三篇文章为蛋白质组学研究提供重要信息
由EMBL等处的研究人员公布的三篇文章对大规模蛋白质组学的数据分享和信息比较方面提出了新的方法见解，令这些数据能更易被科学家们分享使用，这些文章发表在8号和26号的《Nature Biotechnology》杂志上。 这三篇文章中的两篇作为Perspectives papers公布在杂志上，可免费获得，主要是提出了蛋白质组学和分子相互作用实验的公布要求，并讨论了这些方法的执行（mplementation），影响（impact）和益处（benefit）。最后一篇文章，公布在26号的杂志上，提出了这些标准如何不仅对于研究人员而言有帮助，而且也通过更详细和完整的信息来源有利于更广泛的交流。 原文检索：Nature Biotechnology 25, 887 - 893 (2007) Published online: 8 August 2007 | doi:10.1038/nbt1329The minimum informati......阅读全文
《自然方法学》：可视蛋白质组学
瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体(Leptospira interrogans)这种病原体中定位蛋白复合物的新方法，称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。 活细胞中的生化进程分为多个功能单元，它们在细胞内有着特定的时间和空间分布。一般来说，这些单元
Nature年度技术：定向蛋白质组学
时近岁末，各大杂志接连进行了年终盘点，此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾，评点了2012年的科技进展，科技政策以及重要人物，中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点，选出了2012年度技术成果：定向蛋白质组学(targe
Nature方法：发布蛋白质组检测新技术
在Fred Hutchinson癌症研究中心癌症蛋白质组学专家Amanda Paulovich博士领导下，一个国际科学家研究小组证实了大规模、标准化蛋白质检测的可行性，这是验证疾病生物标志物和药物靶点的必要条件。 这项在线发表在12月8日《自然方法》(Nature Methods)
蛋白质组学牛人Nature发表重要成果
第一次结合两种新兴的大规模实验技术：多通道质谱分析法和具有高水平自然遗传多样性的小鼠种群，哈佛医学院(HMS)和Jackson实验室(JAX)的研究人员解决了生物学和医学中一个悬而未决的问题：遗传变异是如何影响蛋白质水平的？ 蛋白质是构成所有细胞和生物结构与功能“零件表”的氨基酸链。因此，了解
Nature－Methods－|－朝思暮想：单细胞蛋白质组测序之梦
近期，Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics，探讨了单细胞蛋白组学的发展，提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远（Credit: S. Larochell
《自然》子刊专题：蛋白质组学中的质谱
涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条，一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化，另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术（Mass spectrometry，MS）是蛋白质组学常用
英国自然杂志《Nature》介绍
英国自然杂志《Nature》 www.nature.comNPG Nature Asia-Pacific www.natureasia.com 出版：英国MacMillan.Ltd 创刊：1869年 刊期：周刊 定位：兼顾学术期刊和科学杂志，即科学论文具较高的新闻性和广泛的读者群。论文不仅要
蛋白质组和蛋白质组学分析
随着人类基因 组计划研究成果的公布，人们对基因的认识逐渐清晰，但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性，与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系，对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此，作为生命活动的直接承担者――蛋白质，成为后基
研究人员利用“机器学习”帮助鉴定磷酸化位点
EMBL的欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）的研究人员创建了迄今为止最大的参考磷酸化蛋白质组，将近120000个人类磷酸化位点。为了识别最重要的成员，他们使用了一种机器学习方法，能够根据功能重要性对其进行排名。 蛋白质是细胞的核心分子机器，可以通过类似于分子开关的蛋白质修饰来调节。磷酸化
Nature：蛋白质组学揭示新冠治疗靶标－抑制病毒复制！
新冠肺炎已迅速在全球蔓延，对全球公共卫生造成严重威胁并对全球经济造成严重影响。目前针对新冠主要是一些支持性和对症治疗，因此迫切需要开发抑制SARS-CoV-2感染或复制的疗法。尽管SARS-CoV-2与其他冠状病毒有相似之处。但目前仍然缺乏对SARS-CoV-2感染机制的理解以及针对新冠的潜在治
EMBL科学家发布新荧光标记技术
欧洲分子生物学实验室EMBL的科学家们在12月8日的《Nature Methods》上发表了一种新标记技术，为人们揭示了小鼠神经系统的更多细节。研究者们可以在此基础上很方便的使用各种人工标记，拓展自己的研究范围，提高荧光成像的分辨率。“这一技术能帮我们看到之前看不清楚的细节，”这项研究的领导者，EM
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合，然后将DNA从被修饰的碱基处切割，电泳分离，结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰，不能切断，可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念：一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
中国学者Nature－Biotechnology发表蛋白质组学分析新技术
来自中科院计算技术研究所的研究人员发表了题为“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章，公布了新一代开放式搜索算法Open-p
蛋白质组学大爆发，2021年10月Nature同期4篇
近年来蛋白质组技术应用取得飞速发展，高水平研究成果风起云涌，层出不穷。仅2020年，国际顶级期刊Cell，Nature ，Science累计发表75篇蛋白质组学、及蛋白质修饰组学技术相关研究成果，在生命科学、医学与农业科学领域接连取得重大突破。 2021年10月27日，Nature同期
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
三篇文章为蛋白质组学研究提供重要信息
由EMBL等处的研究人员公布的三篇文章对大规模蛋白质组学的数据分享和信息比较方面提出了新的方法见解，令这些数据能更易被科学家们分享使用，这些文章发表在8号和26号的《Nature Biotechnology》杂志上。 这三篇文章中的两篇作为Perspectives papers公布在杂志上，可免
Nature：对抗自然界的“杀手”
近几十年，两栖类在全球范围内出现了种群数量快速下降，主要元凶之一是两栖动物壶菌病。该病由真菌壶菌（chytrid fungus）引起，是一种新出现的急性的只感染两栖动物的致死性传染病，是目前全球两栖动物多样性的最大威胁。 但是7月10日Nature杂志上的一篇文章却表明，面对这种恶性杀手，动物
Nature扩展教科书，基因功能研究的新层面
就像一个管弦乐队中的音乐家们，他们拥有相同的乐谱，却在不同的间隔时间内开始和结束演奏。细胞也拥有相同的基因，却在基因组中的不同位点启动和完成对它们的转录。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员，第一次描述了由于这样的起点和终点变化所导致的信使RNAs (mRNAs)惊人的多样性。他们
Nature－|－仅隔两周，蛋白质组再揭肿瘤新靶点
继两周前，nature上发表了利用蛋白质组学发现胰腺癌治疗靶点和诊断标志物的突破性成果后（添加该文链接）。5月2日，又一篇卵巢癌新靶点的文章在nature上重磅发表！！还是那个蛋白质组，却是肿瘤领域又一重要新发现！！！ 肿瘤转移一直是困扰癌症治疗的一大问题。5月2日，来自芝加哥大学的Er
复旦大学等处发表Nature文章－解析肝癌蛋白质组学研究
肝癌是全世界造成癌症死亡的第三大杀手，更是有中国特色的一种癌症。诱发肝癌的因素很多，包括病毒、环境和遗传因素的共同作用。在我国，肝癌发生的最大危险因素之一是乙肝病毒感染。 来自复旦大学附属中山医院，军事医学科学院的研究人员发表了题为“Proteomics identifies new ther
Nature－|－仅隔两周，蛋白质组再揭肿瘤新靶点
继两周前，nature上发表了利用蛋白质组学发现胰腺癌治疗靶点和诊断标志物的突破性成果后（添加该文链接）。5月2日，又一篇卵巢癌新靶点的文章在nature上重磅发表！！还是那个蛋白质组，却是肿瘤领域又一重要新发现！！！ 肿瘤转移一直是困扰癌症治疗的一大问题。5月2日，来自芝加哥大学的E
Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
《自然》：首个甲虫基因组问世
一个国际科研团体将在3月27日的《自然》杂志上发表他们的最新研究成果——首个甲虫全基因组序列。新测序的甲虫中文名称为赤拟谷盗(red flour beetle)，学名为Tribolium castaneum，是农业上的一大害虫。因此，它也成为第一种进行基因组测序的害虫，这对农业除害具有重要意义。
《自然》：葡萄基因组测定完成
葡萄成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物 一项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作为“葡萄酒之都”的荣誉，他们完整测定了一种葡萄的基因组。葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物（其它3种分别是小麦、拟南芥和白杨木），这有望加深科学家对开花植物进化过程的理解
Nature：基因组的“气味”
问问你身边的十个人，他们是如何寻找自己的伴侣的，也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了，一项最新的研究指出，嗅觉系统具有超乎想象的敏感性，能精确鉴别遗传上的相关性，这表明这种能力能为同类识别，伴侣选择，以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。 许多方面的动物行为都需要了解
Nature：水母基因组之谜
太平洋侧腕水母的基因组中缺少很多常见基因。 栉水母基因序列草图的发表揭示了一种与众不同的神经系统。 栉水母（comb jelly）——或栉水母门动物（ctenophore）——看起来就像微小的迪斯科球，它们利用特殊的纤毛推动自己在海洋中游动，并且用粘性触手来捕获更微小的猎物。圣奥古斯丁佛罗里达大
Nature公布小麦基因组
利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序，他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表，有望帮助人们增加小麦产量，培育更适应环境变化的品种。 到2050年，世界人口预计会从七十亿增加到九十亿，在可用耕地越来越少的情况下，要满足全球对粮食持续增长的需求，
打开盲盒：AlphaFold2预测了人类全蛋白质组－将免费开放
翘首以盼8个月的 AlphaFold2 的论文与源码发布后一周，今天 DeepMind 再度公布关于 AlphaFold2 的重磅信息：用 AlphaFold2 完全预测了人、大肠杆菌、果蝇、斑马鱼等21种生物的全蛋白质组内35万个蛋白质结构！这项工作发表在了本周出版的Nature上。 Hol