教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质沉淀数据和表观遗传学修饰等。使用者可以选择多种显示模式，以heat map、柱状图、散点图或其他形式查看他们的数据。更为吸引人的是IGV的使用是免费的哟！测序数据reads通过与参考基因组比对可以直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变，还可以查看拷贝数变化、染色质沉淀数据和表观遗传学修饰等。前期准备工具：IGV软件参考基因组：例人参考基因组Homo_sapiens_HG19.sorted.gtf测序数据文件：例bam、bw等一、IGV下载及安装1.请打开您常用的浏览器，在http://www.broadinstiute......阅读全文
教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染
必备技能！云序生物教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质
巧用荧光成像，实现肿瘤干细胞的可视化治疗
众所周知，肿瘤由各种不同类型的细胞构成，目前我们还不清楚光动力检测是否能够识别肿瘤内部的所有细胞。 肿瘤干细胞（Cancer stem cells ，CSCs）是一种极其重要的、具有自我更新能力的肿瘤细胞。它们是影响肿瘤进程和放/化疗抗性的主要细胞类型，也是导致治疗后肿瘤复发的主要原因。评估以
教你轻松搞定血气分析
目前，血气分析已被广泛应用于临床各科，特别是在危重病人抢救中占重要地位。它有助于了解病情、鉴别诊断、观察疗效和估计预后。通过血气分析，能对病人的通气功能，换气功能主要是缺氧和二氧化炭潴留情况,及机体的酸碱状态，电解质紊乱的程度有一个较全面的了解。同时，PH值是估计预后的主要特征之一，即pH值愈低，纠
教你轻松看懂凝血常规
一、凝血酶原时间（PT） 1、正常参考值：12-16秒。 2、临床应用：凝血酶原时间是检查外源性凝血因子的一种过筛试验，是用来证实先天性或获得性纤维蛋白原、凝血酶原、和凝血因子Ⅴ、Ⅶ、Ⅹ的缺陷或抑制物的存在，同时用于监测口服抗凝剂的用量，是监测口服抗凝剂的首选指标。据报道，在口服抗凝剂的过程
新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日，中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台，实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者，硕士研究生黄沛霖为第二作者，南开大学计算机学院刘健教授
多功能植物小RNA分析工具|一站式小RNA分析及可视化
日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要调控分子。目前已有的分析工具多数依赖于命令行环境，
科学家开发一款多功能植物小RNA分析工具
近日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。 sRNAminer软件整体功能概览。课题组供图 据介绍，植物小RNA是植物生长发育和营养繁殖过程的重要
怎样巧用离心机呢？小析姐教你几招。。
目前，实验室常用的是电动离心机，因其转动速度快，要注意安全，特别要防止在离心机运转期间，因不平衡或试管垫老化，而使离心机边工作边移动，使其从实验台上掉下来，或因盖子未盖，离心管因振动而破裂，玻璃碎片旋转飞出，造成事故。因此，使用离心机时，必须注意如下操作： （1）离心机套管底部要垫棉花或试管垫
教你巧用万用表测量大值电阻
31/2位和41/2位数字万用表电阻档的最大量程一般是20MΩ。对于31/2位数字万用表而言，使用不同的电阻量程也只能测量0.1Ω～19.99MΩ范围内的电阻；而对于41/2位数字万用表，则只能测量0.01Ω～19.999MΩ范围内的电阻。当被测电阻Rx≥20MΩ时，仪表将显示溢出符号“
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究（一）
从表达谱至海绵机制完美进阶，教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读：禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属，慢病毒亚科的家族成员，可引起禽类多种肿瘤性疾病，如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症，以及禽类骨髓白血病，导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究（二）
3.gga-miR-373 通过与YAP1的3’UTR区结合负调控YAP1的表达，并且过表达gga-miR-375可减弱EMT生信预测揭示YAP1是gga-miR-375的潜在靶基因，进一步的双荧光素酶报告基因证实了gga-miR-375可通过结合YAP1的3’UTR区抑制YAP1的表达；在体外细胞
教你几招轻松区分粪类圆线虫和钩虫
寄生虫一直在我们身边，并没有那么遥远。虽然不如解放初期那般泛滥，现如今其实也并不少。本人虽然工作很多年从来没找到过，但是在丁香园论坛和群里面各位同行发现了不少。地域性也是比较强，广东、广西、云南等地寄生虫发现率还不算低。 其中以蛲虫检出率最高，甚至可以在大便中见到成虫，镜下也可以见到成
光子的量子纠缠实现快速可视化
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507000.shtm
新年大扫除！化学妹子教你如何轻松搞定
新年将近，又快到了年底“洗旧迎新”大扫除的时候。一个清新、干净的家庭环境无疑会让全家人新年过得更放心、更舒心！化学妹子带来了一些大扫除清洗时的小窍门……大家赶紧get起来吧。 【任务一】：清洗大件窗帘 窗帘，因拆洗不方便，往往年底才洗一次，灰尘与污垢自然积得比较多，成为大家年底洗涤的头等大事
轻松实现液相色谱的方法转换（二）
然后将方法转换到填充1.7μm填料的内径为2.1mm 的BEH C18 柱上。为了保持两个柱子上的线速度相同，将流速减小到0.22 ml/min，同时将进样量从2μl减少到0.8μl，压力为380bar。为了补偿延迟体积的差异，在梯度中引入了0.5min的初始持续时间。这些条件下的结果与用
轻松实现液相色谱的方法转换（一）
图1. 从Agilent 1200系列LC系统到Agilent 1290 Infinity LC系统的方法转换。 本文对Agilent 1290 Infinity液相色谱系统用于测定盐酸胃复安药物制剂中的杂质和有关物质的性能进行了评价。1200系列HPLC系统上的常规LC方法很
人类中心粒组装实现可视化
沿着纵轴切割并从上方观察的人类中心粒模型。瑞士日内瓦大学科学家将高分辨率显微镜和运动学重建技术相结合，成功实现人类中心粒组装过程可视化。发表在《细胞》杂志上的这项研究，阐明了中心粒组装的复杂性，为研究其他细胞器开辟了新途径。中心粒是细胞内的一种桶状结构，由多个蛋白质组成。这些蛋白质的突变可引起一系列
增强的金属检测软件轻松实现了产品切换
为使数量不断增加的食品制造商提高加工生产线的灵活性，梅特勒-托利多金属检测开发了 Profile 金属检测系统软件。新软件提高了对于含水分食品和干燥食品的检测灵敏度，通过使用 Profile 金属检测机现有的“产品聚类”功能，它简化了产品切换，并使制造商可以在单一频率设置上加工各种产品。
教你轻松应对全自动凯氏定氮仪的常见故障
在调查饲料营养价值时，检测饲料中的氮含量是基础工作之一。只是饲料氮含量怎么检测，我们经常使用的测氮仪器主要是半自动凯氏定氮仪和全自动凯氏定氮仪，其中全自动凯氏定氮仪应用更多。但是全自动凯氏定氮仪在使用的过程中，常会出现一些问题，如果用户不懂得处理，将会大大影响我们的使用效果，下面我们就主要来了解一下
比率荧光探针实现可视化检测农药残留
近期，中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所研究员蒋长龙团队在氨基甲酸酯农药和有机磷农药残留分析检测方面取得新进展。研究设计制备了两种高效的比率荧光纳米探针，并结合智能手机的颜色识别器，实现对食品和环境水体中农药的可视化定量检测。相关研究成果发表在《化学工程杂志》（Chemical Engi
活细胞RNA检测－一步轻松实现
一提到RNA的检测，大家的脑海中可能会立即浮现出：RT-PCR、FISH、Northern blot等。的确，这些都是检测RNA的经典方法，但它们需要裂解、固定、RNA抽提等，颇为繁琐。其实，RNA的检测完全可以更smart。默克密理博最新推出的SmartFlare™ RNA“灵光”技术
中药制丸机出现故障了？本文教你如何轻松分析与应对！
中药制丸机可生产蜜丸、浓缩丸、水蜜丸、水丸包括丸状食品。适用于小型药厂、大中型药厂试制室、中医药研究所、医院、私人诊所、中药店、名贵滋补品现场加工销售点、整机采用不锈钢制作，符合GMP标准。且体积小，耗能低，效率高，噪音小，无污染，操作简单，安全可靠，本机采用220V照明电，取电极为方便。
单分子测序轻松升级参考基因组
现代基因组学的最大需求之一，就是得到人类和模式生物的高质量完成基因组。目前，人们利用二代测序技术对越来越多的物种(从原核生物到真核生物)进行了基因组测序，取得了许多重要的研究成果。 不过大部分物种的基因组还中存在有大量的缺口gap，就目前的数据来说，各种已测序物种的基因组中缺口gap所占的
巧用扫描电镜实现衬底支撑石墨烯的高质量成像
常见的衬底支撑石墨烯体系，有SiC热解生长石墨烯、Cu等金属衬底上CVD法生长石墨烯、Si上转移石墨烯等。石墨烯的常用结构表征技术包括透射电镜、拉曼（Raman）、原子力显微镜（AFM）、光学显微镜以及扫描电镜（SEM）。其中，SEM具有分辨率达纳米级、观测范围大、速度快、无损等优点，在石墨烯的生长
净化器性能环境测试舱教你如何轻松选择合适的空气净...
净化器性能环境测试舱教你如何轻松选择合适的空气净化器空气是每一个人赖以生存的气体，自诞生之日开始，就与我们的生存息息相关。近年来，社会进步，时代发展，空气质量日益下降，高效净化空气中的雾霾污染物,拦截空气中颗粒物的产品已经逐渐进入了人们的视野，空气净化器应运而生。 然而，目前空气净化器市场品牌
新型纳米探针可实现农药可视化定量检测
近期，中国科学院合肥物质院固体所蒋长龙研究员团队在氨基甲酸酯农药和有机磷农药残留分析检测方面取得新进展，设计制备了两种高效的比率荧光纳米探针，并结合智能手机的颜色识别器，实现对食品和环境水体中农药的可视化定量检测。相关研究成果发表在Chemical Engineering Journal和ACS
新型纳米探针可实现农药可视化定量检测
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505204.shtm 近期，中国科学院合肥物质院固体所蒋长龙研究员团队在氨基甲酸酯农药和有机磷农药残留分析检测方面取得新进展，设计制备了两种高效的比率荧光纳米探针，并结合智能手机的颜色识别器，实现对食
全基因组测序各步骤工具
全基因组测序（WGS）是下一代测序技术，用于快速，低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大，解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块，数据处理、检测变异和综合分析，具体如下图所示：由于WGS现在已经非常成熟了，
巧用低压验电笔
低压验电笔是常用一种辅助安全用具。用于检查500V以下导体或各种用电设备外壳是否带电。一支普通低压验电笔，可随身携带，掌握验电笔原理，结合熟知电工原理，灵活运用技巧很多。 （1）判断交流电与直流电口诀 电笔判断交直流，交流明亮直流暗， 交流氖管通身亮，直流氖管亮一端。 说