上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律
7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。该工作通过对多生物物种RNA编辑事件的系统发现和分析,首次揭示了RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律,及其主要在动物神经功能和神经发育上的作用。 RNA编辑是转录后RNA分子发生碱基插入、删除或替换,从而导致基因编码序列改变的机制。目前研究最多的是A-to-I RNA编辑,即广泛存在于后生动物中RNA上腺嘌呤(A)脱氨基变为次黄嘌呤(I)的碱基变换。A-to-I编辑是由一类作用于RNA分子的腺苷脱氨酶(ADAR)催化,主要发生在RNA双链结构区域。而次黄嘌呤在翻译的过程中会被识别成为鸟嘌呤(G),带来mRNA 编码改变,增加遗传多样......阅读全文
什么是表观遗传学
是研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰,即探索从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴学科。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等。而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等;表观基因组
-Science:父亲“原罪”之表观遗传
如果你患有糖尿病、癌症或甚至有心脏问题,或许你应该将其归罪于父亲或甚至祖父的行为或环境。近年来,科学家们已证实甚至在母亲怀上后代之前,父亲的生活经历包括食物、药物、暴露于毒性产物、压力等都可以影响他的孩子、甚至孙子的发育和健康。 然而,尽管科学家们在这一领域已开展了十年的研究工作,对于延续数代
Science:祖母的表观遗传“原罪”
如果一名孕妇营养不良,由于所谓的“表观遗传”效应,她的孩子罹患肥胖症和2型糖尿病的风险要高于一般人。一项小鼠新研究证实,妊娠期的这种营养“记忆”还可通过雄性后代的精子传递给下一代,提高她们孙辈的疾病风险。换句话说,其印证了一句老的格言“你祖母的饮食都会影响你”。这项研究还对表观遗传效应如何代代相
关于RNA编辑的基本介绍
RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。 早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿
CRISPR的新前沿:编辑RNA
基因编辑工具CRISPR令科学家们修改DNA的能力发生了革命性的变化,如今,该工具的一种新的版本能对RNA进行靶向修改。编辑RNA而不是DNA有若干优点,例如,它能减轻与DNA相关的在伦理方面的顾虑,它能为科学家在活体生物中提供更为精确的编辑时间框架(如在关键性的发育期中)。在这里,David
关于RNA编辑的分类介绍
RNA编辑主要类型有: ①简单编辑,单碱基转变的转录后调节; ②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格; ③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋
RNA编辑如何促进肿瘤生长?
最近一项新的研究,对于RNA(核糖核酸)编辑在癌症中可能发挥的作用,提供了新的见解。这项研究结果发表在《Scientific Reports》杂志,可以让我们进一步了解参与肿瘤发生和发展的一种新机制,并因此可能在未来带来更好的治疗方案。 在每一个健康的人体细胞中,连接到DNA中的遗传信息,被转
污染改变表观遗传信息
美国《科学美国人》杂志日前刊登了华盛顿州立大学生殖生物学中心主任迈克尔·斯金纳的研究文章《一种新的遗传》。这项研究通过动物实验发现,特定污染物会引发可导致疾病或生殖问题的表观遗传修饰,而这是在不改变动物DNA序列的情况下发生的。 迈克尔·斯金纳的实验室以及其他一些实验室,主要针对大鼠和小鼠的一
靶向表观遗传因子显奇效!
12月11日,研究人员《Journal of Cell Biology》上发表了该项研究成果,文章标题为“SUV420H2 Is an Epigenetic Regulator of Epithelial/Mesenchymal States in Pancreatic Cancer ”(“SU
Science医学:首个胃癌表观遗传图谱
来自杜克-新加坡国大医学研究生院的研究人员在新研究中发现了大量由环境因素触发的胃癌新亚型。这项基于表观遗传学的新研究获得了对胃癌复杂性的新认识,有可能促成对这一仅次于肺癌的全球第二位癌症杀手更好的治疗策略。论文发表在10月17日的《科学转化医学》(Science Translational
《科学》推出“表观遗传学”专题
10月29日出版的《科学》杂志刊登专题——《表观遗传学》(Epigenetics)。专题导言文章《什么是表观遗传学》(What Is Epigenetics?)说,多细胞有机体的细胞名义上拥有同样的DNA序列(因而拥有同样的遗传指令系统),但是它们却维持着不同的显型。这种记录了发育和环
《Cell》文章:特殊的表观遗传调控
来自中科院生物物理所,美国哥伦比亚大学的研究人员发表了题为“Multisite Substrate Recognition in Asf1-Dependent Acetylation of Histone H3 K56 by Rtt109”的文章,报道了Rtt109-Asf1-H3-H4复合物的
Nature头条:父母的表观遗传“原罪”
一项争议性的小鼠研究报告称,某些恐惧可数代遗传。作者们认为类似的现象有可能会影响人类的焦虑和成瘾性。这项研究发表在12月1日的《自然神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上,并被放在Nature网站首页头版头条推荐。 但另一些研究人员则对这些研究结果提出了质疑,因为还
表观遗传信息的定义
中文名称表观遗传信息英文名称epigenetic information定 义细胞或者多细胞生物中与DNA序列本身无关的,但可以传递给子代细胞的信息。这是在发育过程中获得的信息,能影响基因表达,也能对表型产生影响。如DNA甲基化、染色质结构改变和环境因子(如氧化剂和毒剂等)对DNA的修饰等。应用学
Science新文章解析癌症表观遗传
目前大多数癌症治疗的效果并不理想。在力图根除肿瘤之时,肿瘤学家们往往借助于放疗或化疗,这使得在遏制癌性生长的同时也导致了健康组织受损。来自洛克菲勒大学C. David Allis实验室的一项新研究,或许可以使科学家们朝着高精确度靶向肿瘤的癌症治疗更近一步。他们的研究结果在线发表在3月2
母乳喂养改善婴儿表观遗传
9月《儿科学》(Pediatrics)杂志报道了来自布朗大学Warren Alpert医学院教授、妇婴医院布朗中心主任Barry M. Lester博士课题组的一项研究,“我们发现,孕产妇护理可以改变婴儿应激生理反应相关基因活性,特别是调控激素皮质醇(cortisol)的释放。” Lester
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
表观遗传学名词解释
表观遗传学(英语:epigenetics)又译为表征遗传学、拟遗传学、表遗传学、外遗传学以及后遗传学,在生物学和特定的遗传学领域,其研究的是在不改变DNA序列的前提下,通过某些机制引起可遗传的基因表达或细胞表现型的变化。表征遗传学是1980年代逐渐兴起的一门学科,是在研究与经典的孟德尔遗传学遗传法则
营养与健康所通过量化表观遗传时钟的随机成分阐明表观遗传时钟本质
近日,中国科学院上海营养与健康研究所Andrew E. Teschendorff研究组在《自然-衰老》(Nature Aging)上,发表了题为Quantifying the stochastic component of epigenetic aging的研究论文。该研究论证了表观遗传时钟的重要组
著名遗传学家表观遗传学新成果
可卡因成瘾性的一个主要挑战在于,在戒断期之后的高复发率。但新的研究表明,在药物戒断过程中,我们DNA的变化可能为更有效的成瘾疗法开发,提供了有希望的方法。 加拿大麦吉尔大学和以色列巴尔依兰大学的研究人员,将这项研究结果发表在最近的《Journal of Neuroscience》。他们指出,戒
Nature发表表观遗传学重要发现-决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl
遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器(prime editors,PEs)可同时实现任意碱基类型的精准替换,以及小片段的精准插入、替换和删除。目前,几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成,但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点,限制了引导编辑器
大脑RNA编辑位点“辞典”发布
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如
转录组的重编写:RNA编辑
前 言 基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA
RNA编辑技术治疗严重罕见病
肌肉萎缩症目前还没有治愈的方法,患有这种疾病的儿童在早年失去了重要的肌肉力量。根据来自美国西北大学医学院和芝加哥大学的一项最新研究,一种被称为“外显子跳跃(exon skipping)”的RNA编辑技术,在治疗一种罕见而严重形式的肌肉萎缩症的过程中,已经取得初步成效。相关研究结果发表在十月十二日
新基因编辑技术“RNA桥”来了!
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
转录组的重编写:RNA编辑
基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了
新基因编辑技术“RNA桥”来了!
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
RNA编辑的生物学意义
RNA编辑的生物学意义主要有:①校正作用,因4个核苷酸的插入移码,使其肽链的序列和其他生物的相似;②调控翻译,通过编辑可以引入或去除起始密码子或终止密码子;③扩充遗传信息,经编辑后增加了肽链的编码信息量。