你必须知道的质谱鉴定中10条FAQ

质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,应用前景十分广泛。那么,有问题了怎么解决呢? 问题1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级? 答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(peptide-mass mapping, PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定,二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的结果从而实现蛋白质的鉴定。二级质谱能够得到部分肽短的序列,具有更高的可靠性。随着现在杂志对数据的要求越来越严格,二级质谱鉴定是蛋白鉴定的大趋势,而且即使目前做一级质谱鉴定的结果,也需要挑选部分PMF结果做二级质谱验证。 问题2. 研究的物种不是模式生物怎么办? 答:可以参考亲缘关系最近的模式生物做比对而实现蛋白质的成功鉴定,如果质谱图很好而没有鉴定结果说明这是一个全新的蛋白,可以采用d......阅读全文

蛋白鉴定方法之质谱相关技术

  质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞

质谱鉴定,常见疑问解答

问题1、一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?答:一级质谱鉴定的方式主要为胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定;二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的

蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题

蛋白质(Protein)是生物体中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物细胞,作为生命的物质基础之一,蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用,因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。现代研究结果发现越来越多的多肽同蛋白质一样

蛋白质凝胶电泳后或者质谱后怎么鉴定

看你的目的.如果你只是检测目标蛋白大小的话,加上蛋白质marker,考染观察条带大小即可.你要是想知道蛋白质的氨基酸序列的话就去打质谱.话说蛋白质的质谱就是序列分析.

如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异

1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末,或经过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽,离子化的多肽进入质谱,母离子检

如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异

1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末,或经过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽,离子化的多肽进入质谱,母离子检

暨大研发另类质谱鉴定算法,大幅提高蛋白质组鉴定能力

  暨南大学的研究人员利用翻译组测序(RNC-seq)数据作为稳态细胞内蛋白质的“标准答案”,并另辟蹊径,提出了蛋白水平上的一种简单有效的多算法结果整合策略,不用做额外的实验,零成本轻松提高蛋白质组鉴定数量,同时有效降低假阳性率。  鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是

质谱鉴定微生物的原理

  在应用MALDI-TOF MS时,通常将微生物样本与一种饱和的低分子量无机化合物溶液(称为基质)进行混合加在靶板上,待干后样本与基质共结晶后形成了以基质包裹构架的样本固体沉淀。样本基质结晶体经激光辐射,基质从激光中吸收能量使样品吸附,基质与样品之间发生电荷转移使得样品分子电离,离子在加速电场下获

暨大另类质谱鉴定算法策略大幅提高蛋白质组鉴定能力

  鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是蛋白质组研究的标准研究方法。从质谱谱图中鉴定蛋白质需要依赖搜库算法,现有许多算法被开发出来,常见的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料:修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒:消化缓冲液                                                                  萃取液                                                          

利用纳升级液相色谱--串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料 修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒 消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材 多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤 3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝 G-250

质谱鉴定常见问题解答

1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级? 答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定,二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF

质谱鉴定常见问题解答

   1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?  答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定,二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展

  3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an

蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题解决方法

  蛋白质(Protein)是生物体中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物细胞,作为生命的物质基础之一,蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用,因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。   现代研究结果发现越来越多的多肽

细菌鉴定让MALDITOF质谱焕发青春

      MALDI,即基质辅助激光解析电离(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization),是指离子源,也就是激发部分。这就好像是枪支的子弹,有圆形单头和尖形单头,有的善于穿甲、有的善于爆破。MALDI离子源属于软电离,相比之下还有其他离子源,其电离方

蛋白、测序、质谱全方位布局,达瑞生物参展临床质谱论坛

  2023年4月14-15日,“第四届北京临床质谱会”成功举办。广州市达瑞生物技术股份有限公司(以下简称“达瑞生物”) 在本次论坛带来了其标志性的串联质谱平台和飞行时间质谱平台产品。分析测试百科网邀请到达瑞生物华北大区销售总监贾广锋,为观众详细介绍产品。  关于达瑞生物:  广州市达瑞生物技术股份

好消息-美研究人员开源了脂质质谱鉴定软件LIQUID

  分析测试百科网讯 近日,一份基于LC-MS/MS ,针对脂质鉴定的开源软件被发布出来。  脂多糖在许多代谢疾病中起关键作用,包括高血压,糖尿病和中风。因此,身体的脂质-其“脂质体”的完整概况非常重要。  脂质体研究通常基于与串联质谱联用的液相色谱(LC-MS / MS)。但是研究人员很难快速处理

你必须知道的质谱鉴定中10条FAQ

  质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,应用前景十分广泛。那么,有问题了怎么解决呢?  问题1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?  答:一级质谱鉴定的方式主要指胎指纹图谱(peptide-mass mapping, PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分

奥美拉唑药物杂质高分辨质谱快速鉴定(一)

前言杂质分析对于药物的研发至关重要 1。在研究过程中,杂质谱信息能帮助药物化学家优化合成路线和避免潜在的有毒杂质。在开发过程中,当大量母体化合物存在时,鉴定和表征痕量杂质至关重要,从而促进了高分辨率、高灵敏度和高扫描速度的 HR-MS 仪器和智能化结构鉴定软件的发展。为了展示 HR-MS

奥美拉唑药物杂质高分辨质谱快速鉴定(二)

II. Mass Frontier 用于未知物的结构鉴定采用Mass Frontier 的“碎片离子搜索”(FISh)功能处理HRAM 全扫描和 MS/MS 数据,见图 3-a。 FISh 能轻易识别出与母体化合物具有相同碎片离子的化合物,见图 3-b,并根据碎片推断出可能的杂质结构,见图

你必须知道的质谱鉴定中14条FAQ

   质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,不过,目前的应用还不是特别广泛。那么,有问题了怎么解决呢?本文收集了相关的新手对于这项技术的常见问题与解决方法。希望能更好地帮助大家了解这项技术。  问题1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?  答:一级质谱鉴定的方式

质谱及质谱的目的

质谱,是一种分析方法,原理就是让带电原子、分子或分子碎片按质荷比的大小顺序排列,打出相应的谱线。待分析的样品分子在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子,进入由电场和磁场组成的分析器中;其中离子束中速度较慢的离子通过电场后编转大,

气体分析质谱质谱原理

    质谱仪配备QuaderaTM 分析软件, 操作简单, 功能强大, 有128 个检测通道,可生成用户特殊应用软件界面. 在参数设置, 多种实测方式, 谱库, 数据统计, 谱图放大, 光标, 输入输出模块等性能的支持下, 可以更方便地进行定性定量分析以及在线离线分析.     Omnistar/

质谱检测法与蛋白质分析

    质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。    在生命科学研究工作中有一个重要问

质谱检测法与蛋白质分析

在生命科学研究工作中有一个重要问题,就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息,我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来,从原则上来说,也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗,透过这个窗口,我们就能够对复杂的细胞调控网

利用MALDI质谱进行高级微生物鉴定以精简治疗

  引起人类疾病的病原微生物种类繁多。不同微生物菌株会导致不同程度的疾病,从普通感冒到可能危及生命的感染,如结核病(TB)。类似地,不同菌株对抗菌药物的敏感性不同,有些菌株对多种药物完全耐药,有些菌株具有中等敏感性,有些菌株则对治疗完全敏感。  抗生素耐药性对全球健康构成了严重威胁,并给全球医疗体系

利用MALDI质谱进行高级微生物鉴定以精简治疗

  引起人类疾病的病原微生物种类繁多。不同微生物菌株会导致不同程度的疾病,从普通感冒到可能危及生命的感染,如结核病(TB)。类似地,不同菌株对抗菌药物的敏感性不同,有些菌株对多种药物完全耐药,有些菌株具有中等敏感性,有些菌株则对治疗完全敏感。  抗生素耐药性对全球健康构成了严重威胁,并给全球医疗体系