最新研究告诉你癌症个性化治疗的必要性
最近，一个西奈山医学院伊坎研究所的试点项目结果显示在许多临床实验室中，多维的个性化基因组分析对于病人的治疗来说比特定基因的筛查面板更加有效。该西奈山科研团队的科学家们使用了一套完整的基因组分析方法完成了其个性化癌症治疗技术的开发与测试。 随着NGS技术运行成本的逐渐降低，临床实验室快速配备了针对于不同癌症肿瘤DNA致病突变筛查面板。癌症患者肿瘤组织中携带的特定遗传变异对于指导病人的癌症个性化治疗至关重要。在目前的癌症个性化治疗项目中，研究人员与临床医生通常都会同时收集病人基因组成的相关数据与其肿瘤组织的测序数据，通过比较探明个性化遗传分析对于病人癌症治疗的作用。 “为每一位病人裁剪癌症治疗方案是一件引人入胜的事情。每一种肿瘤都有其独特的信号通路与遗传特征，这些因素直接影响着肿瘤的发病与癌症的临床疗效。”文章的第一研究作者，西奈山伊坎研究所遗传学和基因组学助教以及临床基因组信息学主任陈荣博士向读者解释道（陈荣博士之前的一篇......阅读全文
2016值得关注的技术：基因组分析深度学习
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
Nature发布大型全基因组RNA分析研究
由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术，将有助于科学团体以从前不可能达到的规模，来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。 科学家们开发出了一种方法，能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况，由此阐明植物以及其他的活体生物对环境
Illumina收购Edico－Genome，加速基因组数据分析
Edico的DRAGEN™ Bio-IT平台为新一代测序带来了更快更简化的输出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司（纳斯达克代码：ILMN）宣布收购新一代测序（NGS）数据分析加速解决方案的领先供应商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN™ B
经胎盘传播伴基因组差异病例分析2
讨论垂直传播是妊娠期传染病的一个主要并发症[1]。相比于未妊娠的育龄期女性，妊娠期女性需要更关注新冠病毒[2]。新冠感染后早产、子痫前期、剖宫产、胎儿血管灌注不良、胎膜早破和围产期死亡的发生率更高[3，4]。尽管有许多文献报道了新冠的垂直传播[5]，但是目前只有Vivanti[6]、Fenizia[
经胎盘传播伴基因组差异病例分析1
病例情况27岁孕妇（孕2产1）在34+4周时入院治疗，主诉发热3天，腹痛，胎动减弱。入院前1天开始干咳。患者偏胖（BMI=27），全身状况良好。产前检查正常，32+2周时产科超声示胎儿体重正常范围。入院时，病人迅速隔离。鼻咽拭子采样，通过实时定量聚合酶链式反应（RT-PCR）检测新冠病毒。此时患者体
全基因组重测序的生物信息分析内容
1．数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计，测序深度分析。2．一致性序列组装与参考基因组序列（Reference genome sequence）的比对分析，利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型，并组装出该个体
《Cell》：如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日，这一计划已经取得了许多成果，最新Cell杂志公布了泛癌症图谱（Pan-Cancer Atlas），这也是癌症基因组图谱（TCGA）的收官项目，同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表，以及相关的一些主要发现（每种肿瘤类型的标记论文）。 生物通报道：2005年美国国立
植物基因组DNA的RFLP多态性分析
一、原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间，也存在于同一种植物的不同个体之间。RFLP多态性是指DNA限制性内切酶酶切片段长度的多态性(restniction fragment length olymophorphism)。由于碱基顺序的差异，在不同的
北京基因组所实现对大样本全基因组数据的群体遗传学分析
计算基因组学旨在发展理论和方法学，对基因组数据进行数据挖掘、提取信息。其中对遗传多态性，如基因频谱、单倍型结构等进行建模，利用群体基因组水平的遗传变异数据来推断群体的历史和变迁是群体遗传学的核心内容。传统的群体遗传学分析方法通常基于小样本数据，所推断的多为相对古老的历史事件，例如，被广泛应用的L
Nature－Genetics揭示基因与环境的复杂互作
目前的个性化医疗主要是通过分子分析（尤其是基因测序）来鉴定遗传突变，进而评估个体患上特定疾病的风险。但日内瓦大学（UNIGE）的科学家们指出，真正的个性化医疗远没有这么简单。 研究人员对四百对双胞胎进行了RNA测序，量化了遗传背景和环境背景对基因表达的影响。这项发表在Nature Geneti
NEJM：首个高度个性化治疗的抗癌药物问世
一种量身定制的药物，可攻击肿瘤细胞的致命弱点，从而缩小或稳定某些较难根治的遗传性癌症患者身上的肿瘤。此项早期试验成果发表在近期的《新英格兰医学杂志》(NEJM)网络版上。 这种被称为Olaparib的药物是世界上首个可达至高度个性化治疗的新型抗癌药物。研究人员在药物开发过程中引入了一种“综
应对肝炎“个性化”治疗是关键－心态健康有助康复
据世界卫生组织的数据显示，全球约有慢性乙肝患者2.4亿人，慢性丙肝患者1.5亿人，每年约有一百万人死于与病毒性肝炎相关的疾病。为了提高人们对病毒性肝炎及其所导致的疾病的认识和了解，世界卫生组织把乙肝病毒的发现者、诺贝尔奖得主巴鲁克·塞缪尔·布隆伯格的生日，每年的7月28日定为“世界肝炎日”。今
血液检测可使肺癌患者获得早期的个性化治疗
一项最新研究详细介绍了血液检测的发展通过血液检测可以在72小时内识别与非小细胞肺癌（NSCLC）相关的基因突变。研究人员说，血液检测或许能够使得肺癌得到更快、更有效的治疗。 这种新的检测技术是由Gary A. Pestano博士及其Biodesix公司的同事一同研发出来的，Biodesix公司
NATURE：个性化的鸡尾酒疗法或可战胜癌症
近日在science发表的一项研究预示了癌症个性化治疗的未来。国际间关于癌症的基因组测序的努力已经完成了一份突变目录，这些突变能够促进肿瘤生长，并为药物靶点提供了诱人的位点。但是，试图开发靶向打击的疗法至今是令人沮丧的：许多药物最初能够缩小肿瘤，但是癌症往往能够死灰复燃。一个看似十分有用的疗法可
中英研究团队共同开发个性化疫苗系统
英国伦敦玛丽女王大学和郑州大学的研究人员合作开发了一种个性化疫苗系统，最终可能延迟胰腺癌的发生。该研究为在高风险人群中开发预防癌症的疫苗以及减慢患者的肿瘤生长上提供了强有力的概念证明。该团队在使用小鼠的临床前模型研究发表在《临床癌症研究》杂志上。 对于由已知病原体引起的某些癌症，如引起子宫颈癌
华因康推出个性化生物医疗新技术
昨日下午，华因康基因科技有限公司新闻发布会暨签约仪式在深圳会展中心六楼郁金香厅举行，向卫生医疗界、公众传达华因康公司高通量测序平台在战略合作项目、临床应用领域取得实质性进展。深圳市政府副秘书长余新国，南山区区长李小甘，区委常委、常务副区长王克力等出席活动。 发布会上华因康基因科技有限公司宣
专访朱永新：好的教育应该满足个性化需求
全国政协常委、中国教育学会副会长朱永新接受南都专访： 好的教育应该满足个性化需求 让大家像淘宝购物一样选课上课 全国政协常委朱永新 和朱永新先生的这次采访，是在饭后散步的过程中完成的。朱先生健步如飞，同时仍能思维敏捷地回答每一个问题，让人觉得有点跟不上他的节奏。 朱永新是全国政协常委、第
新型个性化生物医学3D图像诊断
研发人员解释道：这项革新可极为快速和精确的获得生物体的3D图像。从广义上讲，螺旋光学投影成像即：使物品旋转的同时还能垂直移动从而获得三维图像。4D-Nature，一个由学校支持，并从卡三科技园区创业基地独立出来的公司，根据客户的需求，在生物医学基础研究领域提供多种应用，设计，发展并安装高等投影设
奥巴马推出“精确医学计划”－推动发展个性化医疗
美国总统奥巴马30日推出“精确医学计划”，提议在2016财年向该计划投入2.15亿美元，以推动个性化医疗的发展。 奥巴马当天在白宫举行的“精确医学计划”活动上说，“精确医学”为实现重大医学突破创造巨大机遇，为新一代拯救生命的医学发现铺平道路，“并有望让我们所有人获得我们自己和我们的家人保持健康
个性化给药！基因芯片了解一下
临床上同病同治不同疗效的现象比比皆是，面对一些格外棘手的患者，以往医生只能无奈地解释为个体化差异。如今，以药物基因组学理论和基因检测为基础的“个体化药物治疗”可以实现量体裁衣式的个体化给药，它可以帮助医生解决患者的用药问题。 1.介绍 基因芯片，是把大量已知序列探针集成在同一个基片(如玻片、
个性化给药！基因芯片了解一下
临床上同病同治不同疗效的现象比比皆是，面对一些格外棘手的患者，以往医生只能无奈地解释为个体化差异。如今，以药物基因组学理论和基因检测为基础的“个体化药物治疗”可以实现量体裁衣式的个体化给药，它可以帮助医生解决患者的用药问题。 1.介绍 基因芯片，是把大量已知序列探针集成在同一个基片
“组学与个性化治疗”专题研讨会
“组学与个性化治疗”专题研讨会Symposium and Personalized treatment “组学与个性化治疗”专题研讨会 会议时间：2014年9月24-26日 会议地点：上海新国际博览中心 主办单位：中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会（CNHUPO） 承办单位：
利用原代细胞模型探索药理药效个性化治疗方案
如何将基础研究的发现和方法应用于临床疾病治疗的指导和监测也是转化医学力攻的重要方向之一。对于人类健康首要杀手--肿瘤的重要治疗手段是化疗，长期以来，由于无法在对病人进行化疗前进行不同个体对药物的敏感性和耐药性的预测，而主要根据临床医生的经验进行判断给药，具有极大的盲目性。很多时候这种不科学地给药和治
－Sci－Transl－Med：肿瘤基因测序可能会误导癌症治疗
最近，约翰霍普金斯大学的科学家们研究表明，肿瘤基因组测序所获得的遗传变化线索，如果不先与癌旁组织的遗传信息进行比较，可能会误导近一半癌症患者的治疗。 约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员称，他们分析了超过800名癌症患者的测序数据——由Personal Genome Diagnost
5万人基因组分析发现新致病基因
一些宾夕法尼亚人并没有意识到自己携带了一些提高心脏病和中风风险的基因突变。在一项迄今最大规模的研究中，科学家网罗了超过5万人的基因组数据，并连同他们的电子健康档案，最终识别出潜在的新的致病基因。这些数据进一步证明，每250人中便有1人携带了可能使其罹患心脏病和中风的基因变异，尽管他们并没
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学
PNAS：新型DNA分析策略助力土壤宏基因组研究
对于土壤微生物来说，这是最好的时代。虽然没有人进行过准确的调查，但一勺土壤中就容纳了数千亿个微生物细胞，包含成千上万的物种。密歇根州立大学(MSU)微生物生态学中心的特聘教授Jim Tiedje指出：“土壤是地球上最多样的微生物栖息地，但我们很少了解土壤微生物的身份和功能。”Tiedje和M
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸（RNA）编辑是RNA水平一种常见的修饰，是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日，来自中科院昆明动物研究所的消息，由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队，在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍，对二倍体生物来说，虽然两个等位基因的
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸（RNA）编辑是RNA水平一种常见的修饰，是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日，来自中科院昆明动物研究所的消息，由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队，在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍，对二倍体生物来说，虽然两个等位基