上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Microbiology》发表了题为“Pathological phenotypes and in vivo DNA cleavage by unrestrained activity of a phosphorothioate-based restriction system in Salmonella”的研究论文。 DNA磷硫酰化修饰是由硫原子取代了DNA磷酸骨架上非桥联氧原子，进而形成具有序列特异性和空间构象专一性的DNA大分子结构。这是表观遗传学领域近年发现的一种新型生理修饰现象，它突破了现有的DNA骨架由碳、氢、氧、氮、磷五种......阅读全文
采用改进的CTAB法提取细菌总DNA
实验概要通过改进的CTAB法可快速简便的提取细菌总DNA，通过本实验可掌握CTAB法从细菌提取DNA的原理和方法。 实验原理CTAB (hexadecyltrimethylammonium bromide，十六烷基三甲基溴化铵)，是一种阳离子去污剂，具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特
研究发现DNA甲基化修饰精准调控植物生物钟周期
生物钟通过协调细胞内代谢和生理活动的节律性以适应由地球自转而产生的昼夜光温周期性变化，为植物生长发育提供适应性优势。在多种真核生物中均已发现组蛋白修饰可参与调控生物钟周期，但DNA甲基化作为表观修饰的另一重要类型，是否参与以及如何调控真核生物的生物钟尚不清楚。 中国科学院植物研究所研究员王雷研
科学家利用DNA首次实现碳纳米管可控有序修饰
记者日前从华南理工大学获悉，该校前沿软物质学院林志伟教授与美国国家标准与技术研究院（NIST）研究员Ming Zheng，利用DNA首次实现了单壁碳纳米管（SWCNTs）的可控有序修饰。相关研究发表于Science。审稿人对相关研究成果给予了高度评价，认为该工作完成了过去很多研究者尝试但收效甚微
科学家利用DNA首次实现碳纳米管可控有序修饰
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484561.shtm 可控有序修饰的单壁碳纳米管。研究团队 供图 记者日前从华南理工大学获悉，该校前沿软物质学院林志伟教授与美国国家标准与技术研究院（NIST）研究员Ming Zheng，利用DN
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一，是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展，但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想，我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来，随着宏基因组测序等研究手段的不断进展，人们发现肠道菌群能广泛
阻断DNA复制可抑制抗药性细菌生长
近来抗药性细菌的增加成为大众健康的严重威胁，人们需要新的治疗手段来应对这类细菌的感染。美国科学家在11月14日出版的《分子细胞》杂志上发表文章表示，他们找到了一种新的毒素，能够通过阻断DNA复制机能来抑制细菌的生长。该发现为开发下代抗生素奠定了基础。 美国麻省理工学院科学家、研究文章作者迈
《自然—医学》：白细胞利用“DNA弹弓”抵御细菌感染
美国和瑞士科学家近日研究揭示了嗜曙红细胞(eosinophil，白细胞的一种)帮助机体抵御细菌感染的机制。研究发现，嗜曙红细胞能被细菌激活，用类似“弹弓”的方式释放出线粒体DNA，创建成一张“网”捕获并杀死细菌。相关论文发表在《自然—医学》(Nature Medicine)上。 嗜曙红细胞仅占人体
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
表观遗传修饰的细胞中DNA发生BZ构象转变被揭示
细胞核中，缠绕在组蛋白上的双链DNA一般以右手螺旋的B-DNA构象存在，但也会存在其它构象。组蛋白的乙酰化修饰是表观遗传学研究的重要内容。当组蛋白发生乙酰化时，DNA 与组蛋白八聚体的紧密缠绕被解开。那么，组蛋白的乙酰化是否影响DNA的构象，甚至导致B-DNA构象向其它构象包括Z-DNA构象转化
SUMO化修饰通过调控相分离影响DNA修复和肿瘤耐药的机制
DNA作为遗传信息的主要载体，其结构的完整与功能的完善对于维持基因组的稳定性和保障生命体正常生理活动具有重要意义。不同类型的DNA损伤修复对于维持基因组稳定性至关重要，针对最严重的DNA双链断裂损伤（DSB），细胞主要通过非同源末端连接（NHEJ）与同源末端重组（HR）进行修复。 泛素E3连接
维生素C直接参与产生一种全新的DNA修饰
近日，国际学术期刊《Nature》在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组联合多家单位合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue”。研究首次在莱茵衣藻（Ch
《Cell》子刊：什么？糖尿病竟与DNA的这种表达修饰有关
糖尿病影响全球超过4亿人，同时研究者先前就已经注意到糖尿病具有家族遗传性，因此，先前的研究多集中于多基因调控的胰岛细胞病变上，而几乎没有研究注意到糖尿病这一常见的内科疾病也与表观遗传学相关。近日，发表于《Cell Metabolism》杂志上的文章阐明了表观遗传学在糖尿病产生中的病理生理机制。
Science：霍乱弧菌掠夺其它细菌DNA的分子机理
当霍乱弧菌感染机体小肠时就会引发霍乱，该疾病的主要特点为急性水样腹泻引发的严重脱水，近日，来自瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）的科学家通过研究阐明，霍乱弧菌可以利用很小的“矛”可以刺穿并且杀灭周围的细菌，随后“窃取”走这些细菌的DNA，这种机制称之为水平基因转移，霍乱弧菌利用这种机制就可以变得非
Science：霍乱弧菌掠夺其它细菌DNA的分子机理
当霍乱弧菌感染机体小肠时就会引发霍乱，该疾病的主要特点为急性水样腹泻引发的严重脱水，近日，来自瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）的科学家通过研究阐明，霍乱弧菌可以利用很小的“矛”可以刺穿并且杀灭周围的细菌，随后“窃取”走这些细菌的DNA，这种机制称之为水平基因转移，霍乱弧菌利用这种机制就可以变得非
Y染色体完整测序或改善细菌DNA研究
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507607.shtm
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（二）
三.组织或液体样品中细菌DNA提取该方案适合于从各种组织、血液、分泌液等液体样品中提取基因组DNA和寄生的细菌DNA。纯化的DNA可直接用于各种细菌的检测。若需从粪便样品中提取细菌DNA，我们推荐使用DePure Stool DNA Kit，若需要从土壤样品中提取细菌DNA，推荐使用DePure
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（一）
细菌基因组DNA提取试剂使用说明书◆ 产品说明基于硅胶柱纯化方式。试剂中的溶菌酶消化去除细菌的细胞壁，革兰氏阳性细菌还可加入玻璃珠涡旋破壁，在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化，DNA释放到裂解液中。加入乙醇后，转移至吸附柱中过滤，DNA被吸附至吸附柱的膜上，而蛋白质则被去除。吸附柱经Buffer G
细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明
细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂，采用独特的溶解系统，可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿，也无需进行耗时的醇类沉淀，整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M
方法二：细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一 二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；
DNA细菌病原体检测试剂盒
DNA细菌病原体检测试剂盒 DNA细菌病原体检测试剂盒依据DNA信息快速筛查食品中的沙门氏菌、志贺氏杆菌、产生细胞毒素的大肠杆菌等。 DNA细菌病原体检测试剂盒优势特点： 两步完成检测，无需DNA提取 可同时识别多个病原体 成本低，不需要电泳 节省时间，整个
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时，它能改变许多的特征，而主要的生物活性功能，如酶活性或特异结合位点，可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先，PEG连接在蛋白质或多肽的表面上，提高了它的分子大小
由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
记者日前从上海交通大学获悉，该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 DNA是生命的遗传物质，由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化
上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破，《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modif
Nat－Commun：DNA修饰会促进乳腺癌对激素疗法产生耐受性
对激素疗法产生耐受性的乳腺癌细胞中的DNA常常会发生表观遗传学的改变，激素疗法是一种治疗ER+乳腺癌的有效疗法，而ER+乳腺癌在所有诊断的乳腺癌患者中占到了70%的比例；逆转这些表观遗传学改变或许有望帮助降低乳腺癌患者的复发率。图片来源：CC0 Public Domain 近日，一项刊登在国际
RNA加工修饰
中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰，主要加工方式是切断和碱基修饰，真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。
翻译后修饰
中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说，这是蛋白质生物合成的较后步骤。
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰（一）
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操作简
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰（二）
（2）在整条肽中的某个Lys侧链接入FITC，Lys侧链为末端为-NH2的四碳直链烷基，直接起到了降低空间位阻的作用。这种修饰方式能够灵活的在整条肽中任何位置进行FITC修饰，而不仅仅局限于末端。我们所采用的FITC修饰多肽的两种形式，都具有操作简便，成功率高，容易分离纯化等优点。2.AMC修饰7-