天津大学同期刊发两篇Science文章:合成生物学重大成果

由天津大学系统生物工程教育部重点实验室元英进领导的研究组3月10日在Science杂志上刊发两篇文章,一篇文章报道了全化学合成重新设计的真核生物酿酒酵母十号染色体,长达707 Kb,创建了一种高效定位生长缺陷靶点的方法(pooled PCRTag mapping[PoPM]),解决了合成型基因组导致细胞失活的难题,并且提供了一种表型和基因型关联分析的新策略,有助于延伸对基因组和细胞功能的认知。另外一篇文章首次报道了精确匹配设计序列的真核生物染色体的化学合成,验证和评判了当前真核生物人工染色体的设计原则。同时,开发了定制化人工构建酿酒酵母环形染色体的方法,为研究染色体重排、癌症、衰老、人类染色体异常疾病等提供了新的研究思路和研究模型。 两篇文章的通讯作者均为元英进教授,第一作者分别为天津大学博士生吴毅和 “国家优青获得者”李炳志,以及博士生谢泽雄和李炳志。 合成生物学(Synthetic Biology)是继“DNA双螺旋......阅读全文

“人工合成酵母基因组计划”最新成果发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511980.shtm

是否允许人工合成基因组?人类基因组编写计划引忧虑

  2016年5月,130名科学家、企业家和政界人士在哈佛大学举办了一场仅限受邀者参加的闭门会议,商讨打造合成人类基因组的雄伟计划。三周后,参与者在浪潮般的批评声中宣布,他们计划通过这一新项目显著降低合成基因组成本。这将是生物科技领域的一项革命性发展,使科学家能够人工培育移植所需的器官。   这项

日破译人工栽培草莓基因组

  日本研究人员27日报告说,他们破译了人工栽培草莓的基因组,这一成果将有助于开发更好看好吃并能抵抗虫害的新品种草莓。   位于千叶县木更津市的上总DNA研究所在英国《DNA研究》杂志网络版上介绍说,研究人员将人工栽培草莓品种“丽红”的染色体DNA序列分成片段,分析碱基对的排列,并与4种野生草莓进

从百万基因组“驶向”人工智能

  导读: 7月28日,王俊接受了Nature和Science网站的专访,畅谈了他现在想将自己的一生都贡献给一项新的“研究计划”的原因,他想构建出一个人工智能健康监测系统,来识别人类个体基因组数据、生理性状(表型)和生活方式之间的关系。   王俊(Jun Wang)是中国最著名的科学家之一。自从16

人工智能快速解码脑癌基因组

  美国哈佛大学医学院团队设计了一种人工智能(AI)医疗工具,可快速解码脑肿瘤的DNA,以确定其在手术过程中的分子身份,而现有方法需要几天甚至几周的时间才能获得这些关键信息。研究成果7日发表在《医学》杂志上。  脑科手术期间准确的分子诊断(详细描述细胞中DNA的变化)可帮助神经外科医生决定切除多少脑

人工智能快速解码脑癌基因组

  美国哈佛大学医学院团队设计了一种人工智能(AI)医疗工具,可快速解码脑肿瘤的DNA,以确定其在手术过程中的分子身份,而现有方法需要几天甚至几周的时间才能获得这些关键信息。研究成果7日发表在《医学》杂志上。  脑科手术期间准确的分子诊断(详细描述细胞中DNA的变化)可帮助神经外科医生决定切除多少脑

山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制

  山苍子,是我国南方家喻户晓的一种香树,其果实有香气,无毒,可治疗急性肺炎,有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄  4月3日,《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色

Neurology-Genetics:IBM人工智能-高效分析脑瘤基因组

  随着肿瘤靶向治疗和个性化治疗方法的不断进步,越来越多的医生意识到了对肿瘤进行基因组测序的重要性。从肿瘤基因组分析中往往能找到更有针对性和更有效的靶向治疗方案,为患者带来更好的疗效。不过,从大量的基因组数据中迅速找到潜在的治疗方案并不是一件容易的事情,但这却是计算机和人工智能程序能够发挥作用的地方

合成基因组发表两月-部分国际反应

  我们也必须记住,自然界本身就是一名已经存在的专家,她在创造可对人类造成极大危害的微生物。合成生物学的最新进展并不一定会把我们带到比现有技术或自然界本身更接近伤害的道路。  慎重的民主就要听不同的观点,考虑对方的论点,最好找到共同点,至少要尊重不同观点,然后作出决定。面对复杂问题各

基因组研究的“98K”——人工智能算法

  每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序,可以比较来自不同细胞条件的数据集,识别增强子区域,然后将其分配给目标基因。  如今,柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆(Martin Vingron)领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊,因为它在每个

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

高质量基因组揭示草果特有风味物质生物合成

近日,华南农业大学联合怒江绿色香料产业研究院、中国农业科学院深圳基因组研究所、广东药科大学等8家单位完成了草果(Amomum tsao-ko)高质量基因组组装工作及解析草果特有风味物质生物合成。相关研究在线发表于Horticulture Research。 草果是姜科豆蔻属重要的香料作物,也是传

反义RNA的人工合成

1.由于对靶mRNA的SD序列的上游区的结构了解甚少,因此,在要设计Ⅱ类反义RNA用于和靶mRNASD序列上游区结合,以期达到调节该mRNA翻译的目的是比较困难的。2.Ⅲ类反义RNA是和mRNA的起始处结合而形成类似ρ-不依赖性的转录终止子而使转录水平上抑制靶基因的表达。因此,要设法在靶mRNA上找

反义RNA的人工合成

既然反义RNA在原核生物中对基因表达起着重要的调控作用,那么人工设计在天然状态下不存在的反义RNA来调节靶基因的表达,想必也是可能的。这已在不少实验中得到证实。1.由于对靶mRNA的SD序列的上游区的结构了解甚少,因此,在要设计Ⅱ类反义RNA用于和靶mRNASD序列上游区结合,以期达到调节该mRNA

利用人工组合转录因子对人类基因组扫描

Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21

燕麦基因组草图绘制并解析出燕麦素的生物合成基因簇

  5月7日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心(CEMPS)、中科院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(CEPAMS)韩斌研究团队与英国约翰英纳斯中心John Innes Centre(JIC)Anne Osbourn研究团队合作完成了禾本科、燕麦属一年生草本植物二倍体燕麦Avena

遗传学大牛将合成完整人类基因组?

  上周,哈佛医学院的著名遗传学家George Church和小伙伴们悄悄邀请了130名科学家、律师、企业家和政府官员,在波士顿召开了一次不对外公开的基因组会议。据说,他们在会议上探讨了体外合成完整大基因组的可行性,以及相关项目的实施。Church后来提供给STAT News的一份声明指出,这样的尝

利用人工组合转录因子对人类基因组扫描2

Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o

如何人工合成离子肽?

  设计肽序列:首先,需要确定要合成的离子肽的氨基酸序列。这通常基于已知的生物活性肽序列或通过计算机辅助设计。  合成氨基酸:在合成过程中,首先需要合成所需的氨基酸。这通常通过固相合成法进行,其中氨基酸被逐一添加到固相载体上。  连接氨基酸:一旦所有所需的氨基酸都已合成,它们就会被通过化学方法连接在

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

基因合成实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 dNTPDAN聚合酶乙醇TE限制性内切核酸酶缓冲液仪器、耗材 水浴锅培养箱实验步骤 1.  将两种寡核苷酸各1 μg加入微量离心管中,加水至17 μl,再加2 μl 的10×测序酶缓冲液。70℃加热5 min,然后在合适的退火温度下保温5  min,取2 μl 留待以后

基因合成实验

            实验方法原理 基因合成是指在体外人工合成双链DNA分子的技术,与寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是单链的,所能合成的最长片段仅为100nt左右,而基因合成则为双链DNA分子合成,所能合成的长度范围50bp-12 kb。基因合成是用人工方法合

基因合成实验

基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。难度系数  2.0共2人点评打分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏 8人收藏基因合成实验标签: 基因 合成基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。基因合成实验实验方法原理基因合成是指在体外人工

基因合成实验

基因合成可应用于:(1)代谢通路合成;(2)基因网络构建;(3)疫苗设计。实验方法原理基因合成是指在体外人工合成双链DNA分子的技术,与寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是单链的,所能合成的最长片段仅为100nt左右,而基因合成则为双链DNA分子合成,所能合成的长度范围50bp-12 kb。基因合成是用

我国学者在合成型基因组重排领域取得重大突破

           图1.精确控制合成型单倍体和二倍体酵母基因组重排图2.体外DNA重排图3.杂合二倍体与跨物种基因组重排  在国家自然科学基金项目(项目编号:21750001,21621004)等资助下,天津大学元英进教授带领的合成生物学研究团队开发了一系列原创的基因组重排技术和策略,

英国启动“合成人类基因组计划”引发广泛关注

据英国《卫报》最新消息,英国研究人员正启动一项雄心勃勃但颇具争议的计划:从零开始“书写”人类DNA。该项目被称为“合成人类基因组计划”(SynHG),由牛津大学教授杰森·钦牵头,联合剑桥大学、曼彻斯特大学、肯特大学、帝国理工学院等多家科研机构共同推进,目标是在未来几十年内开发出可完整合成人类基因组的

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1

全基因组测序的人工智能快速诊断技术可与时间赛跑

  遗传病是新生儿的头号杀手,也是五岁以下儿童死亡的主要原因之一。在中国,新生儿出生缺陷的发生率约为6%,遗传病占总出生缺陷的30%。北美约有4%的新生儿患有遗传病,约15%的儿童医院住院患者患有罕见病。对于重症患者来说,时间就是生命,在治疗患有遗传病的重症儿童时,时间更是至关重要。快速的全基因组测

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a