科学家成功绘制虹鳟鱼完整基因组
法国科研人员最近完成了虹鳟鱼基因组的完整测序，并发现虹鳟鱼基因组较好地保留了1亿年前一次重要进化事件的遗迹，可以帮助了解脊椎动物的进化历程。 虹鳟鱼属鲑科，原产于北美洲太平洋沿岸。它肉质鲜美，在全世界被广泛养殖，同时也是被科学家研究最多的鱼类之一。 来自法国国家农学研究中心、国家基因测序中心等多家机构的科研人员在最新一期英国《自然—通讯》杂志上刊登了研究报告。这是科学界首次发布鲑科鱼类的完整基因组测序。 大约1亿年前，虹鳟鱼基因组经历了一次罕见的“全基因组倍增”，也就是整个基因组复制出一个副本的现象。全基因组倍增对生物进化有着深远影响，但大多数已知的这类事件非常古老，往往有2亿年到3亿年历史，留下的痕迹不明显。 虹鳟鱼的这次全基因组倍增发生得相对较晚，为深入研究这类现象提供了一个独特的机会。分析显示，经过1亿年的进化，虹鳟鱼基因组里的“原版”和“副本”仍非常相似。 科研人员说，这两部分不仅整体结......阅读全文
榕属叶绿体基因组比较研究获进展
近年来，叶绿体基因组因基因组小、突变率和重组率低的特点，被广泛用于植物系统发育、分子进化、谱系地理学的研究。榕属（Ficus）作为桑科的最大属，且是热带雨林的关键物种，而其系统发育关系仍需进一步研究。榕属物种具有多样的生态型，体现了对不同生境的高度适应性。尽管近年来关于榕属叶绿体基因组的研究有所
大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日，国际癌症基因组协会（ICGC）在著名的《Nature Communications》杂志，发表了一篇令人瞠目的文章，它为即将到来的癌症基因组学研究时代，奠定了基础。该项目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
作物基因组学研究进展（一）
作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１8年度主要农
研究揭示水稻基因组－“垃圾－DNA”－的真相
对于动植物的 DNA 来说，仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质，进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后，便不再继续翻译，这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”， 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。 近十年来，随着探索未知的技术的进步，这些所谓 “垃圾 DNA
作物基因组学研究进展（二）
⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一，小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响，小麦生产面临严峻的挑战，对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ Ｌ．）是３个不同亚基因组形成的异源
德国基因组研究资源中心将关闭
德国基因组研究资源中心（RZPD）日前宣布，将在7月底终止服务，并且ImaGenes和Atlas生物实验室（Biolabs）将会结果它的大部分服务内容。关闭的原因尚未公布。 这个以柏林和海德尔堡为大本营的非营利性机构通过Affy公司的欧洲代理商NimbleGen提供Affy公司芯片服务。该中心宣布
基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据，并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基
基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展
与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联 日前，中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema
上海消保委开会讨论“三文鱼”定义
将淡水虹鳟鱼归为三文鱼——一则《生食三文鱼》团体标准的发布，引发社会各界广泛争议。昨日，上海市消保委对“三文鱼之争”召开公开讨论会，申城人大代表、水产专家、知名律师纷纷提出质疑，而标准制定方中国水产流通与加工协会代表也主动来沪“应战”，对公众疑问进行了解释。 俗称定义应保持不变 上海海洋大学
批发价只有三文鱼一半的虹鳟鱼－最近也自称“三文鱼”了
连日料大厨都难以分清 市民们表示无法区分 李光（化名）是杭州一家著名日料连锁店的主厨，对于他来说，最近听到最多的一个词就是虹鳟鱼，这种在此前被排除在三文鱼家族之外的鱼类，正在被不少水产批发商所提及。 本周二上午，记者带着从水产市场买来的虹鳟鱼和三文鱼来到李光的店里，从业近十年的他坦言这是自
基因组所国际合作项目椰枣基因组测序及功能研究获进展
最近，由中国科学院北京基因组研究所与沙特阿卜杜拉国王科技城(King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST)共同启动的合作项目“枣椰 (Phoenix dactylifera L.)基因组计划”获得系列进展，本月初其标志性研究—
杂交稻基因组学研究获进展
中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队，在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展，2月5日，相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 据介绍，杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
重庆市桑树基因组研究取得显著成果
在向仲怀院士的带领下，家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)何宁佳教授领衔的研究小组联合浙江省农业科学院、广东省农业科学院、中国林业科学研究院和深圳华大基因研究院等单位的专家，历时三年完成了桑树基因组研究，取得了一系列重要发现。一是确证了桑树染色体基数为7，这是百余年来，对桑树学科发展最重要
陈亮小组茶树功能基因组研究取得进展
我国只有不到25%的茶园栽种经过改良的品种 茶树是一种重要的经济植物，由于其自身特性的限制，茶树分子生物学尤其是功能基因研究相对迟缓。在国家自然科学基金等的资助下，中国农业科学院茶叶研究所研究员陈亮率先展开茶树功能基因组、茶树分子标记研究，从更深层次上认识茶树生长发育、起源、
英国基因组学研究进展迅速
随着基因数据的逐渐增多，临床医生能够更好地治疗患者，同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service，NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。 近日，英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
国际研究小组完成多细胞团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学7月9日报告说，一个国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物，一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、加拿大和日本科研人员组成
基因组研究揭示藏彝走廊居民复杂起源
中国西南山区是中国民族最多样化的地区之一。在迄今为止对当地居民进行的最全面基因分析中，研究人员揭示，这些族群的居住和迁徙历史比之前得出的结论更复杂。相关研究4月26日发表于《细胞报告》。藏彝走廊——以该地区的两个主要民族命名，位于中国青藏高原的东部边缘，被认为是民族迁徙和多样化的重要地区。藏彝走廊拥
SARS病毒基因组复制机制研究获突破
近日，武汉大学生命科学学院教授郭德银领导的研究组以选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标，通过酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析，发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性，一是参与RNA 5’-端加帽的N7-甲基转移酶，二是进行RNA
科学家质疑全基因组关联研究意义
外围遗传突变对疾病影响甚微 全基因组关联研究通过大量人群寻找与疾病或性状相关的DNA变异 对于某种疾病而言，当比较足够多的患病与不患病人群基因组后，与疾病相关的遗传变异便有可能脱颖而出。这也是全基因组关联研究（GWAS）背后运行的哲学——十多年来，研究人员利用它来寻找包括精神分裂症和类风湿
诺奖得主Nature发布基因组研究重要成果
一个国际科学家小组完成了对章鱼（octopus）的基因组测序，发现了与章鱼不同寻常的生物学，包括它能够改变皮肤的颜色和纹理，及分散的大脑使得它的8条手臂能够独立移动相关的一些基因。 该研究小组测序并注释了常见的加州两斑章鱼(California two-spot octopus)。这项研究是由
中国科学家主导完成梨基因组研究
由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 2012年11月13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定
Science：三项鸟类全基因组测序研究
目前，一个国际科学家小组完成了一项迄今为止最大的动物全基因组研究。为了构建鸟类的生命树，研究小组测定、组装和比较了48种鸟类的全基因组，这些鸟包括鸵鸟、蜂鸟、乌鸦、鸭、猎鹰、鹦鹉、鹤、朱鹭、啄木鸟和鹰，囊括了现代鸟类的所有主要分支。作为鸟类系统基因组学财团（由来自20个国家80家机构的200多名
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员，发现了一个机制可以解释：一些遗传突变在一种基因组中会致病，而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》（Nature）杂志上的研究论文中，研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。
家蚕基因组甲基化谱研究获突破
我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱 由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”，5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》（Nature Biotechnology）上发表，这是中国科学家
A188玉米自交系基因组的研究取得突破
近日，中国农业科学院作物科学研究所作物基因组选择育种创新团队与美国堪萨斯州立大学合作，对玉米重要自交系A188的基因组进行了组装。该研究在高质量的基因组组装基础上，深入解析了玉米愈伤组织的基因表达和DNA甲基化特征，并利用比较基因组方法揭示了基因组结构变异对玉米性状的重要影响。相关研究成果在线发
研究团队合作发布白木香基因组精细图谱
近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所崔鹏团队合作发布了白木香基因组精细图谱，相关研究结果已发表在GigaScience期刊。该基因组精细图谱的发布将为野生白木香种群保护生物学、沉香结香机制和香味基因及树种的进化研究奠定良好基础，也为进一步基于基因组的白木
中国科学家完成梅花基因组研究
2012年12月28日，由北京林业大学、深圳华大基因研究院及北京林福科源花卉有限公司等多家单位合作完成的梅花基因组研究成果在《自然• 通讯》(Nature Communication)杂志上在线发表。该研究解析了梅花相关种属的进化起源及其相关性状的分子机制，为进一步探究蔷薇科植物的进化关
研究发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系，其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进