Science：测序需警惕！你可能检测到了“假突变”
你可能检测到了一个“假突变”！2月17日，科学家们在Science上表示，在DNA样本中检测到的的一些序列突变实际上可能是样本处理过程中遭受损伤所造成，诱导损伤引发的突变占据了大多数的低频及中频突变。更重要的是，他们发现，被广泛使用的测序数据集中也存在着DNA损伤的印迹，包括千人基因组计划数据集（1000 Genomes Project ）和Atlas癌症基因计划数据集（The Cancer Genome Atlas）。这些损伤直接混淆了数据集中体细胞突变的鉴定。 发现问题再解决问题，这是科学的发展模式。针对这种现象，研究人员已经设计出了专门用于评估损伤程度的算法，并建议在样品制备过程中使用DNA修复酶，或许这种方法可以纠正“假突变”的问题。 DNA样本制备引发突变 众所周知，从古老标本或福尔马林固定的石蜡包埋组织中提取DNA样本很容易造成破碎和引发化学修饰，这会导致DNA发生突变。最近的证据表明，事实上任何DNA样本......阅读全文
生物芯片生物样本的制备方法
分离纯化、圹增、获取其中的蛋白质或DNA、RNA并用荧光标记， 才能与芯片进行反应。用DNA芯片做表达谱研究时，通常是将样品先抽提MRNA，然后反转录成CDNA。同时掺入带荧光标记的dCTP或dUTP。
细菌表达蛋白质和样本制备
一般直接用SDS凝胶加样缓冲液裂解，具体方法如下：[试剂与设备]（1）表达待检测蛋白质的细菌。（2）50mmoL／LTris-HCl（pH7.4）。（3）2xSDS凝胶加样缓冲液：100mmol／L Tris—HCl（pH6.8）200mmol／L 二硫苏糖醇（DTT）4％ SDS（电泳级）0.2％
新鲜实体组织样本的制备（机械法）
剪碎法网搓法研磨法实验方法原理机械法分散实体组织。用手术剪刀剪碎组织、用锋利的解剖刀剁碎组织或用匀浆器制成组织匀浆，再用细注射针头抽吸细胞或用 300 日尼龙网滤出单细胞悬液；采用网搓法也能获得大量细胞。机械法易造成细胞碎片和细胞团块，所以常与其他方法配合使用。实验材料组织
外周血单个核细胞样本的制备
实验方法原理 血液是天然的单个细胞分散的细胞悬液，血细胞在生理状态下呈分散的游离状态。它是流式细胞分析的理想样品。血液中的主要细胞成分为白细胞、红细胞和血小板；而其中白细胞主要成分又分为淋巴细胞、单核细胞和粒细胞。但在血细胞中一般检测单个核细胞较为多见。实验材料 外周血试剂、试剂盒 肝素生理盐水实验
外周血单个核细胞样本的制备
实验方法原理血液是天然的单个细胞分散的细胞悬液，血细胞在生理状态下呈分散的游离状态。它是流式细胞分析的理想样品。血液中的主要细胞成分为白细胞、红细胞和血小板；而其中白细胞主要成分又分为淋巴细胞、单核细胞和粒细胞。但在血细胞中一般检测单个核细胞较为多见。实验材料外周血试剂、试剂盒肝素生理盐水实验步骤一
ELISA样本制备及注意事项（二）
七、ELISA 实验中关节滑液的采集、处理和保存1、口腔关节：患者取坐位，常规消毒后，作皮下及关节后区局部浸润麻醉。然后嘱患者大张口，采用装有2ml生理盐水的注射器（5号针头）作关节上腔穿刺，髁后进针，针尖方向斜向前、内、上，抵达关节结节后斜面后稍后退，回抽如发现有淡黄色液体，即表明已进入关节上腔，
几种典型扫描电镜生物样本制备
隨着科学技术的发展，扫描电子显微镜技术已成为检测物质性能和表征微观结构的重要手段，被广泛应用于食品学、生物学、医学、高分子材料等领域[1]。扫描电子显微镜在科学研究中有广泛应用，如观察不同淀粉颗粒的超微形貌[2]、蛋白复合膜的微观结构[3]、淀粉纳米颗粒的研究[4]及不同储藏过程中肉食类微结构的变化
ELISA样本制备及注意事项（一）
一、血清的采集、处理和保存1、真空采血针采集新鲜血液，加入无菌试管中；2、采血后室温静置1小时；3、将采集血液用离心机4℃，2500rpm离心10min；4、取上清。分装冻存备用：2-8℃下，可放置保存24-48小时；-20℃下，可放置保存1个月；-80℃下，可放置保存6个月；5、根据你的实验需要，
PCR扩增样本DNA的HLA基因片段
一、PCR扩增体系1. 1.0uM 引物2. 300ng待测样本基因组DNA3. 2.0U Taq多聚酶4. 200uM 各种dNTP5. 用1 X PCR缓冲液（10mM Tris-HCl，pH8.3，50mM KCl，1.5mM MgCl2，0.01%明胶）调至总体积100ul，并用50ul矿物
常规组织样本核酸（DNA/RNA）提取纯化
20 分钟内快速纯化高品质，高产量，即用型 DNA（见图 20）多种规格可选择：Mini Kit 可处理 25 mg 组织，Micro Kit 可处理小于 10 mg 组织完全去除污染物和抑制剂可在 QIAcube 上进行自动化纯化表1 QIAamp DNA Mini Kit纯化各类样本的核酸产量样
DNA芯片的制备方式
DNA芯片又叫做基因芯片（gene chip）或基因微阵列（microarray），寡核酸芯片，或DNA微阵列，它是通过微阵列技术将高密度DNA片段阵列以一定的排列方式使其附着在玻璃、尼龙等材料上面。由于常用计算机硅芯片作为固相支持物，所以称为DNA芯片。
酵母DNA的小量制备
实验方法原理 通过消化细胞壁，然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割，也可用作 PCR 的模板。
酵母DNA的小量制备
实验方法原理通过消化细胞壁，然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割，也可用作 PCR 的模板。实验材料酶解酶 100T酵母细胞试剂、试剂盒异丙醇醋酸钾SDS醋酸钠山梨糖醇缓冲液TE酵母
快速制备酵母DNA法
实验概要本实验制备了酵母转化质粒，快速从转化酵母菌中分离了用于Southern分析的基因组DNA。主要试剂2％ Triton X－100，1％SDS，100mmol/L NaCl，10mmol/L Tris-HCl(pH8)，1mmol/L Na2EDTA，苯酚：氯仿：已戊醇（25：24：1），YP
质粒DNA大量制备实验
碱裂解法 平衡离心法 实验方法原理 这一方案科能是最常用的质粒制备方法，该法不仅相当决捷可靠，而且可获得相当纯净的粗制DNA。
质粒DNA大量制备实验
实验方法原理 这一方案科能是最常用的质粒制备方法，该法不仅相当决捷可靠，而且可获得相当纯净的粗制DNA。实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 葡萄糖TrisEDTATENaOHSDS异丙醇乙醇乙酸甲仪器、耗材 离心机漩涡混合器水浴锅实验步骤 1. 往2 ml 烧瓶中加入500 ml ，含有适当抗生素的L
质粒DNA的大量制备
实验概要本方法用于从细菌中提纯大量质粒DNA。主要试剂1. STE 0.1mol/L NaCl 10mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) 2. 溶液Ｉ 50mmol/L葡萄糖 25mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 10mmol/L EDTA(
制备互补DNA的方法
制备互补DNA，往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质，则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分。就胰岛B细胞而论，此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA，后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体，如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原)，则可从沉淀
酵母菌DNA制备
实验材料 酵母试剂、试剂盒 YPD破菌缓冲液酚氯仿异戊醇LB仪器、耗材 玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤 1. 注盛于一个13 mm×100 mm 无菌玻璃试管中的2 ml 培养基接种含有带目的基因的质粒的酵母单菌落，在转动或摇动培养箱中30℃过夜培养到静止期。2. 将1.5 ml 的过夜培养
酵母DNA的小量制备
实验方法原理 通过消化细胞壁，然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割，也可用作 PCR 的模板。实验材料 酶解酶 100T酵母细胞试剂、试剂盒 异丙醇醋酸钾SDS醋酸钠山梨糖醇缓冲液T
质粒DNA的小量制备
实验概要本方法用于从细菌中制备提纯少量质粒DNA。主要试剂1. 溶液Ｉ 50mmol/L葡萄糖 25mmol/L Tris．Cl(pH8.0) 10mmol/LEDTA(pH8.0) 溶液Ｉ可成批配制，每瓶约100ml，在6.895×104Pa高压下蒸气灭菌15分钟，贮存于4℃。2. 溶液Ⅱ 0.2
DNA片段的制备方法
常用以下方法获得DNA片段：①用限制性核酸内切酶将高分子量DNA切成一定大小的DNA片段；②用物理方法(如超声波)取得DNA随机片段；③在已知蛋白质的氨基酸顺序情况下，用人工方法合成对应的基因片段；④从mRNA反转录产生cDNA。
质粒DNA的制备方法
有多种分离质粒的方法，如碱裂解法、煮沸裂解法、层析柱过滤法等。
DNA探针的制备方法
基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针，常常是比较烦琐的。以细菌为例，细菌的基因组大小约为5×106碱基，约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针，通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法，即将细菌DNA切成小片段后（如用限制性内切酶做不完全水解）分别
“DNA探针”的制备过程
基因组DNA探针的获得有赖于分子克隆技术的发展和应用。要得到一种特异性DNA探针,常常是比较烦琐的。以细菌为例,细菌的基因组大小约为5×106碱基,约含3000个基因。要获得某细菌特异的核酸探针,通常要采取建立细菌基因组DNA文库的办法,即将细菌DNA切成小片段后(如用限制性内切酶做不完全水解)分别
λ噬菌体DNA的制备
实验概要本实验介绍了λ噬菌体DNA的制备、操作步骤和注意事项。实验原理λ噬菌体是最早使用的克隆载体，λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子，它在宿主细胞有两种生活途径：其一是裂解生长，环状DNA 分子在细胞内多次复制，合成大量噬菌体基因产物，装配成噬菌体颗粒，裂解宿主菌再进行下一次
线粒体DNA突变与母亲年龄
一项研究探索了与诸如癌症和糖尿病等疾病有联系的遗传突变的母亲到子女的传播。细胞的代谢动力工厂线粒体拥有自己的从母亲遗传来的基因组，有时候在一个人身上可能含有多个线粒体DNA(mtDNA)类型，这种现象被称为异质性。Kateryna D. Makova及其同事探索了异质性在一个人类人群中的普遍
DNA突变的概念和原因
突变是由于DNA复制（特别是减数分裂）出错或DNA损伤（如暴露于辐射或致癌物引起）后错误的修复造成的。
细胞化学词汇DNA点突变
点突变指只有一个碱基对发生改变。广义点突变可以是碱基替换，单碱基插入或碱基缺失；狭义点突变也称作单碱基替换（base substitution）。碱基替换又分为转换（transitions）和颠换（transversions）两类。点突变具有很高的回复突变率。
DNA基因突变的类别
按照基因结构改变分类小规模突变小规模突变影响基因中的一个或几个核苷酸 （只影响到一个核苷酸的突变称为点突变）。小规模突变包括：插入：将一个或多个额外的核苷酸添加到DNA中。它们通常由转座因子引起，或由重复元件错误复制所致。位于基因编码区的插入可改变mRNA的剪接（剪接位点突变）或引起阅读框架的移位（