送给生物实验室达人的10个偷懒技巧

1、质粒DNA提取 提取质粒的时候,最后一步的酒精挥发很关键,基本上是其后续的酶切反应的决定性因素。所以这一步尽量挥发长一点时间,最好是空调吹热风,或是37度温箱放长一点的时间,我试过室温过夜,酶切很好。 将amp浓度提高到200ug/ml,下班前接种,次日一早收获菌体,此时OD虽然不高,质粒丰度却不一般。菌体量少些,操作体积(管数)也小(少)。 手提质粒,如果用氛氯仿和氯仿两步抽提,再注意一下手法,严格按照参考书上面的操作的话,提出的质粒不比任何质粒提取试剂盒差,我感觉好像还好一点,我就用过一次试剂盒,比较了之后不如我手提的好,以后再也没用过了。 2、 Western Blot 做western blot的时候,大家往往会摸索一抗、二抗的浓度,封闭时间,曝光时间等等,而每次变换其中的一个条件就需要从新跑胶、转膜,甚至重新提蛋白,这样会浪费大量的时间。其实完全没有必要这样。一次转膜后,将PVDF膜晾干,裁减成小块,......阅读全文

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

DNA测序常见问题分析及解决办法

常见问题 具体情况 可能的原因 处理办法 备注 样品准备问题

USE-诱变实验

本方法中,两条寡核苷酸引物杂交到变性重组质粒 DNA 双链的同一条链上。一条引物(诱变引物)携带一个拟引进靶 DNA 序列的突变,第二条引物携带一个能破坏质粒单一限制酶位点的突变。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料带 mutS 表型(

USE-诱变实验

实验材料 带 mutS 表型(例如BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态试剂、试剂盒 退火缓冲液贮存液合成缓冲液噬菌体 T4DNA 连接酶噬菌体 T4DNA 聚合酶或测序酶单一位点的限制性内切核酸酶琼脂糖凝胶诱变引物选择引物质粒 DNA仪器、耗材 70°C

USE-诱变实验

            实验材料 带 mutS 表型(例如 BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态 带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态 试剂、试剂盒

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

分子克隆蛋白表达实验指南(六)

10. 测序  突变后氨基酸序列没有变化仍可用于表达。测序报告中blast时若有‘-’符号,则人工对照测序图谱。  测序验证后没有突变或者同义突变的重组质粒必须小抽,50ul,conc300ug/ml备份。测序文件应妥善保存,蛋白表达完成后一并提交存档。  获得GS后,即可构建含GE的重组T载体,用

快速了解反转录引物随机引物

  随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一非特异的引物来拷贝全长mRNA。  1.特异性引物一般在增低丰度目的基因才选择使用,用得比较少。一般都推荐用Oligo(dT)或随机引物代替基因特异性引物。由于rna的二级结构破坏不完全,导致特异性

什么是上游引物和下游引物

虽然这个问题很简单,但我怎么发觉挺难回答的......上游引物就是和要扩增基因片断上游序列结合的引物(引物就是单链寡聚核苷酸,基因扩增需要从引物开始),同理,下游引物指与目的基因片断下游序列结合者。具体示意如下:(上下两条长线代表DNA模板)5'-----------------------

淋病的实验室诊断和药敏

淋球菌实验室检查包括涂片,培养检查淋球菌、抗原检测,药敏试验及PPNG测定,基因诊断。       (一)涂片检查:        取患者尿道分泌物或宫颈分泌物,作革兰氏染色,在多形核白细胞内找到革兰氏阴性双球菌。涂片对有大量脓性分泌物的单纯淋菌性前尿道炎患者,此法阳性率在90%左右,可以初步诊断

知识分享:基因定点突变

  实验原理   基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。   定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择3

质粒

Extrachromosomal Elements-Plasmids (Michael Blaber)What's plasmid? Find answer here. It provides background information on the features of plasmid

设计引物遵循原则、引物保存和各种PCR的引物设计

一 设计引物应遵循以下原则1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上

基因定点突变知识

实验原理基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择30-35bp长度

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)  PCR Primer Design (Newman Lab)  PCR Primer Design (Eppendorf)Detail

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)  PCR Primer Design (Newman Lab)  PCR Primer Design (Eppendorf)Detail

分子克隆蛋白表达实验指南(十)

13.连接产物转化DH5α(预开42C水浴)       与T载体转化相同,先转化DH5α,筛选及扩增目的重组质粒       转化DH5α后挑6~8个菌落验证,验证项目:  1.  目的基因引物PCR验证  2.  表达载体引物PCR验证  3.  Step2中PCR产物胶回收后,以胶回收为模板、

设计引物时需要避免引物之间形成什么而造成引物自连。

设计引物时需要避免引物之间形成_碱基互补配对。而造成引物自连。相同末端或相同黏性末端或相同平末端。末端特指双链DNA分子的端位碱基,是专用名词,不可以用在单链引物上。且引物之间的碱基互补配对不一定是所有碱基都能够互补配对,少量配对也会使两种引物结合在一起,从而不能获得特异性DNA产物。

目的基因在大肠杆菌中的诱导表达

[实验原理] 将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点:易于生长和控制;用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具

分子克隆技术(质粒DNA和DNA插入片段的制备、连接反应...2

PCR引物决定PCR的特异性,引物的设计就显得尤为重要。下面以已知DNA序列设计引物为例介绍设计引物应考虑的几个方面:1、GC比值:众所周知,碱基对中的GC之间有三条氢键,AT之间有两条氢键,GC和AT在引物序列中的合理比例是设定PCR中退火温度的重要依据。通常在一个引物中GC和AT各半即可。2、长

肽适配体的亲和力成熟实验

实验方法原理 实验材料 质粒 DNA酵母株试剂、试剂盒 Taq 聚合酶10×缓冲液引物 dATPdGTP dCTPdTTPMgCl2 MnCl2完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板Xgal 平板仪器、耗材 PCR 管PCR 纯化柱自动热循环器 30℃ 培养箱实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「

肽适配体的亲和力成熟实验

实验材料质粒 DNA酵母株试剂、试剂盒Taq 聚合酶10×缓冲液引物dATPdGTPdCTPdTTPMgCl2MnCl2完全极限(CM) 缺失成分培养基和平板Xgal 平板仪器、耗材PCR 管PCR 纯化柱自动热循环器30℃ 培养箱实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 制备

分子克隆蛋白表达实验指南(五)

8. TA质粒转化菌落的验证  与表达载体的验证不同,转化TA质粒时不用双酶切验证。只需用目的基因引物和TA载体引物PCR验证即可。TA载体引物PCR片段比插入片段大约长150bp。  目的基因退火温度与之前胶回收时温度相同,TA退火温度60C即可,但可在55~70之间变动,不会影响结果。  挑取至

菌落pcr步骤

一、引言常规的PCR扩增需要进行细菌培养、质粒制备等多步操作后才能进行基因扩增,操作繁琐耗时较长,同时在反复的操作中DNA量损失也较大,产率较低。在1989年 Gussow Clackson3建立了菌落PCR( colony PCR)法,菌落PR与我们通常的普通DNA的PCR的不同在于,直接以单个菌

克隆的筛选和快速鉴定

实验概要掌握快速细胞破碎法测定大小不等的众多的质粒DNA;和菌落PCR快速鉴定克隆。实验原理在这个实验方法中,只需配制一种细胞缓冲液(它可以在室温下保存,长期使用)。利用破碎细胞缓冲液中的阴离子去污剂---SDS在37℃溶解膜蛋白,使细胞破裂,并解聚核蛋白,SDS还能与蛋白质结合形成复合物,使得蛋白

引物篇:普通PCR-和-QPCR-引物异同点

Q问题: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一样? A 回答:     二者的设计原则有相同也有不同;相同处:•         序列的查找是一致的;•         序列选取应在基因的保守区段;•         选取合适的扩增片段大小•         避免引物自身或与引物之间形成4个或4个