基因组所小内含子进化机制研究获得新进展
插入删除数目和比值 近日，在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下，该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析，进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在，使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和进化机制研究获新进展。相关学术论文在PLoS ONE杂志发表，并且被GenomeWeb网站推荐为“每日精选”。 内含子是真核基因组的重要和必需组成部分，并且它在mRNA的加工、选择性剪接和核外运输等过程中发挥着精确且复杂的作用。在基因组进化研究中，尽管内含子并没有像编码区域一样受到足够的重视，但越来越多证据表明内含子和它们的序列受到潜在功能相关的自然选择作用。 此次博士生王大鹏等的发现：出现在长度范围为88-124nt上的小内含子的删除/插入比值要高于50-86nt；另外，出现在GC含量（鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比例）小于65%的小内......阅读全文
为什么QPCR引物设计在跨外显子的接头区
如果反转录体系里面有基因组残留，而且你的引物没有跨内含子，这样的情况下就很容易造成你的Ct偏小（除了cDNA扩增外，基因组的模板也会作为模板进行扩增，导致模板起始量偏高）；cDNA逆转后是切除内含子的，而基因组是存在内含子的，如果你的引物设计在了跨两个外显子的区域，则只能扩增cDNA而不扩增基因组。
微生物所开发出梭菌基因删除新策略
梭菌(Clostridium)是一类与人类关系非常密切的细菌。其中既有许多致病菌，如产生外毒素的破伤风梭菌和肉毒梭菌等；也有一些具有重要工业应用价值或潜力的梭菌，如丙酮丁醇梭菌和热纤梭菌等。 基因失活或基因删除是细菌功能基因组学研究的基本手段。近年来，基于乳酸乳球菌II型内含子剪切机制开发
PNAS破解新物种进化的难题
经过将近5000亿次的尝试，美国德克萨斯大学（UT）奥斯汀分校的研究人员，见证了一个罕见的事件，也许解决了一个进化的难题：内含子——位于基因中的非编码DNA序列，在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上，解决了关于新物种进化的基本问题，并可以增进我们对于“基因表达以及癌
非编码序列内含子子长度多度性((ILPs)
实验概要本实验中运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列，从而开发潜在的ILP标记，通过EPIC-PCR开发候选ILP标记，最后用实验验证及评价了ILP标记。实验步骤1. 水稻釉粳亚种基因组比较搜索ILP我们运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列
内含子的开放续框中编码产生的蛋白介绍
(1)核酸内切酶:在DNA的靶位点剪切,使内含子得以插入;(2)反转录酶:涉及将内含子RNA变成DNA拷贝;(3)成熟酶:从前体的RNA中切掉内含子的部分。
关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍
核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则（GU-AG规则）(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
绿潮藻叶绿体基因组进化机理研究取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503670.shtm石莼属海藻是一类具有重要生态功能和开发潜力的经济海藻，同时也是一类可以暴发性生长导致绿潮灾害的大型绿藻，在全球范围内广泛分布。近日，中国科学院海洋研究所海洋生态环境基因组学团队围绕石莼
解析了苹果轮纹病两种主要病原菌的动态进化模式
苹果轮纹病是一种世界性病害，也是我国苹果三大病害之一，严重影响我国苹果产业的可持续发展。 2021年5月24日，西北农林科技大学植物保护学院孙广宇教授团队在Environmental Microbiology上在线发表题为“Comparison of mitochondrial genomes
真核生物基因组的结构特点
真核生物基因组结构特点:1、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因组是双份的（即双倍体，diploid），即有两份同源的基因组。2、真核细胞基因转录产物为单顺反子（monocistron），即一个结构基因转录、翻译成一个mRNA分子，一条多肽链。3、
Cell：染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展
近期，北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell（IF：41.582）在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者对油松进行了
科学家发现内含子对细胞适应饥饿的调节机制
1月16日，加拿大舍布鲁克大学科研人员在Nature上发表了题为“Introns are mediators of cell response to starvation”的文章，发现内含子对细胞的饥饿反应具有调节作用。 内含子是所有真核细胞普遍存在的特征，通过对最初转录产物剪接除去内含子以产
内含子的重要功能：帮助酵母应对压力下的生存
内含子（intron）的存在，是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中，需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说，内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长，并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂，由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准，移码错位一个碱基都会导
两篇Nature发现内含子的新作用：帮助细胞应对压力
一直以来，科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候，从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。 1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用（至少在酵母中
嗜热细菌或可解开高等生物早期进化谜团
据物理学家组织网报道，生存在日本温泉中的一种嗜热细菌或许可解开高等复杂生物体早期进化的谜团，并可能成为21世纪生物燃料生产的关键。相关研究报告发表在《公共科学图书馆·生物学》（Public Library of Science Biology）杂志上。 分子生物学教授艾伦·兰博维兹介绍说，
全外显子测序和高通量测序一样吗
能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序，是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序，从而检测出约85%的致病突变，测序深度更高，数据更有效，变异检测更准确。全基因组测序，是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序，可以同时
割裂基因的基本信息介绍
真核生物的基因组十分复杂，DNA的含量也比原核生物的大得多。噬菌体由于基因组很小，但又要编码一些必不可少的蛋白，碱基显然不够用，这样不仅几乎所有的碱基都参加编码，而且在进化中还出现了“重叠基因”，以有限的基因编码更多的遗传信息。真核基因组正好相反，DNA十分富余，这样不仅无需“重叠基因”，而且很
中国学者Cell子刊揭示基因组“暗物质”中环状RNA新分子
9月27日，国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文，发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子，揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知，人类基因组中存在大量被称为基因组
科学家揭示内含子来源环形RNA新分子及转录调控功能机制
9月27日，国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文，发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子，揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知，人类基因组中存
病毒基因组的结构特点介绍
1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比，病毒的基因组很小，但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小，所含信息量也较小，只能编码4种蛋白质，而痘病毒的基因组有300kb之大，可以编码几百种蛋白质，不但为病毒复制所涉及的酶类编码，甚至为核苷酸代谢的酶类编码，因此
真核生物基因组的特点
问题一：真核生物基因组的结构特点有哪些 真核生物基因组有以下特点1.真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体,diploid），即有两份同源的基因组。2.真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRN
外显子基因为什么保守？《Nature－Genetics》出新答案了！
基因的基本结构分外显子和内含子，比较不同物种的基因发现外显子序列通常是保守的，而内含子序列则很少保守。外显子的种间差异不大，换句话说，人和老鼠、线虫的外显子基因都很相似。 这种相似性的科学解释是，外显子是生物体生存的关键区域，这部分区域的许多变异都会导致死亡表型，所以未存于世。内含子由于没有
假基因的产生方式
复制即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为non-processed或duplicatedpseudogenes反座即mRNA转录本经过反转录为cDNA，再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被称为processedp
假基因的产生方式
复制即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为non-processed或duplicatedpseudogenes反座即mRNA转录本经过反转录为cDNA，再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被称为processedp
假基因的产生方式
复制即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为non-processed或duplicatedpseudogenes反座即mRNA转录本经过反转录为cDNA，再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被称为processedp
Mol－Cell：基因的剪接作用如何影响机体的患病风险
没人知道一天中有多少次，甚至在一个小时内，我们体内的数万亿个细胞需要制造多少蛋白质，但我们知道，细胞会以大规模的方式在不断制造蛋白质，一旦该过程发生的话，细胞核中就会发生一种称之为RNA剪接（RNA splicing）的编辑过程，其能够确保RNA指令被传送至与机体基因蓝图精确对应的细胞工厂中。图
关于假基因的生产方式介绍
1、复制 即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为non-processed或duplicatedpseudogenes 2、反座 即mRNA转录本经过反转录为cDNA，再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被
逆转录元件发生反向剪接插入DNA过程的原理与结构基础
逆转录元件是一种以RNA为媒介，通过“copyand paste”的方式在基因组中不断扩增的基因元件【1,2】。在哺乳动物基因组中有超过45%的遗传成分都是逆转录元件，因此逆转录转座事件如果在不恰当的地方发生就会导致基因紊乱或者基因疾病等严重后果【3】。 II组内含子（Group II int
令人吃惊的最古老DNA
来自加州大学伯克利分校，美国能源部基因研究所（U.S. Department of Energy Joint Genome Institute-- DOE JGI），挪威卑尔根大学等处的研究人员发现地球上最古老的动物物种之一：海洋海葵的基因组与脊椎动物的基因组存在令人惊讶的相似性。 而且这一研究也
昆明动物所在食肉目分子系统学方面取得新进展
食肉目犬型超科(Caniformia)各科间的系统发育关系一直是近年来食肉目系统发育关系研究的热点，至今仍处于众说纷纭的状态，尤其是小熊猫科的系统发育位置。小熊猫因其似熊非熊的形态特征，使得它的进化地位存在很大的争议，无法得到解决。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大