位中剂量患者使用SB-913 16周后糖胺聚糖（GAGs）水平有显着下降（尿GAG下降51%，硫酸皮肤素下降32%，硫酸类肝素下降61%）。但在外
日研究气象数据如何影响水稻基因
将气温、降水量等气象数据输入电脑程序，就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况，这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。 这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究，研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8号”，
Nat－Genetics：大数据揭示疾病的基因关联
想象一下，雨水落在人行道上的场景。虽然雨滴落地似乎是随机发生的，但随着时间的推移，人行道仍然会有一片区域保持干燥。这个类比类似于犹他大学健康研究所的研究人员设计的一种新方法。他们探索了超过100,000名健康人，以确定我们不容易改变的基因区域。他们认为，这些“受限制”区域的DNA突变可能会导致严
基因大数据深度挖掘，我们将面临挑战
在日前于北京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，众多与会专家就基因技术发展方向及面临的机遇与挑战进行了深入交流。作为一种新型基因检测技术，基因测序能从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性、个体的行为特征及行为合理性。基因测序技术能锁定个人病变基因，予以提前预防和治疗。
基因“好”“坏”，大数据说了算
为什么白菜有卷心不卷心之分，颜色也有黄绿蓝白多种，但同属十字花科的拟南芥，全世界的却都长一个样？4月18日，科技日报记者从江苏省农业科学院获悉，该院杜建厂研究团队发现，基因性质在很大程度上取决于选择方式，白菜的多样性可能是因为正选择作用基因较多。 根据自然选择方式的不同，基因一般可分为两种类型
基因组数据分析的“金标准”
五月十八日，美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员，在《Nature M
－生物医学基因大数据：现状与展望
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域：临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
警惕基因检测背后的数据安全问题
日前，国内知名基因检测公司23魔方推出第四代基因检测产品。23魔方CEO周坤称，目前，23魔方已累积16万人的样本数据库，是中国消费级基因检测公司中最大的。“得益于真实可留存的规模用户数据，23魔方可以进一步开展科学研究，做准做精项目。” 点评：基金检测公司主张用科技预测未来，并提供精准的护肤
在Matlab中探索基因表达数据分析
DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学 工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA 探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱，微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下，如两种不同的肿瘤
山东莱芜加密环境监测网络，划定管理权限
实行环保网格化管理，是山东省莱芜市委、市政府2014年确定为民办的10件实事之一。截至目前，这套体系建设进展怎样？能否起到应有的成效？ 记者日前在瀛汶河雪野旅游区断面附近一处不起眼的平房内看到，几台设备正在运行，其中一台显示COD2.8mg/L。“这里是汇河雪野水质自动监测站，仪器自动从汇河取
记成都高原气象研究所西南涡加密观测科学试验
2015年西南涡加密观测大气科学试验团队合影。 一只南美洲亚马逊河流域热带雨林中的蝴蝶，偶尔扇动几下翅膀，可以在两周以后引起美国得克萨斯州的一场龙卷风。这是美国气象学家洛伦兹1963年提出的“蝴蝶效应”理论。 在中国气象局成都高原气象研究所（以下简称高原所）所长李跃清眼中，西南涡更是一只吐水成雨
GenomeAsia－100K最新数据公布！探索亚洲人基因数据的秘密
目前已经测序的人类基因组序列中约有6%的样本来自亚洲个体。而世界上约一半的人口是亚洲人。GenomeAsia 100K项目成立于2016年，由Macrogen、盆唐首尔大学医院精准医疗中心、新加坡南洋理工大学、印度基因组分析企业MedGenome和美国罗氏集团子公司Genentech等组成，旨在
华大基因回应14万中国人基因大数据是否外泄
就深交所问询函，华大基因回复表示：“14 万中国人基因大数据”项目无外方合作机构。项目分析工作均在境内由中国科研团队完成。14 万中国人基因大数据来自同意将样本和数据供科学研究的受检者。研究披露的是群体分析结果，不包含任何可识别个人身份信息，不存在泄露个人隐私的风险。 昨天北京青年报记者获悉，
北京基因组所数据资源建设取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式，整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展，也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 生命与健
AbbVie公布泛基因型丙肝疗法数据
图片来源于网络 近日，在美国肝病研究学会（AASLD）组织的The LiverMeeting？2018上， AbbVie公司宣布了关于其泛基因型慢性丙型肝炎病毒（HCV）疗法Mavyret（glecaprevir/pibrentasvir）的新数据。来自3b期临床试验EXPEDITION-8的结果
基因测癌：在大数据中酝酿“中国突破”
研制鼻咽癌疫苗，引进国际先进的基因检测平台……我国科学家表示，如果加大对临床试验的数据采集和共享，有望通过基因测序技术让更多癌症患者受益。 中医提倡“治未病”，西医也在研究通过基因提前治病。一批国际知名的生命科学学者和临床医学专家，近日共同交流基因测序的最新研究成果，并探讨如何在临床转化上取
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多专
plos－biology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
中国开放最新家蚕基因组研究数据
“我们通过网络，以开放的姿态与世界共享家蚕基因组最新研究成果”，中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀26日介绍，包含有最新研究数据的中国家蚕遗传数据库目前已收到来自国内外科研人员的访问25万余次。 向仲怀介绍，中国家蚕遗传数据库由西南大学家蚕基因研究团队和深圳华大基因研究院合
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
又一灭绝物种全基因组数据解析
日前，吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据，重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起源
基因大数据走向临床应用，哪些问题要克服？
为了推动基因组研究在临床中的应用，多个国家层面的大规模研究项目已经开启。2014年英国发起了10万人基因组计划，美国和中国也宣布了百万人基因组数据相关计划。许多区域性的大数据计划也在进行中。例如，宾夕法尼亚州的盖辛格健康系统（GeisingerHealth System）和纽约的再生元制药公司合
－英公开埃博拉病毒基因测序数据
一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序，并已将数据在网上公开发布，免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。 剑桥大学３日发布公告称，２０１４年埃博拉疫情在西非暴发后，来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本，并利用美国一家公司开发的新