中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普渡大学研究团队,通过全转录组高通量深度m6A测序,揭示了拟南芥不同器官之间差异性的m6A甲基化模式。这项研究发表在十二月十四日的Genome Biology杂志上,文章的通讯作者是Zhaobo Lang和Yizhen Wan。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,兼具信息分子和调控分子双重功能,不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白,也调节着许多生物学过程。RNA的转录后修饰为其多样化的功能奠定了基础。据估计RNA上有一百多种化学修饰,但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。 m6A是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,介导了超过80......阅读全文
2017诺贝尔奖预测:表观遗传会上榜吗?
10月“诺贝尔奖月”即将来到,颁奖期正在临近,科学家们和各方面专家们又开始了一年一度的预测活动,尽管严肃的态度各异,焦点都只有一个:谁将赢得今年的诺贝尔奖项? 表观遗传学是指在基因组的水平上研究不改变DNA序列而通过表观遗传修饰调控基因表达改变的学科。由于被认为有可能解释衰老、人类发育和如癌症
多篇文章聚焦免疫应答背后的表观遗传相互作用
国际人类表观基因组联盟(IHEC)近日在《Cell》等杂志上发表了40多篇论文,为人们呈现了原代组织的表观遗传数据集,以及复杂人类疾病的细胞机制分析。其中,几个团队开始解析免疫细胞发育、谱系确定和分化,以及免疫应答背后的复杂表观遗传相互作用。 在一项发表于《Immunity》的研究中,德国的
著名学者朱健康院士Cell-Research发表表观遗传学研究成果
生物通报道:转座子通常是通过表观遗传学机制(包括DNA甲基化)保持沉默的。12月9日,在《Cell Research》杂志上发表的一项研究中,来自中科院上海生命科学研究院、美国普渡大学以及中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员,在拟南芥中将一对Harbinger转座子衍生蛋白(HDPs)——HD
揭秘阿尔兹海默病患者如何失去对基因活性的控制?
阐明大脑中控制基因活性的分子机制或能帮助理解阿尔兹海默病的发病机理,近日,一项刊登在国际杂志Nature Neuroscience上的研究报告中,来自英国埃克塞特大学的科学家们通过研究揭开了基因活性指示器和阿尔兹海默病的发病关联,相关研究或为后期科学家们开发治疗阿尔兹海默病的新型疗法提供新的思路
表观基因组的概念
中文名称表观基因组英文名称epigenome定 义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表观遗传研究热点(一)
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和DNA甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布Nature, Cell和Science等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这
上海药物所合作研究发现一种新组蛋白表观遗传修饰
美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室联合中科院上海药物研究所、美国加州大学圣地亚哥分校、法国Joseph Fourier大学等单位研究人员合作完成的关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文于9月18日在《细胞》杂志上在线发表。这也是上海药物所与赵英明教授合作的化学蛋白质组学研究中
复旦大学石雨江、徐彦辉教授Cell子刊新文章
近日来自复旦大学、布莱根妇女医院和哈佛大学医学院的研究人员在新研究中揭示了一种组蛋白去甲基化调控的新机制,相关论文发表在12月20日的《分子细胞》(Molecular cell)杂志上。 来自复旦大学生物医学研究院的石雨江(Yujiang Geno Shi)教授和徐彦辉(Yanhui
表观遗传修饰的细胞中DNA发生BZ构象转变被揭示
细胞核中,缠绕在组蛋白上的双链DNA一般以右手螺旋的B-DNA构象存在,但也会存在其它构象。组蛋白的乙酰化修饰是表观遗传学研究的重要内容。当组蛋白发生乙酰化时,DNA 与组蛋白八聚体的紧密缠绕被解开。那么,组蛋白的乙酰化是否影响DNA的构象,甚至导致B-DNA构象向其它构象包括Z-DNA构象转化
研究发现胚胎可接收亲本特有的信息层
最近,旧金山州立大学的研究人员发现,解释一个新胚胎遗传密码的信息,根据它来自于父亲还是母亲而有所不同。 研究人员在2014年10月9日《PLOS Genetics》发表的一篇文章中,详细阐述了精子和卵子传递成功繁殖所需要的信息的多层过程。尽管一层是被转移的DNA密码,这项新研究发现了不是由DN
北大汤富酬发表表观基因组新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性。基因表达在时间和空间上的表观遗传学调控,对于人类发育是至关重要的。近年来,表观基因组已经成为了生物医学领域的一大研究热点。 北京大学的研究团队对早期人类胚胎进行深入研究,获得了胎儿大脑、心脏和肝脏的表观基因组景观。这一成果发表在十二月
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类:基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP)和重亚硫酸盐测序(bisulfite sequencing, BS)引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性,使常规的分子生物学
寿命能推算吗?加州大学科学家提出“预测方法”
从古至今,从国内到国外,从炼丹术到现代科学,长生不老似乎一直是人类乐此不疲的追求。 但若要延缓衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大学洛杉矶分校(UCLA)生物统计学家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)发现了一种预测一个人生命周期的方法:基于300~500个DNA甲基化标记,
Nature子刊:殊途同归的疾病通路
面肩肱型肌营养不良症FSHD是一种严重的遗传疾病,患者会经历进程性的肌无力,约五分之一的患者在40岁时需要使用轮椅。FSHD通常是可遗传的,不过有时也会由于新突变而发病。科学家们发现了FSHD的新发病机制,阐述了表观遗传学修饰在该疾病发生中的作用,文章发表在十一月十一日的Nature Gen
表观基因组学研究指南(三)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal
Cell子刊惊人发现:饮食会通过肠道菌影响表观基因组
UW-Madison研究团队十一月二十三日在Molecular Cell杂志上发表文章指出,饮食会影响肠道菌释放的代谢物。这些代谢物作用于宿主近端结肠、肝脏和脂肪组织的组蛋白,通过表观遗传学途径改变这些组织的基因转录。 研究人员首先对无菌小鼠和肠道菌活跃的小鼠进行比较。他们发现,肠道菌群能改变
达尔文加拉马克,可能才是完整的进化论
随着科学的进一步发展,达尔文理论也显示出了一些不足之处。 所谓物竞天择,适者生存,现代生物学的许多主流研究方向都以查尔斯·达尔文(Charles Darwin)“自然选择”的进化论为基础:只有最能适应环境的生命体才能在物种演化的洪流中获得生存和繁衍的权利。这个自然选择的过程也被称为适应,而最容
表观遗传学研究获重大突破
同济大学高绍荣团队首次从全基因组水平上揭示了小鼠植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程,并发现宽的H3K4me3修饰在植入前胚胎发育过程中对基因表达发挥重要调控作用。相关成果9月15日在线发表于《自然》。 高绍荣研究组利用极少量的细胞检测了小鼠植入前胚胎发育各个
Nature报道表观遗传学新发现
日前,芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。 RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序(RNA binding motif,RBMs)1、2、3的结合来控制细胞
Nature:遏制哮喘的表观遗传学酶
研究人员发现重编程小鼠体内促哮喘的免疫细胞可以减少气道损伤和炎症,并有可能促成哮喘患者的新治疗。 研究人员能够重编程的促哮喘细胞是一种称为Th2细胞的免疫细胞,他们确定了一种可以修饰这些细胞DNA的酶。该酶可作为开发过量Th2细胞导致的慢性炎症疾病,尤其是过敏性哮喘的新疗法的一个靶点。相关
Nature:癌症与表观遗传学重编程
延胡索酸(fumarate)是细胞三羧酸循环的一种中间产物。它天然存在于蔬菜水果中,也被用作调味的食物添加剂。Nature杂志发表的一项最新研究表明,代谢物延胡索酸过多会造成表观遗传学重编程,进而推动癌症发展。 遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌(HLRC)是一种罕见的人类癌症,会引起皮肤肿瘤和肾癌。
表观遗传学热点酶的作用机制
加州大学圣芭芭拉分校的研究人员发现大肠杆菌的Dam酶在DNA上移动进行修饰时会发生“跳跃”,并对其物理特性和行为进行了分析,这一研究成果能为生物医学研究和其他科学应用提供帮助。该文章发表在Journal of Biological Chemistry杂志上。 大肠杆菌的适应机制使其能依
PerkinElmer发布表观遗传学和NGS新品
在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上,PerkinElmer公司展示了一系列新产品,包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。 表观遗传学新品 表观遗传学生化工
PNAS首次评估表观遗传学突变率
Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中,精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率,有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物(包括人类)的
Nature综述:表观遗传学预测癌症弱点
由Bellvitge生物医学研究协会癌症表观遗传与生物学研究组Manel Esteller领导的研究组,发表题为“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的综述文章,概况了近期在应用表观遗传
表观遗传学有助解释妊娠高血压
弗吉尼亚联邦大学(VCU)医学院的研究者发现,一种关键酶的基因表达变化可能会导致有先兆子痫的孕妇出现高血压,并使她们形成血栓的易感性增加。这些结果可为孕妇高血压和血栓形成的最佳治疗方法提供线索,高血压和血栓形成可能会阻断孕妇内脏器官的血流,并且导致器官衰竭。 研究者一直致力于从分子层面
Science发文揭示人类早期胚胎组蛋白修饰重编程过程
清华大学生命科学学院颉伟课题组与郑州大学第一附属医院孙莹璞/徐家伟课题组合作,揭示了人类早期发育过程中组蛋白修饰的重编程过程。研究成果以“人类亲本-合子转变中组蛋白修饰的重编程”(Resetting histone modifications during human parental-to-z
上海生科院发现植物去甲基化调控的新机制
2月12日,国际权威学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组的研究论文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
厦门大学PNAS发表癌症研究新成果
来自厦门大学的研究人员证实,Menin通过表观遗传上调Yap1的转录促进了肝癌的形成。这一研究发现在线发表在10月7日的《美国科学院院刊》(PNAS)上。 文章的通讯作者是厦门大学金光辉(Guang-Hui Jin)教授,金教授早年毕业于白求恩医科大学,主要研究领域为探讨疾病发病进程中
DNA甲基化反应的作用机制
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(