中国农科院研究团队揭开白菜甘蓝两类蔬菜作物驯化秘密
中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队,对白菜和甘蓝两类芸薹属作物的驯化进行了深入研究,揭示了驯化与古多倍化形成的亚基因组的关系,相关研究结果于8月15日在线发表于英国《自然·遗传学》杂志。 白菜和甘蓝类蔬菜是大众餐桌上最常见的蔬菜,其最大特点是类型极其丰富多样。但这两个物种为什么能被驯化出多样的类型,一直是待解的难题。此外还有一个特别有趣的现象:2000年前和500年前,经过欧洲人和中国人的独立驯化,两者都能形成叶球或者膨大根(茎)这样非常相似的性状,这又是为什么? 为此,王晓武团队完成了白菜和甘蓝类蔬菜作物代表材料的基因组重测序,构建了白菜和甘蓝类蔬菜的群体基因组变异图谱,发现叶球的形成与多种植物激素信号传导相关基因以及叶片背性和腹性两类不同极性形成的基因受高度选择相关;膨大根(茎)的形成除与生长素相关基因受选择有关外,还与细胞快速膨大和糖转运相关基因的选择有关。 研究还发现白菜和甘蓝这两个物种分别产生结......阅读全文
白菜甘蓝油菜全基因组序列测定
由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。 研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该
中美科学家揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜
甘蓝型油菜是油菜的常见类型,也是人类食用植物油的重要来源。中美科研人员历时4年研究,通过全基因组重测序揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜,有助于通过基因选育提升甘蓝型油菜的产量和品质。相关研究成果已于近日由国际学术期刊《自然·通讯》在线发表。 甘蓝型油菜由白菜与甘蓝通过自然杂交进化而来,因产量高、
中美科学家揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜
甘蓝型油菜是油菜的常见类型,也是人类食用植物油的重要来源。中美科研人员历时4年研究,通过全基因组重测序揭开甘蓝型油菜“家族血统”之谜,有助于通过基因选育提升甘蓝型油菜的产量和品质。相关研究成果已于近日由国际学术期刊《自然·通讯》在线发表。 甘蓝型油菜由白菜与甘蓝通过自然杂交进化而来,因产量高、
中国农科院研究团队揭开白菜甘蓝两类蔬菜作物驯化秘密
中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队,对白菜和甘蓝两类芸薹属作物的驯化进行了深入研究,揭示了驯化与古多倍化形成的亚基因组的关系,相关研究结果于8月15日在线发表于英国《自然·遗传学》杂志。 白菜和甘蓝类蔬菜是大众餐桌上最常见的蔬菜,其最大特点是类型极其丰富多样。但这两个物种为什么能被驯
【Nature子刊】农科院、华大基因联手完成甘蓝测序
中国农业科学院油料作物研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、华大基因等多家研究机构的科学家们近日完成了对甘蓝基因组的测序,并将这种作物的基因组草图发表在五月二十三日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是油料作物研究所的研究员刘胜毅(Shengyi Liu)
科学家首次明确白菜等蔬菜祖先基因
很少有人知道,百姓餐桌上经常“露面”的白菜、甘蓝、芥菜和油菜等,在蔬菜专业研究领域都属于芸薹属。长期以来,这些蔬菜的“祖先”到底是谁?对于研究芸薹属植物起源与进化的科学家来说一直是个难解之谜。日前从中国农业科学院获悉,该院王晓武研究员带领的科研团队多年从事芸薹属物种的研究,主导了白菜基因组的测序
研究人员首次明确白菜等蔬菜祖先基因
很少人知道,百姓餐桌上经常“露面”的白菜、甘蓝、芥菜和油菜等,在蔬菜专业研究领域都属于芸薹属。长期以来,这些蔬菜的“祖先”到底是谁?对于研究芸薹属植物起源与进化的研究人员来说一直是个难解之谜。记者日前从中国农业科学院获悉,该院蔬菜花卉研究所王晓武研究员带领的科研团队对芸薹属物种基因组进化的研究获
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有
结构变异:甘蓝进化的“分子加速器”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517537.shtm结球甘蓝、抱子甘蓝、羽衣甘蓝、球茎甘蓝,加上芥蓝、青花菜、花椰菜……这些看起来长得非常不一样的蔬菜,都是甘蓝。 甘蓝群体具有丰富的形态多样性。受访者供图“甘蓝类蔬菜作物表型变异
全基因组重测序的生物信息分析内容
1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体
世界首个梅花全基因组重测序研究完成
日前,北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心,与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱,“梅花花部性状的遗传结构”(The genetic architecture of
我国已完成31个大豆基因组重测序
由香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中国科学院等单位合作的“大豆回家”项目研究成果,“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式”11月14日在国际著名杂志《自然—遗传学》上在线发表。 该研究首次对野生大豆和栽培大豆全基因组进行了大规模遗传多态性分析,为全球大豆的遗传学研
与结球白菜驯化相关的重要候选基因的鉴定
021年5月31日,Genome Biology(IF3y=12.683)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的题为“Impacts of allopolyploidization and structural variation on intraspecific diversi
来中国60余年,甘蓝型油菜练成“半冬性”技能
生长期仅200天左右、亩产油菜籽达130公斤、与水稻形成无缝衔接……这就是上世纪50年代中期才来到中国的甘蓝型油菜。 经过60余年的持续改良,它适应了中国五湖四海的气候环境,不仅掌握了“半冬性”的新技能,而且产量逐渐提升。 近日,《自然—遗传》(Nature Genetics)在线发表了中国
小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474824.shtm 随着全球对特色咖啡需求的显著增加,开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的。近日,中国科学院武汉植物园的科研人员,通过基因组重测序等方式发现的SNPs,或与咖啡中重要农艺性状的重要基
昆明植物所在甘蓝WRKY基因家族研究中取得新进展
甘蓝(Brassica oleracea)是十字花科芸苔属植物,其作为人类广泛食用的蔬菜而具有重要的经济价值。甘蓝种内形态差异巨大,有着众多的品种或变种,如花椰菜(菜花)、结球甘蓝(卷心菜或包菜)、芥蓝、西兰花和苤蓝等。然而,甘蓝抗病抗虫能力不强,极易受到病菌的感染或昆虫蚕食,制约着甘蓝绿色栽培
二月兰基因组为十字花科野生资源利用提供新思路
二月兰 中国农科院蔬菜所供图近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种团队完成了二月兰基因组的解析。通过基因组比较分析,在十字花科古多倍化演化和高产优质油脂性状等的遗传基础上取得了重要发现。相关成果发表在《植物—通讯》(Plant Communications)上。二月兰属于十字花
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
研究团队部通过基因组重测序结果揭示枣树起源
近日,《植物生物技术》在线发表了洛阳师范学院教授赵旭升课题组的研究成果。他们通过对分布广泛的493份枣种质(包括202份野生种和291份栽培种)进行基因组重测序,结合群体基因组进化分析、全基因组关联分析系统揭示了枣树的起源、驯化历史,解析了枣树重要园艺性状变异的遗传基础,为后续其他重要性状的研究
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽,庶民采之。”五千年前,华夏始祖将野生大豆驯化,变成今天的“五谷”之一。而今,一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日,由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
中国农科院Nat-Genet发表蔬菜育种重大突破
大头菜和白菜有很多共同之处:它们都有紧密包裹起来的叶子,形成一个多叶的头状。然而,值得注意的是,这两种作物起源于两种不同的芸薹属植物, 是由来自不同大洲的农民所使用和驯化。8月15日在《Nature Genetics》发表的一项研究中,来自中国农科院、南京农业大学以及荷兰瓦赫宁根大学的科学家表明
接近完整:高质量白菜基因组图谱发布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组,揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》(Plant Biotechno
甘蓝中含有的这种植物化合物可减少多种癌症风险
洋白菜、包心菜、圆白菜、莲花白、卷心菜、包菜……其实这些都是同一种蔬菜,官方名称叫结球甘蓝。看上去很普通有些圆滚滚的结球甘蓝中,其实含有能够减少癌症风险的有益成分。 十字花科蔬菜能减少结肠癌和胃癌发病率 结球甘蓝具有蔬菜的营养特点,水分含量比较高,能量低,含有少量蛋白质和脂肪,膳食纤维含量高
揭示了多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响机制
524个白菜品种亲缘关系 中国农科院供图 BrPIN3.3中的结构变异与大白菜叶球驯化相关 中国农科院供图 近日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队揭示的多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响机制。该研究鉴定了与
“千种动植物基因组计划”一期启动100多种测序
由深圳华大基因研究院发起的“千种动植物基因组计划”,一期已启动100多种动植物基因组测序分析项目,其中近一半的项目已经完成或接近尾声。 华大基因5月13日召开发布会称,该“千种计划”在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展,该计划将加速全球基因组学研
我国科学家对桃进行全基因组重测序-绘制进化路线
我们平时吃的桃是如何进化而来的?近日,一项针对桃的全基因组重测序研究揭开了这一谜底。该研究对84份桃种质进行重测序,在全基因组水平上绘制了从光核桃到普通桃的进化路线,并鉴定了与人工选择相关的候选基因,揭示了桃的进化历史及人类活动对果树的影响。 这项研究由中国农业科学院郑州果树研究所王力荣研究团
中国农业科学院Nature-Genetics发表测序新成果
来自中国农业科学院、荷兰瓦赫宁根大学和研究中心、南京农业大学等机构的研究人员证实,在芜菁(Brassica rapa)和甘蓝(Brassica oleracea)中亚基因组平行选择与形态多样化和作物驯化有关联。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983
我科学家主导完成白菜全基因组研究
8月29日,由多国科学家共同合作完成的白菜全基因组研究成果在《自然—遗传学》上在线发表。这是由中国科学家主导,通过国际合作完成的又一重大成果。 白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜。据了解,科学家开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种
BnWOX基因在油菜响应冷和旱胁迫调控中起重要作用
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506979.shtm植物特异性WUSCHEL相关同源盒(WOX)转录因子家族是植物所特有的一类转录因子(Transcription Factors,TFS),是真核同源盒转录因子超家族(Homeobox,