著名学者庄小威发表研究新成果新方法助力单细胞RNA分析
系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位，有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交（smFISH）是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间定位的有力武器。去年四月，哈佛大学著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）教授在Science杂志发布了高度多重化的smFISH成像技术——MERFISH。这种突破性技术能在单细胞水平上实现空间分辨的高度多重化RNA分析。 现在，庄小威团队找到了提高MERFISH性能的好办法。他们在美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表文章，详细介绍了一种特殊的样本处理方法。文章指出，高度多重化的单分子FISH可以在单细胞中实现空间分辨的基因表达图谱分析。然而，FISH探针脱靶结合和细胞自体荧光带来的背景，限制了该技术的一些重要应用，特别是在多重化程度更高、成像短RNA和组织样本的时候。 为此，研究人员开发了一种清理样本的方法。首先他们鉴定了FISH探针与细胞组分的脱靶结合，这是FIS......阅读全文
徕卡THUNDER成像系统在探索微生物肠道免疫机制的应用
由SARS-CoV-2冠状病毒引起的Covid-19影响了世界的方方面面。免疫和治疗方法等抗病毒方向的研究在2020年具有高优先级，显微镜在这类研究中起着举足轻重的作用。了解受体结合、基因组释放、复制、组装和病毒出芽的基本原理及免疫应答，可以使用不同的方法和显微镜。鉴于显微镜在感染生物
庄小威《科学》再发突破性成像技术，称最棒成果是下一个
3月15日，小威和87少同班同学见面时称：最棒的成果是下一个。 在单个细胞中了解转录组的表达谱和空间景观，是全面认识细胞行为的基础。日前，著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）领导研究团队在Science杂志上发表了一项突破性的单分子成像技术，MERFISH（multiplexed err
著名学者庄小威Science再发突破性技术
在单个细胞中了解转录组的表达谱和空间景观，是全面认识细胞行为的基础。日前，著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）领导研究团队在Science杂志上发表了一项突破性的单分子成像技术，MERFISH（multiplexed error-robust fluorescence in situ
新方法可在大量细胞内自动测定基因表达
《自然—方法学》报道了一种可在数千个人体细胞中自动测量基因表达的方法。该方法使单分子荧光原位杂交技术（smFISH）成倍放大，并能确定细胞内RNA转录发生的位置，为了解RNA转录的生物功能提供了重要线索 通过将目标与荧光探针相结合，smFISH可用于检测细胞内的特定RNA序列，但要将每个R
珀金埃尔默高内涵在脑切片中的应用
随着单分子荧光原位杂交(single molecule fluorescent in situ hybridization,smFISH)以及RNAscope技术的发展，曾经仅用来观察细胞组织形态的大脑切片在神经领域科学家们的手中已经可以为我们展现单细胞水平丰富多彩的基因表达了。就像这样一切二标
著名学者庄小威发表研究新成果新方法助力单细胞RNA分析
系统性分析单细胞的RNA丰度和空间定位，有助于我们理解细胞和发育生物学的许多方面。单分子荧光原位杂交（smFISH）是在单细胞中研究RNA拷贝数和空间定位的有力武器。去年四月，哈佛大学著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）教授在Science杂志发布了高度多重化的smFISH成像技术——
著名学者庄小威连发Science、PNAS
在单个细胞中了解转录组的表达谱和空间景观，是全面认识细胞行为的基础。去年4月，著名学者庄小威（Xiaowei Zhuang）领导研究团队在《Science》杂志上发表了一项突破性的单分子成像技术，MERFISH（multiplexed error-robust fluorescence in s
Science最新综述－|－空间组学技术概览与展望，详解技术原理与优势
导读 几乎所有看似无限复杂的生物学都发生在三维空间中。在生物体内，细胞必须在三维组织中相互作用和组合，每个细胞的位置与其固有性质一样重要，决定着组织的功能或疾病的功能障碍。因此，即使在研究简单生物体或单个组织的结构时，不仅需要破译成千上万个细胞的分子谱，还需要了解空间环境如何以及造成怎样的影响
人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗
胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所，是组成免疫系统的重要器官。到目前为止，还不清楚在整个生命过程中，人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究，但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。 由来自VIB炎症研究中心（VIB Center for
严军研究组通过单细胞测序技术发现新的神经元亚型
2月18日，《自然-神经科学》期刊在线发表了题为《小鼠视交叉上核基因表达的时空单细胞分析》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组完成。该研究通过单细胞测序技术对小鼠昼夜节律中枢——视交叉上核进行了系
Nature－Methods新年展望：高多重成像
今年第一期《Nature Methods》评出了2015的年度技术——单颗粒冷冻电镜（cryo-EM）。除此之外，该杂志还对一些热门技术进行了一番展望，包括细胞内蛋白标记、精准光遗传学、高多重成像、亚细胞图谱分析等等。 荧光团之间的光谱重叠，是成像复杂生物学结构的一个主要障碍。这种限制让绝大多
哺乳动物昼夜节律神经机制获突破
昼夜节律在生物体中广泛存在，对调节人们一天之中的运动、睡眠、代谢等诸多生理过程起着重要的作用。在人类社会中，如果这个生物钟紊乱会导致包括睡眠障碍在内的各种疾病，那么，它在神经系统中是如何产生、维持以及发挥作用的？ 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中
解码生物钟－哺乳动物昼夜节律神经机制获突破
昼夜节律在生物体中广泛存在，对调节人们一天之中的运动、睡眠、代谢等诸多生理过程起着重要的作用。在人类社会中，如果这个生物钟紊乱会导致包括睡眠障碍在内的各种疾病，那么，它在神经系统中是如何产生、维持以及发挥作用的？ 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中
新一代高效多重荧光原位杂交技术研制成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494789.shtm近日，华中农业大学教授曹罡、副研究员戴金霞团队在《自然—通讯》发表新一代效率高、特异性强、信号强和背景噪音低的荧光原位杂交方法—p-FISH rainbow，突破了现有的技术壁垒，克服
新一代高效多重荧光原位杂交技术研制成功
近日，华中农业大学教授曹罡、副研究员戴金霞团队在《自然—通讯》发表新一代效率高、特异性强、信号强和背景噪音低的荧光原位杂交方法—p-FISH rainbow，突破了现有的技术壁垒，克服了目前荧光原位杂交技术领域的缺陷和不足，可广泛应用于动物、植物和病原微生物中多种生物分子的高效检测、细胞亚群和空
动态监控果蝇翻译过程，揭示空间异质性
mRNA翻译成蛋白质的过程涉及到的因子已经有大量的研究，但是在活的多细胞生物体中多步骤的翻译过程是如何进行的还未可知。为了回答该问题，法国蒙彼利埃大学Mounia Lagha研究组与Jeremy Dufourt（第一作者）合作在Science发文，题为Imaging translation dy
通过序列杂交和条形码进行单细胞原位分析
现代系统生物学有两种革新技术：基因组学和单细胞生物学，前者具备同时监测生物体中所有基因和蛋白质的能力，后者则可以在自然微环境中跟踪单细胞的一些特定基因。 两种技术都很强大，但具有互补的局限性：基因组学平均了一个细胞群的异质性和空间复杂性，而单细胞技术一次只能探测几个基因。因此，将基因组学与单细
超高分辨直接观测基因表达的染色质时空调控
生命科学的一个基本问题是在个体发育中，单个细胞如何分化成各种类型的组织细胞。这个过程高度依赖于基因表达的精确时空调控，而这种细胞特异基因表达与染色质的调控密切相关。比如，不同的顺式调控原件增强子能够在不同细胞中选择性地激活目标基因。每个基因经常由分布在千碱基(kb)甚至兆碱基(Mb)以外的多个增
Science：Pax3－mRNA如何控制肌肉干细胞命运？
组织保持稳态和再生取决于组织特异性的干细胞群体，其中的一些干细胞群体长时间处于静止状态。在脊椎动物中，肌肉干细胞（MuSC）是骨骼肌再生所必需的。近期的研究已表明，久坐不动小鼠中的MuSC对成年肌纤维的维持起着重要的作用，它们对隔膜肌（diaphragm muscle）的贡献较大，而对下后肢肌（
－Nature－Methods：2016年最值得关注的八大技术
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc