北大魏文胜课题组：提高基因敲除效率的新方法
基因组编辑技术，可让科学家们能够在各种哺乳动物细胞系中实现基因敲除。然而，用一种典型的方法，以一种及时的方式，完全破坏一个靶基因，在技术上是具有挑战性的。为了提高产生可靠基因组修饰的效率，北京大学生命科学学院魏文胜课题组，设计了一种方法，其使用一个线性供体片段，该片段包含一个报告系统。结合一种不依赖于同源重组（HR）的敲入策略，研究人员成功地富集了特异性携带靶基因突变的细胞克隆。相关研究结果发表在11月1日的《FEBS Letter》杂志。基因组编辑技术彻底改变了基因功能的实验性研究。三大主要技术：ZFN（锌指核酸酶）、TALENs（转录激活因子样效应物核酸酶）和CRISPR / CAS系统，采用不同的机制来产生序列特异性双链断裂（DSB），随后触发本地修复系统来完成序列特异性的修饰。这些强大的技术在功能基因研究、染色体位点的动态和实时成像、疾病突变的纠正、基因疗法中有着广泛的应用。CRISPR / Cas系统由于其效率高、易操......阅读全文
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
等位基因特异性PCR的功能
等位基因特异性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物与模板之间的碱基错配可以有效地抑制PCR反应，进而达到模板区分（等位基因区分）的目的。
等位基因特异性扩增法简介
等位基因特异性扩增法（allele -specific amplificarion,ASA) 是基于PCR技术的一种单核苷酸突变检测法，是分析已知碱基替代或微小片段缺失和插入型突变的常规技术。在PCR 的引物设计中，根据已知突变位点性质在引物3 ' 端或中间设计一错配碱基，使之仅能与突变
等位基因特异性PCR的应用
由于PCR过程中引物延伸是3'端开始的，所以3'末端的碱基对引物的延伸来说处于至关重要的位置。如果这个碱基与模板互补，则引物能从不间断延伸，PCR可以正常进行，得到特定长度扩增带。反之，则不能延伸。所以只要将与正常等位基因所不同的那个突变碱基安排在引物3'最末端，当用某一含突
等位基因特异性PCR的原理
等位基因特异性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物与模板之间的碱基错配可以有效地抑制PCR反应，进而达到模板区分（等位基因区分）的目的。
组织特异性基因敲除的定义
中文名称组织特异性基因敲除英文名称tissue-specific gene knockout定 义在特定组织细胞类型中使基因功能完全丧失的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），发育遗传学（二级学科）
等位基因特异性PCR技术的原理
由于PCR过程中引物延伸是3'端开始的，所以3'末端的碱基对引物的延伸来说处于至关重要的位置。如果这个碱基与模板互补，则引物能从不间断延伸，PCR可以正常进行，得到特定长度扩增带。反之，则不能延伸。所以只要将与正常等位基因所不同的那个突变碱基安排在引物3'最末端，当用某一含突
等位基因特异性PCR的技术特点
等位基因特异性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物与模板之间的碱基错配可以有效地抑制PCR反应，进而达到模板区分（等位基因区分）的目的。
等位基因特异性PCR的工作原理
由于PCR过程中引物延伸是3'端开始的，所以3'末端的碱基对引物的延伸来说处于至关重要的位置。如果这个碱基与模板互补，则引物能从不间断延伸，PCR可以正常进行，得到特定长度扩增带。反之，则不能延伸。所以只要将与正常等位基因所不同的那个突变碱基安排在引物3'最末端，当用某一含突
等位基因特异性PCR近期改进方法
1. 在3‘末端附近引入额外错配2. 腺苷三磷酸双磷酸酶介导的等位基因特异PCR法(apyrase-mediated allelespecific extension, AMASE)3. 焦磷酸解激活的聚合反应法(Pyrophosphorolysis-activated polymerization
北大魏文胜课题组：提高基因敲除效率的新方法
基因组编辑技术，可让科学家们能够在各种哺乳动物细胞系中实现基因敲除。然而，用一种典型的方法，以一种及时的方式，完全破坏一个靶基因，在技术上是具有挑战性的。为了提高产生可靠基因组修饰的效率，北京大学生命科学学院魏文胜课题组，设计了一种方法，其使用一个线性供体片段，该片段包含一个报告系统。结合一种不依赖
北大魏文胜课题组：提高基因敲除效率的新方法
基因组编辑技术，可让科学家们能够在各种哺乳动物细胞系中实现基因敲除。然而，用一种典型的方法，以一种及时的方式，完全破坏一个靶基因，在技术上是具有挑战性的。为了提高产生可靠基因组修饰的效率，北京大学生命科学学院魏文胜课题组，设计了一种方法，其使用一个线性供体片段，该片段包含一个报告系统。结合一种不
等位基因特异性PCR技术的研究发展
ASPCR的发展，主要是围绕提高3’末端碱基错配分辨率来进行的。为了提高ASPCR对末端碱基错配的分辨力，人们尝试了许多方法。比如：改换另一条链进行分析以规避这些错配延伸率高的碱基组合；把控制PCR反应的关键成分稀释到接近极限的浓度；在检测用引物的3'末端附近人为引入新的错配；截短Taq D
等位基因特异性PCR早期的改进方法
Bottema 等（1993）提出两个解决方案：一是设计引物时，如果引物3'末端可能与样品模板形成延伸率高的碱基错配，那么可以考虑以其互补链作为模板，从而避开这些高延伸率的错配。二是把控制PCR反应的关键成分稀释到接近极限的浓度。由于错配延伸效率毕竟比正配延伸要差，在扩增资源极低的情况下，错
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸（RNA）编辑是RNA水平一种常见的修饰，是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日，来自中科院昆明动物研究所的消息，由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队，在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍，对二倍体生物来说，虽然两个等位基
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸（RNA）编辑是RNA水平一种常见的修饰，是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日，来自中科院昆明动物研究所的消息，由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队，在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍，对二倍体生物来说，虽然两个等位基因的
基因敲除（KO）在验证抗体特异性的应用
抗体作为基础科学研究和临床试验常用的工具之一，主要通过抗原-抗体的反应揭示蛋白质在生命活动中的变化。尽管它们被广泛的使用，但是没有相关标准以确保商业抗体特异性和质量上的一致性。这使得科学界一直存在“重现危机”，浪费了科学家们大量的时间和金钱，妨碍生命科学研究的快速发展。因此，对抗体进行敏感性和特异性
猪等位基因特异性表达的时空特异性首获系统研究
近日，我国学者首次系统研究了猪等位基因特异性表达（ASE）的时空特异性，揭示了在不同发育时期、不同组织中的亲本决定型和等位基因型决定型两种ASE类型。相关成果在线发表于《自然-通讯》杂志。现代养猪产业普遍采用专门化品系选育和配套系杂交，其目的是充分利用杂种优势。基因表达调控是将基因型转化为表型的关键
Nat－Med：等位基因特异性基因编辑有望治疗遗传性耳聋
在一项新的研究中，来自美国哈佛医学院和波士顿儿童医院的研究人员利用一种新的基因编辑方法挽救了患有遗传性听力丧失的小鼠的听力，而且在成功地做到这一点的同时没有产生任何明显的脱靶效应。这些被称为贝多芬小鼠（Beethoven mice）的动物因为具有相同的导致人类进行性听力丧失（progressiv
等位基因特异性寡核苷酸印迹的方法特点
中文名称等位基因特异性寡核苷酸印迹英文名称allele specific oligonucleotide blot定 义一种测定基因突变的方法。即应用等位基因特异性寡核苷酸(ASO)仅与完全互补的序列结合，故1个碱基错配即足以阻止ASO探针与目的基因片段杂交；将ASO探针连接dT多聚尾巴，结合于固
等位基因特异性寡核苷酸印迹的方法介绍
中文名称等位基因特异性寡核苷酸印迹英文名称allele specific oligonucleotide blot定 义一种测定基因突变的方法。即应用等位基因特异性寡核苷酸(ASO)仅与完全互补的序列结合，故1个碱基错配即足以阻止ASO探针与目的基因片段杂交；将ASO探针连接dT多聚尾巴，结合于固
等位基因特异性寡核苷酸印迹的功能作用
一种测定基因突变的方法。即应用等位基因特异性寡核苷酸(ASO)仅与完全互补的序列结合，故1个碱基错配即足以阻止ASO探针与目的基因片段杂交；将ASO探针连接dT多聚尾巴，结合于固相支持物上，受检基因在杂交液中，生物素标记的DNA可结合辣根过氧化物酶，借助抗生物素系统使无色基质变成有色沉淀，从而进行测
大肠杆菌基因组基因无痕敲除的优化方法
近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成生物学等领域的重要工具菌株，是生产重组蛋白、氨基酸、有机酸、能源物质和一些重要化工产品的主力微生物之一。为使大肠杆菌获得新的性状和生产能力， 基因敲除及基因敲入是构建新型大肠杆菌的重要手段。 近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织 试剂、试剂盒
哺乳动物中制备基因组DNA实验
实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1. 切下组织并立即剪成小块，置于液氮中冻结。 2. 将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎，或用锤子将其捣为细粉末，每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.
哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成
从鸭嘴兽到蓝鲸，每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少，现在，一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上，对理解哺乳动物的进化和保护工作具有重要意义。 研究人员利用了来自32个活物种的高质量基因组序列，这
等位基因特异性寡核苷酸印迹的定义和方法
中文名称等位基因特异性寡核苷酸印迹英文名称allele specific oligonucleotide blot定 义一种测定基因突变的方法。即应用等位基因特异性寡核苷酸(ASO)仅与完全互补的序列结合，故1个碱基错配即足以阻止ASO探针与目的基因片段杂交；将ASO探针连接dT多聚尾巴，结合于固
研究揭示苹果转座子调控等位基因特异性表达机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm 苹果花瓣颜色与MYB10和MYB110a的表达量相关。中国农科院果树所供图 近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构，从全基因组层面上阐
基因敲除简介
基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术，是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA同源重组原理，用设计的同源片段替代靶基因片段，从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展，除了同源重组外，新的原理和技术也逐渐被应用，比较成功的有基因