复旦权威期刊发表乳腺癌新成果

乳腺癌是女性中最常见、也最严重的恶性肿瘤之一。40-60岁之间、绝经期前后的妇女发病率较高,仅约1-2%的乳腺患者是男性。这种恶性肿瘤通常发生在乳腺上皮组织,会严重影响女性的身心健康乃至危及生命。三阴乳腺癌是乳腺癌中最凶险的一种,大约占乳腺癌的16%。 复旦大学附属肿瘤医院的研究团队对三阴乳腺癌进行了转录组分析,揭示了一个综合性的mRNA-lncRNA预后指标。这项研究于二月二十九日发表在十大肿瘤学期刊之一的Cancer Research杂志上,文章的通讯作者是复旦大学附属肿瘤医院的邵志敏教授。 邵志敏教授的研究团队希望为TNBC患者开发RNA指标,以便更好的评估癌症风险,选择更合适的辅助疗法。他们通过转录组芯片对TNBC和正常乳腺组织进行了分析,鉴定了与乳腺癌复发有关的肿瘤特异性mRNA和长非编码(lncRNA)。 研究人员在此基础上开发了一个mRNA-lncRNA综合指标,mRNA包括FCGR1A、RSAD2和 C......阅读全文

Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27

又一国产高分数据库,堪称lncRNA神器

  之前我们介绍了好用的CRN数据库,可以在线分析差异表达lncRNA并绘制与差异mRNA联系的网络图。那么有没有能直接出lncRNA与预后相关的生存曲线图的工具呢?答案当然是有的!这次我们就一起来看一下这个数据库!  lnCAR数据库(https://lncar.renlab.org/)是由中山大

中山大学宋尔卫团队合作再取突破

  ATR-Chk1通路在细胞对DNA损伤和复制应激的反应中是必不可少的,而长链非编码RNA (lncRNAs)在调节该通路中的作用在很大程度上仍然未知。  2024年7月14日,中山大学罗曼莉及宋尔卫共同通讯在Cell Insight 在线发表题为“ATR/Chk1 interacting lnc

肿瘤抑制子HIC1通过影响下游lncRNAnumb进而影响葡萄膜黑...

肿瘤抑制子HIC1通过影响下游lncRNA-numb进而影响葡萄膜黑素瘤(UM)激活过程研究背景葡萄膜黑素瘤(UM)是一种最常见的眼内肿瘤,占据了黑色素瘤的5%左右。大约有一半的原发UM患者有发生肝转移的风险,但是目前对于分子层面的精确诊断和治疗还不完善。先前的研究表明,基因组拷贝数变异与UM的转移

肿瘤抑制子HIC1通过影响ncRNAnumb葡萄膜黑素瘤-激活过程

  葡萄膜黑素瘤(UM)是一种最常见的眼内肿瘤,占据了黑色素瘤的5%左右。大约有一半的原发UM患者有发生肝转移的风险,但是目前对于分子层面的精确诊断和治疗还不完善。先前的研究表明,基因组拷贝数变异与UM的转移风险有关。GNAQ,GNA11,BAP1的基因突变也与UM相关。现有研究表明,转录组长链非编

南开大学权威期刊发表癌症研究新成果

  C-Myc是一种活跃于很多人类肿瘤中的重要转录因子,但人们还不清楚它的作用机制。南开大学的研究团队在乳腺癌细胞中鉴定了一个介导c-Myc转录激活的lncRNA/蛋白复合体,这项研究前不久发表在十大肿瘤学期刊之一的Cancer Research杂志上,文章的通讯作者是南开大学生命科学学院的叶丽虹教

江南大学王学东团队涉嫌图片捏造-8.7分的文章被撤回

  长链非编码 RNA (lncRNA) 作为致癌基因或肿瘤抑制因子,在肿瘤发生和化疗耐药性中发挥重要作用。  2018年10月14日,江南大学王学东团队在Cancer Letter(IF=8.68) 在线发表题为“Downregulation of lncRNA GAS5 confers tamo

南京医科大学最新文章:癌细胞中的RNA表达模式

  系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA,来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索,旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR

如何研究lncRNA?三位科学家现身说法

  人生如戏,相信长链非编码RNA(lncRNA)也体会到了。之前一直遭冷遇,如今却是万人迷。其实,人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据,人类基因组中包含16,000条lncRNA,产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据,目前已知

著名遗传学家Nature发表lncRNA重要发现

  长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生

食物中的成分如何影响重要的lncRNA表达?

  尽管不断有突破性研究成果涌现,癌症依然还是令人谈虎色变的绝症。各种传说中的防癌食品一会儿备受热捧,一会儿又被各种科技网红辟谣扒皮,令人搞不清方向。不过常言道,research,research,就是要反反复复来来回回地search,不然那怎么叫re-search?众多网红的抗癌食物中,花椰菜始终

LncRNADILC阻碍肝癌干细胞更新和增殖

   中国工程院院士、第二军医大学王红阳教授课题组长期从事恶性肿瘤的基础与临床研究,对肿瘤发生发展的分子病理机制和细胞信号转导有重要建树。近期,该实验室使用Arraystar LncRNA芯片发现了与肝癌干细胞的自我更新相关的分子--Lnc-DILC。高表达的Lnc-DILC可以竞争性结合IL-6,

LncRNADILC阻碍肝癌干细胞更新和增殖

中国工程院院士、第二军医大学王红阳教授课题组长期从事恶性肿瘤的基础与临床研究,对肿瘤发生发展的分子病理机制和细胞信号转导有重要建树。近期,该实验室使用Arraystar LncRNA芯片发现了与肝癌干细胞的自我更新相关的分子--Lnc-DILC。高表达的Lnc-DILC可以竞争性结合IL-6,阻

著名遗传学家Nature发表lncRNA重要发现

长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学

共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了

第二军医大学Hepatology聚焦lncRNA

  来自第二军医大学的研究人员在新研究中证实,在肝再生过程中一种称之为lncRNA-LALR1(Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1)的长链非编码RNA通过激活Wnt/β-Catenin信号促进了肝细胞增殖。相关论文

Nature重大发现:让癌症上瘾的lncRNA

  与比利时根特大学的研究人员合作,来自VIB/鲁汶大学的科学家们揭示出了恶性黑色素瘤与非编码RNA基因SAMMSON之间不同寻常的联系。SAMMSON基因特异地表达于人类恶性黑色素瘤中,并且引人注目地是,侵袭性皮肤癌的生长高度依赖于这一基因。研究结果有可能为改进诊断工具及皮肤癌的治疗铺平道路。  

高产华人教授Nat-Genet发表lncRNA研究成果

  最近,斯坦福大学的研究人员发现,被称为P53的肿瘤抑制基因,可通过一个叫做DINO的调控RNA分子而得以稳定。这种相互作用有助于细胞对DNA损伤做出反应,并可能在癌症的发展和过早老化中发挥作用。该研究结果发表在9月26日的《Nature Genetics》杂志上。  知道什么时候抓牌,什么时候把

共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

  lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提

Nature-子刊:研究lncRNA功能的新方法

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,有的位于基因间或者内含子中。

揭示lncRNA在EMT过程中发挥的作用

西班牙塞利维亚大学教授José A Pintor-Toro长期从事生物化学与细胞生物学研究, 近期,其实验室利用Arraystar LncRNA芯片研究发现了在TGF-β诱导的上皮-间质细胞转化(EMT)过程早期起直接调控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1,TGF-β诱导直接引起lnc-Sp

LncRNA搭上m6A后逆袭为新星

m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell,Cell

共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

  lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提

Cell子刊:超保守lncRNA的重要功能

  谈到遗传物质,我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA(脱氧核糖核酸)。这些DNA会转录成为RNA,进而指导各种蛋白质的合成,例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外,细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。  MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA,这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭

应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应

中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基

LncRNA:从“转录噪声”到科研高地的逆袭

  2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时,第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物,并将其命名为长链非编码RNA,也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里,由于它不参与蛋白质的编码,当时认为不具有生物学功能,科学家们都普遍认为lncRNA仅仅是基

中科院Nature子刊发重要成果:帮助癌症干细胞的lncRNA

  癌症干细胞(CSC)能够通过自我更新和分化,启动并维持癌症的发生和发展。人们已经在越来越多的肿瘤中分离和鉴定到了癌症干细胞,比如结肠癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。  肝癌是一种预后很差的常见恶性肿瘤。我国是肝癌高发国家,每年约有11万人死于这种疾病。肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌的主要类型,也是恶性

世界宣传乳腺癌日|教你如何识别早期乳腺癌!

  在乳腺癌中,异常基因导致乳腺细胞生长不受控制,并且不会正常死亡。  如果这些细胞生长缓慢且不侵入其他组织,它们就会形成良性肿瘤。这些通常是被认为对健康危害不大的肿块。  当异常细胞以更快的速率生长并开始侵入周围组织时,它们形成癌性肿瘤。这些团块会造成严重的风险,可以在整个身体内进行散播,形成新的

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘

  外泌体是指包含多种RNA(环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白质的盘状囊泡(30-200nm)。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于各种体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡,能够参与细胞间通讯。目前,有关外泌体分泌、摄取、

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析

  近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through