UCSF:如何打破临床基因测序“死循环”僵局?

近日,加州大学旧金山分校(University of California San Francisco, UCSF)表示,他们与硅谷创业公司Syapse正在合作一个项目。利用Syapse公司的技术,加州大学准备筹建一个遗传数据库,存储各种转移性癌症样本及病人临床信息,以期为今后癌症治疗提供指导。该项目的领导者,医学遗传学家Robert Nussbaum 认为:“现在临床基因检测面临一个僵局:如果没有足够的临床数据做支持,就无法知晓治疗是否有效;如果无法确切知道治疗的效果,那么就没有人愿意接受该治疗。因此,必须有人来打破这种死循环的僵局。” 11月5日,Foundation Medicine和EmergingMed公司将开展合作为医生和病人提供癌症基因检测的临床指导服务。 但UCSF期望通过医院能够收集到可用的数据用于构建遗传、医学信息数据库,将数据收集和分析的结果作为专家常规医疗的一部分。 UCSF并不是唯一一家将基因组......阅读全文

每10秒就有1人患癌症,这些数据你要知道

  肿瘤的发病情况究竟如何呢?我们一起来看看我国最新最权威的数据。今年国家癌症中心发布了2017年收集的2014年的全恶性肿瘤登记资料,这两个时间点可能让您产生疑问。  由于我国地大物博,人口众多,层级众多,要想把全国30多个省市的数据集中起来需要一定的时间,到2017年才收集全2014年的数据。而

癌症单细胞测序数据分析常用的方法有哪些?

癌症单细胞测序数据分析常用的方法包括以下几种:  1. 数据预处理    - 质量控制:去除低质量的细胞和测序数据,例如根据基因检测数量、线粒体基因比例等指标筛选。    - 数据标准化:校正测序深度和细胞间的差异,使数据具有可比性。  2. 细胞聚类分析    - 使用算法(如 K-M

美大规模评估癌症病人临床和基因组数据

  英国《自然·遗传学》杂志1月15日在线发表的一项大型研究称,美国癌症中心展开了大规模癌症晚期患者临床数据和基因组数据评估,结果显示癌细胞的突变水平与患者接受检查点抑制剂治疗后的存活率相关。该研究意味着这一现象普遍存在于众多类型的癌症中,或有助于预测哪些患者将对这种免疫疗法应答良好。  人们一直致

罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测

个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点,相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括:第一步,对少量癌症基因的突变热点进行测序,这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物,此作为快速的初步筛

新的血液检测可以检测8种类型癌症

  据外媒报道,研究人员开发了一种新的血液检测方法,可以检测八种常见类型的癌症,包括肝癌和胰腺癌。  有一天,医生可能使用这种方法在癌症症状发作之前检测出早期的癌症,从而提高患者成功治疗和生存的可能性。  这项名为CancerSEEK的测试在血液中寻找许多被认为是癌症早期征兆的化合物。据研究报告,这

谷歌研发癌症自主检测器-无痛检测癌细胞

  核心提示:谷歌正用合成皮肤甚至真人皮肤检测一项高新技术——能够主动侦查人体内癌细胞的腕带。  谷歌正用合成皮肤甚至真人皮肤检测一项高新技术——能够主动侦查人体内癌细胞的腕带。  位于加州的谷歌X实验室负责研发工作,虽然还处在研究早期,但基础设想已经成熟。安德鲁•康拉德博士说:

重碳酸盐可帮助检测癌症

英国一项新研究发现,在人体中平衡酸碱度的重碳酸盐,可被癌变组织分解成二氧化碳,从而使癌变部位的酸度比周围部位高。研究人员说,重碳酸盐的这一特性可用来帮助检测癌症。 据《自然》杂志5月28日报道,英国剑桥大学的一个研究小组发现,核磁共振成像技术能追踪重碳酸盐在人体中发生的化学变化,因此能在早期帮助诊断

北京迈基诺:检测你的癌症基因

  最常见的两个用药检测是罗氏的赫赛汀和阿斯利康的易瑞沙。前者对HER2阳性的乳腺癌患者有效;后者对EGFR突变的非小细胞肺癌患者有效。赫赛汀 1998年就已上市,相应的检测在医院已经很成熟。易瑞沙2008年在国内上市,相应的检测还没能在医院全部推行。今年6月,又一款新药获批在中国上市,用药之前

神秘DNA提供新的癌症检测法

  最近,美国弗吉尼亚大学的研究人员发现,存在于染色体外面的奇特环状DNA,根据产生它们的细胞类型,而有所差异。这一研究结果增加了一种诱人的可能性,即,这些环状DNA可以作为不同类型癌症的生物标志物。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》。  MicroDNAs,是一类已被命名的新DN

检测癌症分子“指纹”可改进早期诊断

《分子细胞》杂志11日发布了一项研究,指出不同类型的癌症拥有独特的分子“指纹”,这些特征可以在疾病早期被检测到。这项由巴塞罗那基因组调控中心进行的研究发现,利用小型便携式扫描仪只需几个小时,就能以极高的精度获取这些“指纹”,为开发新的非侵入性诊断测试铺平了道路。这种测试能够比现有方法更快、更早地识别

基因检测可提高癌症治愈率?

  据报道,三年前,弗雷德-巴克(Fred Barker)被诊断出患有一种罕见的肾上腺恶性癌症,多数患上此病的人寿命将少于半年。而高度复杂的基因测试改变了癌症的治疗方式,也使得弗雷德的生命延续了将近三年。  这项测试的目的是寻找特定的肿瘤基因,之后便可以对病人进行针对性的药物治疗。这个月初,美国临床

基因突变检测指导癌症靶向治疗

  肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突

基因检测能否延长癌症患者的生命?

  在决定治疗方案时,先进行基因检测,这在肺癌治疗领域已成为共识。不过,肿瘤基因检测的产品获批、商业化,还需国内公司通过长期随访、病例积累,自证临床价值。   (在决定治疗方案时,先进行基因检测,这在肺癌治疗领域已成为共识,美国、欧洲、中国等的医生组织均制定了相应的共识文件。图/视觉中国)   

国外癌症基因液体检测技术进展

  通过技术手段从病人体液中检测出相关的癌症信号,让病人提前获知癌症信号、及时治疗;Freenome公司获得555万美元种子轮投资。  前不久,美国Freenome公司获得种子轮融资555万美元。本轮融资由Andreessen Horowitz领投,跟投方Founders Fund、Data Col

日本开发出癌症检测新方法

   据日本《朝日新闻》报道,近日,日本国立癌症研究中心的研究团队宣布,其已经研究开发出一种全新的癌症检测方法。运用该方法,只需要采集少量的血液样本,就能够全面地对与癌症相关的60种基因物质进行综合检测。  在此之前,如果希望进行同样的全面检测,通常需要提取患者癌变部位的组织来进行检测。而新的检测方

2015年癌症检测前沿技术盘点

  每年,癌症在全球致死700万人,我国也有100万人因此失去生命。为了降伏这一绝症,科学家们付出了极大努力,研究出多种癌症检测技术。那么,2015年又有哪些令人瞩目的癌症检测技术呢?  1、新型成像检测技术  近日,刊登在国际杂志《CancerResearch》上的一项研究报告中显示,来自曼彻斯特

一种癌症检测新方法

日本国立癌症研究中心的研究团队宣布,其已经研究开发出一种全新的癌症检测方法。运用该方法,只需要采集少量的血液样本,就能够全面地对与癌症相关的60种基因物质进行综合检测。 在此之前,如果希望进行全面检测,通常需要提取患者癌变部位的组织来进行检测。而新的检测方法则在避免增加患者身体负担的前提下,反复

哥斯达黎加利用机器人辅助癌症检测

  哥斯达黎加大学发布消息称,其一项机器人研制计划最近获得成功,机器人协助病理学家进行活组织检查从而检测癌症。这是该国第一次用于疾病诊断的自动化活组织检查。   在整个试验过程中,有两个机器人相互配合,相关任务的专家进行人机配合优化。活组织检查是一种需要很大体力的操作,同时在一个较长时间内动作又是雷

检测癌症相关DNA修饰新测序方法

  牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明,他们开发的新方法,TET辅助吡啶硼烷测序(TET-assisted pyridine borane sequencing,TAPS)是一种比亚硫酸氢盐测序(bis

用于检测癌症的迷你实验室

在本刊杂志的采访中,Christoph Krafft 医生介绍了如何通过迷你实验室来诊断胰腺癌。          “Cando平台是指将迷你实验室与拉曼光谱仪联用,而无需另外的生物分子作为标记物。” -------------Christoph Krafft博士,光学细胞诊断研究

可以检测多种癌症的血液标记物

胰腺癌的早期症状相对不明显,经常导致癌细胞扩散到其他器官之后才被发现。为了改善胰腺癌病人的预后,开发早期胰腺癌检测方法变得非常重要。为了实现这一目标,来自日本的科学家们在血液中发现了一些蛋白能够加强对胰腺癌的检测。结合传统的生物标记物,能够实现对早期阶段胰腺癌的诊断,这在之前是非常困难的。为了发现可

日本用虫子检测癌症?一滴尿即可完成早期癌症筛查

  作为“世界癌症防治先进国家”的日本,不时的推出癌症早期检查的新技术,最近又开发出一项“一滴尿”的癌症检查新技术,并打算在明年一月投入实际实施,而价格却相当便宜。  那一滴尿测癌症又是怎么一回事儿呢?10月2号,开发这种特色技术的生物启动企业HIROTSU生物科学与福冈县久留米市等合作,可以使用体

-AACR:“GENIE”呼之欲出,志在共享癌症基因组临床数据

  11月6日,Genomeweb报道,美国癌症研究协会(AACR)推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目,旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。  该项目中的“GENIE”寓意Genomics(基因组学)、Evidence(证据)、Neoplasia(肿瘤)Inform

如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章?

  玩转数据库,助你发牛文!   癌症研究究竟有多难?让我们来捋一下基本思路:首先,要有一定数量的高质量肿瘤临床样本;其次……等一下,是不是在“首先”这一步就卡住了?癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织,还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不

日本首次公布居民癌症3年生存率数据

日本国立癌症研究中心近日首次发布了日本居民的癌症3年生存率数据,各类癌症的3年平均生存率约为71.3%,其中前列腺癌生存率最高,为99%,最低的胰腺癌仅为15.1%。 该机构在其官方网站上发布了2011年确诊癌症患者的3年生存率和2008年、2009年确诊癌症患者的5年生存率,涵盖前列腺癌

人工智能大数据助力精准医疗-“阿尔法狗”们能识别癌症

  将人工智能用于癌症的早期筛查,大数据分析患上肿瘤的可能性,完全无纸化的“全程医疗”,甚至VR(虚拟现实)技术也可以用于医疗影像会诊……记者17日在中国国际医疗器械博览会发现,和往届不同的是,这一届“中国最大的医疗器械展”上,不少厂商带来的“黑科技”更跨界和融合,不仅不高冷,而且能为患者真正省钱、

如何利用TCGA数据库进行深度癌症研究及发大牛文章?

玩转数据库,助你发牛文!癌症研究究竟有多难?让我们来捋一下基本思路:首先,要有一定数量的高质量肿瘤临床样本;其次……等一下,是不是在“首先”这一步就卡住了?癌症研究中的高质量的肿瘤样本不但要有切除适当的肿瘤瘤体和癌旁组织,还需要每个病人的各项病理指征、家族病史、治疗手段、疗效以及对病人不间断的随访信

WHO发布最新癌症数据,这些关键行为你是不是每天都在做?

  癌症是全球主要的公共卫生问题,近年来,由于饮食、环境、人口的老龄化等因素,全球癌症发病率不断增长,癌症作为主要死因的情况日益突出。  2024年2月1日,世界卫生组织国际癌症研究机构(WHO IARC)发布了最新的全球癌症负担数据的报告:Global cancer burden growing,

一种新的血液检测方法,可以检测多种癌症

  一项新血液测试的试验表明,一种正在开发的新血液测试能够以较高的准确性筛查多种类型的癌症。丹娜-法伯癌症研究所的研究人员近日在2019年欧洲肿瘤医学协会(ESMO)大会上展示了这项多中心试验的结果。  这项测试由GRAIL公司开发,使用下一代测序技术探测DNA中微小的化学标记(甲基化),这些标记会

循环肿瘤细胞检测新技术,让癌症检测更快、更准

  在癌症诊断与治疗中,医生通常是利用活组织检查来进行确诊并跟踪治疗效果。这种方法不仅会给患者带来创伤,而且价格昂贵。循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cell, CTC)检测打破了这一僵局。CTC是存在于癌症患者血液循环系统中的游离癌细胞,被认为是癌症生长、转移的一个重要因素。近年