中科院青岛生物能源与过程所徐健来水生所学术交流
徐健研究员作学术报告 5月31日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所徐健研究员应邀来水生生物研究所进行学术交流, 作了题为“Establishment of a novel Nannochloropsis-based research model and platform technology for algal biofuel production”的创新系列讲座报告。 徐健研究员首先介绍了青岛能源所在筛选高产油微藻、微藻的基因组学研究、微藻产油相关代谢网络解析及等遗传改造方面所开展的工作。然后他详细介绍了通过高通量测序的方法对拟微绿藻进行全基因组水平和全转录组水平的分析，在此基础上进一步鉴定与高生物量、高产油等性状相关的基因及调控因子如microRNA。微藻基因组学研究工作也为后续的产油微藻遗传改造工作提供了重要依据。 水生所相关学科组的科研人员及研究生认真听取了报告，并与徐健研究员进行了热......阅读全文
北京基因组所召开生物计算研讨会
10月27日下午，中国科学院北京基因组所组织召开了“北京基因组研究所计算生物学研讨会”，会议由所长吴仲义主持，书记杨卫平、副所长李俊雄、基因组所生物信息研究人员以及科技处相关人员参加了会议。 研讨会上，与会学者就目前计算生物学领域中涉及如何运用大规模高效的理论模型和数
基因组所召开“创新2020”战略研讨会
研讨会现场 6月11日，中国科学院北京基因组研究所发展战略研讨会召开。基因组所各研究组组长、管理支撑部门负责人、副研及以上科研骨干50余人参加了会议。所党委书记、常务副所长杨卫平主持了会议，会议从下午一点半一直延续到晚上九时。在会议期间，与会人员与院、所领导就基因组所发展创
中科院海洋所破译海参基因组
记者从中科院海洋所获悉，国际学术期刊PLoS Biology13日在线刊发了由中国科学院海洋研究所杨红生研究员课题组和相建海、李富花研究员课题组主导，天津生物芯片技术公司、加拿大纽芬兰纪念大学等单位合作，由张晓军、孙丽娜、袁剑波等青年科研人员为共同第一作者，协力完成的研究论文“The sea c
昆明植物所等首次成功破译茶树基因组
茶是世界上最为古老也是最为广泛饮用的含咖啡因软饮料，目前全球160多个国家的30亿人喝茶爱茶。普遍认为，茶树起源于中国的云南、四川等地；作为传播中国文化的使者，在茶从中国起身向世界各地传播的数千年的漫长历程里，与全球100多个国家多元的文化邂逅交融，发展形成了地球上复杂而美妙的茶文化。除了因为迷
上海生科所Nature基因组研究新成果
近日来自中科院上海生命科学研究院、日本国立遗传学研究所和中国农业科学院的研究人员通过绘制水稻基因组变异图谱揭示栽培稻(cultivated rice)的起源，相关论文“A map of rice genome variation reveals the origin of cultivate
基因组所成功开发整合网络工具iBIG
近日，中科院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星，带领其团队成功开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy)，该研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Hum
昆明动物所等破译山羊和绵羊基因组
在“973”项目的支持下，中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后，近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此，所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。 山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动
水生所发现基因组可编码藻胆体降解蛋白的无尾噬藻体
噬藻体是侵染蓝藻的病毒。噬藻体与宿主的相互作用以及对蓝藻高度专一的致死性感染，可调节控制水华蓝藻的密度与种群结构，减少蓝藻水华的形成与危害，有助于蓝藻细胞溶解物参与地球生物化学循环。作为一种潜在控制有害蓝藻水华的生物效应因子，噬藻体成为水生病毒学和水环境科学研究的热点对象。 近日
基因组所参加国际基因组ENCODE计划取得系列研究成果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组分析数据，并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基
基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展
与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联 日前，中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema
基因组所半导体所研制的“模块化DNA分析系统”通过验收
4月1日，由中科院北京基因组研究所与中科院半导体研究所共同承担的中科院重大科研装备研制项目——“模块化DNA分析系统”项目，通过专家组评审验收。该项目的完成，标志着我国在第二代DNA测序仪研发方面，形成了具有自主知识产权的高通量DNA测序技术及其系统样机，在高端生命科学仪器装备国产化方面取得了突
成都生物所利用水生植物浮萍开展废水处理研究获进展
氮磷污水的大量排放是造成我国水污染的主要原因之一。目前主要技术是采用微生物将有机氮转化为氮气，将磷转化为污泥来除去氮磷，需要通过暴气等消耗大量的电能技术来实现，运行费用高，而且难以实现资源的再利用。同时，氮磷又是农作物生长所必需的营养元素，但是因为废水量大，氮磷的浓度相对于陆生为主的农作物需要较
水生所四膜虫多基因家族分子进化研究取得新进展
BMC evolutionary biology杂志10月27日在线发表了中国科学院水生生物研究所原生动物功能基因组学学科组博士生熊杰完成的题为Genome-wide identification and evolution of ATP-binding cassette tran
水生所中俄鲫鱼资源遗传评价和遗传多样性研究取得新进展
被认为起源于欧亚大陆东部的鲫鱼复合种由二倍体鲫和三倍体银鲫组成,其二倍体鲫行有性生殖，而三倍体银鲫已通过人工繁育试验证实具有有性生殖和单性雌核生殖的双重生殖方式，这些特殊性已使鲫成为研究脊椎动物进化问题的一个独特物种。最近, 由中国科学院水生生物研究所研究员桂建芳主持的中俄鲫鱼资源遗传
水生所揭示银鲫单性和有性多重生殖方式的细胞和发育机制
单性多倍体脊椎动物已知可采用雌核生殖、孤雌生殖或杂种生殖繁育后代。银鲫作为多倍体脊椎动物的特例，已被发现拥有单性雌核生殖和有性生殖多重生殖方式，然而，应答这些生殖方式的细胞和发育机制尚不清楚。 最近，中国科学院水生生物研究所研究员桂建芳学科组通过β-tubulin和Spindlin共定位纺锤体
水生所鱼类模式识别受体抗病毒感染机制研究取得进展
RIG-I样受体(RIG-I like receptors，RLRs)是一类新发现的模式识别受体，能够识别细胞质中的病毒RNA，在抗病毒天然免疫中起着重要的作用。RIG-I样受体包括3个成员, 即视黄酸诱导基因I (RIG-I)、黑色素瘤分化相关基因5 (MDA5)以及LGP2。在
水生所质疑光合膜形成机理获七实验室联合研究结果支持
光合作用是生物圈的能量基础，而光合作用发生于称为类囊体膜的光合膜上，因而光合膜形成机理成为生物学的重要问题之一。欧洲学者曾于2001年在PNAS同一期发表两篇论文(98: 4238-4242; 98: 4243-4248)，分别在蓝藻(集胞藻)和高等植物(拟南芥)报道了一种蛋白VIPP1
水生所揭示急性白血病基因MLL对斑马鱼血细胞发生的作用
急性白血病基因MLL编码一个组蛋白甲基化转移酶，能通过表观遗传机制调控Hox等基因的表达。它与70多种基因发生重排是导致急性淋巴细胞白血病（ALL）和急性骨髓性白血病（AML）发生的主要原因。由于小鼠mll基因敲除导致早期胚胎死亡，因此对于它在早期胚胎发育中的作用及其分子机制仍很不
水生所邀请专家学者共同谋划国家重点实验室发展
朱玉贤院士（左一）作报告 4月8日至9日，应淡水生态与生物技术国家重点实验室（中国科学院水生生物研究所）的邀请，蛋白质与植物基因研究国家重点实验室（北京大学）主任朱玉贤院士、生物膜与膜生物工程国家重点实验室（中科院动物研究所、清华大学、北京大学）主任王世强教授等一行10位专家学者到
水生所揭示卵母细胞特异的H2A变体的生物学作用
卵母细胞特异的组蛋白变体虽已被建议在早期胚胎发育中行使了重要功能，但其确切的证据及其生物学作用目前还不清楚。 最近，中国科学院水生生物研究所桂建芳研究员学科组在2009年从鱼类中鉴定出一个新的卵母细胞特异的H2A组蛋白变体(Biology of Reproduction, 81:
水生所揭示银鲫单性和有性多重生殖方式的细胞和发育机制
单性多倍体脊椎动物已知可采用雌核生殖、孤雌生殖或杂种生殖繁育后代。银鲫作为多倍体脊椎动物的特例，已被发现拥有单性雌核生殖和有性生殖多重生殖方式，然而，应答这些生殖方式的细胞和发育机制尚不清楚。 最近，中国科学院水生生物研究所研究员桂建芳学科组通过β-tubulin和Spindlin共定位纺锤体
水生所揭示鱼类PKZ和PKR激酶在抗病毒反应中的协同作用
哺乳类eIF2a激酶家族有四个成员：PKR、PERK、HRI和GCN2，分别响应不同的细胞胁迫环境。当病毒感染细胞时，PKR被激活，然后磷酸化底物eIF2a阻断蛋白合成起始，抑制病毒复制。 鱼类eIF2a激酶基因首先获得鉴定的不是PKR，而是由中国科学院水生生物研究所桂建芳研
地化所内陆水生系统内源有机质稳定性研究获进展
人类活动的加剧，使全球气温升高，温室气体显著增加，内陆湖泊初级生产增加。因此，内陆湖泊内源有机碳归趋问题对全球碳循环的研究至关重要。有研究表明内陆湖泊的年有机碳固存量高于海洋生态系统。惰性溶解有机物（RDOM）是海洋碳汇的重要组成部分，可在海水中保存数千年。然而，内陆湖泊初级生产产生的RDOM的归趋
地化所内陆水生系统内源有机质稳定性研究获进展
人类活动的加剧，使全球气温升高，温室气体显著增加，内陆湖泊初级生产增加。因此，内陆湖泊内源有机碳归趋问题对全球碳循环的研究至关重要。有研究表明内陆湖泊的年有机碳固存量高于海洋生态系统。惰性溶解有机物（RDOM）是海洋碳汇的重要组成部分，可在海水中保存数千年。然而，内陆湖泊初级生产产生的RDOM的
基因组所国际合作项目椰枣基因组测序及功能研究获进展
最近，由中国科学院北京基因组研究所与沙特阿卜杜拉国王科技城(King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST)共同启动的合作项目“枣椰 (Phoenix dactylifera L.)基因组计划”获得系列进展，本月初其标志性研究—
假水生龙胆的介绍
假水生龙胆（Gentiana pseudoaquaticaKusnez.）一年生草本，高30~50cm。根茎长而横生，疏被棕色、阔披针形鳞片。叶远生；叶柄长15~25cm，禾秆色，基部硫被红棕色卷曲的短毛和披针形小鳞片，向上近光滑；叶片革质，两面无毛狭长圆形至卵状长圆形，长20~30cm，中部宽
胸腹水生化指标
胸腹水临床检测的生化项目很多，其中临床应用意义较大的常见生化指标简述如下：1 糖及其衍生物1.1 葡萄糖(Glucose) 漏出液糖含量与血糖水平一致，渗出液因受细菌或炎症细胞的糖酵解作用，糖含量常不及血糖的一半，化脓性腹水4.4mmol/L，癌性胸腹水与血糖平行，但胸膜受癌细胞广泛浸润时常降至1.
胸腹水生化指标
胸腹水临床检测的生化项目很多，其中临床应用意义较大的常见生化指标简述如下：1 糖及其衍生物1.1 葡萄糖(Glucose) 漏出液糖含量与血糖水平一致，渗出液因受细菌或炎症细胞的糖酵解作用，糖含量常不及血糖的一半，化脓性腹水4.4mmol/L，癌性胸腹水与血糖平行，但胸膜受癌细胞广泛浸润时常
北京基因组所资源建设取得阶段性进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文，在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BI
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas