上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Microbiology》发表了题为“Pathological phenotypes and in vivo DNA cleavage by unrestrained activity of a phosphorothioate-based restriction system in Salmonella”的研究论文。 DNA磷硫酰化修饰是由硫原子取代了DNA磷酸骨架上非桥联氧原子，进而形成具有序列特异性和空间构象专一性的DNA大分子结构。这是表观遗传学领域近年发现的一种新型生理修饰现象，它突破了现有的DNA骨架由碳、氢、氧、氮、磷五种......阅读全文
Cell子刊：DNA酶促氧化修饰新调控作用
哺乳动物基因组DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的动态平衡调节胚胎和成年哺乳动物的神经发生。这种表观遗传修饰不仅控制神经前体细胞的增殖和存活，还会影响新生神经元的轴突生长。近期研究发现5mC在体内可以被TET家族蛋白氧化成5-羟甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而这些氧化修饰在早期胚胎和哺
DNA修饰DNMT3A类型的基因信号通路介绍
CpG甲基化是一种表观遗传修饰，对胚胎发育、印记和X染色体失活具有重要意义。对小鼠的研究表明，DNA甲基化是哺乳动物发育所必需的。这个基因编码一种DNA甲基转移酶，被认为在从头甲基化中起作用，而不是维持甲基化。该蛋白定位于细胞质和细胞核，其表达受发育调节。
DNA修饰ARID1A类型的基因信号通路介绍
该基因编码Swi/Snf家族的一个成员，其成员具有螺旋酶和ATP酶活性，并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分，这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域，对其功能可能很重要。首先，它有一个DNA结合
研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统
DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理 近日，武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统，并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。 细菌磷硫酰化
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
关于组蛋白修饰—DNA甲基的基本内容介绍
在引起基因沉默的过程中，沉默信号（DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配）是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白甲基化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白— 2
超级细菌通过修饰多糖逃避宿主免疫细胞并传播感染
谢菲尔德大学领导的一项新研究已经发现了医院里的超级细菌是如何避开免疫系统而导致感染的，这为新的治疗方法铺平了道路。 谢菲尔德大学分子生物学和生物技术系领导的这项研究调查了粪肠球菌(E. faecalis)如何引起危及生命的感染。粪肠球菌常见于人类消化道。虽然粪肠球菌对健康携带者无害，但它也是一
与DNA白修饰相关因子介绍C8ORF34
该基因编码与环状AMP依赖性蛋白激酶调节剂有关的蛋白。 在接受化学治疗的患者中，该基因的天然突变与发生严重毒性反应的风险增加有关，例如腹泻和中性粒细胞减少。 [由RefSeq提供，2017年3月]This gene encodes a protein that is related to the c
新研究发现维生素C直接参与DNA修饰
近日，国际权威学术期刊《自然》在线发表了来自中科院上海生物化学与细胞生物学研究所徐国良院士联合复旦大学唐惠儒教授和中科院武汉水生生物研究所黄开耀研究员等多个课题组合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an alga
邓子新团队DNA骨架硫修饰研究获新突破
近日，上海交通大学邓子新院士团队对DNA骨架硫修饰生物学意义的研究又获得两项突破。 聚焦核酸研究的著名国际学术刊物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)以特写文章(Featured article)发表了由该团队由德林副教授主持，博士生徐铁刚和姚芬为共同第一作者的
首次发现细菌病毒携带动物DNA
科学家发现，侵入细菌的一种病毒中潜伏着很多能表达出毒性蛋白的基因。这些基因本非病毒基因组的基因，而是来自于黑寡妇毒液基因以及其他一些动物的DNA。研究者们认为，要么是病毒偷窃了其他生物的基因，要么是其他生物的DNA入侵了病毒基因组。 病毒是一种充满争议的生物。他们几乎可以入侵感染三界（动物、植
细菌DNA序列可作信息“存储器”
阿根廷科学家近日成功将该国国歌旋律以人工基因编码形式植入某种细菌染色体中。这一方法不仅可以用来存储音乐旋律，还可能发展为一种拥有巨大应用潜力的信息存储方式。 据阿根廷媒体报道，主持研究的阿根廷信息生物学家费德里克·普拉达介绍说，生物的DNA(脱氧核糖核酸)由四种脱氧核苷酸组成，即腺嘌呤、胸
细菌DNA转录偶联修复的结构基础
活跃的转录基因中的DNA损伤修复比基因组中不活跃的区域更迅速。在细菌中，这个过程被转录修复偶联因子（transcription repair coupling factor , TRCF）介导。TRCF破坏DNA损伤位点的处的RNA聚合酶，并重新启动DNA切除修复机制（DNA excisi
细菌基因组DNA提取方法综述
细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
英开发水管细菌DNA检测技术
英国科学家日前开发出一种DNA检测技术，用以确定饮用水中所含细菌的具体种类。 研究人员发现，水管中几种常见细菌结合体可以形成一种生物薄膜，成为其他可能对人体更为有害的细菌繁衍的“温床”。 研究人员将4种细菌分离出来，并发现其中任何一种细菌都无法独立形成生物薄膜。但是，当这些
细菌中制备基因组DNA实验
小量制备 氯化铯法 实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿
PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用
2014年6月10日，中科院药用植物研究所（IMPLAD）刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参（Salvia miltiorrhiza）叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章，该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第
DNA修饰－SMARCA4类型的基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白是Swi/SNF蛋白家族的一员，与果蝇的布拉马蛋白相似。这个家族的成员有螺旋酶和ATP酶活性，被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分，这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。此外，该蛋白能结合BRCA1
科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式
DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达，从而影响一系列的生物学过程，如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上，DNA甲基化失调与人类疾病密切相关，如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和
GeneLink－未修饰的DNA寡核苷酸的价格表
Gene Link寡核苷酸适用于要求苛刻的应用和一致的结果。我们认为，重视时间并且没有因寡核苷酸质量而导致实验失败的空间的研究人员应考虑使用Gene Link。我们针对每种寡核苷酸的众多质量控制步骤可确保您放心。 Gene Link Oligo合成部门不是“寡头工厂”。在合成过程中以及在通
DNA修饰DICER1类型的基因信号通路介绍
该基因编码一种蛋白质，其氨基端含有一个dexh盒，羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用，由RNA干扰和小时态RNA（strna）途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。
纳米涂层细菌可有效转运口服DNA疫苗
标记免疫疗法治疗癌症又向前迈进一大步，科学家已经证明了纳米涂层细菌能有效转运口服DNA疫苗，这种疫苗能刺激人体自身的免疫系统发挥作用并摧毁癌细胞。这是第一次纳米涂料用于经体内细菌转运口服DNA疫苗。 与未经涂层的细菌相比，涂层细菌可以绕过很多“路障”，这些“路障”到目前为止限制了免疫反应，成为
在滤膜上进行细菌DNA的杂交实验
实验方法原理 本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进行杂交，以及从琼脂板中将与探针特异性杂交的克隆回收培养的方法，这些方法适用于平均长度大于 100 核苷酸的探针。实验材料 带有固定转化克隆 DNA 的滤膜寡核苷酸探针试剂、试剂盒 甲醛预杂交 杂交液BLOTTO预洗液洗脱液
纳米涂层细菌可有效转运口服DNA疫苗
标记免疫疗法治疗癌症又向前迈进一大步，科学家已经证明了纳米涂层细菌能有效转运口服DNA疫苗，这种疫苗能刺激人体自身的免疫系统发挥作用并摧毁癌细胞。这是第一次纳米涂料用于经体内细菌转运口服DNA疫苗。 与未经涂层的细菌相比，涂层细菌可以绕过很多“路障”，这些“路障”到目前为止限制了免疫反应，成
采用改进的CTAB法提取细菌总DNA
实验概要通过改进的CTAB法可快速简便的提取细菌总DNA，通过本实验可掌握CTAB法从细菌提取DNA的原理和方法。 实验原理CTAB (hexadecyltrimethylammonium bromide，十六烷基三甲基溴化铵)，是一种阳离子去污剂，具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特
在滤膜上进行细菌DNA的杂交实验
实验方法原理 本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进行杂交，以及从琼脂板中将与探针特异性杂交的克隆回收培养的方法，这些方法适用于平均长度大于 100 核苷酸的探针。
几种海藻及海洋细菌的DNA制备方法
所周知，海藻由于富含多糖，DNA提取是一大难题，一下是本人在试验过程中收集的海藻DNA制备方法，经试验验证可行，现在贴出来，以觞众战友。一、可大量培养的海洋细菌1、取1ml目的菌菌液至1.5ml的EP管中，5000r/m离心5分钟弃上清，菌体加入500μl水洗涤一次，5000r/m离心5分钟，弃上清
在滤膜上进行细菌DNA的杂交实验
本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进行杂交，以及从琼脂板中将与探针特异性杂交的克隆回收培养的方法，这些方法适用于平均长度大于 100 核苷酸的探针。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进
质粒DNA导入细菌细胞实验——电转化法
实验方法原理高压电转化简单，快捷可靠，而且是目前效率最高的质粒DNA转化大肠杆菌方法。不过该方法需要电转化装置。实验材料菌落试剂、试剂盒LB甘油SOC仪器、耗材平板离心瓶聚丙烯管电阻器电转化池实验步骤1. 接种一个单菌落于5 ml LB培养液，37°C温和振摇培养5 h或过夜。2. 将2.5 m