美国发布《从数据到发现：基因组到健康》白皮书
2014年3月，美国国家数据科学联盟（NCDS）发布了《从数据到发现：基因组到健康》白皮书，以便于解决基因组学面临的重大挑战。该白皮书是通过聚集数据科学领域与基因组学领域的领袖人物，共同探讨当前基因组学的挑战，并集思广益，就最为恰当且技术先进的建议达成的共识。 基因组学能够为数据科学相关研究提供某些美好的承诺。但新发布的白皮书指出，基因组学领域还存在数据来源、收集和管理，界定表型，裁定基因组变异，生物统计学和生物信息学，数据共享和生物伦理与法律六大关键挑战。 数据来源、收集和管理是在不知晓数据将如何被重新利用的情况下维护数据来源，为大数据集的收集和管理提出重大挑战。而由于缺乏标准化的数据元素与协调的数据集，同时缺乏从大型数据集中获取表型数据的相关技术，也使得界定表型问题进一步复杂化。 由于缺乏表型和变异体数据的标准，对变异的界定也十分模糊。另外，由于统计模型和软件不够充分，计算机处理能力不足，运行复杂模型时......阅读全文
首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世
近日，中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学，开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT，通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法，实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》（Advanced S
安捷伦财政收入:－诊断和基因组学增长快
安捷伦科技公司在周三收市后宣布，其第三财季的收入较去年同期下降4%，但诊断和基因组学部门的收入增加54%。 在截至7月31日的第三财季，该公司总收入达16.5亿美元，低于去年同期的17.2亿美元，但略微高于华尔街预计的16.4亿美元。 按业务部门来分，诊断和基因组
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
张锋等人Cell发表空间基因组学最新成果
如果要观察细胞，我们常常需要显微镜。现在，科学家已经开发出一种方法，可通过细胞自身的遗传物质对细胞进行“拍摄”，进而生成独特的可视化图像。虽然当前该方法生成的图像比传统显微镜图像要模糊，但这种方法或许可以帮助科学家们改进癌症治疗，并探索人类神经系统的形成过程等。 在今日发表于Cell杂志的重磅
蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制
慢性乙肝病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是导致我国肝癌发生的最主要原因，约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程，受到机体的系统性调控，基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响，目前这方面的研究报道较少，亟待深入探究。同时，新药研
单细胞基因组学：通往个体化医疗之门
随着第二代测序技术的普及，单细胞测序迎来了迅猛发展。 近日，南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后，在科学网博客里写道：“这是一个非常令人激动的前沿学术会议，我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。” 他对《中国科学报》表示：“单细胞基因测序技术的突破，只是开了
测序技术发展过快？基因组学千万大奖告吹
X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)，因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。 X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示，这是因为如今
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年，全球人口将达到97亿，预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标，作物产量需每年增长2.4%，但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素，但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
Nature论述：单细胞基因组学揭开“免疫新世界”
人类对生命的好奇，从来没有减退。一个多世纪以来，科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞，从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程，挖掘重要的细胞类型和信号通路。 但是，过去几十年，包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解
大数据能否破解数据造假难题？
林宣雄，1962年9月生，江苏宜兴人，西安交通大学环保大数据研究中心主任。1998年获陕西省优秀青年科技工作者称号，1999年主持研发的“国家环境监理信息系统”被确定为国家级火炬计划项目，同年获省优秀软件人才称号；2003年获首届省优秀青年科技创新奖；2008年承担环境保护部节能减排核心重大软件
分析数据的处理——可疑数据的取舍
1. Q-检验法 （3~10次测定适用，且只有一个可疑数据） （1） 将各数据从小到大排列：x1, x2, x3……xn ; （2）计算 （x大-x小）, 即 （xn -x1）; （3）计算 ( x可-x邻), （4）计算舍弃商 Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1
月桂酸的分子数据和计算数据
分子数据1、 摩尔折射率：59.202、 摩尔体积（m3/mol）：221.23、 等张比容（90.2K）：531.34、 表面张力（dyne/cm）：33.25、 极化率（10-24cm3）：23.47计算数据1、 疏水参数计算参考值（XlogP）：4.22、 氢键供体数量：13、 氢键受体数量：
直读光谱软件在查找数据时弹出数据
WinOE: Information! Maxmumdisplay limit has been reached.答：解决技巧：方法一：打开“我的电脑”C：/ARL-DATA/RESULTS将数据剪切到新建文件夹中退出即可；方法二：WinOEUtilitiesDatabases Res
《中国科学数据》：从根源唤醒沉睡的数据
近年来，因“原始数据丢失，工作无法重复”造成的撤稿事件屡见不鲜。 2020年1月，2018年诺贝尔化学奖得主Frances H. Arnold撤掉了2019年5月发表在《科学》上的一篇论文，原因是缺失了关键的原始数据，致使研究成果无法重复。 “只发表论文不公开研究数据，可能会导致科学研究
青岛能源所发表嗜热菌功能基因组学综述
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所功能基因组团队负责人徐健研究员、助理研究员林璐应邀在Biotechnology Advances发表综述文章Dissecting and engineering metabolic and regulatory networks of thermo
昆明植物所在南方菟丝子基因组学研究中取得进展
自然界绝大部分植物都通过叶片的光合作用和根部的水分和营养吸收维持自养生存，而寄生植物则是一类通过寄生在自养植物上获取能量和营养的植物。寄生植物独特的起源、演化和特殊生理生态长期以来吸引着研究者的目光。旋花科茎寄生植物菟丝子寄生行为在实验室中方便控制和观察，近年来已成为许多探索寄生植物生理生态和进
探秘基因组学－首期兴隆湖科学大讲堂开讲
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499442.shtm1953年4月25日，科学家发现了DNA双螺旋的结构，分子生物学时代被开启，人类通过携带着生命遗传信息的DNA，逐渐揭开了生命之迷。在那之后，越来越多的科学家们投入到关于生命科学、人类
北方药用物种基因组学转化研究中心成立
在10月23日，中国北方药用物种基因组学转化研究中心正式揭牌，这标志着我国药用物种基因组学转化研究进入到一个新的发展阶段。 该中心是由中国科学院北京基因组研究所和吉林紫鑫药业股份有限公司共同发起建立的集基础研究、资源保护和应用开发为一体，以长白山脉传统中草药相关生物物种为对象，以加速中医
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
原文： Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities 原文链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/
安第斯皇后凤梨保护基因组学研究获新进展
中国科学院华南植物园研究员葛学军团队与乌普萨拉大学教授Martin Lascoux合作，在安第斯皇后凤梨保护基因组学研究方面取得新进展。他们利用重测序技术对来自秘鲁的9个群体，共计200个安第斯皇后凤梨个体进行研究。相关成果近日发表于《新植物学家》（New Phytologist）。安第斯皇后凤梨。
基因组学北京市重点实验室正式启动
2011年12月5日，ABO成员北京诺赛基因组研究中心有限公司暨国家人类基因组北方研究中心承担的“基因组学北京市重点实验室”正式启动。同时组建了包括沈岩院士、程京院士、贺福初院士等6位院士在内的第二届国家人类基因组北京研究中心学术委员会。 基因组学重点实验室将整合高通量测序和以“云计
非洲受到3700万美元资助启动基因组学项目
一个主要目标是建设非洲遗传学家的能力 在人类基因组的首张草图完成10年之后，非洲希望用6月22日宣布的一项伙伴关系加入到基因组学革命中来。 由美国国立卫生研究院和英国医学慈善机构威康信托基金会资助的价值3700万美元的非洲人类、遗传与健康项目（H3Africa）将让非洲科研人员在
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优，国际市场上的商品名为“medang”，和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群，但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日，中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar
2023年，基因组学革命“狂飙”到了哪一步？
2023年4月25日是DNA双螺旋结构发现70周年纪念日。70年前科学家的这一发现，将生物学研究带入分子时代。携带着生命遗传信息的DNA，以如是美妙的姿态，于纳米级的空间内，传递着生物世界变化万端、生生不息的奥秘。对生命科学史而言，2023年还别具意义——80年前，诺贝尔物理学奖获得者埃尔温·薛定谔
细胞核重编程与癌症基因组学论坛召开
近日，由《自然—遗传学》杂志主办、中科院广州生物医药与健康研究院承办的“细胞核重编程与癌症基因组学”论坛在广州召开。 据了解，在干细胞研究中，诱导多能干细胞的重编程是该领域最受关注的问题之一。目前，干细胞研究和肿瘤研究存在很多交叉。将这两个领域的研究结合起来，有利于更好地使再生医学得以应用并辅
基因组学北京市重点实验室在京揭牌
随着基因检测技术的飞速进步，基因检测逐渐走入我们的生活，“滴血验癌”“基因分析预测疾病”等提法屡见不鲜，有些公众愿意做第一批“吃螃蟹的人”，而有些公众对此持怀疑态度。基因组学北京市重点实验室12月5日在京揭牌，这个实验室将来会做些什么工作?对推动我国基因检测技术及应用的发展能起到什么作用?未来基
科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
肺癌是全球癌症致死的首位原因，而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%，是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型，5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比，小细胞肺癌的治疗手段单一，患者总生存率低。分子表征与组学研究不足，限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展，迄今为止，仅有少量针对小细胞肺癌临
科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
肺癌是全球癌症致死的首位原因，而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%，是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型，5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比，小细胞肺癌的治疗手段单一，患者总生存率低。分子表征与组学研究不足，限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展，迄今为止，仅有少量针对小细胞肺癌临床样
非洲基因组学研究有助制定精准公共卫生政策
过去5年，国际基金组织已经投资了超过1亿美元的项目来推动非洲基因遗传学研究，有望借此改善对非洲人以及在欧洲和美洲的非洲人后裔的治疗手段。现在，第一轮7000万美元资助发放完毕后，英美两国共同发起的“非洲人类遗传与健康计划项目”第二轮6400万美元项目资金正在接受申请。 虽然有人认为，这笔钱应该
脑胶质瘤MRI影像基因组学研究进展
脑胶质瘤是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤，约占所有中枢神经系统肿瘤的27%，原发性中枢神经系统恶性肿瘤的80%。近年来，肿瘤诊断正从组织学层面转向分子遗传学层面。2016年世界卫生组织（World Health Organization，WHO）中枢神经系统肿瘤分类、分级标准修改版仍将脑胶质瘤分