Antpedia LOGO WIKI资讯

斯坦福大学借助PacBio首次临床全基因组测序

在Ricky Ramon 7岁时进行一次例行检查中,犹豫不决的儿科医生送他去拍一张胸部X光片,结果显示在他心脏左上腔里有一个良性肿瘤。对于Ramon来说,这是长达二十年的痛苦而漫长的就医史的开始——伴随他20年的,是没完没了的预约、诊断、和手术。 在此期间,非恶性肿瘤不断重新出现在Ramon的心脏和整个身体中-在垂体腺中,肾上方的肾上腺,甲状腺结节。。。麻烦的是,医生无法诊断他的病情。当拉蒙18岁时,医生认为他的症状可能是Carney综合征—— 一种由PRKAR1A基因突变导致的遗传病症。然而,Ramon的DNA测序结果显示该基因没有发现会导致疾病的变化。 八年后,斯坦福大学医学院的研究人员使用PacBio长读测序重新对Ramon的全基因组进行测序,发现了八年前NGS未能检出的重要缺失,鉴定出Ramon基因组的一段约2,200个碱基对的缺失,并证实Carney综合征的诊断确实是正确的。这是第一次长片段全基因组测序应用于在......阅读全文

PacBio首次确认一种疾病大片段缺失突变

  二代测序为生命科学研究带来了翻天覆地的变化,但是越来越多研究表明这种短读长测序 (short-read sequencing, SRS)虽然高通量,成本低,然而对于串联重复序列、高GC/AT序列、高度多态性区域、高度同源区域以及大片段结构变异的检测能力非常有限,难以全方位的捕捉基因组的变化。据估

5000bp!单分子测序读长再次升级

  PacBio RS单分子测序在发布时就以其超长的读长引起研究者的极大兴趣。在不到一年的时间里,随着年初C2试剂的升级,Pacbio RS的平均读长达到了3000bp,并迅速在测序的各个领域,特别是De novo中发挥了巨大的读长优势。Pacific Biosciences公司在11月6日

基因检测市场已红海第四代技术在前打破上游壁垒是关键

  “我们没有接受他们的收购。原因是他们给出的价格远远低估了Illumina的市场份额和自身价值,” Illumina全球副总兼首席官Tristan Orpin在罗氏开价67亿美元、第二次对其邀约收购时表示。   罗氏和Illumina 分别是各自领域的老大,前者占据体外诊断市场的三分之一,后者占