基于共轭聚合物的疾病基因和蛋白检测新技术

共轭聚合物荧光探针对HT29、HepG2、A498、HL60和M17肿瘤细胞p16、HPP1和GALR2三种基因启动子的甲基化检测分析结果 发展疾病的早期、高灵敏诊断技术对促进重大疾病防治具有重要意义。共轭聚合物具有强的光捕获能力,可用来放大荧光传感信号,为生物传感器的发展提供了新的传感模式。近年来,在基金委、中科院以及科技部的资助下,中国科学院化学研究所有机固体重点实验室的科研人员设计、合成了系列新型水溶性共轭聚合物探针,以给体-受体之间的能量转移或电子转移机制为基础,实现了重大疾病相关的基因以及蛋白质的高灵敏识别与检测,为重大疾病的早期诊断提供了新思路。 DNA甲基化是表观遗传学的核心内容之一,它与癌症的关联是近年来癌症研究的一个热点。他们发展了基于阳离子聚芴的DNA甲基化检测新体系,结合甲基化特异性-PCR技术(MSP)和HpaII限制性酶切-PCR技术,控制聚合物探针选择性地与甲基化特异性......阅读全文

中科院癌症最新研究登Nature子刊

  来自中科院化学研究所,解放军总医院附属第一医院的研究人员利用一种新型荧光共振能量转移技术,分析了中国人群中结肠癌几种相关基因的DNA甲基化水平,从中获得了极高精确度和灵敏度的检测结果,从而为结肠癌的诊断和治疗提出了一种新思路。相关成果公布在Nature Communications杂志上。

基于共轭聚合物的疾病基因和蛋白检测新技术

共轭聚合物荧光探针对HT29、HepG2、A498、HL60和M17肿瘤细胞p16、HPP1和GALR2三种基因启动子的甲基化检测分析结果  发展疾病的早期、高灵敏诊断技术对促进重大疾病防治具有重要意义。共轭聚合物具有强的光捕获能力,可用来放大荧光传感信号,为生物传感器的

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

关于DNA甲基化检测的结果分析

  在进行甲基化和非甲基化PCR扩增时,均设立空白对照和阳性对照。如果只扩增出非甲基化条带,判断为非甲基化;相反,如果只扩增出甲基化条带,则判断为甲基化;如果既能扩增出甲基化条带又能扩增出非甲基化条带,说明是半甲基化状态,在统计结果时也计为甲基化阳性。肿瘤细胞DNA总体甲基化的程度越低,癌症的恶性程

关于DNA甲基化检测的基本介绍

  DNA甲基化是基因表达调控的一种重要机制,DNA甲基化检测是指利用各种方法对肿瘤细胞DNA甲基化程度进行测定。在恶性肿瘤的发展中,甲基化的状态并不是一成不变,肿瘤细胞内全基因组的低甲基化程度与疾病进展、肿瘤大小和恶性程度都有密切的关系,DNA甲基化检测对肿瘤恶性程度的判断有重要意义。

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

化学所在共轭聚合物设计与生物医药应用领域获系列进展

  共轭聚合物具有较强的光捕获能力,可用来放大荧光传感信号,在疾病诊断以及生物检测等方面发挥了越来越重要的作用。近几年来共轭聚合物在细胞与动物水平的荧光成像以及生物医学领域的应用也获得了高度关注。在国家自然科学基金委以及科技部的资助下,中国科学院化学研究所有机固体重点实验室的科研人员在共轭聚合物设计

DNA甲基化与癌症之NGS检测篇

  摘要  DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非

简述DNA甲基化检测的临床意义

  在肿瘤的发生发展过程中,由于CpG岛的局部高度甲基化要早于细胞恶性增生,故其甲基化的检测可用于肿瘤的预测,而全基因组水平的低水平甲基化状态,则随着肿瘤恶性程度的增加而进一步降低,使其可用于肿瘤的诊断以及分级。此外,除了在肿瘤组织中检测甲基化以外,大量研究通过对肿瘤患者血清及其他体液中的肿瘤细胞的

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

DNA甲基化分析

The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive

DNA甲基化预测

实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测,并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有:GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究

关于DNA甲基化检测的操作方法介绍

  1、DNA甲基化检测— 基因组DNA的提取及浓度测定,设计引物时要求所扩增的片段中必须含有一个或一个以上的CpG岛,以保证检测可以正常进行。  2、DNA甲基化检测— 基因组DNA进行化学修饰,主要采用亚硫酸氢钠修饰,注意温度和时间的掌握,修饰后的DNA单链比较脆弱,操作应轻柔,避免剧烈振荡。适

检测DNA甲基化识别四种常见癌

  中美研究人员26日说,DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式,只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析,且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌4种常见恶性肿瘤。   这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成,相

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化

亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较

两项中国学者成果同登Nature子刊

  在最新公布的Nature Communications杂志上,来自中科院上海生命科学研究院,以及化学研究所,解放军总医院附属第一医院的研究人员分别发表了关于双峰驼全基因组序列图谱,以及新型荧光共振能量转移技术的重要成果。   在第一篇文章中,研究人员报道了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制

DNA甲基化技术介绍

DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。介绍DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DN

DNA甲基化的原理

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的

什么是DNA甲基化?

DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性

什么是DNA甲基化?

DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性

dna甲基化与rna甲基化的区别

DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。

DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发

  发表在今天《临床实验胚胎学》杂志上的新研究表明有一种简单的血液测试方法可以确定癌症侵犯其他器官如肺、骨头或大脑等疾病复发的风险。这样的测试对改善所有类型的女性乳腺癌会产生深远影响,这种疾病会影响八分之一的女性。  在研究中,翻译基因组学研究院(TGen)的研究人员确定了21 DNA甲基化热点——

两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化

  两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。   基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应

数字PCR技术在DNA甲基化检测中的应用

DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传修饰之一,发生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上,多发生于CpG岛上,研究发现,DNA甲基化参与调节多种细胞过程,包括胚胎发育,转录,X染色体失活,基因组印迹、染色体稳定性等。许多研究发现,DNA甲基化在一系列的疾病(如癌症等)起到十分重要的作用。在癌症患者中

新方法合成共轭聚合物用于肿瘤的光热治疗

  光热材料能够利用阳光并将其转化为热能,从能源开发和环境保护的角度来看,开发光热材料显得格外有吸引力,其中碳基纳米材料和共轭聚合物都是前景广阔的光热材料。同时,越来越多的证据表明,一些光热材料辅以光热疗法可能会从脱落的肿瘤细胞残留物中生成肿瘤结合剂,从而产生抗肿瘤的免疫效应,有力增强了光热疗法的癌

敏感检测癌症DNA甲基化技术,有望改进非侵入式癌症检测

  检测肿瘤释放进入血液中的游离DNA(cfDNA,cell-free DNA)的突变是一种极具潜力的癌症检测方法。然而这类检测的敏感性和准确性及其检测早期癌症的能力目前仍然处于低水平。一种潜在的替代方法是检测cfDNA上的甲基化水平,因为在肿瘤中,DNA甲基化水平会发生显着的变化。  早期的全基因

华大基因应用粪便DNA甲基化检测技术,赋能肿瘤检测

  在浙江宁波,一家庭父子三人接连查出肠癌,其接诊医生团队通过分析他们的家族史和基因检测结果,最终确认致病原因为林奇综合征,即遗传性非息肉病性结直肠癌。医生解释称,大多数林奇综合征患者是从父母遗传而来的,在该病的遗传模式下,即使只有一个基因突变也可能增加患此病的风险。如果夫妻一方携带突变基因,则每个