PacBio全新SequelII系统助力入侵物种的鉴定

对于美国葡萄园和苹果园的园主来说,斑衣蜡蝉(spotted lanternfly)简直是噩梦一般的存在。这种贪婪的食客吸食葡萄、苹果等70多种植物的汁液。若任其蔓延,将会造成数百亿美元的损失。 不过好消息是,美国农业部的科学家近日已利用PacBio新推出的Sequel II测序系统,对一只田间捕获的斑衣蜡蝉(Lycorma delicatula)进行了高质量的从头组装。 新的基因组资源不仅可以帮助人们了解这种鲜为人知的农业害虫,还有助于对此物种进行全面的基因组监控,并快速测试害虫干预策略。这一点十分重要,因为斑衣蜡蝉已经在宾夕法尼亚周边地区造成了严重的后果。 美国农业部农业科学研究院(USDA-ARS)和PacBio等机构的科学家利用8M SMRT Cell芯片测序并组装了高质量的斑衣蜡蝉参考基因组,并在预印本网站bioRxiv上发布了研究成果。 以往的蜡蝉基因组计划至少需要100-5,000只近交个体和16个不同的......阅读全文

Pacific-Biosciences推出新的Sequel-II测序系统

  Pacific Biosciences of California Inc.(纳斯达克股票代码:PACB)是基因组,转录组和表观基因组的高质量测序的领先供应商,于4月24号宣布Sequel®II系统的商业发布。该系统包括新的8M SMRT®Cell,以及配套试剂,仪器控制软件和SMRT Link

PacBio全新Sequel-II系统助力入侵物种的鉴定

  对于美国葡萄园和苹果园的园主来说,斑衣蜡蝉(spotted lanternfly)简直是噩梦一般的存在。这种贪婪的食客吸食葡萄、苹果等70多种植物的汁液。若任其蔓延,将会造成数百亿美元的损失。  不过好消息是,美国农业部的科学家近日已利用PacBio新推出的Sequel II测序系统,对一只田间

PacBio推出小而强大的测序系统

  之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在2015年9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相

华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务

2015年12月24日,中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术(SMRT)领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下简称PacBio)再次合作,购入亚洲第一台Seque

华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪器系统

  12月24日,华大基因宣布与实时单分子测序技术(SMRT)领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司(PacificBiosciencesofCalifornia,Inc.,以下简称PacBio)再次合作,购入亚洲第一台Sequel测序系统,并有后续购买计划,会将SMRT测序平台纳入其全球业务。今年初华

北京希望组新购5台Sequel测序平台

   北京希望组生物科技有限公司(GrandOmics Biosciences, Co., Ltd., 以下简称“希望组”)与美国太平洋生物公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下简称称“PacBio”)今日宣布达成战略合作,希望组与旗下科技服务公司

【综述】2016年新一代测序技术

  新一代测序几乎影响了生物学领域的每一个角落,科学家们用这一技术测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控和探索微观生命。新一代测序市场如今异常繁荣,但开发者们并没有停下自己的脚步。在最近的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,各大公司纷纷推出了自己的新产品。这些创新旨在推动新

带您了解第三代基因测序技术

  高通量测序技术(也称为二代测序技术)迅猛发展,已逐步广泛应用于基因检测的多个方面的临床服务,其对于单核苷酸多态性和小于50bp的插入或缺失变异检测相对比较准确,但是大的结构变异检测却非常困难。另一类以不经过扩增的单分子测序和长读长为标志的DNA测序技术也随即问世,这类测序技术被称为第三代测序技术

斯坦福团队证明,长读长如何诊断结构变异引起的疾病

一项最近发表的研究显示,长读长测序可以帮助诊断结构变异引起的罕见病,而这些变异难以通过短读长来鉴定。斯坦福大学临床基因组学服务的研究人员上个月在刊前版服务器(Pre-print Server)bioRxiv上报道称,他们利用Pacific Biosciences的Sequel仪器来测序一名身患未知疾

长读长测序可以帮助诊断结构变异导致的罕见病

最近发表的一项研究显示,长读长测序可以帮助诊断结构变异导致的罕见病,这类变异难以用短读长测序进行鉴定。斯坦福大学临床基因组服务部的研究人员近期报道,他们使用 Pacific Biosciences 公司的 Sequel 测序仪对具有未知疾病的个体进行全基因组测序,找到了短读长测序技术未能发现的致病突

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

测序仪性能知多少

  2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降,技术的提高,测序读长增大,研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。  DeciBio最近的市场报告显示, NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因,包括单

测序仪性能知多少

  2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降,技术的提高,测序读长增大,研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。  DeciBio最近的市场报告显示, NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因,包括单

动物性染色体起源新假说,首个鱼类Y染色体整图谱出炉

  2021年7月12日,福建省淡水水产研究所薛凌展团队联合福建师范大学、华中农业大学和维也纳大学等单位,在Genome Biology 在线发表题为“ Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin o

鱼和熊掌兼得,PacBio获得高度准确的长reads

  如今,人类基因组的测序已经达到群体规模,但仍需要结合不同的测序技术(短读长和长读长),才能覆盖各种类型的遗传变异。这无疑增加了测序项目的成本和复杂度。为此,Pacific Biosciences公司的研究人员开发出一种方案,能够在Sequel测序平台上产生高度准确的长reads。  如今,人类基

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

金唯智引入Illumina-X10及PacBio测序平台-深化基因组领域业务

  近日,金唯智宣布引进全球最高通量的测序平台Illumina HiSeq X-10及最新的单分子基因测序系统PacBio Sequel。这些新平台的加入使得金唯智拥有市场上最先进的高通量测序平台,从而全面加强金唯智在基因组学研究、精准医疗与其它应用领域里的服务范围和能力。  新平台能为客户减低成本

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

国内三代测序技术瞄准遗传病诊断

  在过去的2016年,第三代测序获得了完美突破,首次登上了太空,首次完成人类基因组测序,首次确定了二代测序未能检测到的致病性大片段缺失突变,最终确诊了一种罕见遗传病......第三代测序也被Science纳入2016年十大科学突破之一。  第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点,在临床上具有无

基因检测,一台测序仪并不够

  如今,基因组测序的新闻已变得司空见惯,不像几年前,基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探,你也考虑购入一台。挑来选去,不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel告诉你,一台也许并不够。  新一代测序仪在上市之初,价格高昂,仅限“土豪

测序仪:一台也许并不够

  如今,基因组测序的新闻已变得司空见惯,不像几年前,基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探,你也考虑购入一台。挑来选去,不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel告诉你,一台也许并不够。  新一代测序仪在上市之初,价格高昂,仅限“土豪

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析-5

图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是,合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段,通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

PacBio-Q3收入下降,但仪器安装创新高

   Pacific Biosciences公司在上周四收市后宣布,其第三季度的收入同比下降33%,因为去年第三季度收到了罗氏的1000万美元里程碑付款,而今年没有。这家单分子测序公司第三季度的总收入为1390万美元,低于华尔街预计的1580万美元。  在今年第三季度,PacBio的产品收入(包括仪

新一代测序市场五年后有望达到100亿美元

  一提到新一代测序(NGS),大家都觉得这个市场很大。究竟有多大?也许你无法回答。美国市场调查与咨询公司MarketsandMarkets近日发布了一份分析报告,聚焦了新一代测序市场的平台、服务和应用。  这份报告指出,NGS市场规模有望从2016年的40.32亿美元增长到2021年的103.71

带您了解基因测序技术的发展

  在生物多样性急剧减少和物种消失的时代,有时被称为“第六次大灭绝”或“全新世灭绝”,人们对开发有效的生物多样性研究和监测工具提出了很高的要求。迄今为止,世界各地的分类学家已经描述了超过170万个物种。然而,这只是地球上预计存在的数百万生物的一小部分。当试图使用传统的基于形态学的方法对所有物种进行分

我国完成小麦A基因组测序

   5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和