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生物物理所专家第九届全球蛋白质结构预测比赛中获佳绩

12月8日,2010年第九届全球蛋白结构预测比赛结果揭晓,中国科学院生物物理研究所蒋太交研究组发展的Jiang_Assembly蛋白质结构预测服务器进入了前二十名。这标志着我国在蛋白质三维结构预测领域中进入了世界上游水平。 众所周知,蛋白质三维结构预测是计算生物学领域中最具挑战性的一个研究方向,迄今为止还有很多问题悬而未决。为了客观和有效地评估蛋白质结构预测技术发展水平,1994年,美国科学家约翰·莫尔特(John Moult)倡议在全球范围内进行蛋白结构预测比赛(CASP,Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction)。CASP比赛每两年举行一次,已成为计算生物学领域中最权威和最富盛名的比赛,每次比赛都吸引了许多来自生物物理学、计算机科学、高能物理学、计算化学和计算数学等不同领域的专家参加。 第九......阅读全文

德国生物学家解析调控生物钟重要蛋白的三维结构

  德国慕尼黑大学阿道夫﹒布特南特研究所的科学家解析了哺乳动物隐花色素蛋白mCRY1/2和果蝇隐花色素蛋白dCRY的三维分子结构,结果发表在2013年6月7日的《细胞》杂志上。   隐花色素是体内生物钟调控的重要因子。这种蛋白通过感应蓝光使果蝇生物钟与外部白天-黑夜循环变化同步。通过高分辨率解析果

冷冻电镜解析了哪种蛋白的三维结构

  近日,中国科学技术大学微尺度物质科学国家研究中心和生命科学与医学部教授陈宇星和周丛照课题组与孙林峰课题组合作,利用冷冻电镜技术首次解析了人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的近原子分辨率三维结构,为深入理解该类膜蛋白转运的分子机制以及其突变引发疾病的致病机理提供了基础。该研究成果以Cryo-

破解整合酶的三维结构

英国和研究人员在1月31日的《》杂志上报告说,他们合作进行的一项最新研究模拟出的。整合酶在包括艾滋病等逆转录酶病毒中可以找到,并且充当了艾滋病病毒在人体内复制时的“帮凶”。这项重大突破有助于家解决困扰了艾滋病研究领域长达20年的一个难题,从而找到更好的治疗艾滋病的方法。 当艾滋病病毒感染人体时,

基因组的三维结构

  摘要: 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C,这些提供了长距离的染色质相互作用,但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末,两种新方法的迸发,有望绘出全基因组范围的相互作用图谱。  

蛋白质三维结构解析固体核磁共振方法获进展

  中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子物理国家重点实验室的杨俊研究组,在发展蛋白质高分辨三维结构的固体核磁共振测定新技术和新方法方面取得重要进展,相关研究结果于近日在《美国化学会》(J. Am. Chem. Soc.)上在线发表。   相对于液体核磁共振和X射线晶体衍射技术

重要癌症靶标三维结构获解析

  上海科技大学iHuman研究所徐菲课题组与复旦大学、美国南加州大学和斯克瑞普斯研究所等单位合作,解析了重要癌症靶标人源Smoothened受体的多结构域晶体结构,分辨率达到2.9埃(1埃=10-10米),相关成果日前在线发表于《自然—通讯》。  Smoothened受体是Hedgehog信号通路

80后结构生物学家赵强:因为很酷,我选择了结构生物学

赵强在实验室工作。(中科院上海药物所供图)  “为什么会选择生物?因为高考的时候觉得,数理化的体系已经很完整了,但生命科学还有那么多说不清楚的东西。”  “为什么会选择结构生物学?那是因为觉得它很酷啊!完全不能想象,蛋白质结构可以看到……长出的晶体那么漂亮。”  科学是理性的,可选择自己的科研道路却

冷冻电镜新突破!袁曙光团队解析膜蛋白靶标三维结构

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组与德国马普生物物理所合作,利用真实细胞膜冷冻电镜技术,解析了血清素受体5-HT3离子通道的高分率三维精细结构,并通过生物计算系统阐述了其信号转导的分子原理。相关成果发表于《自然—通讯》。袁曙光和Mikhail Kudrya

扩展蛋白的结构

  其氨基末端为约 2 2个氨基酸编码的信号肽,进入分泌途径后被剪切, 使扩张蛋白成为成熟肽 。该蛋白碳末端假定的结合 区域 ( 约10kDa ) 含有一系列保守的色氨酸残基 ( w) , 这些色氨酸残基有一定的间隔,很像纤维酶 的纤维素结合区域。中间区域 ( 1 5 k Da ) 被认为是重要的催

α-角蛋白的结构

  α-角蛋白主要是由α-螺旋构象的多肽链构成的,并与角蛋白的长向平行,即其氨基酸序列分为富含α螺旋的中央棒状区和两侧的非螺旋区域。其立体构造是α-螺旋的典型实例,几何表示为:两股右手α-螺旋向左缠绕,拧成一根称为原纤维的结构,直径为2nm,这就是aa组合的超二级结构。原纤维再排列成“9+2”的电缆