美国发布《从数据到发现:基因组到健康》白皮书
2014年3月,美国国家数据科学联盟(NCDS)发布了《从数据到发现:基因组到健康》白皮书,以便于解决基因组学面临的重大挑战。该白皮书是通过聚集数据科学领域与基因组学领域的领袖人物,共同探讨当前基因组学的挑战,并集思广益,就最为恰当且技术先进的建议达成的共识。 基因组学能够为数据科学相关研究提供某些美好的承诺。但新发布的白皮书指出,基因组学领域还存在数据来源、收集和管理,界定表型,裁定基因组变异,生物统计学和生物信息学,数据共享和生物伦理与法律六大关键挑战。 数据来源、收集和管理是在不知晓数据将如何被重新利用的情况下维护数据来源,为大数据集的收集和管理提出重大挑战。而由于缺乏标准化的数据元素与协调的数据集,同时缺乏从大型数据集中获取表型数据的相关技术,也使得界定表型问题进一步复杂化。 由于缺乏表型和变异体数据的标准,对变异的界定也十分模糊。另外,由于统计模型和软件不够充分,计算机处理能力不足,运行复杂模型时......阅读全文
国际遗传和医学基因组学大会近日召开
日前,安捷伦科技有限公司作为主要赞助商参与了于6月9日至11日在香港大学举行的国际遗传和医学基因组学大会。该次国际会议由美洲华人遗传学会和香港医学遗传学会在历年分别举办的国际学术会议的基础上首次联合举办。会议吸引了国内外从事遗传学和医学基因组学研究的知名学者参与。诺贝尔奖获得者Oliver Smit
全国玉米功能基因组学研究协作平台建立
近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 中国农业科学院生物技术研究所所长李新海致开
科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”
8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape
GENEWIZ收购Beckman-Coulter基因组学服务业务
分析测试百科网讯 近日,全球领先的基因组学服务提供商——GENEWIZ已经签署收购Beckman Coulter基因组学服务业务的最终协议,该业务提供医疗保健、学术和政府机构的专业的基因组测序解决方案(GS)。 “Beckman Coulter的基因组学服务业务和GENEWIZ的全球战略和扩张
PNAS:从基因组学角度剖析“你幸福吗?”
好的心态会对你的基因产生影响。在首个该类研究中,来自加州大学洛杉矶分校和北卡罗来纳大学的研究人员调查了积极心理状态对于人类基因表达的影响。他们发现,不同类型的快乐对人类基因组的影响有着很大的差异。研究报告在线发表在《PNAS》杂志上。 那些有着高水平实现幸福感(eudaimonic w
单分子遇上基因组学:会擦出什么火花
当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
华大基因携手爱丁堡大学,共促基因组学研究
2012年7月24日,深圳华大基因研究院与英国爱丁堡大学签署合作协议,宣布双方将在基因组领域展开广泛的科研合作,通过汇聚中英两国研究专长,加速基因组学在人类健康和农业及其他相关领域的创新和发展。 在签署的合作备忘录中,双方将着眼于对人类和其他生物的科学认识,通过共同努力,对遗传信息进行深入
Illumina推出全球首个基因组学孵化器
Illumina公司是生命科学工具和遗传变异及功能分析集成系统的领先的开发商、制造商和销售商。它不仅能为基因分型、拷贝数变异分析、甲基化研究、基因表达分析以及DNA、RNA、蛋白质的低复制率分析等提供创新的排序和基于阵列的解决方案,同时,它还为消费者的基因组学和诊断学研究进展提供工具和服务。Il
谢晓亮:当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
治疗鼻咽癌新策略:药物基因组学
鼻咽癌是我国华南地区高发的肿瘤类型,但过往对其癌症发生机制和分子分型的研究较少,因而在鼻咽癌的临床治疗中,尚缺乏有效的精准治疗策略。化疗和放化疗是鼻咽癌治疗常用的手段,尤其是对于中晚期或者癌转移患者。但是,如何为不同类型的鼻咽癌患者提供最佳的个性化药物治疗方案,仍是临床上亟待解决的难题。 澳门
深度解读:个人基因组学的现状与发展
什么是Personal Genomics? Personal Genomics,一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支,主要关注个人基因组的测序和分析。 1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息,综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组
解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据,建立数学模型,并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验,凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料,对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据,其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据,建立数学模型,并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验,凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料,对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据,其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据,建立数学模型,并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验,凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料,对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据,其对象是客观的
2年Science基因组学文章引用次数高达100
据The Scientist报道,一篇发表在Science杂志上的基因组学文章成为基因组学领域热门的文章,从2007年发表后,总的引用次数高达100次。 这篇文章即是:V. Nene et al., “Genome sequence of Aedes aegypti, a major ar
973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展
在973计划的支持下,中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。 黄瓜是最重要
水稻基因组学与农业应用研讨会召开
由华大基因研究院举办的“水稻基因组学与农业应用研讨会”近日在深圳召开。 作为世界上最早种植水稻的国家,水稻一直在我国粮食生产中起着举足轻重的作用。华大基因等国内多家单位曾于2002年率先合作完成籼稻基因组框架图与精细图的绘制工作,并在美国《科学》杂志发表科学专论。
双相情感障碍功能基因组学研究新进展
双相情感障碍(Bipolar disorder,BPD)是常见的重性精神障碍。流行病学发现,BPD具有较高的发病率和死亡率。研究表明,BPD的发生与遗传和环境因素有关。BPD的遗传力为80%左右,表明遗传因素在BPD的发生中起主要作用。全基因组关联研究(GWAS)已报道许多BPD风险基因座(lo
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据,首次对苔类目级系统框架进行了重建,得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员,通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员,深圳华大生命科学研究院联合培养研究
基因组学家Venter融资7000万开发抗衰老新药
美国基因组学家克雷格·文特尔(Craig Venter)称,已融资7000万美元,用以新成立一家生物科技公司,该公司将致力于抗衰老新药的研发工作。 文特尔今天表示,已从投资者那里融资7000万美元,用以成立Human Longevity(以下简称“HLI”)公司。H
宏基因组学:查明微生物身份新手段
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
英国|基因组学和基因编辑:未来的研究方向
英国下议院(House of Commons)的科学技术委员会(Science and Technology Committee)发起对基因组学(Genomics)和基因编辑(Genome editing)的调查,呼吁这些新兴的科学领域的研究能提供其影响人类健康、植物、动物和生态系统的证据。20
王宪辉:“寂寞”基因组学和“爱热闹”蝗虫
中国“天眼”建成启用,“悟空”“墨子”发射成功,“蛟龙”号深海科考,体细胞克隆猴成功培育……自从2013年7月17日习近平总书记视察中国科学院并提出“四个率先”要求以来,中国科学院实施“率先行动”计划、加快改革创新发展,产出了一批具有重大国际影响力的标志性科技创新成果,为实施创新驱动发展战略、
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日,记者从海南大学获悉,该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系,实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域,且无
8位大牛畅谈基因组学的未来
过去几十年已经彻底改变了遗传学和基因组学,那么,下一个十年呢?《PLOS Biology》请了不同领域的8位牛人科学家,谈谈他们的预测。无一例外,所有预测都指向更大规模和更多类型的数据。当然,这些大牛都很乐观,许了遗传学和基因组学一个光明的未来。 Wellcome Trust Sanger研究
基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析
人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
Optalysys光计算发力中国基因组学市场
“国际基因组学大会”由华大基因主办,是基因组学领域最具影响力的国际性学术年会。该盛会不仅汇聚了生物组学的专家泰斗和企业精英进行深入的学术交流,更促进了基因组学领域在全球范围内的合作、创新与应用。今年ICG-12大会更是吸引了全球领先的光计算研发公司Optalysys参加,其公司创始人兼CEO N
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E