头发曲直看DNA便知
通过DNA就能知道一个没见过的人是直发还是自来卷！最近科学家的一项研究揭开了人类头发曲直的秘密。来自中科院北京基因组研究所等单位的国内外研究人员，合作进行了一项基于近3万人样本的人类头发曲直的全基因组关联研究。相关研究论文发表在21日的《人类分子遗传学》杂志上。图片来源于网络 人类头发形状是一种高度遗传的表型。在这个项目中，科学家通过问卷和专家评估结合的方式，精确量化了近3万人的头发曲直状况，并分析了800多万个遗传位点和头发曲直的关系。该研究发现8个与人类头发曲直相关的新遗传位点，并验证了前人已报道的多个遗传位点。 此发现提高了对人类头发形状变异的遗传认识，有助于进一步揭开外部可见特征表达变异的分子基础。研究论文第一作者、中科院北京基因组研究所刘凡研究员指出，“数据表明亚洲人群头发曲直的遗传结构不同于世界其他国家，当前发现的卷发相关等位基因在亚洲人群中起很小的作用甚至无作用，或者其作用完全被亚洲特异的EDAR基因变异的......阅读全文
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
用于从全血（10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除，随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇，70%，室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去
从全血中纯化基因组－DNA－实验方法
试剂、试剂盒 乙醇 异丙醇 RNA 酶 A 全血 仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳
机器学习模型预测中风？
中风的诊断可能很棘手，因为患者并不总是表现出典型的症状，而且其他疾病也可能模仿它。研究人员利用现有数据开发了一种机器学习模型，可以准确预测中风，并可能使诊断变得更容易。诊断错误是一个主要的公共卫生问题，造成了可预防的病人伤害和卫生超支。由于诊断错误而导致的可预防的中风死亡比误诊的心脏病发作要常见30
Nature：全基因组测序可预测胰腺癌化疗效果
近日，国际顶尖期刊nature发表了澳大利亚科学家的一项最新研究进展，他们通过对胰腺癌病人进行全基因组测序以及CNV分析重新定义了胰腺癌突变图谱。 胰腺癌目前仍是致死率最高的恶性肿瘤之一，也是人类健康的一个主要负担。研究人员对100个胰腺导管腺癌（PDAC）病人进行了全基因组测序以及copy
新研究可大幅提高杂交水稻全基因组选择预测精度
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人类重要的粮食作物之一，水稻杂交种的产量高于常规自交系品种，但由于杂交稻存在显性等非加性效应，稻米品质的遗传改良比自交稻更具挑战性。湖南农业大学植物保护学院副教授李兰芝团队联合美
基于ASM模型的出水水质预测机理模型
为了推动和规范活性污泥模型的发展，国际水协会(International Water Association, IWA)于1983年组织南非、日本、美国、丹麦、荷兰五国专家成立活性污泥通用模型国际研究小组，致力于新的活性污泥数学模型的开发，并于1987年、1995年和1999年陆续推 出了3个ASM
定位全基因组范围DNA修复的新方法
北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析，可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序（XR-seq）的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。 这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人
Illumina推出Nextera－DNA－Flex全基因组测序制备产品
近日，Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex，它让全血和唾液样本省去了样本制备，也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤，比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程，适合广泛的应用，
DeepMind－AI模型预测天气又快又好
近日一项发表于《自然》的研究报道了谷歌DeepMind开发的首个天气预测人工智能（AI）模型——GenCast。该模型比目前运行中的最佳中期预报系统——欧洲中期天气预报中心的集合预报（ENS）更精准。GenCast在8分钟内就能完成15天的预测，而目前的预测程序需要几个小时。据介绍，包括ENS在内的
换个模型预测气候变化
《自然—气候变化》11月23日发表的多模型分析，依据2030年前后的减排措施预测了气候场景，发现即使最乐观的场景也不足以将全球变暖限制在2°C以内。这个前瞻性建模方法与传统“倒序”设想不同，后者聚焦于预先规定的气候目标并描述如何实现这些目标。大多数气候模型聚焦于一种被称为“倒序推演”的概念，其中目标
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化，环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外，在不断增殖的肿瘤中，具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性（fitness）并不是一成不变的。在化疗药物
DNA甲基化预测
实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测，并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有：GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究
新模型精准预测土壤“碳排放”
从天津大学获悉，日前，该校地科院晏智锋副教授与联合西北太平洋国家实验室—马里兰大学联合全球气候变化研究所合作，在土壤异养呼吸过程模型构建与应用上取得新进展，首次建立了可精准监测土壤“碳排放”的过程模型系统，该系统可更加精准地预报土壤异养呼吸对大气环境的影响。 土壤中的微生物、作物根系和土壤动物
新模型精准预测土壤“碳排放”
记者从天津大学获悉，日前，该校地科院晏智锋副教授与联合西北太平洋国家实验室—马里兰大学联合全球气候变化研究所合作，在土壤异养呼吸过程模型构建与应用上取得新进展，首次建立了可精准监测土壤“碳排放”的过程模型系统，该系统可更加精准地预报土壤异养呼吸对大气环境的影响。 土壤中的微生物、作物根系和土壤动物
从全血中提取基因组DNA用到各试剂的作用
全血基因组DNA提取试剂盒（离心柱型）作用原来具体是这样的：独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA
从全血和体液中提取基因组DNA的操作步骤
提取DNA需要的仪器和试剂： ⑴ 1.5ml 离心管⑵ 移液管: 1000μl, 200μl, 40μl 各一支和移液管尖头: 100-1000μl, 1-200μl 各一盒⑶ 微型滤柱（备用）⑷ 小型旋转混合器一台⑸ 小型离心机: 可放入1.5ml 离心管和2ml收集管.⑹ 恒温水浴⑺ 电冰箱:
开发出新型预测模型来预测HIV疗法的效果
艾滋病毒非常可怕，尤其是其自身非常好的自适应性，如果HIV对于某一个靶点药物产生了变异，那么就变相宣布了此疗法的失败。为了尽量降低HIV的防御机制，医生们会使用许多种药物联合的方法来治疗患者，这种方法就可以使得病毒对特定药物耐受之前经历相当长的变异过程。 近日，刊登在国际杂志PLoS Co
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
如何使用生态模型中逻辑斯蒂增长模型进行预测？
使用逻辑斯蒂增长模型进行预测可以按照以下步骤进行： **一、确定模型形式** 逻辑斯蒂增长模型的一般形式为： \(P(t)=\frac{K}{1 + ae^{-bt}}\) 其中，\(P(t)\)表示在时间\(t\)时的预测值（如种群数量、市场需求等），\(K\)是环境容纳量（最
全血基因组DNA提取试剂盒（50次）使用说明
全血基因组DNA提取试剂盒（50次）试剂盒组成：1．溶液A 25ml 5×STMT(用时按体积比1：4 用灭菌双蒸水稀释)2．溶液B 17ml3. 溶液C 0.6ml RNase A4．溶液D 44ml5. 溶液E 1.25ml Resin（用时充分混匀）6. 溶液F 30ml 洗液(用时加入40m
AI模型“Evo”：揭开基因组“密码全书”新篇章
《科学》杂志15日发布了一项突破性研究成果：美国斯坦福大学Arc研究所团队利用人工智能（AI），开发出一种大规模基因组基础模型“Evo”，翻开了生命的“密码全书”。该模型采用先进架构，能够以前所未有的精度，解析和设计从分子层面到整个基因组级别的DNA、RNA及蛋白质序列。其不仅能够预测突变对细胞内部
欧洲夏季将比模型预测的更炎热
欧洲的酷夏和热浪将比人们担心的更加闷热。一项在近日举行的欧洲地球科学联盟大会上发布的研究表明，行政管理者所依赖的区域气候模型严重低估了夏季的炎热情况，因为它们没有考虑到空气污染减少带来更强烈的阳光。2023年7月，在希腊雅典，女子用瓶装水降温。图片来源：Louisa Gouliamaki/AFP/G
Science：谷歌AI新模型预测天气快又准
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512459.shtm编译 ｜ 辛雨 图片来源：Carlos Munoz Yague 人工智能（AI）公司Google DeepMind开发的机器学习模型GraphCast，在“3至
AI新模型快速预测材料光学性质
未来的中央处理器（艺术图）。图片来源：美国趣味工程网站科技日报讯 （记者刘霞）据美国趣味工程网站近日报道，日本东北大学和美国麻省理工学院科学家，成功开发出一款新人工智能（AI）模型GNNOpt。该模型能以与量子模拟相同的精度预测材料的光学性质，但速度能快100万倍。研究团队表示，这一重要进展有望加速
流感疫情多严重？这个模型来预测
最近，身边感冒的人突然多了起来，提示我们季节性流感又来了。流感，似乎伴随着人类的历史，有时严重，有时轻微。芝加哥大学的研究人员通过研究流感病毒如何演化，可以更好地预测未来的流感有多严重。这项成果近日发表在《Science Translational Medicine》上。 季节性流感每年会造
生态模型中逻辑斯蒂增长模型与其他预测模型相比有哪些优缺点？
逻辑斯蒂增长模型与其他预测模型相比，有以下优点和缺点：优点：描述种群增长规律：在生物学领域，能较好地描述生物种群在资源有限环境下的增长情况，呈现出先加速增长后趋于稳定的特征，符合许多生物种群实际增长模式，如鱼类种群数量在一定水域内的变化 51626。考虑环境限制因素：相比指数增长模型等简单模型，逻辑
禽类全血基因组DNA－提取试剂盒（50－次）使用说明
禽类全血基因组DNA 提取试剂盒（50 次）试剂盒组成：溶液A： 30ml溶液B： 0.6ml RNase A溶液C： 50ml溶液D： 2ml Resin（用时充分混匀）溶液E： 30ml 洗液(注：用时加入35ml 无水酒精)溶液F: 10ml TE 缓冲液实验步骤:1． 取300μl 抗凝血,
Nature－Genetics：单细胞全基因组DNA甲基化组新发现
北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心，北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法，首次在单细胞分辨