海洋所首次完成仿刺参基因组测序和组装

日前,我国科学家在国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,将对我国刺参产业发展产生重要推动作用。 该成果由中国科学院海洋研究所研究员杨红生团队和相建海团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测序技术获得132Gb高质量DNA序列数据,覆盖全基因组160倍。科研人员利用针对高复杂度基因组组装的创新策略,在国际上首次成功完成了野生刺参的基因组组装,目前获得的框架图总长度达到765Mb,组装叠连群Contig N50达112Kb,该数值优于国际迄今已发表的多数水产动物基因组图谱的指标。初步检测表明,功能基因区覆盖达95%以上。该项研究得到了国家科技部“973”、“863”计划,国家基金委,中国科学院和山东省、青岛市科技厅的资助。 早在上世纪50年代,海洋所科研人员就开展了海参的形态分类和经典生物学研究,查清了我国海参的分布和生......阅读全文

海洋所首次完成仿刺参基因组测序和组装

  日前,我国科学家在国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,将对我国刺参产业发展产生重要推动作用。  该成果由中国科学院海洋研究所研究员杨红生团队和相建海团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测

中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装

   近日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,我国科学家正式完成仿刺参基因组测序和组装,这在国际上尚属首次。该研究成果对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,对我国刺参产业发展将产生重要推动作用。  据了解,该项研究得到了国家科技部973 、863计划,国家基金委,中国科学院和山东省科技厅、青岛市

耐高温刺参良种选育技术通过验收

  中国科学院海洋研究所研究员杨红生承担的山东省农业良种工程重大课题“速生抗病耐高温刺参良种选育”以及“863”计划子课题“刺参、海胆高产、抗逆品种的培育”等项目的阶段性成果,近日通过了现场验收。与会专家对中国科学院海洋研究所在耐高温刺参良种选育与白刺参规模化苗种繁育技术方面所取得的系列成

海洋所刺参良种选育取得进展

  11月30日,由中国科学院海洋研究所杨红生研究员承担的山东省农业良种工程重大课题“速生抗病耐高温刺参良种选育”和刘石林助理研究员承担的“十二五”国家863计划课题“高值海珍品良种培育”子课题部分工作顺利通过现场验收,专家组对课题在耐温高产刺参良种选育、白刺参和紫刺参苗种规模化培育、刺参体外标记、

黄海所:发现刺参免疫通路基因

  灿烂弧菌(Vibrio splendidus)是刺参(Apostichopus japonicus)腐皮综合症的主要致病因素之一,严重危害刺参养殖产业的发展。  为筛选涉及灿烂弧菌侵染的刺参免疫基因,并探索这一过程的分子机制,中国水科院黄海水产研究所王印庚研究员领衔的课题组对灿烂弧菌侵染的抗性型

仿刺参肠道再生和皂苷合成研究取得重要进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究非常缺乏。  近日,记者从中科院海洋所了解到,该所实验海洋生物学重点实验室研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海

仿刺参肠道再生和皂苷合成研究取得重要进展

   非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究非常缺乏。  近日,记者从中科院海洋所了解到,该所实验海洋生物学重点实验室研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在

“东方玉龙”白刺参良种选育与产业化取得进展

  7月31日,山东省海洋与渔业厅组织有关专家对中国科学院海洋研究所、山东东方海洋科技股份有限公司、烟台辰宇水产有限公司和烟台市水产研究所共同实施的“东方玉龙”白刺参良种选育与产业化项目进行了现场验收。  经过10余年的努力,项目组制定了白刺参亲参选育指标,研究了白刺参体壁组织的细胞学特征,查明了黑

海洋所刺参池塘生态苗种培育和资源修复技术取得进展

  目前我国刺参增养殖模式主要是围堰和池塘养殖,在水深4-5m的浅海也进行少量增养殖,南方一些地方也进行笼养。浅海增养殖的刺参与围堰和池塘养殖的刺参相比,更加接近野生环境自然生长的刺参,品质和价格相对较高,2014年浅海增养殖鲜活刺参售价高达80-120元/500g,而池塘养殖的鲜活刺参售价仅为50

刺参良种选育和健康苗种培育技术研究取得阶段性进展

  近日,由中科院海洋所分别与山东东方海洋科技股份有限公司和马山集团有限公司承担的刺参良种选育和健康苗种培育技术烟酒取得阶段性进展,山东省海洋与渔业厅组织专家进行现场验收并给予充分肯定。  课题组制订了耐高温刺参苗种选育技术方案,建立了耐高温刺参种参筛选指标体系,总计培育出耐高温子一

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究新进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。相关

天津生物芯片参与绘制海参基因组

  海参属于棘皮动物,是其中体型与形态最为特殊的种类,且处于从无脊椎向脊椎动物分化的独特进化地位,也是国内外重要的海产经济物种,具有极高的营养与医用价值。  10月12号,国际学术期刊PLoS Biology在线刊发了天津生物芯片参与的海参全基因组精细参考图谱项目文章-“The sea cucumb

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。

海洋所多项成果获青岛市科技奖励

  4月12日,青岛市科学技术奖励大会召开,对获得2011年度科技奖励的成果和个人进行了表彰。   中科院海洋研究所多项成果获奖。其中,由陈丽蓉等完成的“中国边缘海沉积矿物学的研究”获自然科学一等奖,由杨红生等完成的“刺参优质苗种培育与健康增养殖”获科技进步一等奖;“浒苔及其它绿藻类

横断山喜马拉雅特有物种的分布区演化研究获进展

  横断山-喜马拉雅地区是生物多样性热点地区,拥有丰富的植物多样性及物种特有性,该区域特有物种的形成和维持是研究的热点。中国科学院西双版纳热带植物园生物地理与生态学研究组硕士研究生母其勇在研究员星耀武的指导下,以该地区特有属忍冬科刺萼参属(Acanthocalyx)为研究对象,利用谱系地理学的手段,

盐度对水生动物的影响你都知道吗?

  盐水可以溶解一些盐类和有机物,含盐量也是养殖水体的一项重要指标。水产养殖动物在养殖的过程中,会经常转移到不同的水体,当动物的体液与外液浓度不同时,就有可能出现脱水,导致体内离子平衡破坏,影响生长发育,了解含盐量对水产养殖动物生长的影响有利于更好的改进水质。  1、水生动物对含盐量的适应性  水生

海洋酸化让海参“变矮”,海水升温则会减轻这一影响

  自工业革命以来,大气中CO2水平的上升导致了海洋酸化(Ocean acidification,OA)和变暖(Ocean warming,OW)。IPCC(2021)报告表明,到21世纪末,海洋平均pH值将下降0.3-0.4个单位(RCP8.5),海水平均温度将上升1.5°C至3.0°C。OA和O

海洋酸化让海参“变矮”,海水升温则会减轻这一影响

自工业革命以来,大气中CO2水平的上升导致了海洋酸化(Ocean acidification,OA)和变暖(Ocean warming,OW)。IPCC(2021)报告表明,到21世纪末,海洋平均pH值将下降0.3-0.4个单位(RCP8.5),海水平均温度将上升1.5°C至3.0°C。OA和OW已

海洋所蛇目白尼参苗种人工繁育技术取得进展

  日前,由中科院海洋所张志怀副研究员承担的“863”海水养殖种子工程课题“蛇目白尼参苗种繁育技术”取得重要进展。科研人员经过3年多的采捕、蓄养,蓄积了蛇目白尼参种参270公斤,通过不断的建立、优化饲养、促熟和生殖条件,于2012年成功培育出蛇目白尼参幼体和稚参。   日前,该项目在海南省临高县万

海洋所2个新品种通过农业部水产新品种审定

  日前,农业部公布了2017年审定的18个水产新品种,中国科学院海洋研究所牵头培育的脊尾白虾“科苏红1号”及刺参“东科1号”2个新品种位列其中,获得农业部颁发的水产新品种证书。  脊尾白虾“科苏红1号”(品种登记号:GS-01-004-2017)由海洋所研究员相建海和李富花团队与江苏省海洋水产研究

海湾生境和生物资源修复技术创新应用通过鉴定

  12月28日,山东省科技厅组织专家对“山东半岛海湾生境和生物资源修复技术创新与应用”成果进行了鉴定。该项目由中国科学院海洋研究所牵头,联合中国海洋大学、山东省海洋生物研究院、山东省海洋资源与环境研究院、国家海洋局第一海洋研究所、马山集团有限公司、山东蓝色海洋科技股份有限公司、山东东方海洋科技股份

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

中科院海洋所破译海参基因组

  记者从中科院海洋所获悉,国际学术期刊PLoS Biology13日在线刊发了由中国科学院海洋研究所杨红生研究员课题组和相建海、李富花研究员课题组主导,天津生物芯片技术公司、加拿大纽芬兰纪念大学等单位合作,由张晓军、孙丽娜、袁剑波等青年科研人员为共同第一作者,协力完成的研究论文“The sea c

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

川续断科的简介

  双子叶植物纲菊亚纲川续断目的1科,1年生或多年生草本,稀小灌木,光滑, 被长毛或有刺。叶对生,稀轮生,单叶,稀羽状复叶,无托叶。花序一般为具有总苞的聚伞形密头状花序或穗状轮伞花序,少数为圆锥花序。花两性,左右对称,小总苞平截,冠状、刚毛状或成齿刺;花萼小,杯状、管状,或全裂成 5~20条针刺或羽

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检