Science子刊发现全新的DNA修复机制
DNA分子的化学性质并不是特别稳定,会形成不同性质的损伤,因此DNA损伤应答是必不可少的。莫斯科国立大学Vasily M. Studitsky教授的研究团队,发现了一个全新的DNA修复机制。这项研究发表在Science Advances杂志上,为防治神经退行性疾病带来了新启示。 “高等生物的DNA与组蛋白结合包装成核小体,DNA双螺旋与组蛋白互作的一面隐藏在核小体中。只有在读取遗传信息的时候,核小体结构才会打开,”领导这项研究的Vasily M. Studitsky说。 DNA的这种紧密包装导致修复酶难以接近。如果DNA损伤没有得到修复,就会使突变累积、细胞死亡甚至引发多种疾病,包括阿尔茨海默症等神经退行性疾病。 在DNA转录过程中,RNA聚合酶沿着DNA链前行,遇到断裂就会停下,随后触发一系列反应,让相应的酶来修复受损位点。不过人们一直认为,RNA聚合酶无法检测到另一条DNA链上的断裂。 “我们发现,‘隐藏’在核小......阅读全文
单聚及二聚核小体的纯化实验
实验材料寡聚核小体中等或大的寡聚核小体成分试剂、试剂盒CaCl2MgCl2微球菌核酸酶EDTA甘油梯度缓冲液仪器、耗材超速离心机聚异质同晶管梯度制备装置实验步骤1. 解冻约 1 ml 寡聚核小体(约 1~2 mg/ml 比较理想),预热到 30℃。2. 加入 100 mmol/L CaCl2 至终浓
抗核小体抗体检测的临床意义
1.抗核小体抗体近年来已成为系统性红斑狼疮(SLE)的标志抗体,其敏感性高、特异性强,对SLE诊断有越来越重要的意义。AnuA对SLE的敏感性为60%~80%,特异性为97%~99%。2.AnuA多见于活动性狼疮,特别是狼疮肾,尤其对抗dsDNA抗体、抗DNP抗体、抗Sm抗体、抗组蛋白抗体阴性的
潘学文博士Nature解析DNA修复
生物通报道:来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子:Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色,为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路,相关成果公布在Nature杂志上。 文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan,生物通音译),其早年
染色体断裂,如果修复不当会导致细胞死亡
染色体断裂是对细胞最有害的DNA损伤。如果不进行修复,它们会阻止染色体的复制和分离,停止生长周期并导致细胞死亡。这些断裂经常出现在肿瘤细胞中,并在遗传物质的复制过程中自然发生。为了修复遗传物质中的这种损害,细胞将信息从未受损的子本拷贝转移到断裂的副本,这被称为姊妹染色单体之间的重组。图片来源于网
染色质着丝粒区核小体组装的结构机理研究获新成果
人源HJURP与CENP-A以及组蛋白H4复合体的晶体结构 5月1日,中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组在Genes & Development杂志上发表了题目为Structure of a CENP-A-histone H4 heterodimer in
阿司匹林能预防癌症?蒋晖揭示阿司匹林促DNA修复新机制
阿司匹林(Aspirin,乙酰水杨酸),1898年上市以来,至今已有超过百年的临床应用,成为医药史上三大经典药物之一。至今仍是世界上应用最广泛的解热、镇痛和抗炎药,也是作为比较和评价其他药物的标准制剂。近年来,阿司匹林被发现在多种疾病中有效,甚至对神经退行性疾病、心血管疾病、癌症等重大疾病也有着一定
核小体识别和泛素化机制,有助开发更好的癌症治疗方法
在一项新的研究中,来自美国梅奥诊所的研究人员利用先进的成像技术,对BRCA1-BARD1蛋白复合物有了前所未有的了解,该复合物在乳腺癌或卵巢癌患者中经常发生突变。这项研究确定了BRCA1-BARD1功能的多个方面,为未来的转化研究、癌症预防工作和药物开发提供了支持。相关研究结果于2021年7月2
华人科学家Nature公布核小体分布图
来自美国西北大学分子生物学系,统计系等处的研究人员发表了题为“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章,通过建立了一种新方法,在全基因组范围内分析核小体分布的位置,这将有助于揭示体内与转录相关的核
抗核小体抗体的检测及应用是什么?
凋亡细胞是核小体的重要来源,当SLE患者的吞噬细胞对凋亡细胞的清除能力受损或降低,导致核小体在患者体内大量存积,多聚核小体与活化的单核细胞结合后被抗原递呈细胞呈递给CD4+Th2细胞,Th2细胞增殖活化,激活B细胞产生抗核小体抗体(AnuA)。 AnuA特异性高,与SLE病情活动性相关,通常采
用梯度盐透析的方法组装核小体串实验
实验方法原理 实验材料 非标记的 G5E4 DNA末端标记的 G5E4 DNA 牛血清白蛋白(BSA)试剂、试剂盒 高盐缓冲液低盐缓冲液实验步骤 1. 准备如下的重组混合液(最后加入组蛋白):约 100 ug/ml 9 份未标记和 1 份末端标记(摩尔数比)的 G5E4 DNA 混合物20 mmol
去-H1-的寡聚核小体的离心实验
实验材料精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材匀浆器冷冻超速离心机MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g 离心 10 min(用
用梯度盐透析的方法组装核小体串实验
实验材料非标记的 G5E4 DNA末端标记的 G5E4 DNA牛血清白蛋白(BSA)试剂、试剂盒高盐缓冲液低盐缓冲液实验步骤1. 准备如下的重组混合液(最后加入组蛋白):约 100 ug/ml 9 份未标记和 1 份末端标记(摩尔数比)的 G5E4 DNA 混合物20 mmol/L Tris·Cl,
酶联免疫吸附法(ELISA)核小体测定的步骤
1、将凋亡细胞裂解后高速离心,其上清液中含有核小体; 2、在微定量板上吸附组蛋白体; 3、加上清夜使抗组蛋白抗体与核小体上的组蛋白结合; 4、加辣过氧化物酶标记的抗DNA抗体使之与核小体上的DNA结合; 4、加酶的底物,测光吸收制。
与DNA双链断裂修复相关新基因被发现
德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生
天差地别!CRISPR导致的DNA断裂后修复与理论差距巨大
尽管世人对CRISPR-Cas9基因编辑抱有很高期望,科学家们仍对其人体临床应用持怀疑态度。为什么呢? “基因编辑非常强大,但是到目前为止还有许多问题和错误需要探索。它们的工作方式就像一个黑匣子,有许多猜想和假设,”加州大学伯克利分校分子生物学教授Jacob Corn说。“现在,我们终于有能力
科学家有望开发出帕金森等大脑疾病的新型疗法
近日,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自俄勒冈健康与科学大学的科学家们通过研究发现,一种此前认为与细胞功能异常和死亡相关的小型蛋白实际上在修复DNA破碎方面扮演着关键角色,文章中,研究者发现,α-突触核蛋白在预防诸如帕金森疾病等大脑疾病中神经元死亡上扮演着
著名学者庄小威Nature解析核小体重塑
来自哈佛大学的研究人员在新研究中探究了ISWI染色质重塑因子协调重塑核小体的机制。研究结果发表在6月29日的《自然》(Nature)杂志上。 文章的通讯作者之一是著名的华裔女科学家,哈佛大学庄小威(Xiaowei Zhuang)教授,庄教授早年毕业于中国科技大学少年班,34岁的时候就成为了哈佛
用逐步盐透析的方法组装核小体模板实验
实验材料牛胸腺 DNA放射性标记的 DNA纯化的天然核心组蛋白试剂、试剂盒NaClTE 缓冲液仪器、耗材MWCO 透析管实验步骤1. 准备如下的重组混合液:约 8 ug 未标记的超声破碎的牛胸腺 DNA (作为载体 DNA; 加自 1~2 mg/ml 储液)200 000~400 000 cpm 单
去-H1-的寡聚核小体的凝胶过滤实验
实验材料精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材匀浆器冷冻超速离心机MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g 离心 10 min(用
用逐步盐透析的方法组装核小体模板实验
实验方法原理 实验材料 牛胸腺 DNA放射性标记的 DNA纯化的天然核心组蛋白试剂、试剂盒 NaClTE 缓冲液仪器、耗材 MWCO 透析管实验步骤 1. 准备如下的重组混合液:约 8 ug 未标记的超声破碎的牛胸腺 DNA (作为载体 DNA; 加自 1~2 mg/ml 储液)200 000~40
抗核小体抗体检测的原理及临床意义
原理 将高度纯化的核小体靶抗原固定于微孔板上,患者血清中的抗核小体抗体可与之结合,通过辣根过氧化物酶(HRP)标记的第二抗体(抗人IgG)反应及酶底物/色原显色,即可检测此抗体。 临床意义 1.抗核小体抗体近年来已成为系统性红斑狼疮(SLE)的标志抗体,其敏感性高、特异性强,对SLE诊断有
精确编辑基因!利用机器预测细胞修复CRISPR诱发的DNA断裂
当双螺旋DNA因损伤(比如X射线暴露)发生断裂时,细胞中的分子机器会开展基因“自动校正(auto-correction)”,从而将基因组重新连接在一起,但是这种修复通常是不完美的。细胞中的天然DNA修复过程能够以一种看似随机且不可预测的方式在断裂位点处添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Ca
中国科大真核生物DNA损伤修复机理研究取得新进展
近日,中国科学技术大学生命科学学院滕脉坤教授、姚雪彪教授带领的研究组揭示了人类范可尼贫血互补群蛋白M (FANCM)与其关联因子蛋白复合物MHF1/MHF2的三元复合物结构,以及此三元复合物之间的分子识别和相互作用新机制,为范可尼贫血的致病机理研究提供了新的线索和思路。此发现将推动人们对人类细胞
研究构建核小体结合蛋白在线数据库并揭示染色质调控新机制
染色质是真核细胞中DNA包装和基因表达调控的核心结构。核小体作为染色质的基本单位,与各种蛋白质的相互作用决定了基因表达的精确调控。理解核小体结合蛋白的结构特征和相互作用机制,对揭示表观遗传调控、疾病发生机制以及开发新型治疗策略具有重要意义。然而,传统实验方法在解析这些复杂相互作用时面临成本高、耗
上海生科院提出改进的核小体精确定位算法iNPS
9月18日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所韩敬东组的最新研究论文Improved Nucleosome Positioning Algorithm iNPS for Accurate Nucleosome Posit
临床化学检查方法介绍嗜中性粒细胞核鼓槌小体
嗜中性粒细胞核鼓槌小体介绍: 鼓槌小体,在成熟中性粒细胞(杆状或分叶)核之一端(或其他部位),可见有一直径2-4μm向外伸出之突起,其头部(顶端)椭圆或更似鼓锤状,故而得名。一个细胞中通常含有一个,有时含有两个,染色与胞核一致。有人以此来鉴别男性与女性。正常成人,中性粒细胞含性染色体者,女性占5%
Science:结构上揭示核小体依赖性的cGAS抑制机制
在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员首次确定了先天免疫系统中一种名为cGAS的关键DNA感应蛋白与核小体结合在一起时的高分辨率结构,其中核小体是细胞核内最重要的DNA包装单位。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Structura
血液的化学检验项目中性粒细胞核鼓槌小体介绍
中性粒细胞核鼓槌小体介绍: 中性粒细胞核鼓槌小体是细胞上的一种球形或椭圆形突起。其检查方法是采周围血做涂片,甲醇液固定,吉姆萨染色,油镜下观察。一般女性多核白细胞的核鼓槌出现率为2%-3%,而男性几乎没有。中性粒细胞核鼓槌小体正常值: 男性:1.5%中性粒细胞核鼓槌小体临床意义: 鉴别两性畸形
临床化学检查方法介绍中性粒细胞核鼓槌小体介绍
中性粒细胞核鼓槌小体介绍: 中性粒细胞核鼓槌小体是细胞上的一种球形或椭圆形突起。其检查方法是采周围血做涂片,甲醇液固定,吉姆萨染色,油镜下观察。一般女性多核白细胞的核鼓槌出现率为2%-3%,而男性几乎没有。中性粒细胞核鼓槌小体正常值: 男性:1.5%中性粒细胞核鼓槌小体临床意义: 鉴别两性畸形
去-H1-的寡聚核小体的溶解和纯化实验
实验方法原理 实验材料 精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒 MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材 匀浆器冷冻超速离心机 MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤 1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g