韩敬东研究员Cell子刊探讨“垃圾”DNA

人类基因组上含有大量的反转录元件,其中Alu序列的拷贝数最多,在灵长类基因组上有超过100万份拷贝,约占到人类基因组总长度的10%,仍然目前对于Alu元件的功能仍知之甚少。来自中科院上海生命科学研究院的研究人员在新研究中证实,一些Alu元件朝着增强子方向发生了演化。这一研究发现发表在《Cell Reports》杂志上。 中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所所长的韩敬东(Jing-Dong J. Han)研究员是这篇论文的通讯作者。其主要研究方向包括:研究生物网络的结构、动态及其功能;利用功能基因组学数据,寻找疾病有关的基因及进一步研究其病理作用;以及探求遗传基因网络中内在的完全稳定机制。 所有动物都有大量冗余的垃圾DNA,它们和其他DNA一样,都是遗传材料,但不能编码用于建造动物身体、加速细胞内化学反应的蛋白质。在我们的基因图谱中,实际上只有2%的DNA能够编码蛋白质。1972年,已故遗传学家大野乾(......阅读全文

基因组DNA文库构建必备实验技巧2

技术支持资料:材料缓冲液和溶液- 碱裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制碱裂解液I 约100ml,灭菌,保存在四度。- 碱裂解液II,新鲜配置,室温保存0.2 N NaOH (从10N的NaOH新鲜制备)1% (

Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验

放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交试剂、试剂盒预杂交液SSCSDS仪器、耗材硝酸纤维素滤膜实验步骤1. 准备适合即将进行的工作的杂交溶液。每平方厘米硝酸纤维素滤膜或尼龙膜大约需要 0.2 ml 预杂交液。预杂交液:用于检测低丰度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard

磁珠法提取基因组DNA的原理

(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生

GenStar基因组DNA提取纯化产品选择指南

基因组DNA相对稳定,故其提取方法也相对简单。通常细胞通过表面活性剂处理,释放出基因组DNA,经过蛋白酶和RNA酶消化后,经有机溶剂抽提和乙醇沉淀或过柱纯化即可获得一定量的基因组DNA。目前商品化的基因组DNA提取试剂盒分为溶液型和离心吸附柱型两种。溶液型产品价格经济,产率高,可获取适用于建立文库的

微量基因组DNA提取试剂盒说明

本试剂盒提供了高效、快速从各种微量生物样本中纯化得到较高浓度基因组DNA的方法,例如:微量血液、细胞、动物组织、干燥血迹、临床棉签、毛囊等。采用本公司特有的DNA-only硅胶膜离心柱和配方,搭配Foregene Protease,可以在20-80分钟提取到较高浓度、高质量的基因组DNA。专

基因组DNA文库构建必备实验技巧1

基因组DNA文库用途十分广泛,如用于人类及动植物基因组学研究,基因表达调控研究,分析、分离特定的基因片段等。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为四大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。一、分离基因组DNA(gDNA) 毫无

酵母菌基因组DNA的提取实验

基本方案             实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒

哺乳动物中制备基因组DNA实验

实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1.  切下组织并立即剪成小块,置于液氮中冻结。 2.  将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用锤子将其捣为细粉末,每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.  

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

人类生物基因组DNA可以分为哪几类?

1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异,在人类细胞基因组中,这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列,一般在基因组中只有一个拷贝(单一基因),然而,也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况,这些都来自于从基因家族里派生出来

如何从粪便中快速提取基因组DNA

粪便基因组DNA快速提取方法,无抑制物,可直接做PCR。采用硅胶膜技术从新鲜或冷冻人类粪便或其他样品类型(混有高浓度的PCR抑制剂)中抽提多至30μg 的基因组、细菌、病毒和寄生物DNA。独特的吸附树脂配合经优化的缓冲液可去除PCR抑制剂。方便的Aidlab 离心柱纯化过程只需40分钟,用于

BIOG血清、血浆游离DNA提取试剂盒(病毒基因组DNA提取)...

BIOG血清、血浆游离DNA提取试剂盒(病毒基因组DNA提取)使用说明特点◎操作简便快速,可在半小时内获得理想的DNA;◎提取DNA纯度高,无抑制剂,A260/A280为1.7-1.9;◎产量更高,较国内同类产品高出20%;◎可用于血清、血浆等游离样本中DNA的提取;◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂,安全

粪便基因组DNA提取试剂盒(Stool-DNA-Extraction-Kit)使用说明

粪便基因组DNA提取试剂盒(Stool DNA Extraction Kit)存储室温(15℃-25℃) 干燥保存,有效期12个月,2℃-8℃保存时间更长。【注】试剂盒开封后溶液A、B 、C 、D 需在2-8℃保存。货号&规格YJ0219-50 | 50TYJ0219-100 | 100T产品组分试

逆转录元件发生反向剪接插入DNA过程的原理与结构基础

  逆转录元件是一种以RNA为媒介,通过“copyand paste”的方式在基因组中不断扩增的基因元件【1,2】。在哺乳动物基因组中有超过45%的遗传成分都是逆转录元件,因此逆转录转座事件如果在不恰当的地方发生就会导致基因紊乱或者基因疾病等严重后果【3】。  II组内含子(Group II int

衍射光学元件(DOE元件)在医疗美容中的应用

介绍 随着激光技术的使用成为医学和美容治疗领域中更不可或缺的工具,在基于激光的医疗设备中操纵光束输出的能力变得越来越重要。衍射光学元件(DOE)通过允许以多种方式操纵光束,提供了独特的解决方案,同时重量轻,薄而紧凑。 皮肤修复 皮肤重铺包括广泛的治疗方法,旨在使皮肤外观免受许多因素造成的瑕疵的影响,

DNA重组广泛存在人类基因组中

科技日报北京7月26日电 (记者张梦然)日本理化学研究所综合医学科学中心科学家主导的国际合作研究发现,在人类每个细胞的基因组中,重复数百万次的特定基因组序列重组普遍存在于正常细胞和疾病状态的细胞中。确定这种曾被认为是“垃圾”的DNA序列的重组机制,对于了解人体细胞如何发育以及是什么导致它们“生病”至

如何使用离心机提取植物基因组DNA

   如何使用离心机提取植物基因组DNA植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样?植物组织提取基因组DNA 一、材料www.runwelltac.com 幼嫩叶子。 二、设备 移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50ml离心管(有盖)及5ml和1.5ml离心管,

从全血中纯化基因组-DNA-实验方法

试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%,室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

试剂、试剂盒 ddH20Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶 dNTP质粒 DNAPCR 引物仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂ddH202. 酶和酶缓冲液10X Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各

关于全自动基因组DNA测序仪的简介

  全自动基因组DNA测序仪是一种用于基础医学领域的分析仪器,于2010年6月21日启用。  1、技术指标:  3130xl 采用 16 道毛细管,3130 系统采用 4道毛细管 · 24 小时无人监控操作 · 仪器设置更方便更简单 · 新型自动灌胶系统进行灌胶 · 检测池加热器改进了温度控制 ·

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材 热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal

海洋不同生境总基因组DNA的提取

实验概要本实验采用NaI/玻璃粉方法、溶菌酶与蛋白酶K/离心吸附柱方法以及试剂盒PowerSoil  DNA Isolation Kit (MO BIO  Laboratories,Inc.)三种方法对海洋岸边土壤、海水以及沉积物三种样品进行DNA抽提。为比较不同方法的抽提效果,采用分光光度计对DN

以硅膜为基础分离基因组-DNA-实验

硅化学法已成为从小鼠尾剪取物、动物组织和组织培养细胞等样品中纯化高质量基因组 DNA 的方法之一。Wizard SV 基因组 DNA 纯化体系是利用一个充有固相硅的滤膜来纯化 基因组 DNA 的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒PBSNa2 HP04KH2P

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

在该方案中,用限制性内切酶的混合物处理人类基因组 DNA(内切酶混合物的识别位点为 4bp),产生大概 50〜500bp 的片段。最终使用这一类型的表达文库,是通过利用表型的和生化的筛选方法,分离编码功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶处理后,基因组 DNA 片段成为平末端,然

从全血中纯化基因组-DNA-实验方法

用于从全血(10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除,随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A

植物基因组DNA的RFLP多态性分析

一、原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的不同个体之间。RFLP多态性是指DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(restniction fragment length olymophorphism)。由于碱基顺序的差异,在不同的

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材

以硅膜为基础分离基因组-DNA-实验

            试剂、试剂盒 PBS Na2 HP04 KH2PO4 NaCl KC1 消化液 MasterMix 蛋白酶 K

方法三:酵母菌基因组DNA的提取

方法三:酵母菌基因组DNA的提取一:仪器:同方法一二:试剂:SE缓冲液(1M山梨醇,0.1MEDTA pH7.5);溶菌酶(50mg/ml);20%PVP;蛋白酶K缓冲液(10mM Tris pH7.6  0.5% SDS 1mM EDTA);其余同前三:操作 1.5ml  对数生长期细菌细胞