韩敬东研究员Cell子刊探讨“垃圾”DNA
人类基因组上含有大量的反转录元件，其中Alu序列的拷贝数最多，在灵长类基因组上有超过100万份拷贝，约占到人类基因组总长度的10%，仍然目前对于Alu元件的功能仍知之甚少。来自中科院上海生命科学研究院的研究人员在新研究中证实，一些Alu元件朝着增强子方向发生了演化。这一研究发现发表在《Cell Reports》杂志上。 中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所所长的韩敬东(Jing-Dong J. Han)研究员是这篇论文的通讯作者。其主要研究方向包括：研究生物网络的结构、动态及其功能;利用功能基因组学数据，寻找疾病有关的基因及进一步研究其病理作用;以及探求遗传基因网络中内在的完全稳定机制。 所有动物都有大量冗余的垃圾DNA，它们和其他DNA一样，都是遗传材料，但不能编码用于建造动物身体、加速细胞内化学反应的蛋白质。在我们的基因图谱中，实际上只有2%的DNA能够编码蛋白质。1972年，已故遗传学家大野乾(......阅读全文
激素应答元件
中文名称激素应答元件英文名称hormone response element定 义基因的启动子或增强子中能与细胞核内的激素受体相结合的DNA序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
血清应答元件
中文名称血清应答元件英文名称serum response element;SRE定 义血清及生长因子诱导基因表达时，基因启动子中的一段DNA序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
光学元件清洁
在购买光学元件后，行之有效的保养可保持其质量并延长其使用的寿命。选择合适的清洁产品和使用适当的方法与清洁元件本身同样重要。不当的清洁方法可 能会损坏如光学透镜，反射镜，过滤器或光栅等使用的光学产品抛光的表面或专业膜，降低几乎任何应用的性能。另外，在清洁光学产品时，请注意您的衣服和您的 环
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
Southern 印迹 放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交 实验方法原理 硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强，当电泳后凝胶经过DNA变
知识分享：动物细胞基因组DNA提取
实验原理 真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
为了进行 FDD 基因表达的分析，以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术，在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前，必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
基本方案2－基因组－DNA－的扩增
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒4dNTP 混合物10 X PCR 扩增缓冲液寡聚核苷酸引物Taq DNA 聚合酶矿物油筛（子）琼脂糖DNA 分子大小标准参照物仪器、耗材聚丙稀微量离心管循环变温加热器实验步骤
使用离心机提取植物基因组DNA
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样？植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器，冷冻高速离心机，台式高速离心机，水浴锅，陶瓷研钵，50ml离心管（有盖）及5ml和1.5ml离心管，弯成钩状的小玻棒。（这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的，可以一机配多种
Science：宏基因组研究挑战DNA编码规则
人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的，例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示，自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队，获得来自1776种环境（包括17个人体区域）的微生物宏基因组数据，以便在其中寻找重编
磁珠法提取基因组DNA的原理
(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂，可使动植物的细胞裂解，并使与DNA结合的蛋白质变性，DNA游离释放，磁球可以特异地吸附DNA，通过洗涤，去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质，再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA，得到纯度和浓度均很高的DNA，可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生
植物组织制备基因组DNA实验——CTAB法
实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中， 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部， 从而达到提取的目的。实验材料植物组织试剂、试剂盒CTAB液2-疏基乙醇TE高盐TE氯仿异戊醇仪器、耗材研钵离心机培养箱实验步骤1. 在所需量
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
磁珠法提取基因组DNA的原理
a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂，可使动植物的细胞裂解，并使与DNA结合的蛋白质变性，DNA游离释放，磁球可以特异地吸附DNA，通过洗涤，去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质，再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA，得到纯度和浓度均很高的DNA，可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生物
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
实验材料 基因组 DNA试剂、试剂盒 限制性缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 1. 7~20 μg 基因组 DNA 稀释到 500 μl 合适的限制性缓冲液中。4℃ 过夜。2. 每管加 10~20 单位限制性酶。孵育 4~6 小时。10 μl 消化液在小琼脂糖凝胶上电泳检测消化的程度。如果需要，
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中，真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接，形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理
从总－RNA－中除去基因组－DNA－实验
试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿（3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性（甲醛)琼脂糖凝胶（配制过程见第 18步）
磁珠法提取基因组DNA的原理
(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂，可使动植物的细胞裂解，并使与DNA结合的蛋白质变性，DNA游离释放，磁球可以特异地吸附DNA，通过洗涤，去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质，再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA，得到纯度和浓度均很高的DNA，可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生
小鼠基因组DNA抽提操作规程
一、原理与意义先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解，然后用蛋白酶去除其中的蛋白，再用氯仿一次抽提（无需用酚抽提）、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇再沉淀即可得到完整DNA。该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA。抽提出来的DNA能用于几乎所
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中，真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接，形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体
酵母基因组DNA的玻珠制备法
实验概要本实验利用玻珠制备法制备了酵母基因组DNA。主要试剂无菌水，裂解缓冲液，5mol/L NaCl，苯酚，氯仿：已戊醇(24：1)，乙醇，TE缓冲液，EDTA-Sark，蛋白酶K，5mol/L醋酸铵主要设备摇床，玻璃离心管，台式离心机，玻珠，振荡器，P-1000移液器，1.5ml离心管实验步骤1
基因组DNA提取纯化的注意事项
大多数动物组织可以用裂解缓冲液和蛋白酶/蛋白酶 K 进行高效裂解。在加入裂解液之前需要将组织切成小块，有条件的话建议使用 TissueLyser 或研钵等提前进行均质化。骨骼肌，心脏，皮肤等组织含有收缩蛋白，结缔组织和胶原蛋白，所以利用蛋白酶 / 蛋白酶 K 进行充分消化是必须的。FFPE
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中，真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接，形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶牛小肠碱
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织 试剂、试剂盒
研究揭示水稻基因组－“垃圾－DNA”－的真相
对于动植物的 DNA 来说，仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质，进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后，便不再继续翻译，这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”， 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。 近十年来，随着探索未知的技术的进步，这些所谓 “垃圾 DNA
癌基因转化细胞：基因组DNA转染法
实验概要 癌基因转化细胞实验步骤1．提取基因DNA（含癌基因）。2．DNA准备：取供体DNA50～100微克，加3M NaCl或醋酸钠使最终浓度至0.3M混匀。3．再加2倍体积无水乙醇，3000转/分离心10分钟，去上清。4．加入转染缓冲液，待DNA充分融解后，再加入2.5M CaCl2，令最终浓度
研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相
对于动植物的DNA来说，仅有不到5%能够翻译成蛋白质，进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后，便不再继续翻译，这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”， 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。 近十年来，随着探索未知的技术的进步，这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。
酵母菌基因组DNA的提取实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1. 1.5 ml 对数生长期细菌细胞。2. 离心，12 000 rpm，1-2 min。3.
植物基因组总DNA的分离———SDS法
实验方法原理SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料植物新鲜叶片试剂、试剂盒液氮提取缓冲液(用前加入)20%S
植物基因组总DNA的分离———SDS法
实验方法原理 SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料 植物新鲜叶片试剂、试剂盒 液氮提取缓冲液(用前加入)2