中国学者发表RNA甲基化重要成果

基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普渡大学研究团队,通过全转录组高通量深度m6A测序,揭示了拟南芥不同器官之间差异性的m6A甲基化模式。这项研究发表在十二月十四日的Genome Biology杂志上,文章的通讯作者是Zhaobo Lang和Yizhen Wan。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,兼具信息分子和调控分子双重功能,不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白,也调节着许多生物学过程。RNA的转录后修饰为其多样化的功能奠定了基础。据估计RNA上有一百多种化学修饰,但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。 m6A是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,介导了超过80......阅读全文

表观遗传学研究获重大突破

  同济大学高绍荣团队首次从全基因组水平上揭示了小鼠植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程,并发现宽的H3K4me3修饰在植入前胚胎发育过程中对基因表达发挥重要调控作用。相关成果9月15日在线发表于《自然》。  高绍荣研究组利用极少量的细胞检测了小鼠植入前胚胎发育各个

PerkinElmer发布表观遗传学和NGS新品

  在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上,PerkinElmer公司展示了一系列新产品,包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。   表观遗传学新品   表观遗传学生化工

Nature:遏制哮喘的表观遗传学酶

  研究人员发现重编程小鼠体内促哮喘的免疫细胞可以减少气道损伤和炎症,并有可能促成哮喘患者的新治疗。   研究人员能够重编程的促哮喘细胞是一种称为Th2细胞的免疫细胞,他们确定了一种可以修饰这些细胞DNA的酶。该酶可作为开发过量Th2细胞导致的慢性炎症疾病,尤其是过敏性哮喘的新疗法的一个靶点。相关

表观遗传学有助解释妊娠高血压

  弗吉尼亚联邦大学(VCU)医学院的研究者发现,一种关键酶的基因表达变化可能会导致有先兆子痫的孕妇出现高血压,并使她们形成血栓的易感性增加。这些结果可为孕妇高血压和血栓形成的最佳治疗方法提供线索,高血压和血栓形成可能会阻断孕妇内脏器官的血流,并且导致器官衰竭。    研究者一直致力于从分子层面

PNAS首次评估表观遗传学突变率

  Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的

表观遗传学热点酶的作用机制

  加州大学圣芭芭拉分校的研究人员发现大肠杆菌的Dam酶在DNA上移动进行修饰时会发生“跳跃”,并对其物理特性和行为进行了分析,这一研究成果能为生物医学研究和其他科学应用提供帮助。该文章发表在Journal of Biological Chemistry杂志上。   大肠杆菌的适应机制使其能依

Nature子刊发布大脑表观遗传学重要图谱

  表观遗传修饰的重要性越来越被人们所认识,但在人类大脑中的作用并不是很清楚,实际上在胚胎和成人大脑中,神经干细胞增殖并通过一些受到高度调控的过程生成神经元和神经胶质,包括DNA和组蛋白修饰以及非编码RNAs调控在内的表观遗传学机制在神经发生的不同阶段发挥至关重要的作用。另一方面异常的表观遗传调控也

组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系

在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—

植物DNA去甲基化的机理和功能

  10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i

躁郁症药物再造蚂蚁

  无论觅食、照顾幼小,还是守卫巢穴,木匠蚁中的工蚁为它们的蜂王和蜂群无私地辛苦工作着。如今,生物学家阐明了如何对一些工蚁的DNA进行微小化学修饰,让它们更加勤劳地工作,或者改变其在蚂蚁社会中所承担的职务。    佛罗里达弓背蚁中的未成年工蚁(左)和成年工蚁 图片来源:Riley J. Graham

新研究揭示表观遗传和代谢如何在癌症发育中发挥作用

  最近一项研究对表观遗传学如何调节人类基因程序进行了研究。该研究表明如果表观遗传受到扰乱就有可能开启癌基因或关闭抑癌基因,这两种事件都会导致正常细胞变成肿瘤细胞引起癌症。  半世纪以前的实验曾经发现影响DNA包装的化学修饰可以开启或关闭基因的表达,这样就引入了表观遗传学密码的概念。  表观遗传学的

纳米孔测序联合光学测绘揭示转基因植物细节

  索尔克的研究人员利用最新的DNA测序技术,在分子水平上研究植物插入新基因后会发生什么。  索尔克的研究人员绘制了具有最高分辨率的转基因植物系基因组和表观基因组图,为了精确地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上会发生什么。他们的研究结果发表在2019年1月15日的PLOS Genetics,阐明

遗传发育所在植物着丝粒形成及其表观遗传学研究中获进展

  植物着丝粒含有大量的重复序列和反转座子,结构复杂并受表观遗传学调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所韩方普研究组长期从事植物着丝粒的表观遗传学研究,曾在植物中首次发现着丝粒的失活现象并初步分析失活着丝粒的调控机制可能与DNA甲基化状态相关。由于着丝粒的特殊表观遗传学调控机制,植物着丝粒的DNA序

Nature聚焦p53与癌症表观遗传

  来自宾夕法尼亚大学Perelman医学院的一项新研究发现,侵袭性癌症生长及一些表观遗传改变与突变p53蛋白有关。在本周的《自然》(Nature)杂志上这一研究小组描述了他们的研究结果以及对于一些难治癌症的意义。  领导这一研究的是多伦多大学细胞与发育生物学、遗传学和生物学系教授Shelley B

Nature聚焦p53与癌症表观遗传

  来自宾夕法尼亚大学Perelman医学院的一项新研究发现,侵袭性癌症生长及一些表观遗传改变与突变p53蛋白有关。在本周的《自然》(Nature)杂志上这一研究小组描述了他们的研究结果以及对于一些难治癌症的意义。   领导这一研究的是多伦多大学细胞与发育生物学、遗传学和生物学系教授Shelley

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

石晓冰:CRISPR发现与癌症有关的蛋白“阅读器”

  近二十年来,科学家开始逐渐认识到DNA中的遗传密码只代表了生命蓝图中的一部分信息。遗传信息还来自于DNA结构上的特殊化学标签模式,这些表观遗传学标签决定了DNA包装的紧密程度以及特定基因的开关。  2014年,石晓冰研究组与清华大学李海涛教授研究组合作发现了一类新型组蛋白乙酰化修饰“阅读器”:Y

尚永丰院士连发PNAS,PLoS文章揭示癌细胞机制

  来自天津医科大学,北京大学,天津市医学表观遗传学重点实验的研究人员发表了题为“Histone demethylase KDM5B is a key regulator of genome stability”的文章,发现KDM5B是对DNA损伤应答至关重要的一个蛋白,而且这种酶也是基因组

武汉大学青年教授信号研究登权威刊物

  来自武汉大学生命科学学院,华中科技大学等处的研究人员发现在免疫信号转导通路的一种新机制:表观遗传因子选择性调控特定基因的激活,是信号转导通路下游的重要调节因素之一,这一研究成果将表观遗传学与下游基因调控联系在了一起,对于免疫系统研究等方面具有重要意义,相关成果公布在国际著名细胞生物学研究杂志Jo

逆境中心等揭示以DTF1为中心的DNA甲基化调控新机制

  5月1日,国际学术期刊《美国科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences) 在线发表了中科院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组和北京生命科学研究所何新建课题组的学术论文DTF1 is a core co

庄小威院士:新成像方法测量染色质的表观遗传修饰

  空间组学方法的最新发展使得单细胞转录组分析和三维基因组组织具有较高的空间分辨率。空间分辨单细胞表观基因组学方法将扩展空间组学工具的知识库,加速对细胞和组织功能的空间调节的理解。  2022年10月21日,哈佛大学庄小威团队在Cell 在线发表题为“Spatially resolved epige

两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传

  一般认为胚胎早期发育过程中,精子仅仅提供DNA遗传信息,其它方面主要由卵细胞决定,然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果,指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育,这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念,也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。  

表观遗传学药物有望解决癌症治疗难题

  表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。这样的措施将大大有

表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究

随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存

表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究

随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗

基因组研究的“98K”——人工智能算法

  每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。  如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个

精准医疗:再吸金€6.7亿,4篇Nature奠定临床新技术

  近年来,随着基因组学技术在医疗领域的广泛应用,全球范围内对疾病的诊疗能力有了很大的提高,各国政府也纷纷制定了相关的医疗计划,并投入大量的资金。近日法国首次宣布启动《法国基因组医疗2025》计划,精准医疗再度吸来重金。疾病诊疗技术是精准医疗得以实现的关键,6月27日,Nature平台连发四篇文章证

施扬、何川教授发表Nature综述:新表观遗传学标记

  N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)是一种广泛存在于原核生物的甲基化修饰碱基,主要在宿主防御系统中起作用。最近科学家们发现,6mA在真核生物中也比较普遍,而且承担着重要的生物学功能。  哈佛大学的施扬(Yang Shi)教授和芝加哥大学的何川(Chuan He)教授日前在

免疫细胞的衰老,主因是环境-|-Cell揭示根源

  来自于斯坦福大学医学院的科学家们完成了这一庞大的工作,分析了大量免疫细胞。他们发现,相比于年轻人,老年人的免疫细胞携带更多的染色质修饰。而且,这些修饰差异主要来源于环境。  研究团队的关注点在于组蛋白(与细胞核内DNA紧密结合的蛋白结构)修饰,是表观遗传学的重要部分,后者在健康、疾病领域有着不容

2015国家自然科学基金:表观遗传学什么是重点

  来自国家自然科学基金委员会的消息,8月18日国家自然科学基金委员会公布了2015年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16709项、重点项目624项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16155项、地区科学基金项目2829项、海外及港澳学者合作研究基