青岛能源所发明简易高效的单细胞分选与测序对接技术
为了满足考察自然界中细胞“原位功能”这一共性科学需求，“现场”、“实时”的单细胞分选与测序已成为生命科学装备研制领域的一个重要发展趋势。尽管第三代测序技术已实现仪器微型化，但与测序对接的单细胞精准分选装备却仍然相当笨重和昂贵，难以支撑各种科学考察中针对微生物组功能的现场分析。最近，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心研究员马波带领的微流控系统团队，通过设计简易高效的单细胞分选与测序对接装置，实现了每个试管有且只有一个细胞（One-Cell-One-Tube），有望服务于“现场”、“实时”乃至“便携式”的单细胞分选与测序。 与人体和高等动植物细胞相比，微生物细胞通常更小（0.1-10 微米），更加难于精准操纵，因此分离获取目标单细胞、并且实现测序反应要求的“One-Cell-One-Tube”是一个关键难点。目前的自动单细胞分离方法大多依赖于昂贵且体积庞大的荧光流式细胞分选仪（FACS），而现有的手动单细胞分离和......阅读全文
《细胞》：单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了来自一个成人男子91个
单细胞测序技术的发展趋势
单细胞测序技术的发展呈现出以下几个主要趋势：更高的分辨率和准确性不断提高检测的灵敏度和特异性，能够更精确地检测低丰度的转录本和稀有细胞类型。减少技术噪音和误差，提供更准确的基因表达定量。多组学整合整合基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组等多组学信息，全面揭示细胞的状态和功能。实现同时对多个层面的分子
单细胞分离仪与流式细胞仪相比有哪些优点？
单细胞分离仪与目前市场上常见的流式细胞仪和单细胞测序相比有以下优点： 1.没有样本容量或细胞数。与传统流式细胞分析仪，可以处理任何小样本数量从5μl回收率高的细胞悬液，通常需要至少2万个细胞来进行单细胞分离。 2.温和的分配。脆弱细胞的剪切应力更低(更好的生存能力)，分选过后细胞
2017单细胞扩增测序技术的最新进展
细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位，不同类型的细胞形态迥异，功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同，相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析，但是随着研究的深入，这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据，往往忽略了细胞个体间的
探讨应用前景－单细胞拉曼创新技术研讨会在广州举办
11月15日，由南方医科大学检验医学部、中国科学院青岛生物能源与过程研究所共同发起的单细胞拉曼创新技术研讨会在广州举办。 会议研讨了单细胞拉曼技术在临床医学检验、微生态、肿瘤细胞等领域的应用前景。南方医科大学江医院检验医学部主任周宏伟表示，耐药性的广泛传播与滥用抗生素密不可分，快速检测病原菌药
单细胞测序的主要步骤和特点介绍
单细胞测序的兴起，不仅是新概念炒作，而是在相关领域，长时间由于技术的瓶颈很多生物学问题没有解决，现在突然有一个技术可以高性价比地解决这些问题，导致这个技术被大量应用。 以单细胞转录组测序技术为例开展探讨，单细胞转录组主要包括以下四个步骤，其中关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选，这是决定单细胞
临床单细胞拉曼耐药性快检仪面世－全流程3小时内完成
抗生素的滥用导致了细菌耐药性蔓延这一“世纪危机”。为了推动全社会合理使用抗生素，世界卫生组织（WHO）自2015年以来将每年11月的第三周确定为“世界提高抗生素认识周（World Antibiotic Awareness Week, WAAW）”。在2018年WAAW来临之际，青岛能源所发布了自
科学家发明光镊辅助静态池成像分选技术
OPSI技术服务单细胞多组学研究 课题组供图 单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具，但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段，是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。 近日，中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成
同济大学发布单细胞测序新技术
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。 加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在五月五日的Geno
单细胞测序基准数据集有哪些特点？
单细胞测序基准数据集通常具有以下特点：高质量和准确性：数据经过严格的质量控制和处理，具有较低的噪声和错误率，以确保分析结果的可靠性。多样性：涵盖多种细胞类型、组织来源和实验条件，能够全面评估分析方法在不同情况下的性能。标注详细：包括已知的细胞类型、标记基因、细胞状态等信息，为评估分析结果的准确性提供
单细胞测序预测化疗的有效性
在近一项研究中，来自密歇根大学的Jun Hee Lee博士课题组使用一种单细胞RNA测序的技术，*展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA损伤的基因表达差异。他们发现，这些反应可以被分为三类：激控制细胞死亡，细胞分裂或应激反应。相关结果发表在近的《Cell Reports》杂志上。“不同
北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术
来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法，这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异，提高单细胞全转录组分析的准
计算小RNA分子的单细胞测序新法
最近，卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序，测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构
单细胞研究指南：测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这
单细胞测序有望揭示胃癌异质性
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514613.shtm
当宏基因组遇上单细胞测序
日前，科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性，但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上，研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
单细胞测序技术未来的发展方向
单细胞测序技术未来可能的发展方向包括：多模态单细胞分析整合多种类型的信息，如同时测量基因表达、染色质可及性、蛋白质水平、代谢物含量等，以更全面地描绘单细胞的状态。更高通量和更低成本能够在更短的时间内处理更多的单细胞，同时降低技术成本，使其更广泛地应用于基础研究和临床实践。时空分辨率提升不仅了解细胞的
北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术
来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法，这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异，提高单细胞全转录组分析的准
Nature子刊：癌症单细胞测序新技术
只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画，你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点，从远处看就形成了一幅图像。与之相似，生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱，然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。 发布在7月22日《自然生物技术》(
PNAS：单细胞测序绘制大脑的细胞图谱
斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表文章，介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。 研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法，他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型，并确定神经元的亚型。他们还观察了
单细胞RNA测序发现新的免疫细胞
最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究，详细检测了一组新发现的免疫细胞（被称为ILC）。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析，瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们，发现了三个以前未知的ILC子群，并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。 先天淋巴细胞（ILC）是
单细胞多组学高通量测序平台（一）
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息，如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程，而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息（如DNA层面的基因序列），从而解读生物体运行机制，应用于疾病的诊断和治
单细胞研究指南：测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家，请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库，处理和分析结果数据。 那么，细胞之间的哪
单细胞RNA测序，众多研究都pick它
多细胞测序和单细胞测序，你pick谁？如今，大多数研究人员也许会选择后者，因为不一样的角度，会带来不一样的见解。 多细胞测序和单细胞测序，你pick谁？如今，大多数研究人员也许会选择后者，因为不一样的角度，会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究，可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（二）
DroNC-seq10月，Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一个新的测
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（一）
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞，得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是，就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样，没有两个细胞是完全相同的。所以，单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
单细胞研究指南：测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这
单细胞测序的核心优势及产品特点
单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。单细胞在许多领域都占有一席之地，对于癌症早期的诊断、追踪以及个体化治疗具有重要意义。 初次听说细胞测序技术，又是什么噱头？如果细胞测序就能测一个细胞或几个细胞的话，这有什么意义？特别是对异质性高的肿瘤组织来讲，测一个细胞能代表什么？ 无论是蠕虫，蓝
单细胞测序技术的应用案例有哪些？
以下是一些单细胞测序技术的应用案例： 1. 肿瘤研究： - 描绘肿瘤细胞的异质性，识别不同的肿瘤细胞亚型，了解肿瘤的发生、发展和转移机制。 - 发现肿瘤微环境中的免疫细胞组成和状态，为免疫治疗提供靶点和策略。 2. 神经科学： - 解析大脑中不同类型神经元的基因表达
单细胞测序技术的检测下限是多少？
单细胞测序技术的检测下限会受到多种因素的影响，包括所采用的具体技术方法、样本质量、实验操作等。一般来说，单个细胞中的 DNA 含量非常少，例如人类单个细胞的 DNA 含量仅有 6pg（皮克），而基因组建库的下限通常为 1ng（纳克），这就需要在单细胞测序建库前对全基因组进行扩增。目前常用的基因组扩增