生物物理所专家第九届全球蛋白质结构预测比赛中获佳绩

12月8日,2010年第九届全球蛋白结构预测比赛结果揭晓,中国科学院生物物理研究所蒋太交研究组发展的Jiang_Assembly蛋白质结构预测服务器进入了前二十名。这标志着我国在蛋白质三维结构预测领域中进入了世界上游水平。 众所周知,蛋白质三维结构预测是计算生物学领域中最具挑战性的一个研究方向,迄今为止还有很多问题悬而未决。为了客观和有效地评估蛋白质结构预测技术发展水平,1994年,美国科学家约翰·莫尔特(John Moult)倡议在全球范围内进行蛋白结构预测比赛(CASP,Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction)。CASP比赛每两年举行一次,已成为计算生物学领域中最权威和最富盛名的比赛,每次比赛都吸引了许多来自生物物理学、计算机科学、高能物理学、计算化学和计算数学等不同领域的专家参加。 第九......阅读全文

微管蛋白的结构特点

是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5.5

Cell:蛋白固有结构失序

  许多蛋白(固有无序蛋白,IDPs)或蛋白区域(固有无序蛋白区域:IDRs)缺乏明确的生理条件三维结构,这些蛋白虽然未折叠,且高度动态化,但是其本身并没有变性,相反蛋白的固有结构失序就是其天然功能状态。   作为一类缺乏稳定结构的特殊蛋白质,固有无序蛋白在生命活动中行使重要的生物学功能,与人类重大

胶原蛋白的基本结构

其基本结构为三股胶原蛋白多肽链相互缠绕形成的三螺旋结构,直径为1.5nm。部分类型的胶原蛋白三螺旋可组合成相互平行的有序多聚体,称为胶原蛋白纤丝(collagen fibril),其直径在10-300nm,长度可达几μm。胶原蛋白纤丝可以进一步组装成直径为0.5-3μm、长度为上百μm的胶原蛋白纤维

酶蛋白的结构特点

酶蛋白具有一般蛋白质的物理化学性质,由20种天然氨基酸构成的生物大分子化合物,是由氨基酸以肽健(酰胺健)聚合成的肽链,一个蛋白质分子可能由一条肽链构成,也可能由几条肽链构成。在蛋白质肽链上的氨基酸残基按严格确定的顺序排列,它的侧链可以是各种天然氨基酸,不是单一氨基酸残基的重复。   酶蛋白是球蛋白,

波形蛋白的结构

波形蛋白单体,与所有其他中间丝一样,具有一个中心α-螺旋结构域,其末端由非螺旋氨基(头部)和羧基(尾部)结构域覆盖。两种单体可能以促进它们形成卷曲螺旋二聚体的方式共翻译表达,这是波形蛋白组装的基本亚基。α-螺旋序列包含有助于在螺旋表面形成“疏水密封”的疏水氨基酸模式。此外,酸性和碱性氨基酸呈周期性分

微管蛋白的结构特点

tubulin组成微管的蛋白质称为微管蛋白。微管蛋白是球形分子,有两种类型:α微管蛋白(α-tubulin)和β微管蛋白(β-tubulin),这两种微管蛋白约占微管蛋白总量的80%~95%,具有相似的三维结构,能够紧密地结合成二聚体,作为微管组装的亚基。α亚基由450个氨基酸组成,β亚基是由455

Ras蛋白的结构特点

Ras蛋白为膜结合型的GTP/GDP结合蛋白,相对分子质量为2.1万,定位于细胞膜内侧.它由188或189个氨基酸组成,它的第一个结构域为含有85个氨基酸残基的高度保守序列,接下来含有80个氨基酸残基的结构域中,Ras蛋白结构轻微不同,除了K2Ras末端25个氨基酸由于不同的外显子而分为A型和B型外

肌动蛋白的结构

肌动蛋白的氨基酸序列是最高度保守的蛋白质之一,因为它在进化过程中几乎没有变化,在藻类和人类等不同物种中的差异不超过20%。因此,它被认为具有优化的结构。它有两个显着特征:它是一种缓慢水解ATP的酶,ATP是生物过程的“通用能量货币”。然而,需要ATP以保持其结构完整性。其高效的结构是由几乎xxx的折

胶原蛋白的结构功能

胶原蛋白是生物高分子,动物结缔组织中的主要成分,也是哺乳动物体内含量最多、分布最广的功能性蛋白,占蛋白质总量的25%~30%,某些生物体甚至高达80%以上。

骨桥蛋白的基因结构

  OPN人的OPN基因定位在染色体4q13,是单一编码基因,8kb大小,具有7个外显子和6个内含子组成。小鼠位于5号染色体上,基因长约7Kb,包括7个外显子,其5’端有启动子序列,该启动子中IKb长度也被测序并用GCG程序分析了转录因子的可能识别部位,这些转录因子包括API-5、PEA-3、PEA

肌球蛋白的结构

肌球蛋白是长形不对称分子,形状如“Y”字,长约160nm。电子显微镜下观察到它含有两条完全相同的长肽链和两对短肽链,组成两个球状头部和一个长杆状尾部。肌球蛋白分子量约460kD,长肽链的分子量约240kD,称重链;短链称轻链。将肌肉肌球蛋白用5,5′-二硫双(α-硝基苯甲酸,DTNB)处理后放出的一

膜生物学国家重点实验室首次揭示完整藻胆体的三维结构

   光合作用是地球上的生物赖以生存的基础。为了获取更多的光能,生物体发展出了多种捕光蛋白系统。其中存在于蓝藻和红藻中的藻胆体是迄今已知的最大的捕光蛋白复合物,它位于膜表面,并与位于膜中的光和反应中心结合,能将吸收的太阳光以极高的效率传递给光合反应中心以便进一步转化为有机物并释放氧气。这个巨大的超分

结构生物学领域迎来“不结晶”革命

   在英国剑桥市一座钢结构建筑深处的地下室里,一场大规模的“叛乱”正在上演。  一个约3米高的庞大金属箱正通过消失在屋顶上的橙色粗电缆,静悄悄地发射兆兆字节的数据。这是全球最先进的冷冻电子显微镜之一:一台利用电子束为冷冻的生物分子成像并揭秘其分子形状的设备。英国医学研究委员会分子生物学实验室(LM

ATP的基本结构和生物学功能

ATP由3个磷酸基团,一个腺嘌呤核苷组成,在生物体内作为能量货币,主要功能是为细胞的生命活动(DNA复制、转录、翻译等等)提供能量

Nature,Cell文章揭示关键结构生物学

  清华大学生科院近年来在结构生物学研究方面取得了许多进展,2017年开年也连续在Cell,Nature杂志上发表重要成果,首先高宁研究组与北京大学分子医学所陈雷研究组合作,报道了ATP敏感的钾离子通道(KATP)的中等分辨率(5.6Å)冷冻电镜结构,揭示了KATP组装模式,为进一步研究其工作机制提

Cell:重磅!首次破解人cGAS的三维结构

  人体是为生存而建造的。人体中的每一个细胞都受到一组免疫蛋白的严密保护,而且这些免疫蛋白装备了几乎万无一失的雷达来检测外来的或受损的DNA。  人细胞中的一个最为关键的哨兵是一种被称作cGAS的“第一响应者”蛋白,它检测外来的和发生癌变的DNA的存在,并启动一种信号级联反应,从而触发身体防御。  

科学家破解整合酶的三维结构

  英国和美国研究人员在1月31日的《自然》杂志上报告说,他们合作进行的一项最新研究模拟出整合酶的三维结构。整合酶在包括艾滋病病毒等逆转录酶病毒中可以找到,并且充当了艾滋病病毒在人体内复制时的“帮凶”。这项重大突破有助于科学家解决困扰了艾滋病研究领域长达20年的一个难题,从而找到更好的治疗艾滋病的方

生命中心颜宁研究组:类转运蛋白-ABCA1-的三维结构

  2017 年 6 月 8 日,生命中心颜宁研究组在《细胞》(Cell)杂志在线发表了题为《人源脂类外向转运蛋白 ABCA1 的结构》(Structure of the Human Lipid Exporter ABCA1)的研究论文,首次报道了胆固醇逆向运输过程中的关键蛋白 ABCA1 近原子分

德国破解新冠病毒主要蛋白酶三维结构-有助抑制剂研发

  新冠疫情在全球蔓延,对于新冠病毒本身的研究也在不断取得新的突破。德国就破解了新冠病毒主要蛋白酶的三维结构,有望用于新药物的研发。  根据德国科研人员在美国《科学》杂志上发表的最新论文,Mpro是新冠病毒中的主要蛋白酶,在病毒复制过程中起着关键的作用。  借助高强度的X射线,科研人员解码了Mpro

多种关键蛋白!非洲猪瘟病毒衣壳高分辨率电镜三维结构

  近日,中国科学院微生物研究所高福团队联合中国农业科学院哈尔滨兽医研究所仇华吉团队、南方科技大学王培毅团队、中国科学院生物物理研究所章新政团队以及微生物所施一团队,在非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)结构领域取得新进展,解析了非洲猪瘟病毒衣壳(Capsid

关于蛋白质结构的一级结构介绍

  蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(sequence),也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。  迄今已有约一千种左右蛋白质的

蛋白质的结构域与三级结构的分类α/β型结构

一、结构域是蛋白质三级结构的基本结构单位和功能单位  蛋白质三级结构的基本结构单位是结构域。一个蛋白质可以只包含一个结构域也可以由几个结构域组成,故结构域是能够独立折叠为稳定的三级结构的多肽链的一部分或全部。结构域也是功能单位,通常多结构域蛋白质中不同的结构域是与不同的功能相关联的。许多已知的例子表

简述黏蛋白的蛋白质结构

  成熟黏蛋白是由两个不同的区域:  氨基和羧基末端区域被轻度糖基化,且富含半胱氨酸。半胱氨酸残基参与建立二硫内和黏蛋白单体之间的联系。  的10〜80残基序列的多个串联重复序列,其中多达一半的形成的大的中央区域的氨基酸是丝氨酸或苏氨酸。这个区域被与数百饱和O-连接的寡糖。N-连接寡糖中也发现对粘蛋

关于骨桥蛋白的蛋白结构的介绍

  OPN作为带负电的非胶原性骨基质糖蛋白,广泛的分布于多种组织和细胞中,其相对分子质量约为44 kDa,约含300 个氨基酸残基,其中天冬氨酸、丝氨酸和谷氨酸残基占有很高的比例,约占总氨基酸量的一半。骨桥蛋白多肽链的二级结构中包括8个α螺旋和6个β折叠结构,高度保守的RGD基元两端各有一个β折叠结

血管生成蛋白的结构特点

中文名称血管生成蛋白英文名称angiogenin定  义最初从人腺癌培养细胞中分离的一种小分子蛋白质。能使新血管在活组织中生长。健康的非癌组织也产生这种小分子蛋白质,有35%的序列与胰核糖核酸酶同源。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)

简述网格蛋白的结构

  有两种类型的轻链:α链和β链,二者的氨基酸有60%是相同的,但还不知道它们在功能上有什么差别。许多三腿复合物再组装成六边形或五边形网格结构,即包被亚基,然后由这些网格蛋白亚基组装成披网格蛋白小泡。

核糖核蛋白颗粒的结构

中文名称核糖核蛋白颗粒英文名称ribonucleoprotein particle定  义由RNA和蛋白质组合的颗粒体。如信号识别颗粒、端粒酶、核糖核酸酶P、核糖体、剪接体、编辑体等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

肌动蛋白的结构组成

肌动蛋白是细胞中两种细丝的单体 亚基 :细丝,细胞骨架的三个主要成分之一,以及细丝,是肌细胞中收缩装置的一部分。它可以作为称为G-肌动蛋白 (球状)的游离单体存在,或作为称为F-肌动蛋白 (丝状)的线性聚合物 微丝的一部分存在,这两者对于细胞的移动和收缩等重要的细胞功能是必不可少的。

GNAS蛋白的结构和作用

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

免疫球蛋白的结构

  1.轻链和重链  Ig基本结构:两对四条肽链通过链间二硫键连接形成Ig的单体结构。两条相同的长链称为重链,即H链;另两条相同的短链称为轻链,即L链。  两条重链间,轻链与重链间以二硫键相连,整个Ig分子呈“子呈字型。结构域由链内二硫键所连接的两个β片层所组成。  2.可变区和恒定区  (1)可变